RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000316412.9

PRAMEF20-201, Transcript of PRAME family member 20, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PRAMEF20, Length 1,597 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF20-201ENST00000316412 TULP4Q9NRJ4 1543 aa24.13■■□□□ 1.45
PRAMEF20-201ENST00000316412 PTCH1Q13635 1447 aa24.12■■□□□ 1.45
PRAMEF20-201ENST00000316412 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP24.12■■□□□ 1.45
PRAMEF20-201ENST00000316412 NWD1Q149M9 1564 aa24.09■■□□□ 1.45
PRAMEF20-201ENST00000316412 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
PRAMEF20-201ENST00000316412 CDCA8Q53HL2 280 aa24.08■■□□□ 1.45
PRAMEF20-201ENST00000316412 POLR3GLQ9BT43 218 aa24.08■■□□□ 1.45
PRAMEF20-201ENST00000316412 MYOM1P52179 1685 aa24.08■■□□□ 1.45
PRAMEF20-201ENST00000316412 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
PRAMEF20-201ENST00000316412 KCNA6P17658 529 aa24.07■■□□□ 1.44
PRAMEF20-201ENST00000316412 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
PRAMEF20-201ENST00000316412 EVC2Q86UK5 1308 aa24.05■■□□□ 1.44
PRAMEF20-201ENST00000316412 ADGRB2O60241 1585 aa24.04■■□□□ 1.44
PRAMEF20-201ENST00000316412 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
PRAMEF20-201ENST00000316412 STRCP1A6NGW2 1772 aa24.03■■□□□ 1.44
PRAMEF20-201ENST00000316412 CERKQ8TCT0 537 aa23.99■■□□□ 1.43
PRAMEF20-201ENST00000316412 CDK19Q9BWU1 502 aa23.98■■□□□ 1.43
PRAMEF20-201ENST00000316412 CABP2Q9NPB3 220 aa23.98■■□□□ 1.43
PRAMEF20-201ENST00000316412 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP23.97■■□□□ 1.43
PRAMEF20-201ENST00000316412 NALCNQ8IZF0 1738 aa23.96■■□□□ 1.43
PRAMEF20-201ENST00000316412 WASLO00401 505 aaPredicted RBP23.96■■□□□ 1.43
PRAMEF20-201ENST00000316412 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP23.95■■□□□ 1.42
PRAMEF20-201ENST00000316412 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
PRAMEF20-201ENST00000316412 FBXO41Q8TF61 875 aa23.94■■□□□ 1.42
PRAMEF20-201ENST00000316412 ATAD2Q6PL18 1390 aa23.92■■□□□ 1.42
PRAMEF20-201ENST00000316412 PANK3Q9H999 370 aa23.91■■□□□ 1.42
PRAMEF20-201ENST00000316412 LTBP4Q8N2S1 1624 aa23.9■■□□□ 1.42
PRAMEF20-201ENST00000316412 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP23.89■■□□□ 1.41
PRAMEF20-201ENST00000316412 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa23.89■■□□□ 1.41
PRAMEF20-201ENST00000316412 FMN2Q9NZ56 1722 aa23.89■■□□□ 1.41
PRAMEF20-201ENST00000316412 USP32Q8NFA0 1604 aa23.88■■□□□ 1.41
PRAMEF20-201ENST00000316412 MIER1Q8N108 512 aa23.88■■□□□ 1.41
PRAMEF20-201ENST00000316412 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa23.88■■□□□ 1.41
PRAMEF20-201ENST00000316412 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa23.88■■□□□ 1.41
PRAMEF20-201ENST00000316412 NINLQ9Y2I6 1382 aa23.88■■□□□ 1.41
PRAMEF20-201ENST00000316412 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP23.88■■□□□ 1.41
PRAMEF20-201ENST00000316412 ATP7BP35670 1465 aa23.88■■□□□ 1.41
PRAMEF20-201ENST00000316412 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP23.87■■□□□ 1.41
PRAMEF20-201ENST00000316412 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP23.87■■□□□ 1.41
PRAMEF20-201ENST00000316412 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP23.87■■□□□ 1.41
PRAMEF20-201ENST00000316412 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa23.87■■□□□ 1.41
PRAMEF20-201ENST00000316412 PRR36Q9H6K5 1346 aa23.86■■□□□ 1.41
PRAMEF20-201ENST00000316412 TMC1Q8TDI8 760 aa23.86■■□□□ 1.41
PRAMEF20-201ENST00000316412 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP23.85■■□□□ 1.41
PRAMEF20-201ENST00000316412 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa23.83■■□□□ 1.41
PRAMEF20-201ENST00000316412 CD163L1Q9NR16 1453 aa23.83■■□□□ 1.4
PRAMEF20-201ENST00000316412 ITSN1Q15811 1721 aa23.83■■□□□ 1.4
