RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027809.7

Opn3-201, Transcript of Opsin-3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Opn3, Length 1,913 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn3-201ENSMUST00000027809 Utp14aQ640M1 767 aaKnown RBP29.92■■■□□ 2.38
Opn3-201ENSMUST00000027809 Nwd1A6H603 1563 aa29.92■■■□□ 2.38
Opn3-201ENSMUST00000027809 Lmtk3Q5XJV6 1424 aa29.92■■■□□ 2.38
Opn3-201ENSMUST00000027809 NrdcQ8BHG1 1161 aa29.91■■■□□ 2.38
Opn3-201ENSMUST00000027809 Asxl2Q8BZ32 1370 aa29.9■■■□□ 2.38
Opn3-201ENSMUST00000027809 Tex14Q7M6U3 1450 aa29.89■■■□□ 2.38
Opn3-201ENSMUST00000027809 Cps1Q8C196 1500 aa29.88■■■□□ 2.37
Opn3-201ENSMUST00000027809 NktrP30415 1453 aa29.88■■■□□ 2.37
Opn3-201ENSMUST00000027809 Gprasp1Q5U4C1 1347 aa29.88■■■□□ 2.37
Opn3-201ENSMUST00000027809 IghaA0A0A6YXW6 389 aa29.87■■■□□ 2.37
Opn3-201ENSMUST00000027809 Arap3Q8R5G7 1538 aa29.87■■■□□ 2.37
Opn3-201ENSMUST00000027809 PzpQ61838 1495 aa29.87■■■□□ 2.37
Opn3-201ENSMUST00000027809 Znf710Q3U288 666 aa29.84■■■□□ 2.37
Opn3-201ENSMUST00000027809 Mink1Q9JM52 1308 aa29.83■■■□□ 2.37
Opn3-201ENSMUST00000027809 Pik3r4Q8VD65 1358 aa29.83■■■□□ 2.37
Opn3-201ENSMUST00000027809 Rpgrip1lQ8CG73 1264 aa29.83■■■□□ 2.37
Opn3-201ENSMUST00000027809 Atp2b2Q9R0K7 1198 aa29.81■■■□□ 2.36
Opn3-201ENSMUST00000027809 Topaz1E5FYH1 1653 aa29.81■■■□□ 2.36
Opn3-201ENSMUST00000027809 Nrxn1Q9CS84 1514 aa29.81■■■□□ 2.36
Opn3-201ENSMUST00000027809 KdrP35918 1367 aa29.81■■■□□ 2.36
Opn3-201ENSMUST00000027809 Rab3gap2Q8BMG7 1366 aa29.81■■■□□ 2.36
Opn3-201ENSMUST00000027809 Cnga1P29974 684 aa29.79■■■□□ 2.36
Opn3-201ENSMUST00000027809 Kif7B7ZNG0 1348 aa29.78■■■□□ 2.36
Opn3-201ENSMUST00000027809 Ppp2r1aQ76MZ3 589 aa29.77■■■□□ 2.36
Opn3-201ENSMUST00000027809 MyclP10166 368 aa29.75■■■□□ 2.35
Opn3-201ENSMUST00000027809 GphnQ8BUV3 769 aaKnown RBP29.75■■■□□ 2.35
Opn3-201ENSMUST00000027809 Exosc9Q9JHI7 438 aaKnown RBP29.75■■■□□ 2.35
Opn3-201ENSMUST00000027809 Dcaf11Q91VU6 549 aa29.74■■■□□ 2.35
Opn3-201ENSMUST00000027809 Gsto1O09131 240 aa29.73■■■□□ 2.35
Opn3-201ENSMUST00000027809 Adgrl1Q80TR1 1466 aa29.73■■■□□ 2.35
Opn3-201ENSMUST00000027809 Cdk19Q8BWD8 501 aa29.72■■■□□ 2.35
Opn3-201ENSMUST00000027809 Usp32F8VPZ3 1604 aa29.72■■■□□ 2.35
