RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394106.6

CMTM4-202, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CMTM4, Length 1,187 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM4-202ENST00000394106 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa44.68■■■■■ 4.74
CMTM4-202ENST00000394106 JCADQ9P266 1359 aa44.67■■■■■ 4.74
CMTM4-202ENST00000394106 ADGRB1O14514 1584 aa44.64■■■■■ 4.74
CMTM4-202ENST00000394106 NHSL1Q5SYE7 1610 aa44.64■■■■■ 4.74
CMTM4-202ENST00000394106 SIRT1Q96EB6 747 aa44.63■■■■■ 4.74
CMTM4-202ENST00000394106 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP44.59■■■■■ 4.73
CMTM4-202ENST00000394106 ORAI2Q96SN7 254 aa44.59■■■■■ 4.73
CMTM4-202ENST00000394106 PRAM1Q96QH2 718 aa44.57■■■■■ 4.73
CMTM4-202ENST00000394106 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP44.56■■■■■ 4.72
CMTM4-202ENST00000394106 DLC1Q96QB1 1528 aa44.55■■■■■ 4.72
CMTM4-202ENST00000394106 TRAK1Q9UPV9 953 aa44.54■■■■■ 4.72
CMTM4-202ENST00000394106 NUTM2FA1L443 756 aa44.53■■■■■ 4.72
CMTM4-202ENST00000394106 SIN3AQ96ST3 1273 aa44.53■■■■■ 4.72
CMTM4-202ENST00000394106 POGKQ9P215 609 aa44.53■■■■■ 4.72
CMTM4-202ENST00000394106 SHPRHQ149N8 1683 aa44.51■■■■■ 4.72
CMTM4-202ENST00000394106 ESCO1Q5FWF5 840 aa44.5■■■■■ 4.71
CMTM4-202ENST00000394106 FMN2Q9NZ56 1722 aa44.49■■■■■ 4.71
CMTM4-202ENST00000394106 NEUROD1Q13562 356 aa44.47■■■■■ 4.71
CMTM4-202ENST00000394106 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP44.45■■■■■ 4.71
CMTM4-202ENST00000394106 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa44.45■■■■■ 4.71
CMTM4-202ENST00000394106 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa44.41■■■■■ 4.7
CMTM4-202ENST00000394106 L3MBTL2Q969R5 705 aa44.41■■■■■ 4.7
CMTM4-202ENST00000394106 LRP6O75581 1613 aa44.39■■■■■ 4.7
CMTM4-202ENST00000394106 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP44.36■■■■■ 4.69
CMTM4-202ENST00000394106 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP44.35■■■■■ 4.69
CMTM4-202ENST00000394106 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP44.35■■■■■ 4.69
CMTM4-202ENST00000394106 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP44.35■■■■■ 4.69
CMTM4-202ENST00000394106 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP44.35■■■■■ 4.69
CMTM4-202ENST00000394106 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP44.35■■■■■ 4.69
CMTM4-202ENST00000394106 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP44.34■■■■■ 4.69
CMTM4-202ENST00000394106 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP44.34■■■■■ 4.69
CMTM4-202ENST00000394106 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP44.34■■■■■ 4.69
CMTM4-202ENST00000394106 NPHP3Q7Z494 1330 aa44.33■■■■■ 4.69
CMTM4-202ENST00000394106 PNPLA6Q8IY17 1366 aa44.32■■■■■ 4.69
CMTM4-202ENST00000394106 ADGRB2O60241 1585 aa44.32■■■■■ 4.69
CMTM4-202ENST00000394106 FOXO3O43524 673 aa44.32■■■■■ 4.69
CMTM4-202ENST00000394106 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP44.32■■■■■ 4.69
CMTM4-202ENST00000394106 NBPF1Q3BBV0 1214 aa44.31■■■■■ 4.68
CMTM4-202ENST00000394106 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP44.28■■■■■ 4.68
CMTM4-202ENST00000394106 KIF1AQ12756 1690 aa44.28■■■■■ 4.68
CMTM4-202ENST00000394106 PXDNQ92626 1479 aa44.25■■■■■ 4.67
CMTM4-202ENST00000394106 PHF8Q9UPP1 1060 aa44.21■■■■■ 4.67
CMTM4-202ENST00000394106 USP32Q8NFA0 1604 aa44.21■■■■■ 4.67
CMTM4-202ENST00000394106 ANKARQ7Z5J8 1434 aa44.2■■■■■ 4.67
CMTM4-202ENST00000394106 WASLO00401 505 aaPredicted RBP44.17■■■■■ 4.66
CMTM4-202ENST00000394106 POTEAQ6S8J7 498 aa44.16■■■■■ 4.66
CMTM4-202ENST00000394106 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP44.16■■■■■ 4.66
CMTM4-202ENST00000394106 TULP4Q9NRJ4 1543 aa44.14■■■■■ 4.66
CMTM4-202ENST00000394106 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa44.13■■■■■ 4.66
