RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000377078.2

USP11-202, Transcript of ubiquitin specific peptidase 11, humanhuman

TSL 5

Gene USP11, Length 1,077 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP11-202ENST00000377078 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa25.05■■□□□ 1.6
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USP11-202ENST00000377078 WAPLQ7Z5K2 1190 aa25.04■■□□□ 1.6
USP11-202ENST00000377078 SIRT1Q96EB6 747 aa25.03■■□□□ 1.6
USP11-202ENST00000377078 DCAF11Q8TEB1 546 aa25.02■■□□□ 1.6
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USP11-202ENST00000377078 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa25■■□□□ 1.59
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USP11-202ENST00000377078 LRP6O75581 1613 aa24.98■■□□□ 1.59
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USP11-202ENST00000377078 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
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USP11-202ENST00000377078 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
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USP11-202ENST00000377078 DLC1Q96QB1 1528 aa24.93■■□□□ 1.58
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USP11-202ENST00000377078 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP24.9■■□□□ 1.58
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USP11-202ENST00000377078 FOXO3O43524 673 aa24.88■■□□□ 1.57
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USP11-202ENST00000377078 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa24.74■■□□□ 1.55
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USP11-202ENST00000377078 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
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USP11-202ENST00000377078 LMOD2Q6P5Q4 547 aa24.67■■□□□ 1.54
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USP11-202ENST00000377078 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.54
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USP11-202ENST00000377078 CDK19Q9BWU1 502 aa24.61■■□□□ 1.53
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USP11-202ENST00000377078 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
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USP11-202ENST00000377078 CCDC61Q9Y6R9 512 aa24.56■■□□□ 1.52
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USP11-202ENST00000377078 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
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USP11-202ENST00000377078 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
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USP11-202ENST00000377078 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa24.52■■□□□ 1.52
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USP11-202ENST00000377078 TONSLQ96HA7 1378 aa24.51■■□□□ 1.51
USP11-202ENST00000377078 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP24.5■■□□□ 1.51
USP11-202ENST00000377078 QRICH2Q9H0J4 1663 aa24.5■■□□□ 1.51
USP11-202ENST00000377078 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
USP11-202ENST00000377078 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
USP11-202ENST00000377078 ALS2Q96Q42 1657 aa24.49■■□□□ 1.51
USP11-202ENST00000377078 PLEKHG3A1L390 1219 aa24.48■■□□□ 1.51
USP11-202ENST00000377078 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
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