RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000051221.12

Ankrd40-202, Transcript of Ankyrin repeat domain-containing protein 40, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ankrd40, Length 1,477 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Mink1Q9JM52 1308 aa43.27■■■■■ 4.52
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Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Gimap5Q8BWF2 308 aa42.69■■■■■ 4.42
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Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Ttll13A4Q9F6 804 aa42.61■■■■■ 4.41
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Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Adgrl1Q80TR1 1466 aa42.52■■■■■ 4.4
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Ankrd40-202ENSMUST00000051221 NinlQ6ZQ12 1394 aa42.37■■■■■ 4.37
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Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Atp7bQ64446 1462 aa42.22■■■■■ 4.35
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Slc5a4bQ91ZP4 660 aa42.21■■■■■ 4.35
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Ybx3Q9JKB3 361 aaKnown RBP42.21■■■■■ 4.35
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