PRAMEF20-201ENST00000316412 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa23.82■■□□□ 1.4
PRAMEF20-201ENST00000316412 CARD14Q9BXL6 1004 aa23.82■■□□□ 1.4
PRAMEF20-201ENST00000316412 TMEM94Q12767 1356 aa23.81■■□□□ 1.4
PRAMEF20-201ENST00000316412 ANP32CO43423 234 aa23.81■■□□□ 1.4
PRAMEF20-201ENST00000316412 CABP1Q9NZU7 370 aa23.81■■□□□ 1.4
PRAMEF20-201ENST00000316412 CCDC61Q9Y6R9 512 aa23.81■■□□□ 1.4
PRAMEF20-201ENST00000316412 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa23.8■■□□□ 1.4
PRAMEF20-201ENST00000316412 AKAP12Q02952 1782 aa23.79■■□□□ 1.4
PRAMEF20-201ENST00000316412 ANKARQ7Z5J8 1434 aa23.79■■□□□ 1.4
PRAMEF20-201ENST00000316412 LRRC7Q96NW7 1537 aa23.78■■□□□ 1.4
PRAMEF20-201ENST00000316412 A0A1W2PP64 1363 aa23.78■■□□□ 1.4
PRAMEF20-201ENST00000316412 NUTM2FA1L443 756 aa23.77■■□□□ 1.4
PRAMEF20-201ENST00000316412 C14orf37Q86TY3 774 aa23.76■■□□□ 1.39
PRAMEF20-201ENST00000316412 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP23.76■■□□□ 1.39
PRAMEF20-201ENST00000316412 MON2Q7Z3U7 1717 aa23.75■■□□□ 1.39
PRAMEF20-201ENST00000316412 C19orf44Q9H6X5 657 aa23.75■■□□□ 1.39
PRAMEF20-201ENST00000316412 TERF2IPQ9NYB0 399 aa23.75■■□□□ 1.39
PRAMEF20-201ENST00000316412 KNSTRNQ9Y448 316 aa23.75■■□□□ 1.39
PRAMEF20-201ENST00000316412 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
PRAMEF20-201ENST00000316412 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP23.74■■□□□ 1.39
PRAMEF20-201ENST00000316412 NSD3Q9BZ95 1437 aa23.74■■□□□ 1.39
PRAMEF20-201ENST00000316412 PLEKHG3A1L390 1219 aa23.74■■□□□ 1.39
PRAMEF20-201ENST00000316412 DCCP43146 1447 aa23.73■■□□□ 1.39
PRAMEF20-201ENST00000316412 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa23.73■■□□□ 1.39
PRAMEF20-201ENST00000316412 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP23.72■■□□□ 1.39
PRAMEF20-201ENST00000316412 IQSEC2Q5JU85 1478 aa23.7■■□□□ 1.38
PRAMEF20-201ENST00000316412 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
PRAMEF20-201ENST00000316412 PARD3Q8TEW0 1356 aa23.69■■□□□ 1.38
PRAMEF20-201ENST00000316412 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
PRAMEF20-201ENST00000316412 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
PRAMEF20-201ENST00000316412 KIF20BQ96Q89 1820 aa23.67■■□□□ 1.38
PRAMEF20-201ENST00000316412 ACEP12821 1306 aa23.67■■□□□ 1.38
PRAMEF20-201ENST00000316412 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
PRAMEF20-201ENST00000316412 NRKQ7Z2Y5 1582 aa23.67■■□□□ 1.38
PRAMEF20-201ENST00000316412 MSH6P52701 1360 aa23.67■■□□□ 1.38
PRAMEF20-201ENST00000316412 MST1RQ04912 1400 aa23.66■■□□□ 1.38
PRAMEF20-201ENST00000316412 RALBP1Q15311 655 aa23.65■■□□□ 1.38
PRAMEF20-201ENST00000316412 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
PRAMEF20-201ENST00000316412 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa23.65■■□□□ 1.38
PRAMEF20-201ENST00000316412 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
PRAMEF20-201ENST00000316412 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa23.65■■□□□ 1.38
PRAMEF20-201ENST00000316412 C1orf167Q5SNV9 1468 aa23.64■■□□□ 1.38
PRAMEF20-201ENST00000316412 CGNL1Q0VF96 1302 aa23.64■■□□□ 1.38
PRAMEF20-201ENST00000316412 UBAP1LF5GYI3 381 aa23.64■■□□□ 1.37
PRAMEF20-201ENST00000316412 CCER2I3L3R5 266 aa23.64■■□□□ 1.37
PRAMEF20-201ENST00000316412 ATF3P18847 181 aa23.64■■□□□ 1.37
PRAMEF20-201ENST00000316412 USP6P35125 1406 aa23.63■■□□□ 1.37
PRAMEF20-201ENST00000316412 CADPS2Q86UW7 1296 aa23.62■■□□□ 1.37
PRAMEF20-201ENST00000316412 PHF8Q9UPP1 1060 aa23.62■■□□□ 1.37
PRAMEF20-201ENST00000316412 SSH2Q76I76 1423 aa23.61■■□□□ 1.37
PRAMEF20-201ENST00000316412 NSD2O96028 1365 aa23.61■■□□□ 1.37
PRAMEF20-201ENST00000316412 KIF1AQ12756 1690 aa23.61■■□□□ 1.37
PRAMEF20-201ENST00000316412 ESCO1Q5FWF5 840 aa23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 81.4 ms