RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP25.58■■□□□ 1.69
CCSAP-201ENST00000284617 CDCA7LQ96GN5 454 aa25.57■■□□□ 1.68
CCSAP-201ENST00000284617 GNAI3P08754 354 aa25.56■■□□□ 1.68
CCSAP-201ENST00000284617 VSIG10Q8N0Z9 540 aa25.56■■□□□ 1.68
CCSAP-201ENST00000284617 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP25.55■■□□□ 1.68
CCSAP-201ENST00000284617 CABP2Q9NPB3 220 aa25.55■■□□□ 1.68
CCSAP-201ENST00000284617 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.55■■□□□ 1.68
CCSAP-201ENST00000284617 FAM13BQ9NYF5 915 aa25.55■■□□□ 1.68
CCSAP-201ENST00000284617 NINLQ9Y2I6 1382 aa25.54■■□□□ 1.68
CCSAP-201ENST00000284617 HFM1A2PYH4 1435 aa25.54■■□□□ 1.68
CCSAP-201ENST00000284617 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP25.54■■□□□ 1.68
CCSAP-201ENST00000284617 SCAPERQ9BY12 1400 aa25.54■■□□□ 1.68
CCSAP-201ENST00000284617 ERICH2A1L162 156 aa25.54■■□□□ 1.68
CCSAP-201ENST00000284617 NFXL1Q6ZNB6 911 aa25.54■■□□□ 1.68
CCSAP-201ENST00000284617 NASPP49321 788 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
CCSAP-201ENST00000284617 SETQ01105 290 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
CCSAP-201ENST00000284617 PSMA5P28066 241 aa25.53■■□□□ 1.68
CCSAP-201ENST00000284617 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa25.53■■□□□ 1.68
CCSAP-201ENST00000284617 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
CCSAP-201ENST00000284617 MCM2P49736 904 aa25.52■■□□□ 1.68
CCSAP-201ENST00000284617 MBD3O95983 291 aa25.52■■□□□ 1.68
CCSAP-201ENST00000284617 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
CCSAP-201ENST00000284617 TRAK2O60296 914 aa25.51■■□□□ 1.67
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
CCSAP-201ENST00000284617 CNTROBQ8N137 903 aa25.51■■□□□ 1.67
CCSAP-201ENST00000284617 CCDC39Q9UFE4 941 aa25.51■■□□□ 1.67
CCSAP-201ENST00000284617 TEX35Q5T0J7 233 aa25.51■■□□□ 1.67
CCSAP-201ENST00000284617 RIC3Q7Z5B4 369 aa25.51■■□□□ 1.67
CCSAP-201ENST00000284617 GCC1Q96CN9 775 aa25.51■■□□□ 1.67
CCSAP-201ENST00000284617 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa25.51■■□□□ 1.67
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM132EQ6IEE7 984 aa25.5■■□□□ 1.67
CCSAP-201ENST00000284617 VPS37DQ86XT2 251 aa25.5■■□□□ 1.67
CCSAP-201ENST00000284617 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
CCSAP-201ENST00000284617 RABEP1Q15276 862 aa25.49■■□□□ 1.67
CCSAP-201ENST00000284617 CFAP70Q5T0N1 1121 aa25.49■■□□□ 1.67
CCSAP-201ENST00000284617 IFT57Q9NWB7 429 aa25.49■■□□□ 1.67
CCSAP-201ENST00000284617 ARAP1Q96P48 1450 aa25.48■■□□□ 1.67
CCSAP-201ENST00000284617 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
CCSAP-201ENST00000284617 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
CCSAP-201ENST00000284617 CCDC30Q5VVM6 783 aa25.48■■□□□ 1.67
CCSAP-201ENST00000284617 OSCARQ8IYS5 282 aa25.48■■□□□ 1.67
CCSAP-201ENST00000284617 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
CCSAP-201ENST00000284617 GAS2L2Q8NHY3 880 aa25.47■■□□□ 1.67
CCSAP-201ENST00000284617 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
CCSAP-201ENST00000284617 CYB5RLQ6IPT4 315 aa25.46■■□□□ 1.67
CCSAP-201ENST00000284617 NEUROD6Q96NK8 337 aa25.46■■□□□ 1.67
CCSAP-201ENST00000284617 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.67
CCSAP-201ENST00000284617 PRKAR2BP31323 418 aa25.44■■□□□ 1.66
CCSAP-201ENST00000284617 PDCP20941 246 aa25.44■■□□□ 1.66
CCSAP-201ENST00000284617 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
