RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319942.7

RABGGTB-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTB, Length 1,496 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP14.23□□□□□ -0.13
RABGGTB-201ENST00000319942 SOX12O15370 315 aa14.22□□□□□ -0.13
RABGGTB-201ENST00000319942 PLA2R1Q13018 1463 aa14.22□□□□□ -0.13
RABGGTB-201ENST00000319942 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP14.21□□□□□ -0.13
RABGGTB-201ENST00000319942 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa14.2□□□□□ -0.14
RABGGTB-201ENST00000319942 PTPRTO14522 1441 aa14.2□□□□□ -0.14
RABGGTB-201ENST00000319942 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP14.18□□□□□ -0.14
RABGGTB-201ENST00000319942 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP14.18□□□□□ -0.14
RABGGTB-201ENST00000319942 YEATS2Q9ULM3 1422 aa14.18□□□□□ -0.14
RABGGTB-201ENST00000319942 VWDEQ8N2E2 1590 aa14.17□□□□□ -0.14
RABGGTB-201ENST00000319942 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa14.17□□□□□ -0.14
RABGGTB-201ENST00000319942 DEPDC5O75140 1603 aa14.17□□□□□ -0.14
RABGGTB-201ENST00000319942 ARSIQ5FYB1 569 aa14.17□□□□□ -0.14
RABGGTB-201ENST00000319942 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP14.16□□□□□ -0.14
RABGGTB-201ENST00000319942 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa14.15□□□□□ -0.14
RABGGTB-201ENST00000319942 LMTK2Q8IWU2 1503 aa14.15□□□□□ -0.14
RABGGTB-201ENST00000319942 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP14.15□□□□□ -0.146e-9■■□□□ 13.5
RABGGTB-201ENST00000319942 CARD11Q9BXL7 1154 aa14.15□□□□□ -0.14
RABGGTB-201ENST00000319942 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa14.14□□□□□ -0.15
RABGGTB-201ENST00000319942 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP14.14□□□□□ -0.15
RABGGTB-201ENST00000319942 RICTORQ6R327 1708 aa14.14□□□□□ -0.15
RABGGTB-201ENST00000319942 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa14.14□□□□□ -0.15
RABGGTB-201ENST00000319942 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP14.13□□□□□ -0.15
RABGGTB-201ENST00000319942 TSPOAP1O95153 1857 aa14.13□□□□□ -0.15
RABGGTB-201ENST00000319942 ABCA6Q8N139 1617 aa14.13□□□□□ -0.15
RABGGTB-201ENST00000319942 TET3O43151 1660 aa14.13□□□□□ -0.15
RABGGTB-201ENST00000319942 MS4A4AQ96JQ5 239 aa14.12□□□□□ -0.15
RABGGTB-201ENST00000319942 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP14.12□□□□□ -0.15
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC52A1Q9NWF4 448 aa14.12□□□□□ -0.15
RABGGTB-201ENST00000319942 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP14.11□□□□□ -0.15
RABGGTB-201ENST00000319942 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP14.1□□□□□ -0.15
RABGGTB-201ENST00000319942 MROH1Q8NDA8 1641 aa14.1□□□□□ -0.15
RABGGTB-201ENST00000319942 TRPM2O94759 1503 aa14.1□□□□□ -0.15
RABGGTB-201ENST00000319942 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa14.1□□□□□ -0.15
RABGGTB-201ENST00000319942 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa14.1□□□□□ -0.15
RABGGTB-201ENST00000319942 CHGAP10645 457 aaKnown RBP14.1□□□□□ -0.15
RABGGTB-201ENST00000319942 NPATQ14207 1427 aa14.09□□□□□ -0.15
RABGGTB-201ENST00000319942 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP14.09□□□□□ -0.15
RABGGTB-201ENST00000319942 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP14.09□□□□□ -0.15
RABGGTB-201ENST00000319942 PBX2P40425 430 aa14.09□□□□□ -0.15
RABGGTB-201ENST00000319942 CNTLNQ9NXG0 1405 aa14.08□□□□□ -0.15
RABGGTB-201ENST00000319942 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa14.08□□□□□ -0.16
RABGGTB-201ENST00000319942 BCORL1Q5H9F3 1711 aa14.08□□□□□ -0.16
RABGGTB-201ENST00000319942 MLECQ14165 292 aa14.08□□□□□ -0.16
RABGGTB-201ENST00000319942 E9PCH4 1651 aa14.08□□□□□ -0.16
RABGGTB-201ENST00000319942 ABCC3O15438 1527 aa14.08□□□□□ -0.16
RABGGTB-201ENST00000319942 AGLP35573 1532 aa14.08□□□□□ -0.16
RABGGTB-201ENST00000319942 EFCAB6Q5THR3 1501 aa14.08□□□□□ -0.16
