RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368547.3

ECHS1-201, Transcript of enoyl-CoA hydratase, short chain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ECHS1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1-201ENST00000368547 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP41.56■■■■■ 4.24
ECHS1-201ENST00000368547 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP41.55■■■■■ 4.24
ECHS1-201ENST00000368547 NALCNQ8IZF0 1738 aa41.52■■■■■ 4.24
ECHS1-201ENST00000368547 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP41.51■■■■■ 4.24
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP41.48■■■■■ 4.23
ECHS1-201ENST00000368547 TESK2Q96S53 571 aa41.48■■■■■ 4.23
ECHS1-201ENST00000368547 C14orf37Q86TY3 774 aa41.47■■■■■ 4.23
ECHS1-201ENST00000368547 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa41.47■■■■■ 4.23
ECHS1-201ENST00000368547 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa41.47■■■■■ 4.23
ECHS1-201ENST00000368547 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa41.45■■■■■ 4.23
ECHS1-201ENST00000368547 ADGRB2O60241 1585 aa41.43■■■■■ 4.22
ECHS1-201ENST00000368547 TULP4Q9NRJ4 1543 aa41.37■■■■■ 4.21
ECHS1-201ENST00000368547 C19orf44Q9H6X5 657 aa41.36■■■■■ 4.21
ECHS1-201ENST00000368547 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa41.36■■■■■ 4.21
ECHS1-201ENST00000368547 MSH6P52701 1360 aa41.35■■■■■ 4.21
ECHS1-201ENST00000368547 SLC24A1O60721 1099 aa41.34■■■■■ 4.21
ECHS1-201ENST00000368547 EVC2Q86UK5 1308 aa41.33■■■■■ 4.21
ECHS1-201ENST00000368547 TMF1P82094 1093 aa41.33■■■■■ 4.21
ECHS1-201ENST00000368547 WASLO00401 505 aaPredicted RBP41.32■■■■■ 4.2
ECHS1-201ENST00000368547 DISP3Q9P2K9 1392 aa41.32■■■■■ 4.2
ECHS1-201ENST00000368547 CDK19Q9BWU1 502 aa41.29■■■■■ 4.2
ECHS1-201ENST00000368547 FMN2Q9NZ56 1722 aa41.29■■■■■ 4.2
ECHS1-201ENST00000368547 DCCP43146 1447 aa41.28■■■■■ 4.2
ECHS1-201ENST00000368547 ATF3P18847 181 aa41.25■■■■■ 4.19
ECHS1-201ENST00000368547 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP41.25■■■■■ 4.19
ECHS1-201ENST00000368547 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP41.23■■■■■ 4.19
ECHS1-201ENST00000368547 CABP2Q9NPB3 220 aa41.23■■■■■ 4.19
ECHS1-201ENST00000368547 NUTM2FA1L443 756 aa41.21■■■■■ 4.19
ECHS1-201ENST00000368547 CADPS2Q86UW7 1296 aa41.21■■■■■ 4.19
ECHS1-201ENST00000368547 CERKQ8TCT0 537 aa41.2■■■■■ 4.19
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ECHS1-201ENST00000368547 USP32Q8NFA0 1604 aa41.18■■■■■ 4.18
ECHS1-201ENST00000368547 CDCA8Q53HL2 280 aa41.18■■■■■ 4.18
ECHS1-201ENST00000368547 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP41.18■■■■■ 4.18
ECHS1-201ENST00000368547 ATP7BP35670 1465 aa41.14■■■■■ 4.18
ECHS1-201ENST00000368547 PRR36Q9H6K5 1346 aa41.14■■■■■ 4.18
ECHS1-201ENST00000368547 MST1RQ04912 1400 aa41.13■■■■■ 4.18
ECHS1-201ENST00000368547 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP41.13■■■■■ 4.17
ECHS1-201ENST00000368547 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP41.13■■■■■ 4.17
ECHS1-201ENST00000368547 POLR3GLQ9BT43 218 aa41.13■■■■■ 4.17
ECHS1-201ENST00000368547 KIF7Q2M1P5 1343 aa41.13■■■■■ 4.17
ECHS1-201ENST00000368547 ANKARQ7Z5J8 1434 aa41.12■■■■■ 4.17
ECHS1-201ENST00000368547 ATAD2Q6PL18 1390 aa41.1■■■■■ 4.17
ECHS1-201ENST00000368547 WASHC2AQ641Q2 1341 aa41.1■■■■■ 4.17
ECHS1-201ENST00000368547 CCDC7Q96M83 1385 aa41.08■■■■■ 4.17
ECHS1-201ENST00000368547 ITSN1Q15811 1721 aa41.08■■■■■ 4.17
ECHS1-201ENST00000368547 C1orf167Q5SNV9 1468 aa41.08■■■■■ 4.17