CMTM4-202ENST00000394106 KRT28Q7Z3Y7 464 aa44.11■■■■■ 4.65
CMTM4-202ENST00000394106 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa44.1■■■■■ 4.65
CMTM4-202ENST00000394106 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP44.1■■■■■ 4.65
CMTM4-202ENST00000394106 PRR36Q9H6K5 1346 aa44.09■■■■■ 4.65
CMTM4-202ENST00000394106 TONSLQ96HA7 1378 aa44.07■■■■■ 4.65
CMTM4-202ENST00000394106 ADAMTS2O95450 1211 aa44.07■■■■■ 4.65
CMTM4-202ENST00000394106 C8orf37Q96NL8 207 aa44.05■■■■■ 4.64
CMTM4-202ENST00000394106 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP44.04■■■■■ 4.64
CMTM4-202ENST00000394106 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP44.04■■■■■ 4.64
CMTM4-202ENST00000394106 PSME1Q06323 249 aa44.03■■■■■ 4.64
CMTM4-202ENST00000394106 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa44.02■■■■■ 4.64
CMTM4-202ENST00000394106 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP44.02■■■■■ 4.64
CMTM4-202ENST00000394106 NBPF8Q3BBV2 869 aa44.01■■■■■ 4.64
CMTM4-202ENST00000394106 CDK19Q9BWU1 502 aa44.01■■■■■ 4.64
CMTM4-202ENST00000394106 AFF2P51816 1311 aa44■■■■■ 4.63
CMTM4-202ENST00000394106 QRICH2Q9H0J4 1663 aa43.97■■■■■ 4.63
CMTM4-202ENST00000394106 ATP7BP35670 1465 aa43.97■■■■■ 4.63
CMTM4-202ENST00000394106 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP43.97■■■■■ 4.63
CMTM4-202ENST00000394106 PCGF6Q9BYE7 350 aa43.97■■■■■ 4.63
CMTM4-202ENST00000394106 ITSN1Q15811 1721 aa43.96■■■■■ 4.63
CMTM4-202ENST00000394106 TNS3Q68CZ2 1445 aa43.96■■■■■ 4.63
CMTM4-202ENST00000394106 NGLY1Q96IV0 654 aa43.94■■■■■ 4.62
CMTM4-202ENST00000394106 SBNO1A3KN83 1393 aa43.92■■■■■ 4.62
CMTM4-202ENST00000394106 LMOD2Q6P5Q4 547 aa43.92■■■■■ 4.62
CMTM4-202ENST00000394106 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP43.92■■■■■ 4.62
CMTM4-202ENST00000394106 GPRASP1Q5JY77 1395 aa43.92■■■■■ 4.62
CMTM4-202ENST00000394106 PLEKHG5O94827 1062 aa43.87■■■■■ 4.61
CMTM4-202ENST00000394106 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP43.86■■■■■ 4.61
CMTM4-202ENST00000394106 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP43.86■■■■■ 4.61
CMTM4-202ENST00000394106 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa43.85■■■■■ 4.61
CMTM4-202ENST00000394106 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP43.85■■■■■ 4.61
CMTM4-202ENST00000394106 ARHGEF10O15013 1369 aa43.83■■■■■ 4.61
CMTM4-202ENST00000394106 CCDC61Q9Y6R9 512 aa43.82■■■■■ 4.61
CMTM4-202ENST00000394106 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP43.81■■■■■ 4.6
CMTM4-202ENST00000394106 CABP2Q9NPB3 220 aa43.81■■■■■ 4.6
CMTM4-202ENST00000394106 CARD11Q9BXL7 1154 aa43.8■■■■■ 4.6
CMTM4-202ENST00000394106 RALGAPBQ86X10 1494 aa43.8■■■■■ 4.6
CMTM4-202ENST00000394106 CABLES1Q8TDN4 633 aa43.79■■■■■ 4.6
CMTM4-202ENST00000394106 RXRBP28702 533 aa43.78■■■■■ 4.6
CMTM4-202ENST00000394106 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP43.77■■■■■ 4.6
CMTM4-202ENST00000394106 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP43.77■■■■■ 4.6
CMTM4-202ENST00000394106 USP21Q9UK80 565 aa43.77■■■■■ 4.6
CMTM4-202ENST00000394106 ALS2Q96Q42 1657 aa43.75■■■■■ 4.59
CMTM4-202ENST00000394106 ACEP12821 1306 aa43.73■■■■■ 4.59
CMTM4-202ENST00000394106 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP43.73■■■■■ 4.59
CMTM4-202ENST00000394106 ABCA3Q99758 1704 aa43.73■■■■■ 4.59
CMTM4-202ENST00000394106 EVC2Q86UK5 1308 aa43.73■■■■■ 4.59
CMTM4-202ENST00000394106 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa43.72■■■■■ 4.59
CMTM4-202ENST00000394106 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP43.71■■■■■ 4.59
CMTM4-202ENST00000394106 PLEKHG3A1L390 1219 aa43.71■■■■■ 4.59
CMTM4-202ENST00000394106 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP43.65■■■■■ 4.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 6.6 ms