RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000270792.9

SH3BGRL3-201, Transcript of SH3 domain binding glutamate rich protein like 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BGRL3, Length 1,661 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRL3-201ENST00000270792 LTBP4Q8N2S1 1624 aa28.36■■■□□ 2.13
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 LRRC7Q96NW7 1537 aa28.36■■■□□ 2.13
SH3BGRL3-201ENST00000270792 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP28.35■■■□□ 2.13
SH3BGRL3-201ENST00000270792 WASHC2AQ641Q2 1341 aa28.35■■■□□ 2.13
SH3BGRL3-201ENST00000270792 C14orf37Q86TY3 774 aa28.35■■■□□ 2.13
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CCDC7Q96M83 1385 aa28.33■■■□□ 2.13
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP28.33■■■□□ 2.13
SH3BGRL3-201ENST00000270792 QRICH2Q9H0J4 1663 aa28.32■■■□□ 2.12
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 KIF7Q2M1P5 1343 aa28.26■■■□□ 2.11
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa28.25■■■□□ 2.11
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 NALCNQ8IZF0 1738 aa28.25■■■□□ 2.11
SH3BGRL3-201ENST00000270792 DISP3Q9P2K9 1392 aa28.25■■■□□ 2.11
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NUTM2FA1L443 756 aa28.23■■■□□ 2.11
SH3BGRL3-201ENST00000270792 C19orf44Q9H6X5 657 aa28.23■■■□□ 2.11
SH3BGRL3-201ENST00000270792 WASLO00401 505 aaPredicted RBP28.23■■■□□ 2.11
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CDK19Q9BWU1 502 aa28.23■■■□□ 2.11
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TULP4Q9NRJ4 1543 aa28.22■■■□□ 2.11
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa28.22■■■□□ 2.11
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TMF1P82094 1093 aa28.22■■■□□ 2.11
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CABP2Q9NPB3 220 aa28.22■■■□□ 2.11
SH3BGRL3-201ENST00000270792 EVC2Q86UK5 1308 aa28.21■■■□□ 2.11
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP28.19■■■□□ 2.1
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 ADGRB2O60241 1585 aa28.18■■■□□ 2.1
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa28.14■■■□□ 2.1
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PRR36Q9H6K5 1346 aa28.13■■■□□ 2.09
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 SLC24A1O60721 1099 aa28.13■■■□□ 2.09
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP28.11■■■□□ 2.09
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 FMN2Q9NZ56 1722 aa28.08■■■□□ 2.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MST1RQ04912 1400 aa28.07■■■□□ 2.08
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 ATP7BP35670 1465 aa28.06■■■□□ 2.08
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 ANP32CO43423 234 aa28.04■■■□□ 2.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TMC1Q8TDI8 760 aa28.04■■■□□ 2.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ORAI2Q96SN7 254 aa28.04■■■□□ 2.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 C1orf167Q5SNV9 1468 aa28.04■■■□□ 2.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SLAIN2Q9P270 581 aa28.03■■■□□ 2.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ESCO1Q5FWF5 840 aa28.03■■■□□ 2.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CABP1Q9NZU7 370 aa28.03■■■□□ 2.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CCDC61Q9Y6R9 512 aa28.03■■■□□ 2.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ATAD2Q6PL18 1390 aa28.02■■■□□ 2.08
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa28.02■■■□□ 2.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ANKARQ7Z5J8 1434 aa28.02■■■□□ 2.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP28.01■■■□□ 2.07
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 IQSEC2Q5JU85 1478 aa27.98■■■□□ 2.07
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TOM1O60784 492 aa27.96■■■□□ 2.07
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PHF8Q9UPP1 1060 aa27.96■■■□□ 2.07
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PIP4K2BP78356 416 aa27.94■■■□□ 2.06
SH3BGRL3-201ENST00000270792 BRINP3Q76B58 766 aa27.94■■■□□ 2.06
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MYOM1P52179 1685 aa27.93■■■□□ 2.06
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa27.93■■■□□ 2.06
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PLEKHG3A1L390 1219 aa27.93■■■□□ 2.06
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 CD163L1Q9NR16 1453 aa27.89■■■□□ 2.05
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 A0A1W2PP64 1363 aa27.87■■■□□ 2.05
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP27.78■■■□□ 2.04
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NPHP3Q7Z494 1330 aa27.78■■■□□ 2.04
SH3BGRL3-201ENST00000270792 USP6P35125 1406 aa27.77■■■□□ 2.04
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP27.76■■■□□ 2.03
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NSD3Q9BZ95 1437 aa27.76■■■□□ 2.03
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP27.75■■■□□ 2.03
SH3BGRL3-201ENST00000270792 AKAP12Q02952 1782 aa27.74■■■□□ 2.03
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa27.72■■■□□ 2.03
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