RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331803.8

UPP1-201, Transcript of uridine phosphorylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UPP1, Length 1,932 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1-201ENST00000331803 CARD14Q9BXL6 1004 aa25.99■■□□□ 1.75
UPP1-201ENST00000331803 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa25.99■■□□□ 1.75
UPP1-201ENST00000331803 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa25.99■■□□□ 1.75
UPP1-201ENST00000331803 ADAMTSL3P82987 1691 aa25.98■■□□□ 1.75
UPP1-201ENST00000331803 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
UPP1-201ENST00000331803 SLIT1O75093 1534 aa25.98■■□□□ 1.75
UPP1-201ENST00000331803 CABP2Q9NPB3 220 aa25.98■■□□□ 1.75
UPP1-201ENST00000331803 ARHGAP23Q9P227 1491 aa25.98■■□□□ 1.75
UPP1-201ENST00000331803 WAPLQ7Z5K2 1190 aa25.96■■□□□ 1.75
UPP1-201ENST00000331803 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa25.96■■□□□ 1.75
UPP1-201ENST00000331803 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
UPP1-201ENST00000331803 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa25.92■■□□□ 1.74
UPP1-201ENST00000331803 SIRT1Q96EB6 747 aa25.92■■□□□ 1.74
UPP1-201ENST00000331803 TECPR2O15040 1411 aa25.9■■□□□ 1.74
UPP1-201ENST00000331803 CDK19Q9BWU1 502 aa25.9■■□□□ 1.74
UPP1-201ENST00000331803 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
UPP1-201ENST00000331803 ATAD2Q6PL18 1390 aa25.89■■□□□ 1.74
UPP1-201ENST00000331803 NINLQ9Y2I6 1382 aa25.89■■□□□ 1.74
UPP1-201ENST00000331803 FAM135BQ49AJ0 1406 aa25.89■■□□□ 1.73
UPP1-201ENST00000331803 NSD3Q9BZ95 1437 aa25.89■■□□□ 1.73
UPP1-201ENST00000331803 MED14O60244 1454 aa25.88■■□□□ 1.73
UPP1-201ENST00000331803 KNDC1Q76NI1 1749 aa25.88■■□□□ 1.73
UPP1-201ENST00000331803 PPP2R1AP30153 589 aa25.88■■□□□ 1.73
UPP1-201ENST00000331803 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa25.87■■□□□ 1.73
UPP1-201ENST00000331803 SLC26A8Q96RN1 970 aa25.87■■□□□ 1.73
UPP1-201ENST00000331803 CPS1P31327 1500 aa25.85■■□□□ 1.73
UPP1-201ENST00000331803 TBX22Q9Y458 520 aa25.84■■□□□ 1.73
UPP1-201ENST00000331803 ZBED9Q6R2W3 1325 aa25.83■■□□□ 1.73
UPP1-201ENST00000331803 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP25.81■■□□□ 1.72
UPP1-201ENST00000331803 ROBO2Q9HCK4 1378 aa25.81■■□□□ 1.72
UPP1-201ENST00000331803 CGNL1Q0VF96 1302 aa25.8■■□□□ 1.72
UPP1-201ENST00000331803 USP32Q8NFA0 1604 aa25.79■■□□□ 1.72
UPP1-201ENST00000331803 WASLO00401 505 aaPredicted RBP25.79■■□□□ 1.72
UPP1-201ENST00000331803 TERF2IPQ9NYB0 399 aa25.79■■□□□ 1.72
UPP1-201ENST00000331803 A0A1W2PP64 1363 aa25.79■■□□□ 1.72
UPP1-201ENST00000331803 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP25.79■■□□□ 1.72
UPP1-201ENST00000331803 PTPRUQ92729 1446 aa25.78■■□□□ 1.72
UPP1-201ENST00000331803 CABP1Q9NZU7 370 aa25.77■■□□□ 1.72
UPP1-201ENST00000331803 DIP2AQ14689 1571 aa25.77■■□□□ 1.72
UPP1-201ENST00000331803 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa25.76■■□□□ 1.71
UPP1-201ENST00000331803 CD163L1Q9NR16 1453 aa25.75■■□□□ 1.71
UPP1-201ENST00000331803 MORC1Q86VD1 984 aa25.75■■□□□ 1.71
UPP1-201ENST00000331803 ANKLE2Q86XL3 938 aa25.75■■□□□ 1.71
UPP1-201ENST00000331803 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP25.73■■□□□ 1.71
UPP1-201ENST00000331803 NSD2O96028 1365 aa25.73■■□□□ 1.71
UPP1-201ENST00000331803 INSRP06213 1382 aa25.71■■□□□ 1.71
UPP1-201ENST00000331803 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP25.69■■□□□ 1.7
UPP1-201ENST00000331803 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP25.68■■□□□ 1.7
UPP1-201ENST00000331803 PTCH1Q13635 1447 aa25.68■■□□□ 1.7
UPP1-201ENST00000331803 ATP7BP35670 1465 aa25.68■■□□□ 1.7
