RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376510.7

MSRB2-201, Transcript of methionine sulfoxide reductase B2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MSRB2, Length 1,803 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSRB2-201ENST00000376510 ARHGAP23Q9P227 1491 aa37.09■■■■□ 3.53
MSRB2-201ENST00000376510 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa37.09■■■■□ 3.53
MSRB2-201ENST00000376510 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP37.07■■■■□ 3.52
MSRB2-201ENST00000376510 CABP2Q9NPB3 220 aa37.07■■■■□ 3.52
MSRB2-201ENST00000376510 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa37.06■■■■□ 3.52
MSRB2-201ENST00000376510 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP37.04■■■■□ 3.52
MSRB2-201ENST00000376510 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP37.03■■■■□ 3.52
MSRB2-201ENST00000376510 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa37.03■■■■□ 3.52
MSRB2-201ENST00000376510 KNDC1Q76NI1 1749 aa37.03■■■■□ 3.52
MSRB2-201ENST00000376510 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP37.03■■■■□ 3.52
MSRB2-201ENST00000376510 CARD14Q9BXL6 1004 aa37.03■■■■□ 3.52
MSRB2-201ENST00000376510 WAPLQ7Z5K2 1190 aa37.02■■■■□ 3.52
MSRB2-201ENST00000376510 SIRT1Q96EB6 747 aa37.01■■■■□ 3.52
MSRB2-201ENST00000376510 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa37.01■■■■□ 3.52
MSRB2-201ENST00000376510 ATAD2Q6PL18 1390 aa37■■■■□ 3.51
MSRB2-201ENST00000376510 NINLQ9Y2I6 1382 aa37■■■■□ 3.51
MSRB2-201ENST00000376510 TECPR2O15040 1411 aa36.97■■■■□ 3.51
MSRB2-201ENST00000376510 FAM135BQ49AJ0 1406 aa36.97■■■■□ 3.51
MSRB2-201ENST00000376510 CDK19Q9BWU1 502 aa36.97■■■■□ 3.51
MSRB2-201ENST00000376510 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa36.96■■■■□ 3.51
MSRB2-201ENST00000376510 NSD3Q9BZ95 1437 aa36.95■■■■□ 3.51
MSRB2-201ENST00000376510 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa36.95■■■■□ 3.5
MSRB2-201ENST00000376510 CPS1P31327 1500 aa36.94■■■■□ 3.5
MSRB2-201ENST00000376510 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP36.93■■■■□ 3.5
MSRB2-201ENST00000376510 MED14O60244 1454 aa36.93■■■■□ 3.5
MSRB2-201ENST00000376510 SLC26A8Q96RN1 970 aa36.92■■■■□ 3.5
MSRB2-201ENST00000376510 TBX22Q9Y458 520 aa36.92■■■■□ 3.5
MSRB2-201ENST00000376510 PPP2R1AP30153 589 aa36.91■■■■□ 3.5
MSRB2-201ENST00000376510 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP36.9■■■■□ 3.5
MSRB2-201ENST00000376510 DIP2AQ14689 1571 aa36.88■■■■□ 3.49
MSRB2-201ENST00000376510 TERF2IPQ9NYB0 399 aa36.87■■■■□ 3.49
MSRB2-201ENST00000376510 USP32Q8NFA0 1604 aa36.86■■■■□ 3.49
MSRB2-201ENST00000376510 CGNL1Q0VF96 1302 aa36.86■■■■□ 3.49
MSRB2-201ENST00000376510 ZBED9Q6R2W3 1325 aa36.84■■■■□ 3.49
MSRB2-201ENST00000376510 WASLO00401 505 aaPredicted RBP36.83■■■■□ 3.49
MSRB2-201ENST00000376510 ANKLE2Q86XL3 938 aa36.82■■■■□ 3.48
MSRB2-201ENST00000376510 ROBO2Q9HCK4 1378 aa36.82■■■■□ 3.48
MSRB2-201ENST00000376510 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP36.8■■■■□ 3.48
MSRB2-201ENST00000376510 A0A1W2PP64 1363 aa36.8■■■■□ 3.48
MSRB2-201ENST00000376510 MORC1Q86VD1 984 aa36.79■■■■□ 3.48
MSRB2-201ENST00000376510 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa36.78■■■■□ 3.48
MSRB2-201ENST00000376510 PTPRUQ92729 1446 aa36.77■■■■□ 3.48
MSRB2-201ENST00000376510 NSD2O96028 1365 aa36.76■■■■□ 3.48
MSRB2-201ENST00000376510 CABP1Q9NZU7 370 aa36.76■■■■□ 3.48
MSRB2-201ENST00000376510 CD163L1Q9NR16 1453 aa36.71■■■■□ 3.47
MSRB2-201ENST00000376510 INSRP06213 1382 aa36.7■■■■□ 3.47
MSRB2-201ENST00000376510 PIK3R4Q99570 1358 aa36.7■■■■□ 3.47
MSRB2-201ENST00000376510 ATP7BP35670 1465 aa36.69■■■■□ 3.46
MSRB2-201ENST00000376510 PTCH1Q13635 1447 aa36.69■■■■□ 3.46
MSRB2-201ENST00000376510 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP36.69■■■■□ 3.46
