RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000089245.6

Shq1-201, Transcript of Protein SHQ1 homolog, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Shq1, Length 1,638 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1-201ENSMUST00000089245 Ppargc1bQ8VHJ7 1014 aa26.9■■□□□ 1.9
Shq1-201ENSMUST00000089245 Srcin1Q9QWI6 1250 aa26.9■■□□□ 1.9
Shq1-201ENSMUST00000089245 Rreb1Q3UH06 1700 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.9
Shq1-201ENSMUST00000089245 Atp2b2Q9R0K7 1198 aa26.89■■□□□ 1.9
Shq1-201ENSMUST00000089245 Nphp4P59240 1425 aa26.89■■□□□ 1.89
Shq1-201ENSMUST00000089245 Ecm2Q5FW85 670 aa26.88■■□□□ 1.89
Shq1-201ENSMUST00000089245 Iqsec2Q5DU25 1478 aa26.88■■□□□ 1.89
Shq1-201ENSMUST00000089245 RalgapbQ8BQZ4 1484 aa26.88■■□□□ 1.89
Shq1-201ENSMUST00000089245 Gm10563F6WIE4 79 aa26.87■■□□□ 1.89
Shq1-201ENSMUST00000089245 Mink1Q9JM52 1308 aa26.87■■□□□ 1.89
Shq1-201ENSMUST00000089245 Itsn2Q9Z0R6 1659 aa26.85■■□□□ 1.89
Shq1-201ENSMUST00000089245 Nwd1A6H603 1563 aa26.85■■□□□ 1.89
Shq1-201ENSMUST00000089245 DnmbpQ6TXD4 1580 aa26.85■■□□□ 1.89
Shq1-201ENSMUST00000089245 NalcnQ8BXR5 1738 aa26.83■■□□□ 1.89
Shq1-201ENSMUST00000089245 Usp32F8VPZ3 1604 aa26.82■■□□□ 1.88
Shq1-201ENSMUST00000089245 Las1lA2BE28 776 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
Shq1-201ENSMUST00000089245 Gimap5Q8BWF2 308 aa26.79■■□□□ 1.88
Shq1-201ENSMUST00000089245 C3P01027 1663 aa26.79■■□□□ 1.88
Shq1-201ENSMUST00000089245 Rock2P70336 1388 aa26.78■■□□□ 1.88
Shq1-201ENSMUST00000089245 Abca14E9Q8F8 1683 aa26.78■■□□□ 1.88
Shq1-201ENSMUST00000089245 D430041D05RikF6ZGR6 1678 aa26.78■■□□□ 1.88
Shq1-201ENSMUST00000089245 CenpjQ569L8 1344 aa26.77■■□□□ 1.88
Shq1-201ENSMUST00000089245 Tom1O88746 492 aa26.76■■□□□ 1.87
Shq1-201ENSMUST00000089245 Pik3c2bE9QAN8 1632 aa26.74■■□□□ 1.87
Shq1-201ENSMUST00000089245 Cdk19Q8BWD8 501 aa26.72■■□□□ 1.87
Shq1-201ENSMUST00000089245 Gm16486A0A1D5RMD1 1434 aa26.71■■□□□ 1.87
Shq1-201ENSMUST00000089245 Sox12Q04890 314 aa26.69■■□□□ 1.86
Shq1-201ENSMUST00000089245 Ttll13A4Q9F6 804 aa26.68■■□□□ 1.86
Shq1-201ENSMUST00000089245 C5P06684 1680 aa26.68■■□□□ 1.86
Shq1-201ENSMUST00000089245 Sipa1l2Q80TE4 1722 aa26.67■■□□□ 1.86
Shq1-201ENSMUST00000089245 NgefQ8CHT1 710 aa26.66■■□□□ 1.86
Shq1-201ENSMUST00000089245 Als2Q920R0 1651 aa26.66■■□□□ 1.86
