RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000391014.1

RNU6-1228P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1228, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-1228P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1228P-201ENST00000391014 J3QL48 77 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-1228P-201ENST00000391014 AXIN1O15169 862 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-1228P-201ENST00000391014 SMPD1P17405 629 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-1228P-201ENST00000391014 MMP16P51512 607 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-1228P-201ENST00000391014 IRF6O14896 467 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-1228P-201ENST00000391014 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
RNU6-1228P-201ENST00000391014 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
RNU6-1228P-201ENST00000391014 GUCA2AQ02747 115 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-1228P-201ENST00000391014 TRIM32Q13049 653 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-1228P-201ENST00000391014 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
RNU6-1228P-201ENST00000391014 WNT7AO00755 349 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-1228P-201ENST00000391014 KDM4AO75164 1064 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-1228P-201ENST00000391014 SKOR1P84550 965 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-1228P-201ENST00000391014 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
RNU6-1228P-201ENST00000391014 MAP2K5Q13163 448 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-1228P-201ENST00000391014 LCE2CQ5TA81 110 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-1228P-201ENST00000391014 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
RNU6-1228P-201ENST00000391014 MRGPRX2Q96LB1 330 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-1228P-201ENST00000391014 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
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RNU6-1228P-201ENST00000391014 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
RNU6-1228P-201ENST00000391014 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
RNU6-1228P-201ENST00000391014 CTC1Q2NKJ3 1217 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-1228P-201ENST00000391014 GRIPAP1Q4V328 841 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-1228P-201ENST00000391014 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
RNU6-1228P-201ENST00000391014 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
RNU6-1228P-201ENST00000391014 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
RNU6-1228P-201ENST00000391014 Q3C1V9 767 aa4.87□□□□□ -1.63
RNU6-1228P-201ENST00000391014 CCDC24Q8N4L8 307 aa4.87□□□□□ -1.63
RNU6-1228P-201ENST00000391014 HPS1Q92902 700 aa4.87□□□□□ -1.63
RNU6-1228P-201ENST00000391014 HOXA2O43364 376 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-1228P-201ENST00000391014 WFS1O76024 890 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-1228P-201ENST00000391014 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
RNU6-1228P-201ENST00000391014 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
RNU6-1228P-201ENST00000391014 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
RNU6-1228P-201ENST00000391014 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-1228P-201ENST00000391014 CCDC102AQ96A19 550 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-1228P-201ENST00000391014 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
RNU6-1228P-201ENST00000391014 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
RNU6-1228P-201ENST00000391014 PCDHGC3Q9UN70 934 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-1228P-201ENST00000391014 SIAH2O43255 324 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-1228P-201ENST00000391014 USP46P62068 366 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-1228P-201ENST00000391014 JUNDP17535 347 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-1228P-201ENST00000391014 TRIM47Q96LD4 638 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-1228P-201ENST00000391014 GPCPD1Q9NPB8 672 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-1228P-201ENST00000391014 TERTO14746 1132 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
RNU6-1228P-201ENST00000391014 WIPF1O43516 503 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-1228P-201ENST00000391014 ALDH1A1P00352 501 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-1228P-201ENST00000391014 NDUFV2P19404 249 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-1228P-201ENST00000391014 WNT7BP56706 349 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-1228P-201ENST00000391014 CLCN1P35523 988 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-1228P-201ENST00000391014 SH3BP2P78314 561 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-1228P-201ENST00000391014 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP4.8□□□□□ -1.64
RNU6-1228P-201ENST00000391014 RETREG3Q86VR2 466 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-1228P-201ENST00000391014 SPIRE2Q8WWL2 714 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-1228P-201ENST00000391014 NUDT12Q9BQG2 462 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-1228P-201ENST00000391014 FDX1P10109 184 aa4.79□□□□□ -1.64
RNU6-1228P-201ENST00000391014 BMP1P13497 986 aa4.79□□□□□ -1.64
RNU6-1228P-201ENST00000391014 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
RNU6-1228P-201ENST00000391014 TRIM46Q7Z4K8 759 aa4.79□□□□□ -1.64
RNU6-1228P-201ENST00000391014 NUTM1Q86Y26 1132 aa4.79□□□□□ -1.64
RNU6-1228P-201ENST00000391014 SENP2Q9HC62 589 aa4.79□□□□□ -1.64
RNU6-1228P-201ENST00000391014 MOXD2PA6NHM9 499 aa4.78□□□□□ -1.64
RNU6-1228P-201ENST00000391014 C6orf229H3BNL8 230 aa4.78□□□□□ -1.64
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RNU6-1228P-201ENST00000391014 EHBP1Q8NDI1 1231 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-1228P-201ENST00000391014 BAP1Q92560 729 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-1228P-201ENST00000391014 EVA1BQ9NVM1 165 aa4.77□□□□□ -1.65
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RNU6-1228P-201ENST00000391014 MS4A1P11836 297 aa4.76□□□□□ -1.65
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RNU6-1228P-201ENST00000391014 VEGFBP49765 207 aa4.76□□□□□ -1.65
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RNU6-1228P-201ENST00000391014 KIFC2Q96AC6 838 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-1228P-201ENST00000391014 UNC93B1Q9H1C4 597 aa4.76□□□□□ -1.65
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RNU6-1228P-201ENST00000391014 PRR7Q8TB68 274 aa4.75□□□□□ -1.65
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RNU6-1228P-201ENST00000391014 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-1228P-201ENST00000391014 TLL2Q9Y6L7 1015 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-1228P-201ENST00000391014 WASF2Q9Y6W5 498 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-1228P-201ENST00000391014 ZMYND10O75800 440 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-1228P-201ENST00000391014 KCNH2Q12809 1159 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-1228P-201ENST00000391014 PTPRNQ16849 979 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-1228P-201ENST00000391014 BARGINQ6ZT62 677 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-1228P-201ENST00000391014 ZFP42Q96MM3 310 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-1228P-201ENST00000391014 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
RNU6-1228P-201ENST00000391014 GMPRP36959 345 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-1228P-201ENST00000391014 ZNF511Q8NB15 262 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-1228P-201ENST00000391014 ERBB4Q15303 1308 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-1228P-201ENST00000391014 SOBPA7XYQ1 873 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-1228P-201ENST00000391014 CFAP99D6REC4 459 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-1228P-201ENST00000391014 MTMR2Q13614 643 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-1228P-201ENST00000391014 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
RNU6-1228P-201ENST00000391014 AMHR2Q16671 573 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-1228P-201ENST00000391014 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
RNU6-1228P-201ENST00000391014 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
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