RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296130.4

CLEC3B-201, Transcript of C-type lectin domain family 3 member B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLEC3B, Length 936 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC3B-201ENST00000296130 LRP6O75581 1613 aa42.46■■■■■ 4.39
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CLEC3B-201ENST00000296130 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP42.45■■■■■ 4.39
CLEC3B-201ENST00000296130 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP42.45■■■■■ 4.39
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CLEC3B-201ENST00000296130 FMN2Q9NZ56 1722 aa42.06■■■■■ 4.32
CLEC3B-201ENST00000296130 KRT28Q7Z3Y7 464 aa42.05■■■■■ 4.32
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CLEC3B-201ENST00000296130 KIF1AQ12756 1690 aa41.99■■■■■ 4.31
CLEC3B-201ENST00000296130 ANKARQ7Z5J8 1434 aa41.97■■■■■ 4.31
CLEC3B-201ENST00000296130 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP41.96■■■■■ 4.31
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CLEC3B-201ENST00000296130 NBPF8Q3BBV2 869 aa41.49■■■■■ 4.23
CLEC3B-201ENST00000296130 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP41.48■■■■■ 4.23
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CLEC3B-201ENST00000296130 ACEP12821 1306 aa41.47■■■■■ 4.23
CLEC3B-201ENST00000296130 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP41.47■■■■■ 4.23
CLEC3B-201ENST00000296130 ITSN1Q15811 1721 aa41.46■■■■■ 4.23
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