RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000001226.9

Sh3bp1-201, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

TSL 5 BASIC

Gene Sh3bp1, Length 2,510 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Sart3Q9JLI8 962 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
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Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Puf60Q3UEB3 564 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 PtprtQ99M80 1454 aa22.16■■□□□ 1.14
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ralbp1Q62172 648 aa22.16■■□□□ 1.14
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Iqsec2Q5DU25 1478 aa22.15■■□□□ 1.14
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ift172Q6VH22 1749 aa22.15■■□□□ 1.14
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Arid3cA6PWV5 409 aa22.14■■□□□ 1.14
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Pank1Q8K4K6 548 aa22.14■■□□□ 1.13
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Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ccdc9Q8VC31 543 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Atxn3Q9CVD2 355 aa22.12■■□□□ 1.13
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Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 AU022751B1B0V2 589 aa22.09■■□□□ 1.13
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ino80Q6ZPV2 1559 aa22.09■■□□□ 1.13
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Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gli2Q0VGT2 1544 aa22.07■■□□□ 1.12
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tecpr2Q3UH45 1423 aa22.07■■□□□ 1.12
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Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Plxnc1Q9QZC2 1574 aa22.06■■□□□ 1.12
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ak7Q9D2H2 614 aa22.06■■□□□ 1.12
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Duxf3A0A0N4SV92 674 aa22.05■■□□□ 1.12
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Skint5A7XUY5 1461 aa22.04■■□□□ 1.12
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Mre11Q61216 706 aa22.04■■□□□ 1.12
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Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 OvosQ3UU35 1456 aa22.04■■□□□ 1.12
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ppm1gQ61074 542 aa22.04■■□□□ 1.12
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Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Stag3O70576 1240 aa22.03■■□□□ 1.12
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Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Adgrl3Q80TS3 1537 aa22.03■■□□□ 1.12
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 InsrP15208 1372 aa22.03■■□□□ 1.12
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Trim58Q5NCC9 485 aa22.02■■□□□ 1.12
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ttc37F8VPK0 1563 aa22.02■■□□□ 1.12
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Eif2ak4Q9QZ05 1648 aa22.01■■□□□ 1.11
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ipo8Q7TMY7 1010 aa22.01■■□□□ 1.11
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ptch1Q61115 1434 aa22.01■■□□□ 1.11
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Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ccdc183A2AJB1 534 aa22■■□□□ 1.11
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 AdgbG3UZ78 1657 aa22■■□□□ 1.11
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Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Kiaa0556Q8C753 1610 aa21.99■■□□□ 1.11
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Hfm1D3Z4R1 1434 aa21.99■■□□□ 1.11
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Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Atp10aO54827 1508 aa21.98■■□□□ 1.11
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Mroh1E0CZ22 1640 aa21.98■■□□□ 1.11
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Hecw2Q6I6G8 1578 aa21.97■■□□□ 1.11
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Apaf1O88879 1249 aa21.97■■□□□ 1.11
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Hsp90ab1P11499 724 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
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Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Nrxn1Q9CS84 1514 aa21.95■■□□□ 1.1
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 4933416C03RikQ3V063 378 aa21.95■■□□□ 1.1
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Polr3glQ8R0C0 218 aa21.95■■□□□ 1.1
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Armcx1Q9CX83 456 aa21.94■■□□□ 1.1
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Irx3P81067 507 aa21.94■■□□□ 1.1
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gtf3c3Q3TMP1 882 aa21.94■■□□□ 1.1
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Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ppp1r9bQ6R891 817 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 AglF8VPN4 1532 aa21.93■■□□□ 1.1
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Med14A2ABV5 1459 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Knl1Q66JQ7 1612 aa21.91■■□□□ 1.1
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ksr2Q3UVC0 959 aa21.91■■□□□ 1.1
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Trim26Q99PN3 545 aa21.91■■□□□ 1.1
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Dip2cE9PWR4 1557 aa21.91■■□□□ 1.1
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Zranb1Q7M760 708 aa21.9■■□□□ 1.1
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Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Pdlim2Q8R1G6 349 aa21.89■■□□□ 1.1
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 RereQ80TZ9 1558 aa21.89■■□□□ 1.1
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tsen2Q6P7W5 460 aa21.89■■□□□ 1.09
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Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Slc52a2Q9D8F3 450 aa21.87■■□□□ 1.09
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Pnmal2G3X9N3 661 aa21.86■■□□□ 1.09
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 KarsQ99MN1 595 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ppp2r3aB2RXC8 1150 aa21.86■■□□□ 1.09
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 AampJ3QN89 436 aa21.84■■□□□ 1.09
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Dusp27Q148W8 1138 aa21.83■■□□□ 1.09
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ccar1Q8CH18 1146 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cep170bQ80U49 1574 aa21.83■■□□□ 1.08
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Stk26Q99JT2 416 aa21.82■■□□□ 1.08
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Adamts7Q68SA9 1657 aa21.82■■□□□ 1.08
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 ArxO35085 564 aa21.82■■□□□ 1.08
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Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Exosc9Q9JHI7 438 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm6268A2A3U9 297 aa21.8■■□□□ 1.08
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