RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000354833.7

SERF1A-202, Transcript of small EDRK-rich factor 1A, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SERF1A, Length 1,889 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERF1A-202ENST00000354833 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP32.82■■■□□ 2.84
SERF1A-202ENST00000354833 LTKP29376 864 aa32.82■■■□□ 2.84
SERF1A-202ENST00000354833 ARHGAP23Q9P227 1491 aa32.82■■■□□ 2.84
SERF1A-202ENST00000354833 NINLQ9Y2I6 1382 aa32.79■■■□□ 2.84
SERF1A-202ENST00000354833 TXNDC2Q86VQ3 553 aa32.79■■■□□ 2.84
SERF1A-202ENST00000354833 BCANQ96GW7 911 aa32.79■■■□□ 2.84
SERF1A-202ENST00000354833 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa32.79■■■□□ 2.84
SERF1A-202ENST00000354833 PPP2R1AP30153 589 aa32.78■■■□□ 2.84
SERF1A-202ENST00000354833 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP32.78■■■□□ 2.84
SERF1A-202ENST00000354833 EID1Q9Y6B2 187 aa32.78■■■□□ 2.84
SERF1A-202ENST00000354833 NSD3Q9BZ95 1437 aa32.78■■■□□ 2.84
SERF1A-202ENST00000354833 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP32.78■■■□□ 2.84
SERF1A-202ENST00000354833 ATAD2Q6PL18 1390 aa32.78■■■□□ 2.84
SERF1A-202ENST00000354833 TECPR2O15040 1411 aa32.78■■■□□ 2.84
SERF1A-202ENST00000354833 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa32.77■■■□□ 2.84
SERF1A-202ENST00000354833 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP32.77■■■□□ 2.84
SERF1A-202ENST00000354833 KNDC1Q76NI1 1749 aa32.76■■■□□ 2.83
SERF1A-202ENST00000354833 WAPLQ7Z5K2 1190 aa32.76■■■□□ 2.83
SERF1A-202ENST00000354833 SIRT1Q96EB6 747 aa32.76■■■□□ 2.83
SERF1A-202ENST00000354833 ADAMTSL3P82987 1691 aa32.75■■■□□ 2.83
SERF1A-202ENST00000354833 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa32.74■■■□□ 2.83
SERF1A-202ENST00000354833 FAM135BQ49AJ0 1406 aa32.73■■■□□ 2.83
SERF1A-202ENST00000354833 USP32Q8NFA0 1604 aa32.73■■■□□ 2.83
SERF1A-202ENST00000354833 CDK19Q9BWU1 502 aa32.71■■■□□ 2.83
SERF1A-202ENST00000354833 CPS1P31327 1500 aa32.71■■■□□ 2.83
SERF1A-202ENST00000354833 MED14O60244 1454 aa32.71■■■□□ 2.83
SERF1A-202ENST00000354833 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP32.68■■■□□ 2.82
SERF1A-202ENST00000354833 INSRP06213 1382 aa32.68■■■□□ 2.82
SERF1A-202ENST00000354833 CGNL1Q0VF96 1302 aa32.66■■■□□ 2.82
SERF1A-202ENST00000354833 A0A1W2PP64 1363 aa32.64■■■□□ 2.82
SERF1A-202ENST00000354833 TERF2IPQ9NYB0 399 aa32.61■■■□□ 2.81
SERF1A-202ENST00000354833 NSD2O96028 1365 aa32.61■■■□□ 2.81
SERF1A-202ENST00000354833 SLC26A8Q96RN1 970 aa32.61■■■□□ 2.81
SERF1A-202ENST00000354833 TBX22Q9Y458 520 aa32.61■■■□□ 2.81
SERF1A-202ENST00000354833 CD163L1Q9NR16 1453 aa32.6■■■□□ 2.81
SERF1A-202ENST00000354833 ROBO2Q9HCK4 1378 aa32.59■■■□□ 2.81
SERF1A-202ENST00000354833 DIP2AQ14689 1571 aa32.59■■■□□ 2.81
SERF1A-202ENST00000354833 WASLO00401 505 aaPredicted RBP32.59■■■□□ 2.81
SERF1A-202ENST00000354833 MORC1Q86VD1 984 aa32.59■■■□□ 2.81
SERF1A-202ENST00000354833 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP32.57■■■□□ 2.81
SERF1A-202ENST00000354833 PTPRUQ92729 1446 aa32.56■■■□□ 2.8
SERF1A-202ENST00000354833 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP32.56■■■□□ 2.8
SERF1A-202ENST00000354833 CABP1Q9NZU7 370 aa32.54■■■□□ 2.8
SERF1A-202ENST00000354833 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP32.54■■■□□ 2.8
SERF1A-202ENST00000354833 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP32.52■■■□□ 2.8
SERF1A-202ENST00000354833 ATP7BP35670 1465 aa32.52■■■□□ 2.8
SERF1A-202ENST00000354833 ADAMTS8Q9UP79 889 aa32.51■■■□□ 2.79
SERF1A-202ENST00000354833 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP32.49■■■□□ 2.79
SERF1A-202ENST00000354833 ADGRB2O60241 1585 aa32.49■■■□□ 2.79
SERF1A-202ENST00000354833 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP32.49■■■□□ 2.79
