RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027809.7

Opn3-201, Transcript of Opsin-3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Opn3, Length 1,913 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn3-201ENSMUST00000027809 Utp14aQ640M1 767 aaKnown RBP29.92■■■□□ 2.38
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Opn3-201ENSMUST00000027809 Tex14Q7M6U3 1450 aa29.89■■■□□ 2.38
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Opn3-201ENSMUST00000027809 Als2Q920R0 1651 aa29.43■■■□□ 2.3
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Opn3-201ENSMUST00000027809 Kif1aP33173 1695 aa29.39■■■□□ 2.3
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Opn3-201ENSMUST00000027809 Tmem94Q7TSH8 1360 aa29.27■■■□□ 2.28
Opn3-201ENSMUST00000027809 Gm10563F6WIE4 79 aa29.25■■■□□ 2.27
Opn3-201ENSMUST00000027809 Col14a1Q80X19 1797 aa29.24■■■□□ 2.27
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Opn3-201ENSMUST00000027809 Astn2Q80Z10 1352 aa29.22■■■□□ 2.27
Opn3-201ENSMUST00000027809 Eif5bQ05D44 1216 aaKnown RBP29.21■■■□□ 2.27
Opn3-201ENSMUST00000027809 Golga2Q921M4 999 aa29.21■■■□□ 2.27
Opn3-201ENSMUST00000027809 Idi1P58044 227 aa29.2■■■□□ 2.26
Opn3-201ENSMUST00000027809 Scn4aQ9ER60 1841 aa29.18■■■□□ 2.26
Opn3-201ENSMUST00000027809 Hoxb7P09024 217 aa29.18■■■□□ 2.26
Opn3-201ENSMUST00000027809 Trim28Q62318 834 aa29.18■■■□□ 2.26
Opn3-201ENSMUST00000027809 Kank1E9Q238 1360 aa29.17■■■□□ 2.26
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Opn3-201ENSMUST00000027809 Rad21Q61550 635 aaKnown RBP29.16■■■□□ 2.26
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