Opn3-201ENSMUST00000027809 Zscan21Q07231 555 aa29.71■■■□□ 2.35
Opn3-201ENSMUST00000027809 Q7TT23 1179 aa29.71■■■□□ 2.35
Opn3-201ENSMUST00000027809 FanciQ8K368 1330 aa29.69■■■□□ 2.34
Opn3-201ENSMUST00000027809 MlecQ6ZQI3 291 aaKnown RBP29.68■■■□□ 2.34
Opn3-201ENSMUST00000027809 Atf7ipQ7TT18 1306 aa29.66■■■□□ 2.34
Opn3-201ENSMUST00000027809 Zranb1Q7M760 708 aa29.63■■■□□ 2.33
Opn3-201ENSMUST00000027809 Pik3c2bE9QAN8 1632 aa29.62■■■□□ 2.33
Opn3-201ENSMUST00000027809 Rimbp3Q3V0F0 1606 aa29.61■■■□□ 2.33
Opn3-201ENSMUST00000027809 Scaf11E9PZM7 1456 aaKnown RBP29.61■■■□□ 2.33
Opn3-201ENSMUST00000027809 HnrnpmQ9D0E1 729 aaKnown RBP29.6■■■□□ 2.33
Opn3-201ENSMUST00000027809 Tnnt3Q9QZ47 272 aa29.59■■■□□ 2.33
Opn3-201ENSMUST00000027809 Rreb1Q3UH06 1700 aaKnown RBP29.58■■■□□ 2.33
Opn3-201ENSMUST00000027809 Rims2Q9EQZ7 1530 aa29.55■■■□□ 2.32
Opn3-201ENSMUST00000027809 PtpruB1AUH1 1446 aa29.55■■■□□ 2.32
Opn3-201ENSMUST00000027809 Map3k19E9Q3S4 1311 aa29.54■■■□□ 2.32
Opn3-201ENSMUST00000027809 Med1Q925J9 1575 aa29.53■■■□□ 2.32
Opn3-201ENSMUST00000027809 NinlQ6ZQ12 1394 aa29.53■■■□□ 2.32
Opn3-201ENSMUST00000027809 D430041D05RikF6ZGR6 1678 aa29.52■■■□□ 2.32
Opn3-201ENSMUST00000027809 Mak16Q8BGS0 296 aaKnown RBP29.51■■■□□ 2.32
Opn3-201ENSMUST00000027809 Prdm10Q3UTQ7 1184 aa29.5■■■□□ 2.31
Opn3-201ENSMUST00000027809 Sirt1Q923E4 737 aa29.5■■■□□ 2.31
Opn3-201ENSMUST00000027809 Idi2Q8BFZ6 227 aa29.48■■■□□ 2.31
Opn3-201ENSMUST00000027809 Tnrc6bQ8BKI2 1810 aaKnown RBP29.48■■■□□ 2.31
Opn3-201ENSMUST00000027809 Q3UJC8 639 aa29.47■■■□□ 2.31
Opn3-201ENSMUST00000027809 IbtkQ6ZPR6 1352 aaKnown RBP29.47■■■□□ 2.31
Opn3-201ENSMUST00000027809 Phlpp1Q8CHE4 1687 aa29.47■■■□□ 2.31
Opn3-201ENSMUST00000027809 Cald1E9QA15 768 aaKnown RBP29.47■■■□□ 2.31
Opn3-201ENSMUST00000027809 Nlrp6Q91WS2 869 aa29.47■■■□□ 2.31
Opn3-201ENSMUST00000027809 Kif20bQ80WE4 1774 aaKnown RBP29.46■■■□□ 2.31
Opn3-201ENSMUST00000027809 N4bp2F8VQG7 1678 aaKnown RBP29.45■■■□□ 2.3
Opn3-201ENSMUST00000027809 Ofd1Q80Z25 1017 aa29.45■■■□□ 2.3
Opn3-201ENSMUST00000027809 Thsd7aQ69ZU6 1645 aa29.45■■■□□ 2.3
Opn3-201ENSMUST00000027809 C5P06684 1680 aa29.44■■■□□ 2.3
Opn3-201ENSMUST00000027809 Als2Q920R0 1651 aa29.43■■■□□ 2.3
