RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000223864.6

PLGRKT-201, Transcript of plasminogen receptor with a C-terminal lysine, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PLGRKT, Length 932 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLGRKT-201ENST00000223864 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa25.45■■□□□ 1.66
PLGRKT-201ENST00000223864 HRCP23327 699 aa25.44■■□□□ 1.66
PLGRKT-201ENST00000223864 C14orf37Q86TY3 774 aa25.43■■□□□ 1.66
PLGRKT-201ENST00000223864 CHRDL2Q6WN34 429 aa25.42■■□□□ 1.66
PLGRKT-201ENST00000223864 C19orf44Q9H6X5 657 aa25.42■■□□□ 1.66
PLGRKT-201ENST00000223864 RGL3Q3MIN7 710 aa25.41■■□□□ 1.66
PLGRKT-201ENST00000223864 SLAIN2Q9P270 581 aa25.41■■□□□ 1.66
PLGRKT-201ENST00000223864 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa25.38■■□□□ 1.65
PLGRKT-201ENST00000223864 CADPS2Q86UW7 1296 aa25.37■■□□□ 1.65
PLGRKT-201ENST00000223864 ATF3P18847 181 aa25.36■■□□□ 1.65
PLGRKT-201ENST00000223864 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa25.35■■□□□ 1.65
PLGRKT-201ENST00000223864 DCCP43146 1447 aa25.33■■□□□ 1.65
PLGRKT-201ENST00000223864 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
PLGRKT-201ENST00000223864 NALCNQ8IZF0 1738 aa25.32■■□□□ 1.64
PLGRKT-201ENST00000223864 PRAG1Q86YV5 1406 aa25.31■■□□□ 1.64
PLGRKT-201ENST00000223864 PHLPP1O60346 1717 aa25.31■■□□□ 1.64
PLGRKT-201ENST00000223864 PTCH1Q13635 1447 aa25.3■■□□□ 1.64
PLGRKT-201ENST00000223864 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa25.29■■□□□ 1.64
PLGRKT-201ENST00000223864 PIK3C2GO75747 1445 aa25.28■■□□□ 1.64
PLGRKT-201ENST00000223864 ROBO2Q9HCK4 1378 aa25.27■■□□□ 1.64
PLGRKT-201ENST00000223864 MYOM2P54296 1465 aa25.24■■□□□ 1.63
PLGRKT-201ENST00000223864 NRXN1Q9ULB1 1477 aa25.23■■□□□ 1.63
PLGRKT-201ENST00000223864 LAMC1P11047 1609 aa25.23■■□□□ 1.63
PLGRKT-201ENST00000223864 MST1RQ04912 1400 aa25.22■■□□□ 1.63
PLGRKT-201ENST00000223864 ILDR2Q71H61 639 aa25.22■■□□□ 1.63
PLGRKT-201ENST00000223864 KNDC1Q76NI1 1749 aa25.22■■□□□ 1.63
PLGRKT-201ENST00000223864 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
PLGRKT-201ENST00000223864 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
PLGRKT-201ENST00000223864 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa25.21■■□□□ 1.63
PLGRKT-201ENST00000223864 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
PLGRKT-201ENST00000223864 BRINP3Q76B58 766 aa25.19■■□□□ 1.62
PLGRKT-201ENST00000223864 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
PLGRKT-201ENST00000223864 TECPR2O15040 1411 aa25.19■■□□□ 1.62
PLGRKT-201ENST00000223864 TMEM132EQ6IEE7 984 aa25.18■■□□□ 1.62
PLGRKT-201ENST00000223864 ABCC11Q96J66 1382 aa25.18■■□□□ 1.62
PLGRKT-201ENST00000223864 STK26Q9P289 416 aa25.17■■□□□ 1.62
PLGRKT-201ENST00000223864 NHSL1Q5SYE7 1610 aa25.15■■□□□ 1.62
PLGRKT-201ENST00000223864 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
PLGRKT-201ENST00000223864 PRR29P0C7W0 189 aa25.15■■□□□ 1.62
PLGRKT-201ENST00000223864 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP25.15■■□□□ 1.62
PLGRKT-201ENST00000223864 PIP4P2Q8N4L2 257 aa25.15■■□□□ 1.62
PLGRKT-201ENST00000223864 JCADQ9P266 1359 aa25.15■■□□□ 1.62
PLGRKT-201ENST00000223864 CFAP70Q5T0N1 1121 aa25.14■■□□□ 1.62
PLGRKT-201ENST00000223864 STAC3Q96MF2 364 aa25.13■■□□□ 1.61
PLGRKT-201ENST00000223864 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa25.11■■□□□ 1.61
PLGRKT-201ENST00000223864 C1orf167Q5SNV9 1468 aa25.11■■□□□ 1.61
PLGRKT-201ENST00000223864 DCAF11Q8TEB1 546 aa25.11■■□□□ 1.61
PLGRKT-201ENST00000223864 SHPRHQ149N8 1683 aa25.1■■□□□ 1.61
PLGRKT-201ENST00000223864 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
