RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000219479.6

NME4-201, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NME4, Length 995 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME4-201ENST00000219479 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP32.02■■■□□ 2.72
NME4-201ENST00000219479 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP32■■■□□ 2.71
NME4-201ENST00000219479 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa32■■■□□ 2.71
NME4-201ENST00000219479 ADAMTS2O95450 1211 aa31.99■■■□□ 2.71
NME4-201ENST00000219479 HRCP23327 699 aa31.99■■■□□ 2.71
NME4-201ENST00000219479 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP31.99■■■□□ 2.71
NME4-201ENST00000219479 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa31.98■■■□□ 2.71
NME4-201ENST00000219479 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP31.97■■■□□ 2.71
NME4-201ENST00000219479 NGLY1Q96IV0 654 aa31.95■■■□□ 2.71
NME4-201ENST00000219479 IFT172Q9UG01 1749 aa31.93■■■□□ 2.7
NME4-201ENST00000219479 MYOM2P54296 1465 aa31.87■■■□□ 2.69
NME4-201ENST00000219479 PXDNQ92626 1479 aa31.87■■■□□ 2.69
NME4-201ENST00000219479 KNDC1Q76NI1 1749 aa31.86■■■□□ 2.69
NME4-201ENST00000219479 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP31.86■■■□□ 2.69
NME4-201ENST00000219479 TECPR2O15040 1411 aa31.86■■■□□ 2.69
NME4-201ENST00000219479 PIK3C2GO75747 1445 aa31.86■■■□□ 2.69
NME4-201ENST00000219479 STK26Q9P289 416 aa31.86■■■□□ 2.69
NME4-201ENST00000219479 USP21Q9UK80 565 aa31.86■■■□□ 2.69
NME4-201ENST00000219479 NPHP3Q7Z494 1330 aa31.84■■■□□ 2.69
NME4-201ENST00000219479 ESCO1Q5FWF5 840 aa31.84■■■□□ 2.69
NME4-201ENST00000219479 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP31.83■■■□□ 2.69
NME4-201ENST00000219479 ATRNO75882 1429 aa31.83■■■□□ 2.69
NME4-201ENST00000219479 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP31.82■■■□□ 2.68
NME4-201ENST00000219479 TMEM132EQ6IEE7 984 aa31.81■■■□□ 2.68
NME4-201ENST00000219479 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP31.81■■■□□ 2.68
NME4-201ENST00000219479 WAPLQ7Z5K2 1190 aa31.79■■■□□ 2.68
NME4-201ENST00000219479 FMN2Q9NZ56 1722 aa31.78■■■□□ 2.68
NME4-201ENST00000219479 ATAD2Q6PL18 1390 aa31.78■■■□□ 2.68
NME4-201ENST00000219479 FOXO3O43524 673 aa31.77■■■□□ 2.68
NME4-201ENST00000219479 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP31.77■■■□□ 2.68
NME4-201ENST00000219479 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa31.77■■■□□ 2.68
NME4-201ENST00000219479 EP400Q96L91 3159 aa31.76■■■□□ 2.67
NME4-201ENST00000219479 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP31.76■■■□□ 2.67
NME4-201ENST00000219479 ABCC11Q96J66 1382 aa31.76■■■□□ 2.67
NME4-201ENST00000219479 NUTM2FA1L443 756 aa31.75■■■□□ 2.67
NME4-201ENST00000219479 NRXN1Q9ULB1 1477 aa31.75■■■□□ 2.67
NME4-201ENST00000219479 BCL9LQ86UU0 1499 aa31.74■■■□□ 2.67
NME4-201ENST00000219479 CFAP70Q5T0N1 1121 aa31.74■■■□□ 2.67
NME4-201ENST00000219479 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa31.73■■■□□ 2.67
NME4-201ENST00000219479 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP31.73■■■□□ 2.67
NME4-201ENST00000219479 KIF1AQ12756 1690 aa31.73■■■□□ 2.67
NME4-201ENST00000219479 DCAF11Q8TEB1 546 aa31.72■■■□□ 2.67
NME4-201ENST00000219479 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP31.71■■■□□ 2.67
NME4-201ENST00000219479 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP31.7■■■□□ 2.67
NME4-201ENST00000219479 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP31.68■■■□□ 2.66
NME4-201ENST00000219479 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa31.68■■■□□ 2.66