CCSAP-201ENST00000284617 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa25.44■■□□□ 1.66
CCSAP-201ENST00000284617 SURF6O75683 361 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
CCSAP-201ENST00000284617 MNS1Q8NEH6 495 aa25.44■■□□□ 1.66
CCSAP-201ENST00000284617 TRIM34Q9BYJ4 488 aa25.43■■□□□ 1.66
CCSAP-201ENST00000284617 PRDM2Q13029 1718 aa25.43■■□□□ 1.66
CCSAP-201ENST00000284617 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
CCSAP-201ENST00000284617 NEK4P51957 841 aa25.43■■□□□ 1.66
CCSAP-201ENST00000284617 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
CCSAP-201ENST00000284617 WASHC4Q2M389 1173 aa25.43■■□□□ 1.66
CCSAP-201ENST00000284617 NLRP6P59044 892 aa25.42■■□□□ 1.66
CCSAP-201ENST00000284617 SDF4Q9BRK5 362 aa25.42■■□□□ 1.66
CCSAP-201ENST00000284617 FSD1Q9BTV5 496 aa25.42■■□□□ 1.66
CCSAP-201ENST00000284617 CFTRP13569 1480 aa25.42■■□□□ 1.66
CCSAP-201ENST00000284617 NCAPD3P42695 1498 aa25.42■■□□□ 1.66
CCSAP-201ENST00000284617 HIP1O00291 1037 aa25.42■■□□□ 1.66
CCSAP-201ENST00000284617 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
CCSAP-201ENST00000284617 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
CCSAP-201ENST00000284617 BACH2Q9BYV9 841 aa25.41■■□□□ 1.66
CCSAP-201ENST00000284617 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
CCSAP-201ENST00000284617 NBPF1Q3BBV0 1214 aa25.4■■□□□ 1.66
CCSAP-201ENST00000284617 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa25.4■■□□□ 1.66
CCSAP-201ENST00000284617 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
CCSAP-201ENST00000284617 OLFM4Q6UX06 510 aa25.4■■□□□ 1.66
CCSAP-201ENST00000284617 ARHGAP5Q13017 1502 aa25.4■■□□□ 1.66
CCSAP-201ENST00000284617 WDR63Q8IWG1 891 aa25.4■■□□□ 1.66
CCSAP-201ENST00000284617 MAP7D2Q96T17 732 aa25.4■■□□□ 1.66
CCSAP-201ENST00000284617 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
CCSAP-201ENST00000284617 RNF214Q8ND24 703 aa25.39■■□□□ 1.65
CCSAP-201ENST00000284617 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP25.39■■□□□ 1.651e-7■■■■□ 24.2
CCSAP-201ENST00000284617 WWC1Q8IX03 1113 aa25.39■■□□□ 1.65
CCSAP-201ENST00000284617 ACBD3Q9H3P7 528 aa25.39■■□□□ 1.65
CCSAP-201ENST00000284617 NBPF8Q3BBV2 869 aa25.38■■□□□ 1.65
CCSAP-201ENST00000284617 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
CCSAP-201ENST00000284617 AFAP1Q8N556 730 aa25.38■■□□□ 1.65
CCSAP-201ENST00000284617 XBP1P17861 261 aa25.37■■□□□ 1.65
CCSAP-201ENST00000284617 FOSBP53539 338 aa25.37■■□□□ 1.65
CCSAP-201ENST00000284617 NLRP2Q9NX02 1062 aa25.37■■□□□ 1.65
CCSAP-201ENST00000284617 GNAI2P04899 355 aa25.37■■□□□ 1.65
CCSAP-201ENST00000284617 FBXW7Q969H0 707 aa25.37■■□□□ 1.65
CCSAP-201ENST00000284617 AKNAQ7Z591 1439 aa25.37■■□□□ 1.65
CCSAP-201ENST00000284617 RAD21O60216 631 aa25.37■■□□□ 1.65
CCSAP-201ENST00000284617 ERC1Q8IUD2 1116 aa25.37■■□□□ 1.65
CCSAP-201ENST00000284617 BRMS1Q9HCU9 246 aa25.37■■□□□ 1.65
CCSAP-201ENST00000284617 EFCAB5A4FU69 1503 aa25.37■■□□□ 1.65
CCSAP-201ENST00000284617 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
CCSAP-201ENST00000284617 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
CCSAP-201ENST00000284617 SYNJ2O15056 1496 aa25.36■■□□□ 1.65
CCSAP-201ENST00000284617 PRM3Q9NNZ6 103 aa25.36■■□□□ 1.65
CCSAP-201ENST00000284617 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
CCSAP-201ENST00000284617 GRIN2BQ13224 1484 aa25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.2 ms