Shq1-201ENSMUST00000089245 Idi1P58044 227 aa26.65■■□□□ 1.86
Shq1-201ENSMUST00000089245 Znf316Q6PGE4 1016 aa26.64■■□□□ 1.85
Shq1-201ENSMUST00000089245 Gsto1O09131 240 aa26.63■■□□□ 1.85
Shq1-201ENSMUST00000089245 Kcna6Q61923 529 aa26.63■■□□□ 1.85
Shq1-201ENSMUST00000089245 Farp2Q91VS8 1065 aa26.62■■□□□ 1.85
Shq1-201ENSMUST00000089245 Sirt1Q923E4 737 aa26.62■■□□□ 1.85
Shq1-201ENSMUST00000089245 Pik3c2aQ61194 1686 aa26.62■■□□□ 1.85
Shq1-201ENSMUST00000089245 GnpatP98192 678 aa26.61■■□□□ 1.85
Shq1-201ENSMUST00000089245 Exosc9Q9JHI7 438 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
Shq1-201ENSMUST00000089245 Ap3b2Q9JME5 1082 aa26.61■■□□□ 1.85
Shq1-201ENSMUST00000089245 Cwc22Q8C5N3 908 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
Shq1-201ENSMUST00000089245 Pola1P33609 1465 aa26.59■■□□□ 1.85
Shq1-201ENSMUST00000089245 Zranb1Q7M760 708 aa26.58■■□□□ 1.85
Shq1-201ENSMUST00000089245 Tnrc6bQ8BKI2 1810 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
Shq1-201ENSMUST00000089245 KdrP35918 1367 aa26.58■■□□□ 1.85
Shq1-201ENSMUST00000089245 Tmem2Q5FWI3 1383 aa26.56■■□□□ 1.84
Shq1-201ENSMUST00000089245 Wnk3Q80XP9 1757 aa26.56■■□□□ 1.84
Shq1-201ENSMUST00000089245 NktrP30415 1453 aa26.55■■□□□ 1.84
Shq1-201ENSMUST00000089245 Sin3aQ60520 1274 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
Shq1-201ENSMUST00000089245 Qtrt2B8ZXI1 415 aa26.54■■□□□ 1.84
Shq1-201ENSMUST00000089245 Ddx17Q501J6 650 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
Shq1-201ENSMUST00000089245 Kif24Q6NWW5 1356 aa26.53■■□□□ 1.84
Shq1-201ENSMUST00000089245 Abcc10Q8R4P9 1501 aa26.53■■□□□ 1.84
Shq1-201ENSMUST00000089245 Slc5a4bQ91ZP4 660 aa26.53■■□□□ 1.84
Shq1-201ENSMUST00000089245 InsrP15208 1372 aa26.53■■□□□ 1.84
Shq1-201ENSMUST00000089245 FanciQ8K368 1330 aa26.52■■□□□ 1.84
Shq1-201ENSMUST00000089245 Slc24a1Q91WD8 1130 aa26.51■■□□□ 1.83
Shq1-201ENSMUST00000089245 DccP70211 1447 aa26.51■■□□□ 1.83
Shq1-201ENSMUST00000089245 Cnga1P29974 684 aa26.5■■□□□ 1.83
Shq1-201ENSMUST00000089245 Idi2Q8BFZ6 227 aa26.48■■□□□ 1.83
Shq1-201ENSMUST00000089245 N4bp2F8VQG7 1678 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
Shq1-201ENSMUST00000089245 Camta1A2A891 1682 aa26.46■■□□□ 1.83
Shq1-201ENSMUST00000089245 Kif1aP33173 1695 aa26.45■■□□□ 1.83
