RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000330233.11

CRIP1-201, Transcript of cysteine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CRIP1, Length 1,311 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1-201ENST00000330233 GPRASP1Q5JY77 1395 aa38.07■■■■□ 3.69
CRIP1-201ENST00000330233 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa38.07■■■■□ 3.69
CRIP1-201ENST00000330233 NALCNQ8IZF0 1738 aa38.07■■■■□ 3.69
CRIP1-201ENST00000330233 DCCP43146 1447 aa38.07■■■■□ 3.69
CRIP1-201ENST00000330233 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP38.07■■■■□ 3.68
CRIP1-201ENST00000330233 CARD11Q9BXL7 1154 aa38.04■■■■□ 3.68
CRIP1-201ENST00000330233 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP38.02■■■■□ 3.68
CRIP1-201ENST00000330233 SLAIN2Q9P270 581 aa38.01■■■■□ 3.68
CRIP1-201ENST00000330233 PIP4K2BP78356 416 aa37.97■■■■□ 3.67
CRIP1-201ENST00000330233 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP37.95■■■■□ 3.67
CRIP1-201ENST00000330233 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP37.94■■■■□ 3.66
CRIP1-201ENST00000330233 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP37.94■■■■□ 3.66
CRIP1-201ENST00000330233 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa37.93■■■■□ 3.66
CRIP1-201ENST00000330233 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP37.91■■■■□ 3.66
CRIP1-201ENST00000330233 MST1RQ04912 1400 aa37.87■■■■□ 3.65
CRIP1-201ENST00000330233 ADGRB2O60241 1585 aa37.87■■■■□ 3.65
CRIP1-201ENST00000330233 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP37.86■■■■□ 3.65
CRIP1-201ENST00000330233 QRICH2Q9H0J4 1663 aa37.84■■■■□ 3.65
CRIP1-201ENST00000330233 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP37.83■■■■□ 3.65
CRIP1-201ENST00000330233 FMN2Q9NZ56 1722 aa37.82■■■■□ 3.65
CRIP1-201ENST00000330233 WASLO00401 505 aaPredicted RBP37.82■■■■□ 3.64
CRIP1-201ENST00000330233 C1orf167Q5SNV9 1468 aa37.8■■■■□ 3.64
CRIP1-201ENST00000330233 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa37.8■■■■□ 3.64
CRIP1-201ENST00000330233 NUTM2FA1L443 756 aa37.75■■■■□ 3.63
CRIP1-201ENST00000330233 BRINP3Q76B58 766 aa37.75■■■■□ 3.63
CRIP1-201ENST00000330233 CDK19Q9BWU1 502 aa37.74■■■■□ 3.63
CRIP1-201ENST00000330233 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP37.73■■■■□ 3.63
CRIP1-201ENST00000330233 SLC24A1O60721 1099 aa37.73■■■■□ 3.63
CRIP1-201ENST00000330233 ESCO1Q5FWF5 840 aa37.72■■■■□ 3.63
CRIP1-201ENST00000330233 USP47Q96K76 1375 aa37.72■■■■□ 3.63
CRIP1-201ENST00000330233 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa37.72■■■■□ 3.63
CRIP1-201ENST00000330233 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa37.71■■■■□ 3.63
CRIP1-201ENST00000330233 ORAI2Q96SN7 254 aa37.71■■■■□ 3.63
CRIP1-201ENST00000330233 ANKARQ7Z5J8 1434 aa37.71■■■■□ 3.63
CRIP1-201ENST00000330233 EVC2Q86UK5 1308 aa37.7■■■■□ 3.63
CRIP1-201ENST00000330233 TULP4Q9NRJ4 1543 aa37.68■■■■□ 3.62
CRIP1-201ENST00000330233 HSPA1LP34931 641 aa37.64■■■■□ 3.62
CRIP1-201ENST00000330233 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP37.64■■■■□ 3.62
CRIP1-201ENST00000330233 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP37.63■■■■□ 3.62
CRIP1-201ENST00000330233 USP32Q8NFA0 1604 aa37.63■■■■□ 3.61
CRIP1-201ENST00000330233 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP37.61■■■■□ 3.61
CRIP1-201ENST00000330233 PHF8Q9UPP1 1060 aa37.61■■■■□ 3.61
CRIP1-201ENST00000330233 PRR36Q9H6K5 1346 aa37.6■■■■□ 3.61
CRIP1-201ENST00000330233 PHLPP1O60346 1717 aa37.6■■■■□ 3.61
CRIP1-201ENST00000330233 TESK2Q96S53 571 aa37.6■■■■□ 3.61
CRIP1-201ENST00000330233 ITSN1Q15811 1721 aa37.59■■■■□ 3.61
CRIP1-201ENST00000330233 CABP2Q9NPB3 220 aa37.59■■■■□ 3.61
CRIP1-201ENST00000330233 CCDC61Q9Y6R9 512 aa37.59■■■■□ 3.61
CRIP1-201ENST00000330233 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP37.58■■■■□ 3.61
CRIP1-201ENST00000330233 KIF1AQ12756 1690 aa37.58■■■■□ 3.61