ECHS1-201ENST00000368547 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa41.08■■■■■ 4.17
ECHS1-201ENST00000368547 SLAIN2Q9P270 581 aa41.06■■■■■ 4.16
ECHS1-201ENST00000368547 CCDC61Q9Y6R9 512 aa41.05■■■■■ 4.16
ECHS1-201ENST00000368547 MYOM1P52179 1685 aa41.02■■■■■ 4.16
ECHS1-201ENST00000368547 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa41.01■■■■■ 4.16
ECHS1-201ENST00000368547 ESCO1Q5FWF5 840 aa41■■■■■ 4.15
ECHS1-201ENST00000368547 TMC1Q8TDI8 760 aa40.99■■■■■ 4.15
ECHS1-201ENST00000368547 ORAI2Q96SN7 254 aa40.99■■■■■ 4.15
ECHS1-201ENST00000368547 TOM1O60784 492 aa40.98■■■■■ 4.15
ECHS1-201ENST00000368547 CABP1Q9NZU7 370 aa40.98■■■■■ 4.15
ECHS1-201ENST00000368547 UBAP1LF5GYI3 381 aa40.96■■■■■ 4.15
ECHS1-201ENST00000368547 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa40.96■■■■■ 4.15
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ECHS1-201ENST00000368547 PHF8Q9UPP1 1060 aa40.93■■■■■ 4.14
ECHS1-201ENST00000368547 NINLQ9Y2I6 1382 aa40.93■■■■■ 4.14
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ECHS1-201ENST00000368547 PLEKHG3A1L390 1219 aa40.91■■■■■ 4.14
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ECHS1-201ENST00000368547 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa40.88■■■■■ 4.13
ECHS1-201ENST00000368547 ACEP12821 1306 aa40.85■■■■■ 4.13
ECHS1-201ENST00000368547 PIP4K2BP78356 416 aa40.85■■■■■ 4.13
ECHS1-201ENST00000368547 CD163L1Q9NR16 1453 aa40.84■■■■■ 4.13
ECHS1-201ENST00000368547 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP40.84■■■■■ 4.13
ECHS1-201ENST00000368547 AKAP12Q02952 1782 aa40.83■■■■■ 4.13
ECHS1-201ENST00000368547 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP40.83■■■■■ 4.13
ECHS1-201ENST00000368547 TERF2IPQ9NYB0 399 aa40.81■■■■■ 4.12
ECHS1-201ENST00000368547 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP40.8■■■■■ 4.12
ECHS1-201ENST00000368547 FOXO3O43524 673 aa40.8■■■■■ 4.12
ECHS1-201ENST00000368547 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP40.79■■■■■ 4.12
ECHS1-201ENST00000368547 A0A1W2PP64 1363 aa40.79■■■■■ 4.12
ECHS1-201ENST00000368547 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa40.79■■■■■ 4.12
ECHS1-201ENST00000368547 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP40.78■■■■■ 4.12
ECHS1-201ENST00000368547 PANK3Q9H999 370 aa40.77■■■■■ 4.12
ECHS1-201ENST00000368547 MON2Q7Z3U7 1717 aa40.76■■■■■ 4.12
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ECHS1-201ENST00000368547 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP40.75■■■■■ 4.11
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP40.74■■■■■ 4.11
ECHS1-201ENST00000368547 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP40.74■■■■■ 4.11
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ECHS1-201ENST00000368547 USP6P35125 1406 aa40.7■■■■■ 4.11
ECHS1-201ENST00000368547 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP40.7■■■■■ 4.11
ECHS1-201ENST00000368547 CARD14Q9BXL6 1004 aa40.68■■■■■ 4.1
ECHS1-201ENST00000368547 KRT28Q7Z3Y7 464 aa40.67■■■■■ 4.1
ECHS1-201ENST00000368547 NRKQ7Z2Y5 1582 aa40.66■■■■■ 4.1
ECHS1-201ENST00000368547 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP40.66■■■■■ 4.1
ECHS1-201ENST00000368547 PXDNQ92626 1479 aa40.65■■■■■ 4.1
ECHS1-201ENST00000368547 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP40.63■■■■■ 4.1
ECHS1-201ENST00000368547 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP40.63■■■■■ 4.09
ECHS1-201ENST00000368547 NSD3Q9BZ95 1437 aa40.63■■■■■ 4.09
ECHS1-201ENST00000368547 PHLPP1O60346 1717 aa40.61■■■■■ 4.09
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