SERF1A-202ENST00000354833 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP32.48■■■□□ 2.79
SERF1A-202ENST00000354833 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa32.48■■■□□ 2.79
SERF1A-202ENST00000354833 PTCH1Q13635 1447 aa32.47■■■□□ 2.79
SERF1A-202ENST00000354833 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa32.46■■■□□ 2.79
SERF1A-202ENST00000354833 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP32.45■■■□□ 2.79
SERF1A-202ENST00000354833 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP32.45■■■□□ 2.78
SERF1A-202ENST00000354833 ANKLE2Q86XL3 938 aa32.44■■■□□ 2.78
SERF1A-202ENST00000354833 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP32.44■■■□□ 2.78
SERF1A-202ENST00000354833 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa32.44■■■□□ 2.78
SERF1A-202ENST00000354833 NEFLP07196 543 aa32.44■■■□□ 2.78
SERF1A-202ENST00000354833 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP32.44■■■□□ 2.78
SERF1A-202ENST00000354833 PIK3R4Q99570 1358 aa32.42■■■□□ 2.78
SERF1A-202ENST00000354833 FYB1O15117 783 aa32.42■■■□□ 2.78
SERF1A-202ENST00000354833 CCDC61Q9Y6R9 512 aa32.42■■■□□ 2.78
SERF1A-202ENST00000354833 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP32.41■■■□□ 2.78
SERF1A-202ENST00000354833 NUDCQ9Y266 331 aa32.41■■■□□ 2.78
SERF1A-202ENST00000354833 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP32.4■■■□□ 2.78
SERF1A-202ENST00000354833 FKBP8Q14318 412 aa32.4■■■□□ 2.78
SERF1A-202ENST00000354833 GGNBP2Q9H3C7 697 aa32.39■■■□□ 2.78
SERF1A-202ENST00000354833 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa32.38■■■□□ 2.77
SERF1A-202ENST00000354833 PRR36Q9H6K5 1346 aa32.36■■■□□ 2.77
SERF1A-202ENST00000354833 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa32.36■■■□□ 2.77
SERF1A-202ENST00000354833 MTHFSP49914 203 aa32.36■■■□□ 2.77
SERF1A-202ENST00000354833 PDE3BQ13370 1112 aa32.35■■■□□ 2.77
SERF1A-202ENST00000354833 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP32.34■■■□□ 2.77
SERF1A-202ENST00000354833 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP32.34■■■□□ 2.77
SERF1A-202ENST00000354833 KIF20BQ96Q89 1820 aa32.33■■■□□ 2.77
SERF1A-202ENST00000354833 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa32.32■■■□□ 2.77
SERF1A-202ENST00000354833 CFAP53Q96M91 514 aa32.32■■■□□ 2.76
SERF1A-202ENST00000354833 SHPRHQ149N8 1683 aa32.3■■■□□ 2.76
SERF1A-202ENST00000354833 KCNA6P17658 529 aa32.29■■■□□ 2.76
SERF1A-202ENST00000354833 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP32.29■■■□□ 2.76
SERF1A-202ENST00000354833 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa32.28■■■□□ 2.76
SERF1A-202ENST00000354833 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP32.27■■■□□ 2.76
SERF1A-202ENST00000354833 MON2Q7Z3U7 1717 aa32.27■■■□□ 2.76
SERF1A-202ENST00000354833 AKAP12Q02952 1782 aa32.26■■■□□ 2.75
SERF1A-202ENST00000354833 PLEKHG3A1L390 1219 aa32.25■■■□□ 2.75
SERF1A-202ENST00000354833 ITSN1Q15811 1721 aa32.24■■■□□ 2.75
SERF1A-202ENST00000354833 CCDC146Q8IYE0 955 aa32.23■■■□□ 2.75
SERF1A-202ENST00000354833 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP32.23■■■□□ 2.75
SERF1A-202ENST00000354833 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP32.21■■■□□ 2.75
SERF1A-202ENST00000354833 NUTM2FA1L443 756 aa32.19■■■□□ 2.74
SERF1A-202ENST00000354833 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP32.18■■■□□ 2.74
SERF1A-202ENST00000354833 ACEP12821 1306 aa32.18■■■□□ 2.74
SERF1A-202ENST00000354833 CDCA7LQ96GN5 454 aa32.18■■■□□ 2.74
SERF1A-202ENST00000354833 ZNF521Q96K83 1311 aa32.17■■■□□ 2.74
SERF1A-202ENST00000354833 NME9Q86XW9 330 aa32.17■■■□□ 2.74
SERF1A-202ENST00000354833 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP32.16■■■□□ 2.74
SERF1A-202ENST00000354833 APAF1O14727 1248 aa32.16■■■□□ 2.74
SERF1A-202ENST00000354833 NGEFQ8N5V2 710 aa32.16■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.1 ms