UPP1-201ENST00000331803 PIK3R4Q99570 1358 aa25.67■■□□□ 1.7
UPP1-201ENST00000331803 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP25.67■■□□□ 1.7
UPP1-201ENST00000331803 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP25.67■■□□□ 1.7
UPP1-201ENST00000331803 ADAMTS8Q9UP79 889 aa25.67■■□□□ 1.7
UPP1-201ENST00000331803 CCDC61Q9Y6R9 512 aa25.67■■□□□ 1.7
UPP1-201ENST00000331803 ADGRB2O60241 1585 aa25.66■■□□□ 1.7
UPP1-201ENST00000331803 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa25.66■■□□□ 1.7
UPP1-201ENST00000331803 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa25.65■■□□□ 1.7
UPP1-201ENST00000331803 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP25.64■■□□□ 1.7
UPP1-201ENST00000331803 FYB1O15117 783 aa25.63■■□□□ 1.69
UPP1-201ENST00000331803 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP25.62■■□□□ 1.69
UPP1-201ENST00000331803 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP25.62■■□□□ 1.69
UPP1-201ENST00000331803 GGNBP2Q9H3C7 697 aa25.62■■□□□ 1.69
UPP1-201ENST00000331803 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
UPP1-201ENST00000331803 PRR36Q9H6K5 1346 aa25.61■■□□□ 1.69
UPP1-201ENST00000331803 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa25.61■■□□□ 1.69
UPP1-201ENST00000331803 KCNA6P17658 529 aa25.61■■□□□ 1.69
UPP1-201ENST00000331803 MTHFSP49914 203 aa25.57■■□□□ 1.68
UPP1-201ENST00000331803 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa25.57■■□□□ 1.68
UPP1-201ENST00000331803 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP25.56■■□□□ 1.68
UPP1-201ENST00000331803 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP25.55■■□□□ 1.68
UPP1-201ENST00000331803 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa25.55■■□□□ 1.68
UPP1-201ENST00000331803 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
UPP1-201ENST00000331803 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP25.55■■□□□ 1.68
UPP1-201ENST00000331803 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
UPP1-201ENST00000331803 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP25.54■■□□□ 1.68
UPP1-201ENST00000331803 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
UPP1-201ENST00000331803 NUTM2FA1L443 756 aa25.53■■□□□ 1.68
UPP1-201ENST00000331803 KIF20BQ96Q89 1820 aa25.53■■□□□ 1.68
UPP1-201ENST00000331803 CFAP53Q96M91 514 aa25.53■■□□□ 1.68
UPP1-201ENST00000331803 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
UPP1-201ENST00000331803 PLEKHG3A1L390 1219 aa25.51■■□□□ 1.67
UPP1-201ENST00000331803 NUDCQ9Y266 331 aa25.51■■□□□ 1.67
UPP1-201ENST00000331803 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa25.5■■□□□ 1.67
UPP1-201ENST00000331803 NEFLP07196 543 aa25.49■■□□□ 1.67
UPP1-201ENST00000331803 AKAP12Q02952 1782 aa25.49■■□□□ 1.67
UPP1-201ENST00000331803 MON2Q7Z3U7 1717 aa25.49■■□□□ 1.67
UPP1-201ENST00000331803 ITSN1Q15811 1721 aa25.49■■□□□ 1.67
UPP1-201ENST00000331803 PDE3BQ13370 1112 aa25.48■■□□□ 1.67
UPP1-201ENST00000331803 ACEP12821 1306 aa25.47■■□□□ 1.67
UPP1-201ENST00000331803 FKBP8Q14318 412 aa25.47■■□□□ 1.67
UPP1-201ENST00000331803 SHPRHQ149N8 1683 aa25.46■■□□□ 1.67
UPP1-201ENST00000331803 NME9Q86XW9 330 aa25.45■■□□□ 1.67
UPP1-201ENST00000331803 CCDC146Q8IYE0 955 aa25.45■■□□□ 1.67
UPP1-201ENST00000331803 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
UPP1-201ENST00000331803 ANKARQ7Z5J8 1434 aa25.41■■□□□ 1.66
UPP1-201ENST00000331803 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa25.4■■□□□ 1.66
UPP1-201ENST00000331803 COG3Q96JB2 828 aa25.4■■□□□ 1.66
UPP1-201ENST00000331803 ZRANB1Q9UGI0 708 aa25.4■■□□□ 1.66
UPP1-201ENST00000331803 USP6P35125 1406 aa25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18 ms