RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293683.9

PDE4A-201, Transcript of phosphodiesterase 4A, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4A, Length 2,583 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4A-201ENST00000293683 ADGRL1O94910 1474 aa22.29■■□□□ 1.16
PDE4A-201ENST00000293683 NEURL4Q96JN8 1562 aa22.29■■□□□ 1.16
PDE4A-201ENST00000293683 RARSP54136 660 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
PDE4A-201ENST00000293683 EFCAB6Q5THR3 1501 aa22.28■■□□□ 1.16
PDE4A-201ENST00000293683 NGEFQ8N5V2 710 aa22.28■■□□□ 1.16
PDE4A-201ENST00000293683 ABCA9Q8IUA7 1624 aa22.28■■□□□ 1.16
PDE4A-201ENST00000293683 TMEM132EQ6IEE7 984 aa22.28■■□□□ 1.16
PDE4A-201ENST00000293683 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
PDE4A-201ENST00000293683 SLC24A1O60721 1099 aa22.27■■□□□ 1.16
PDE4A-201ENST00000293683 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa22.27■■□□□ 1.16
PDE4A-201ENST00000293683 MYO3AQ8NEV4 1616 aa22.27■■□□□ 1.16
PDE4A-201ENST00000293683 RUNDC1Q96C34 613 aa22.27■■□□□ 1.16
PDE4A-201ENST00000293683 NRXN1Q9ULB1 1477 aa22.26■■□□□ 1.15
PDE4A-201ENST00000293683 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa22.26■■□□□ 1.15
PDE4A-201ENST00000293683 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa22.25■■□□□ 1.15
PDE4A-201ENST00000293683 NINLQ9Y2I6 1382 aa22.25■■□□□ 1.15
PDE4A-201ENST00000293683 IQSEC2Q5JU85 1478 aa22.25■■□□□ 1.15
PDE4A-201ENST00000293683 MTHFSP49914 203 aa22.24■■□□□ 1.15
PDE4A-201ENST00000293683 NLRP1Q9C000 1473 aa22.24■■□□□ 1.15
PDE4A-201ENST00000293683 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
PDE4A-201ENST00000293683 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
PDE4A-201ENST00000293683 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
PDE4A-201ENST00000293683 ADGRB3O60242 1522 aa22.21■■□□□ 1.15
PDE4A-201ENST00000293683 QRICH2Q9H0J4 1663 aa22.2■■□□□ 1.14
PDE4A-201ENST00000293683 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
PDE4A-201ENST00000293683 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa22.19■■□□□ 1.14
PDE4A-201ENST00000293683 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa22.18■■□□□ 1.14
PDE4A-201ENST00000293683 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
PDE4A-201ENST00000293683 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
PDE4A-201ENST00000293683 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa22.18■■□□□ 1.14
PDE4A-201ENST00000293683 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa22.17■■□□□ 1.14
PDE4A-201ENST00000293683 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa22.17■■□□□ 1.14
PDE4A-201ENST00000293683 ADGRB1O14514 1584 aa22.17■■□□□ 1.14
PDE4A-201ENST00000293683 WDR63Q8IWG1 891 aa22.16■■□□□ 1.14
PDE4A-201ENST00000293683 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
PDE4A-201ENST00000293683 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
PDE4A-201ENST00000293683 POGKQ9P215 609 aa22.15■■□□□ 1.14
PDE4A-201ENST00000293683 NPATQ14207 1427 aa22.15■■□□□ 1.14
PDE4A-201ENST00000293683 GGT6Q6P531 493 aa22.14■■□□□ 1.14
PDE4A-201ENST00000293683 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
PDE4A-201ENST00000293683 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP22.14■■□□□ 1.13
PDE4A-201ENST00000293683 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
PDE4A-201ENST00000293683 PPLO60437 1756 aa22.13■■□□□ 1.13
PDE4A-201ENST00000293683 BECN1Q14457 450 aa22.12■■□□□ 1.13
PDE4A-201ENST00000293683 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP22.12■■□□□ 1.13
PDE4A-201ENST00000293683 CFAP53Q96M91 514 aa22.12■■□□□ 1.13
PDE4A-201ENST00000293683 LMTK2Q8IWU2 1503 aa22.11■■□□□ 1.13
PDE4A-201ENST00000293683 TBC1D32Q96NH3 1257 aa22.11■■□□□ 1.13