CRIP1-201ENST00000330233 NHSL1Q5SYE7 1610 aa37.57■■■■□ 3.6
CRIP1-201ENST00000330233 ATP7BP35670 1465 aa37.56■■■■□ 3.6
CRIP1-201ENST00000330233 NPHP3Q7Z494 1330 aa37.55■■■■□ 3.6
CRIP1-201ENST00000330233 FOXO3O43524 673 aa37.54■■■■□ 3.6
CRIP1-201ENST00000330233 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP37.53■■■■□ 3.6
CRIP1-201ENST00000330233 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP37.51■■■■□ 3.6
CRIP1-201ENST00000330233 TMF1P82094 1093 aa37.51■■■■□ 3.6
CRIP1-201ENST00000330233 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa37.51■■■■□ 3.6
CRIP1-201ENST00000330233 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP37.5■■■■□ 3.59
CRIP1-201ENST00000330233 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP37.5■■■■□ 3.59
CRIP1-201ENST00000330233 PLEKHG3A1L390 1219 aa37.48■■■■□ 3.59
CRIP1-201ENST00000330233 ATAD2Q6PL18 1390 aa37.48■■■■□ 3.59
CRIP1-201ENST00000330233 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa37.47■■■■□ 3.59
CRIP1-201ENST00000330233 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP37.46■■■■□ 3.59
CRIP1-201ENST00000330233 PSME1Q06323 249 aa37.46■■■■□ 3.59
CRIP1-201ENST00000330233 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP37.46■■■■□ 3.59
CRIP1-201ENST00000330233 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP37.46■■■■□ 3.59
CRIP1-201ENST00000330233 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP37.46■■■■□ 3.59
CRIP1-201ENST00000330233 CDCA8Q53HL2 280 aa37.45■■■■□ 3.59
CRIP1-201ENST00000330233 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa37.44■■■■□ 3.58
CRIP1-201ENST00000330233 KRT28Q7Z3Y7 464 aa37.43■■■■□ 3.58
CRIP1-201ENST00000330233 CABP1Q9NZU7 370 aa37.42■■■■□ 3.58
CRIP1-201ENST00000330233 ACEP12821 1306 aa37.38■■■■□ 3.57
CRIP1-201ENST00000330233 PXDNQ92626 1479 aa37.38■■■■□ 3.57
CRIP1-201ENST00000330233 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP37.38■■■■□ 3.57
CRIP1-201ENST00000330233 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP37.37■■■■□ 3.57
CRIP1-201ENST00000330233 DISP3Q9P2K9 1392 aa37.37■■■■□ 3.57
CRIP1-201ENST00000330233 JCADQ9P266 1359 aa37.36■■■■□ 3.57
CRIP1-201ENST00000330233 TMC1Q8TDI8 760 aa37.32■■■■□ 3.56
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP37.32■■■■□ 3.56
CRIP1-201ENST00000330233 SBNO1A3KN83 1393 aa37.31■■■■□ 3.56
CRIP1-201ENST00000330233 NINLQ9Y2I6 1382 aa37.29■■■■□ 3.56
CRIP1-201ENST00000330233 SHPRHQ149N8 1683 aa37.28■■■■□ 3.56
CRIP1-201ENST00000330233 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa37.28■■■■□ 3.56
CRIP1-201ENST00000330233 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa37.27■■■■□ 3.56
CRIP1-201ENST00000330233 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP37.25■■■■□ 3.55
CRIP1-201ENST00000330233 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP37.24■■■■□ 3.55
CRIP1-201ENST00000330233 AKAP12Q02952 1782 aa37.24■■■■□ 3.55
CRIP1-201ENST00000330233 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP37.23■■■■□ 3.55
CRIP1-201ENST00000330233 TERF2IPQ9NYB0 399 aa37.23■■■■□ 3.55
CRIP1-201ENST00000330233 PNPLA6Q8IY17 1366 aa37.23■■■■□ 3.55
CRIP1-201ENST00000330233 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa37.22■■■■□ 3.55
CRIP1-201ENST00000330233 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP37.22■■■■□ 3.55
CRIP1-201ENST00000330233 TNS3Q68CZ2 1445 aa37.22■■■■□ 3.55
CRIP1-201ENST00000330233 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP37.21■■■■□ 3.55
CRIP1-201ENST00000330233 LMOD2Q6P5Q4 547 aa37.19■■■■□ 3.54
CRIP1-201ENST00000330233 ARHGEF10O15013 1369 aa37.19■■■■□ 3.54
CRIP1-201ENST00000330233 USP6P35125 1406 aa37.19■■■■□ 3.54
CRIP1-201ENST00000330233 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP37.17■■■■□ 3.54
CRIP1-201ENST00000330233 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP37.15■■■■□ 3.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 282.2 ms