NME4-201ENST00000219479 STAC3Q96MF2 364 aa31.67■■■□□ 2.66
NME4-201ENST00000219479 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa31.63■■■□□ 2.65
NME4-201ENST00000219479 USP32Q8NFA0 1604 aa31.63■■■□□ 2.65
NME4-201ENST00000219479 SIRT1Q96EB6 747 aa31.62■■■□□ 2.65
NME4-201ENST00000219479 SLIT2O94813 1529 aa31.6■■■□□ 2.65
NME4-201ENST00000219479 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP31.6■■■□□ 2.65
NME4-201ENST00000219479 GLI3P10071 1580 aa31.6■■■□□ 2.65
NME4-201ENST00000219479 POGKQ9P215 609 aa31.58■■■□□ 2.65
NME4-201ENST00000219479 PRAM1Q96QH2 718 aa31.57■■■□□ 2.64
NME4-201ENST00000219479 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP31.56■■■□□ 2.644e-27■■■■■ 42.2
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NME4-201ENST00000219479 RALGAPBQ86X10 1494 aa31.56■■■□□ 2.64
NME4-201ENST00000219479 TNS3Q68CZ2 1445 aa31.55■■■□□ 2.64
NME4-201ENST00000219479 ABCA3Q99758 1704 aa31.55■■■□□ 2.64
NME4-201ENST00000219479 UNC5CLQ8IV45 518 aa31.54■■■□□ 2.64
NME4-201ENST00000219479 PHF8Q9UPP1 1060 aa31.53■■■□□ 2.64
NME4-201ENST00000219479 TRAK1Q9UPV9 953 aa31.53■■■□□ 2.64
NME4-201ENST00000219479 BRWD3Q6RI45 1802 aa31.53■■■□□ 2.64
NME4-201ENST00000219479 PLCH1Q4KWH8 1693 aa31.52■■■□□ 2.64
NME4-201ENST00000219479 ADGRB1O14514 1584 aa31.51■■■□□ 2.63
NME4-201ENST00000219479 CCDC125Q86Z20 511 aa31.5■■■□□ 2.63
NME4-201ENST00000219479 DLC1Q96QB1 1528 aa31.49■■■□□ 2.63
NME4-201ENST00000219479 NWD2Q9ULI1 1742 aa31.49■■■□□ 2.63
NME4-201ENST00000219479 ADGRB2O60241 1585 aa31.47■■■□□ 2.63
NME4-201ENST00000219479 SBNO1A3KN83 1393 aa31.46■■■□□ 2.63
NME4-201ENST00000219479 ZRANB1Q9UGI0 708 aa31.46■■■□□ 2.63
NME4-201ENST00000219479 PSME1Q06323 249 aa31.45■■■□□ 2.63
NME4-201ENST00000219479 CABLES1Q8TDN4 633 aa31.45■■■□□ 2.63
NME4-201ENST00000219479 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP31.44■■■□□ 2.62
NME4-201ENST00000219479 ANKARQ7Z5J8 1434 aa31.42■■■□□ 2.62
NME4-201ENST00000219479 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP31.41■■■□□ 2.62
NME4-201ENST00000219479 PLEKHG5O94827 1062 aa31.41■■■□□ 2.62
NME4-201ENST00000219479 ARHGEF10O15013 1369 aa31.41■■■□□ 2.62
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NME4-201ENST00000219479 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP31.4■■■□□ 2.62
NME4-201ENST00000219479 VPS72Q15906 364 aa31.39■■■□□ 2.62
NME4-201ENST00000219479 LMOD2Q6P5Q4 547 aa31.38■■■□□ 2.61
NME4-201ENST00000219479 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa31.37■■■□□ 2.61
NME4-201ENST00000219479 NRAPQ86VF7 1730 aa31.36■■■□□ 2.61
NME4-201ENST00000219479 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP31.36■■■□□ 2.61
NME4-201ENST00000219479 NEUROD1Q13562 356 aa31.36■■■□□ 2.61
NME4-201ENST00000219479 SEPT12Q8IYM1 358 aa31.36■■■□□ 2.61
NME4-201ENST00000219479 ALS2Q96Q42 1657 aa31.35■■■□□ 2.61
NME4-201ENST00000219479 SIN3AQ96ST3 1273 aa31.35■■■□□ 2.61
NME4-201ENST00000219479 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP31.34■■■□□ 2.61
NME4-201ENST00000219479 L3MBTL2Q969R5 705 aa31.32■■■□□ 2.6
NME4-201ENST00000219479 TULP4Q9NRJ4 1543 aa31.31■■■□□ 2.6
NME4-201ENST00000219479 FAM83GA6ND36 823 aa31.31■■■□□ 2.6
NME4-201ENST00000219479 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP31.31■■■□□ 2.6
NME4-201ENST00000219479 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP31.31■■■□□ 2.6
NME4-201ENST00000219479 WASLO00401 505 aaPredicted RBP31.29■■■□□ 2.6
NME4-201ENST00000219479 DEFB132Q7Z7B7 95 aa31.29■■■□□ 2.6
NME4-201ENST00000219479 PRR36Q9H6K5 1346 aa31.28■■■□□ 2.6
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