RABGGTB-201ENST00000319942 KIF13AQ9H1H9 1805 aa14.08□□□□□ -0.16
RABGGTB-201ENST00000319942 PRAG1Q86YV5 1406 aa14.08□□□□□ -0.16
RABGGTB-201ENST00000319942 USP47Q96K76 1375 aa14.07□□□□□ -0.16
RABGGTB-201ENST00000319942 PHF8Q9UPP1 1060 aa14.06□□□□□ -0.16
RABGGTB-201ENST00000319942 RALGAPBQ86X10 1494 aa14.06□□□□□ -0.16
RABGGTB-201ENST00000319942 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP14.06□□□□□ -0.16
RABGGTB-201ENST00000319942 NBPF1Q3BBV0 1214 aa14.06□□□□□ -0.16
RABGGTB-201ENST00000319942 REREQ9P2R6 1566 aa14.05□□□□□ -0.16
RABGGTB-201ENST00000319942 WASHC2AQ641Q2 1341 aa14.04□□□□□ -0.16
RABGGTB-201ENST00000319942 IDI1Q13907 227 aa14.04□□□□□ -0.16
RABGGTB-201ENST00000319942 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP14.04□□□□□ -0.163e-8■■□□□ 14.2
RABGGTB-201ENST00000319942 NOS1P29475 1434 aa14.04□□□□□ -0.16
RABGGTB-201ENST00000319942 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa14.03□□□□□ -0.16
RABGGTB-201ENST00000319942 VGFO15240 615 aaPredicted RBP14.03□□□□□ -0.16
RABGGTB-201ENST00000319942 GPRASP1Q5JY77 1395 aa14.03□□□□□ -0.16
RABGGTB-201ENST00000319942 ANP32CO43423 234 aa14.02□□□□□ -0.16
RABGGTB-201ENST00000319942 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa14.02□□□□□ -0.16
RABGGTB-201ENST00000319942 NEURL4Q96JN8 1562 aa14.02□□□□□ -0.17
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC24A1O60721 1099 aa14.01□□□□□ -0.17
RABGGTB-201ENST00000319942 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP14.01□□□□□ -0.17
RABGGTB-201ENST00000319942 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa14□□□□□ -0.17
RABGGTB-201ENST00000319942 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP14□□□□□ -0.17
RABGGTB-201ENST00000319942 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP14□□□□□ -0.17
RABGGTB-201ENST00000319942 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP14□□□□□ -0.17
RABGGTB-201ENST00000319942 HCSTQ9UBK5 93 aa14□□□□□ -0.17
RABGGTB-201ENST00000319942 CCDC7Q96M83 1385 aa14□□□□□ -0.17
RABGGTB-201ENST00000319942 CLTCL1P53675 1640 aa13.99□□□□□ -0.17
RABGGTB-201ENST00000319942 NLRP6P59044 892 aa13.99□□□□□ -0.17
RABGGTB-201ENST00000319942 KIF7Q2M1P5 1343 aa13.98□□□□□ -0.17
RABGGTB-201ENST00000319942 ZMYM3Q14202 1370 aa13.98□□□□□ -0.17
RABGGTB-201ENST00000319942 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa13.98□□□□□ -0.17
RABGGTB-201ENST00000319942 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa13.97□□□□□ -0.17
RABGGTB-201ENST00000319942 CEP152O94986 1710 aa13.97□□□□□ -0.17
RABGGTB-201ENST00000319942 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP13.96□□□□□ -0.17
RABGGTB-201ENST00000319942 HDGFP51858 240 aaKnown RBP13.96□□□□□ -0.17
RABGGTB-201ENST00000319942 CFAP70Q5T0N1 1121 aa13.96□□□□□ -0.17
RABGGTB-201ENST00000319942 POLR3GLQ9BT43 218 aa13.96□□□□□ -0.17
RABGGTB-201ENST00000319942 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP13.96□□□□□ -0.17
RABGGTB-201ENST00000319942 UGGT1Q9NYU2 1555 aa13.95□□□□□ -0.18
RABGGTB-201ENST00000319942 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa13.95□□□□□ -0.18
RABGGTB-201ENST00000319942 TMF1P82094 1093 aa13.94□□□□□ -0.18
RABGGTB-201ENST00000319942 MYOM2P54296 1465 aa13.94□□□□□ -0.18
RABGGTB-201ENST00000319942 CDCA8Q53HL2 280 aa13.93□□□□□ -0.18
RABGGTB-201ENST00000319942 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP13.93□□□□□ -0.18
RABGGTB-201ENST00000319942 CCER2I3L3R5 266 aa13.93□□□□□ -0.18
RABGGTB-201ENST00000319942 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP13.92□□□□□ -0.18
RABGGTB-201ENST00000319942 NUDT7P0C024 238 aa13.92□□□□□ -0.18
RABGGTB-201ENST00000319942 ERVK-7P63135 1459 aa13.91□□□□□ -0.18
RABGGTB-201ENST00000319942 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP13.91□□□□□ -0.183e-6■■□□□ 14.2
RABGGTB-201ENST00000319942 TESK2Q96S53 571 aa13.91□□□□□ -0.18
RABGGTB-201ENST00000319942 ADGRB3O60242 1522 aa13.9□□□□□ -0.18
RABGGTB-201ENST00000319942 KIF1BO60333 1816 aa13.9□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.2 ms