Opn3-201ENSMUST00000027809 Kiaa1107Q80TK0 1369 aa29.41■■■□□ 2.3
Opn3-201ENSMUST00000027809 Kif1aP33173 1695 aa29.39■■■□□ 2.3
Opn3-201ENSMUST00000027809 Abcc10Q8R4P9 1501 aa29.38■■■□□ 2.29
Opn3-201ENSMUST00000027809 CatipB9EKE5 520 aa29.37■■■□□ 2.29
Opn3-201ENSMUST00000027809 Nrxn3Q6P9K9 1571 aa29.37■■■□□ 2.29
Opn3-201ENSMUST00000027809 Esx1O88933 382 aa29.36■■■□□ 2.29
Opn3-201ENSMUST00000027809 P2rx7Q9Z1M0 595 aa29.36■■■□□ 2.29
Opn3-201ENSMUST00000027809 Mon2Q80TL7 1715 aa29.35■■■□□ 2.29
Opn3-201ENSMUST00000027809 Iqsec2Q5DU25 1478 aa29.34■■■□□ 2.29
Opn3-201ENSMUST00000027809 Znf316Q6PGE4 1016 aa29.33■■■□□ 2.29
Opn3-201ENSMUST00000027809 Tns3Q5SSZ5 1440 aa29.32■■■□□ 2.28
Opn3-201ENSMUST00000027809 Unc13bQ9Z1N9 1602 aa29.32■■■□□ 2.28
Opn3-201ENSMUST00000027809 Zfp444Q3TDV8 331 aaKnown RBP29.32■■■□□ 2.28
Opn3-201ENSMUST00000027809 Usp19Q3UJD6 1360 aa29.31■■■□□ 2.28
Opn3-201ENSMUST00000027809 Znf335A2A5K6 1337 aa29.29■■■□□ 2.28
Opn3-201ENSMUST00000027809 C3P01027 1663 aa29.29■■■□□ 2.28
Opn3-201ENSMUST00000027809 NalcnQ8BXR5 1738 aa29.29■■■□□ 2.28
Opn3-201ENSMUST00000027809 GsdmaQ9EST1 446 aa29.28■■■□□ 2.28
Opn3-201ENSMUST00000027809 Brwd3A2AHJ4 1799 aa29.27■■■□□ 2.28
Opn3-201ENSMUST00000027809 Kif16bB1AVY7 1312 aa29.27■■■□□ 2.28
Opn3-201ENSMUST00000027809 Tmem94Q7TSH8 1360 aa29.27■■■□□ 2.28
Opn3-201ENSMUST00000027809 Gm10563F6WIE4 79 aa29.25■■■□□ 2.27
Opn3-201ENSMUST00000027809 Col14a1Q80X19 1797 aa29.24■■■□□ 2.27
Opn3-201ENSMUST00000027809 Map4k4P97820 1233 aaKnown RBP29.22■■■□□ 2.27
Opn3-201ENSMUST00000027809 Astn2Q80Z10 1352 aa29.22■■■□□ 2.27
Opn3-201ENSMUST00000027809 Eif5bQ05D44 1216 aaKnown RBP29.21■■■□□ 2.27
Opn3-201ENSMUST00000027809 Golga2Q921M4 999 aa29.21■■■□□ 2.27
Opn3-201ENSMUST00000027809 Idi1P58044 227 aa29.2■■■□□ 2.26
Opn3-201ENSMUST00000027809 Scn4aQ9ER60 1841 aa29.18■■■□□ 2.26
Opn3-201ENSMUST00000027809 Hoxb7P09024 217 aa29.18■■■□□ 2.26
Opn3-201ENSMUST00000027809 Trim28Q62318 834 aa29.18■■■□□ 2.26
Opn3-201ENSMUST00000027809 Kank1E9Q238 1360 aa29.17■■■□□ 2.26
Opn3-201ENSMUST00000027809 CrbnQ8C7D2 445 aa29.16■■■□□ 2.26
Opn3-201ENSMUST00000027809 Rad21Q61550 635 aaKnown RBP29.16■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 39.8 ms