PLGRKT-201ENST00000223864 WAPLQ7Z5K2 1190 aa25.1■■□□□ 1.61
PLGRKT-201ENST00000223864 SIRT1Q96EB6 747 aa25.09■■□□□ 1.61
PLGRKT-201ENST00000223864 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa25.09■■□□□ 1.61
PLGRKT-201ENST00000223864 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa25.05■■□□□ 1.6
PLGRKT-201ENST00000223864 ADGRB1O14514 1584 aa25.04■■□□□ 1.6
PLGRKT-201ENST00000223864 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa25.04■■□□□ 1.6
PLGRKT-201ENST00000223864 ORAI2Q96SN7 254 aa25.03■■□□□ 1.6
PLGRKT-201ENST00000223864 FMN2Q9NZ56 1722 aa25.03■■□□□ 1.6
PLGRKT-201ENST00000223864 DLC1Q96QB1 1528 aa25.02■■□□□ 1.6
PLGRKT-201ENST00000223864 CHADLQ6NUI6 762 aa25.02■■□□□ 1.6
PLGRKT-201ENST00000223864 SOCS7O14512 581 aa25.01■■□□□ 1.59
PLGRKT-201ENST00000223864 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
PLGRKT-201ENST00000223864 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
PLGRKT-201ENST00000223864 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
PLGRKT-201ENST00000223864 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
PLGRKT-201ENST00000223864 PRAM1Q96QH2 718 aa24.97■■□□□ 1.59
PLGRKT-201ENST00000223864 CREBZFQ9NS37 354 aa24.97■■□□□ 1.59
PLGRKT-201ENST00000223864 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa24.97■■□□□ 1.59
PLGRKT-201ENST00000223864 LRP6O75581 1613 aa24.97■■□□□ 1.59
PLGRKT-201ENST00000223864 ESCO1Q5FWF5 840 aa24.96■■□□□ 1.59
PLGRKT-201ENST00000223864 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
PLGRKT-201ENST00000223864 POGKQ9P215 609 aa24.95■■□□□ 1.58
PLGRKT-201ENST00000223864 FBXO3Q9UK99 471 aa24.94■■□□□ 1.58
PLGRKT-201ENST00000223864 TRAK1Q9UPV9 953 aa24.94■■□□□ 1.58
PLGRKT-201ENST00000223864 NUTM2FA1L443 756 aa24.93■■□□□ 1.58
PLGRKT-201ENST00000223864 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
PLGRKT-201ENST00000223864 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP24.92■■□□□ 1.58
PLGRKT-201ENST00000223864 PNPLA6Q8IY17 1366 aa24.92■■□□□ 1.58
PLGRKT-201ENST00000223864 KIF1AQ12756 1690 aa24.91■■□□□ 1.58
PLGRKT-201ENST00000223864 NPHP3Q7Z494 1330 aa24.91■■□□□ 1.58
PLGRKT-201ENST00000223864 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
PLGRKT-201ENST00000223864 ADGRB2O60241 1585 aa24.9■■□□□ 1.58
PLGRKT-201ENST00000223864 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
PLGRKT-201ENST00000223864 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
PLGRKT-201ENST00000223864 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.58
PLGRKT-201ENST00000223864 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.58
PLGRKT-201ENST00000223864 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.58
PLGRKT-201ENST00000223864 FOXO3O43524 673 aa24.88■■□□□ 1.57
PLGRKT-201ENST00000223864 POTEAQ6S8J7 498 aa24.87■■□□□ 1.57
PLGRKT-201ENST00000223864 PXDNQ92626 1479 aa24.87■■□□□ 1.57
PLGRKT-201ENST00000223864 SIN3AQ96ST3 1273 aa24.86■■□□□ 1.57
PLGRKT-201ENST00000223864 USP32Q8NFA0 1604 aa24.84■■□□□ 1.57
PLGRKT-201ENST00000223864 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
PLGRKT-201ENST00000223864 L3MBTL2Q969R5 705 aa24.84■■□□□ 1.57
PLGRKT-201ENST00000223864 VASPP50552 380 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
PLGRKT-201ENST00000223864 POTEHQ6S545 545 aa24.82■■□□□ 1.56
PLGRKT-201ENST00000223864 ANKARQ7Z5J8 1434 aa24.82■■□□□ 1.56
PLGRKT-201ENST00000223864 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
PLGRKT-201ENST00000223864 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
PLGRKT-201ENST00000223864 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
PLGRKT-201ENST00000223864 PHF8Q9UPP1 1060 aa24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50 ms