Shq1-201ENSMUST00000089245 Map3k19E9Q3S4 1311 aa26.43■■□□□ 1.82
Shq1-201ENSMUST00000089245 Wdr17E9Q271 1322 aa26.42■■□□□ 1.82
Shq1-201ENSMUST00000089245 Mon2Q80TL7 1715 aa26.4■■□□□ 1.82
Shq1-201ENSMUST00000089245 PtpruB1AUH1 1446 aa26.4■■□□□ 1.82
Shq1-201ENSMUST00000089245 Ybx3Q9JKB3 361 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
Shq1-201ENSMUST00000089245 Zfp142G5E869 1843 aa26.4■■□□□ 1.82
Shq1-201ENSMUST00000089245 CatipB9EKE5 520 aa26.39■■□□□ 1.82
Shq1-201ENSMUST00000089245 Fyb1O35601 819 aa26.39■■□□□ 1.81
Shq1-201ENSMUST00000089245 Nyap1Q6PFX7 833 aa26.37■■□□□ 1.81
Shq1-201ENSMUST00000089245 Slc35g1Q8BY79 368 aa26.35■■□□□ 1.81
Shq1-201ENSMUST00000089245 Slc4a1apE9PX68 744 aa26.34■■□□□ 1.81
Shq1-201ENSMUST00000089245 Ggt6Q6PDE7 497 aa26.34■■□□□ 1.81
Shq1-201ENSMUST00000089245 Znf526Q8BI66 675 aa26.33■■□□□ 1.81
Shq1-201ENSMUST00000089245 Bcl2l12Q9D3J3 255 aa26.29■■□□□ 1.8
Shq1-201ENSMUST00000089245 Znf335A2A5K6 1337 aa26.28■■□□□ 1.8
Shq1-201ENSMUST00000089245 Dixdc1Q80Y83 711 aa26.28■■□□□ 1.8
Shq1-201ENSMUST00000089245 Cadps2Q8BYR5 1297 aa26.28■■□□□ 1.8
Shq1-201ENSMUST00000089245 Prdm10Q3UTQ7 1184 aa26.27■■□□□ 1.8
Shq1-201ENSMUST00000089245 TimelessQ9R1X4 1197 aa26.27■■□□□ 1.8
Shq1-201ENSMUST00000089245 Atp7bQ64446 1462 aa26.26■■□□□ 1.79
Shq1-201ENSMUST00000089245 Marf1Q8BJ34 1730 aaKnown RBP26.25■■□□□ 1.79
Shq1-201ENSMUST00000089245 Frmpd2A0A140LI67 1392 aa26.25■■□□□ 1.79
Shq1-201ENSMUST00000089245 Kif16bB1AVY7 1312 aa26.24■■□□□ 1.79
Shq1-201ENSMUST00000089245 Adgrl1Q80TR1 1466 aa26.24■■□□□ 1.79
Shq1-201ENSMUST00000089245 Fam184bQ0KK56 942 aa26.24■■□□□ 1.79
Shq1-201ENSMUST00000089245 Smim5Q8BT42 78 aa26.24■■□□□ 1.79
Shq1-201ENSMUST00000089245 Acsbg1Q99PU5 721 aa26.24■■□□□ 1.79
Shq1-201ENSMUST00000089245 Sbno1Q689Z5 1390 aa26.23■■□□□ 1.79
Shq1-201ENSMUST00000089245 Nrxn1Q9CS84 1514 aa26.23■■□□□ 1.79
Shq1-201ENSMUST00000089245 Tmf1B9EKI3 1091 aa26.22■■□□□ 1.79
Shq1-201ENSMUST00000089245 Sema6bO54951 886 aa26.22■■□□□ 1.79
Shq1-201ENSMUST00000089245 Atp10bB1AWN4 1474 aa26.22■■□□□ 1.79
Shq1-201ENSMUST00000089245 Pank3Q8R2W9 370 aa26.21■■□□□ 1.79
Shq1-201ENSMUST00000089245 NinlQ6ZQ12 1394 aa26.21■■□□□ 1.79
Shq1-201ENSMUST00000089245 Gimap6Q8K349 305 aa26.2■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 16.6 ms