RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000316939.2

GADD45GIP1-201, Transcript of GADD45G interacting protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GADD45GIP1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45GIP1-201ENST00000316939 METP08581 1390 aa29.6■■■□□ 2.33
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CARD14Q9BXL6 1004 aa29.59■■■□□ 2.33
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa29.58■■■□□ 2.33
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CPS1P31327 1500 aa29.58■■■□□ 2.33
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP29.56■■■□□ 2.32
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZBED9Q6R2W3 1325 aa29.56■■■□□ 2.32
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MED14O60244 1454 aa29.56■■■□□ 2.32
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FAM135BQ49AJ0 1406 aa29.55■■■□□ 2.32
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SIRT1Q96EB6 747 aa29.55■■■□□ 2.32
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa29.55■■■□□ 2.32
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ATAD2Q6PL18 1390 aa29.55■■■□□ 2.32
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP29.55■■■□□ 2.32
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LTKP29376 864 aa29.54■■■□□ 2.32
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa29.53■■■□□ 2.32
GADD45GIP1-201ENST00000316939 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP29.52■■■□□ 2.32
GADD45GIP1-201ENST00000316939 EID1Q9Y6B2 187 aa29.52■■■□□ 2.32
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP29.52■■■□□ 2.32
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP29.52■■■□□ 2.32
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NSD3Q9BZ95 1437 aa29.52■■■□□ 2.32
GADD45GIP1-201ENST00000316939 INSRP06213 1382 aa29.51■■■□□ 2.32
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TXNDC2Q86VQ3 553 aa29.51■■■□□ 2.31
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CABP2Q9NPB3 220 aa29.51■■■□□ 2.31
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PPP2R1AP30153 589 aa29.49■■■□□ 2.31
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DIP2AQ14689 1571 aa29.49■■■□□ 2.31
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa29.48■■■□□ 2.31
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP29.48■■■□□ 2.31
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PLPPR3Q6T4P5 718 aa29.46■■■□□ 2.31
GADD45GIP1-201ENST00000316939 BCANQ96GW7 911 aa29.46■■■□□ 2.31
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP29.45■■■□□ 2.31
GADD45GIP1-201ENST00000316939 WAPLQ7Z5K2 1190 aa29.45■■■□□ 2.31
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CDK19Q9BWU1 502 aa29.43■■■□□ 2.3
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NSD2O96028 1365 aa29.43■■■□□ 2.3
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CGNL1Q0VF96 1302 aa29.41■■■□□ 2.3
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CD163L1Q9NR16 1453 aa29.41■■■□□ 2.3
GADD45GIP1-201ENST00000316939 A0A1W2PP64 1363 aa29.4■■■□□ 2.3
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ADGRB2O60241 1585 aa29.4■■■□□ 2.3
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TBX22Q9Y458 520 aa29.39■■■□□ 2.3
GADD45GIP1-201ENST00000316939 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP29.38■■■□□ 2.29
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ROBO2Q9HCK4 1378 aa29.37■■■□□ 2.29
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TERF2IPQ9NYB0 399 aa29.36■■■□□ 2.29
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ATP7BP35670 1465 aa29.36■■■□□ 2.29
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PTPRUQ92729 1446 aa29.35■■■□□ 2.29
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa29.35■■■□□ 2.29
GADD45GIP1-201ENST00000316939 WASLO00401 505 aaPredicted RBP29.34■■■□□ 2.29
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PTCH1Q13635 1447 aa29.33■■■□□ 2.29
GADD45GIP1-201ENST00000316939 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP29.32■■■□□ 2.28
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP29.32■■■□□ 2.28
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SLC26A8Q96RN1 970 aa29.32■■■□□ 2.28
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MORC1Q86VD1 984 aa29.31■■■□□ 2.28
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PIK3R4Q99570 1358 aa29.29■■■□□ 2.28
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP29.29■■■□□ 2.28
GADD45GIP1-201ENST00000316939 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP29.28■■■□□ 2.28
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KIF20BQ96Q89 1820 aa29.28■■■□□ 2.28
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CABP1Q9NZU7 370 aa29.27■■■□□ 2.28
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP29.26■■■□□ 2.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP29.24■■■□□ 2.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa29.24■■■□□ 2.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP29.24■■■□□ 2.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa29.24■■■□□ 2.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa29.24■■■□□ 2.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa29.23■■■□□ 2.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ADAMTS8Q9UP79 889 aa29.23■■■□□ 2.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MON2Q7Z3U7 1717 aa29.22■■■□□ 2.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ANKLE2Q86XL3 938 aa29.22■■■□□ 2.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 AKAP12Q02952 1782 aa29.22■■■□□ 2.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP29.21■■■□□ 2.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ITSN1Q15811 1721 aa29.2■■■□□ 2.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SHPRHQ149N8 1683 aa29.2■■■□□ 2.26
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CCDC61Q9Y6R9 512 aa29.19■■■□□ 2.26
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP29.18■■■□□ 2.26
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FYB1O15117 783 aa29.18■■■□□ 2.26
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP29.18■■■□□ 2.26
GADD45GIP1-201ENST00000316939 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP29.17■■■□□ 2.26
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NUDCQ9Y266 331 aa29.15■■■□□ 2.26
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PRR36Q9H6K5 1346 aa29.15■■■□□ 2.26
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NEFLP07196 543 aa29.14■■■□□ 2.26
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PDE3BQ13370 1112 aa29.13■■■□□ 2.25
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP29.11■■■□□ 2.25
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GGNBP2Q9H3C7 697 aa29.11■■■□□ 2.25
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MTHFSP49914 203 aa29.1■■■□□ 2.25
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CFAP53Q96M91 514 aa29.08■■■□□ 2.25
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NRKQ7Z2Y5 1582 aa29.08■■■□□ 2.25
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP29.08■■■□□ 2.25
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP29.08■■■□□ 2.25
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KCNA6P17658 529 aa29.07■■■□□ 2.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FKBP8Q14318 412 aa29.07■■■□□ 2.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa29.06■■■□□ 2.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PLEKHG3A1L390 1219 aa29.06■■■□□ 2.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa29.04■■■□□ 2.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FMN2Q9NZ56 1722 aa29.03■■■□□ 2.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP29.03■■■□□ 2.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP29.03■■■□□ 2.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ANKARQ7Z5J8 1434 aa29.02■■■□□ 2.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP29.01■■■□□ 2.23
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NGEFQ8N5V2 710 aa29.01■■■□□ 2.23
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NALCNQ8IZF0 1738 aa29■■■□□ 2.23
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP29■■■□□ 2.23
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP29■■■□□ 2.23
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNF521Q96K83 1311 aa28.98■■■□□ 2.23
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NWD1Q149M9 1564 aa28.98■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.4 ms