MSRB2-201ENST00000376510 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP36.68■■■■□ 3.46
MSRB2-201ENST00000376510 ADGRB2O60241 1585 aa36.68■■■■□ 3.46
MSRB2-201ENST00000376510 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP36.67■■■■□ 3.46
MSRB2-201ENST00000376510 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa36.65■■■■□ 3.46
MSRB2-201ENST00000376510 CCDC61Q9Y6R9 512 aa36.64■■■■□ 3.46
MSRB2-201ENST00000376510 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP36.62■■■■□ 3.45
MSRB2-201ENST00000376510 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP36.62■■■■□ 3.45
MSRB2-201ENST00000376510 ADAMTS8Q9UP79 889 aa36.58■■■■□ 3.45
MSRB2-201ENST00000376510 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP36.57■■■■□ 3.45
MSRB2-201ENST00000376510 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP36.56■■■■□ 3.44
MSRB2-201ENST00000376510 FYB1O15117 783 aa36.56■■■■□ 3.44
MSRB2-201ENST00000376510 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa36.55■■■■□ 3.44
MSRB2-201ENST00000376510 GGNBP2Q9H3C7 697 aa36.55■■■■□ 3.44
MSRB2-201ENST00000376510 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP36.54■■■■□ 3.44
MSRB2-201ENST00000376510 KCNA6P17658 529 aa36.54■■■■□ 3.44
MSRB2-201ENST00000376510 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP36.54■■■■□ 3.44
MSRB2-201ENST00000376510 KIF20BQ96Q89 1820 aa36.53■■■■□ 3.44
MSRB2-201ENST00000376510 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa36.53■■■■□ 3.44
MSRB2-201ENST00000376510 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP36.52■■■■□ 3.44
MSRB2-201ENST00000376510 PRR36Q9H6K5 1346 aa36.52■■■■□ 3.44
MSRB2-201ENST00000376510 CFAP53Q96M91 514 aa36.51■■■■□ 3.44
MSRB2-201ENST00000376510 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa36.5■■■■□ 3.43
MSRB2-201ENST00000376510 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP36.5■■■■□ 3.43
MSRB2-201ENST00000376510 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP36.5■■■■□ 3.43
MSRB2-201ENST00000376510 ITSN1Q15811 1721 aa36.49■■■■□ 3.43
MSRB2-201ENST00000376510 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa36.49■■■■□ 3.43
MSRB2-201ENST00000376510 MTHFSP49914 203 aa36.49■■■■□ 3.43
MSRB2-201ENST00000376510 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP36.49■■■■□ 3.43
MSRB2-201ENST00000376510 NEFLP07196 543 aa36.45■■■■□ 3.43
MSRB2-201ENST00000376510 AKAP12Q02952 1782 aa36.45■■■■□ 3.43
MSRB2-201ENST00000376510 NUTM2FA1L443 756 aa36.45■■■■□ 3.43
MSRB2-201ENST00000376510 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa36.44■■■■□ 3.42
MSRB2-201ENST00000376510 MON2Q7Z3U7 1717 aa36.44■■■■□ 3.42
MSRB2-201ENST00000376510 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP36.43■■■■□ 3.42
MSRB2-201ENST00000376510 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP36.42■■■■□ 3.42
MSRB2-201ENST00000376510 PLEKHG3A1L390 1219 aa36.42■■■■□ 3.42
MSRB2-201ENST00000376510 NUDCQ9Y266 331 aa36.4■■■■□ 3.42
MSRB2-201ENST00000376510 PDE3BQ13370 1112 aa36.38■■■■□ 3.42
MSRB2-201ENST00000376510 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP36.38■■■■□ 3.42
MSRB2-201ENST00000376510 ACEP12821 1306 aa36.37■■■■□ 3.41
MSRB2-201ENST00000376510 SHPRHQ149N8 1683 aa36.34■■■■□ 3.41
MSRB2-201ENST00000376510 ANKARQ7Z5J8 1434 aa36.32■■■■□ 3.41
MSRB2-201ENST00000376510 NME9Q86XW9 330 aa36.32■■■■□ 3.41
MSRB2-201ENST00000376510 FKBP8Q14318 412 aa36.31■■■■□ 3.4
MSRB2-201ENST00000376510 CCDC146Q8IYE0 955 aa36.3■■■■□ 3.4
MSRB2-201ENST00000376510 COG3Q96JB2 828 aa36.3■■■■□ 3.4
MSRB2-201ENST00000376510 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP36.29■■■■□ 3.4
MSRB2-201ENST00000376510 FMN2Q9NZ56 1722 aa36.29■■■■□ 3.4
MSRB2-201ENST00000376510 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP36.28■■■■□ 3.4
MSRB2-201ENST00000376510 NALCNQ8IZF0 1738 aa36.27■■■■□ 3.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.7 ms