PDE4A-201ENST00000293683 CCDC27Q2M243 656 aa22.1■■□□□ 1.13
PDE4A-201ENST00000293683 CABP2Q9NPB3 220 aa22.1■■□□□ 1.13
PDE4A-201ENST00000293683 ASXL2Q76L83 1435 aa22.1■■□□□ 1.13
PDE4A-201ENST00000293683 ANTXR1Q9H6X2 564 aa22.09■■□□□ 1.13
PDE4A-201ENST00000293683 MVPQ14764 893 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
PDE4A-201ENST00000293683 TBC1D2Q9BYX2 928 aa22.09■■□□□ 1.13
PDE4A-201ENST00000293683 MYH16Q9H6N6 1097 aa22.08■■□□□ 1.13
PDE4A-201ENST00000293683 TULP4Q9NRJ4 1543 aa22.08■■□□□ 1.13
PDE4A-201ENST00000293683 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa22.08■■□□□ 1.12
PDE4A-201ENST00000293683 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.12
PDE4A-201ENST00000293683 USP32Q8NFA0 1604 aa22.07■■□□□ 1.12
PDE4A-201ENST00000293683 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
PDE4A-201ENST00000293683 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
PDE4A-201ENST00000293683 AAMPQ13685 434 aa22.05■■□□□ 1.12
PDE4A-201ENST00000293683 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa22.05■■□□□ 1.12
PDE4A-201ENST00000293683 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa22.05■■□□□ 1.12
PDE4A-201ENST00000293683 GLI2P10070 1586 aa22.05■■□□□ 1.12
PDE4A-201ENST00000293683 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa22.05■■□□□ 1.12
PDE4A-201ENST00000293683 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
PDE4A-201ENST00000293683 EVC2Q86UK5 1308 aa22.04■■□□□ 1.12
PDE4A-201ENST00000293683 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
PDE4A-201ENST00000293683 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
PDE4A-201ENST00000293683 SMC4Q9NTJ3 1288 aa22.03■■□□□ 1.12
PDE4A-201ENST00000293683 CD109Q6YHK3 1445 aa22.03■■□□□ 1.12
PDE4A-201ENST00000293683 ADGRB2O60241 1585 aa22.03■■□□□ 1.12
PDE4A-201ENST00000293683 TRIM27P14373 513 aa22.02■■□□□ 1.12
PDE4A-201ENST00000293683 GGNBP2Q9H3C7 697 aa22.02■■□□□ 1.12
PDE4A-201ENST00000293683 SSH1Q8WYL5 1049 aa22.01■■□□□ 1.11
PDE4A-201ENST00000293683 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
PDE4A-201ENST00000293683 TRIM35Q9UPQ4 493 aa22■■□□□ 1.11
PDE4A-201ENST00000293683 A0A1W2PP64 1363 aa22■■□□□ 1.11
PDE4A-201ENST00000293683 ZMYM3Q14202 1370 aa22■■□□□ 1.11
PDE4A-201ENST00000293683 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
PDE4A-201ENST00000293683 ITPRIPQ8IWB1 547 aa21.99■■□□□ 1.11
PDE4A-201ENST00000293683 PLEKHF1Q96S99 279 aa21.99■■□□□ 1.11
PDE4A-201ENST00000293683 STK26Q9P289 416 aa21.99■■□□□ 1.11
PDE4A-201ENST00000293683 TMPOP42166 694 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
PDE4A-201ENST00000293683 ARXQ96QS3 562 aa21.98■■□□□ 1.11
PDE4A-201ENST00000293683 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa21.98■■□□□ 1.11
PDE4A-201ENST00000293683 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa21.98■■□□□ 1.11
PDE4A-201ENST00000293683 NSD2O96028 1365 aa21.97■■□□□ 1.11
PDE4A-201ENST00000293683 ABCC3O15438 1527 aa21.97■■□□□ 1.11
PDE4A-201ENST00000293683 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa21.97■■□□□ 1.11
PDE4A-201ENST00000293683 HECW2Q9P2P5 1572 aa21.97■■□□□ 1.11
PDE4A-201ENST00000293683 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
PDE4A-201ENST00000293683 POGZQ7Z3K3 1410 aa21.96■■□□□ 1.11
PDE4A-201ENST00000293683 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.11
PDE4A-201ENST00000293683 C22orf23Q9BZE7 217 aa21.95■■□□□ 1.1
PDE4A-201ENST00000293683 ABCC11Q96J66 1382 aa21.94■■□□□ 1.1
PDE4A-201ENST00000293683 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa21.94■■□□□ 1.1
PDE4A-201ENST00000293683 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa21.94■■□□□ 1.1
PDE4A-201ENST00000293683 TMEM57Q8N5G2 664 aa21.94■■□□□ 1.1
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