RNA–Protein interactions for RNA: YPL207W

TYW1, Iron-sulfer protein required for synthesis of Wybutosine modified tRNA, yeast

Gene TYW1, Length 2,433 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TYW1	YPL207W	YOR192C-C	Q3E736	78 aa		2.67	□□□□□ -1.98
TYW1	YPL207W	RPL39	P04650	51 aa		2.67	□□□□□ -1.98
TYW1	YPL207W	MRPS12	P53732	153 aa		2.67	□□□□□ -1.98
TYW1	YPL207W	YDR381C-A	Q3E6R5	114 aa		2.67	□□□□□ -1.98
TYW1	YPL207W	RPL43A	P0CX25	92 aa	Known RBP	2.65	□□□□□ -1.99
TYW1	YPL207W	RPL43B	P0CX26	92 aa		2.65	□□□□□ -1.99
TYW1	YPL207W	LCL2	Q08045	131 aa		2.65	□□□□□ -1.99
TYW1	YPL207W	IRC21	Q04772	201 aa		2.64	□□□□□ -1.99
TYW1	YPL207W	PRP8	P33334	2413 aa	Known RBP	2.64	□□□□□ -1.99
TYW1	YPL207W	YBR292C	P38357	123 aa		2.64	□□□□□ -1.99
TYW1	YPL207W	ATX1	P38636	73 aa		2.64	□□□□□ -1.99
TYW1	YPL207W	YGL041C-B	Q3E750	60 aa		2.64	□□□□□ -1.99
TYW1	YPL207W	HUG1	Q6Q5K6	68 aa		2.64	□□□□□ -1.99
TYW1	YPL207W	NUM1	Q00402	2748 aa		2.64	□□□□□ -1.99
TYW1	YPL207W	YPR108W-A	Q3E7B3	70 aa		2.63	□□□□□ -1.99
TYW1	YPL207W	YMR105W-A	Q8TGS8	64 aa		2.63	□□□□□ -1.99
TYW1	YPL207W	CCW14	O13547	238 aa		2.62	□□□□□ -1.99
TYW1	YPL207W	SSS1	P35179	80 aa		2.62	□□□□□ -1.99
TYW1	YPL207W	MRX7	P53869	86 aa		2.62	□□□□□ -1.99
TYW1	YPL207W	YNR034W-A	Q3E841	98 aa		2.62	□□□□□ -1.99
TYW1	YPL207W	PAU8	P0CE92	120 aa		2.61	□□□□□ -1.99
TYW1	YPL207W	PAU11	P0CE93	120 aa		2.61	□□□□□ -1.99
TYW1	YPL207W	PAU13	P38725	120 aa		2.61	□□□□□ -1.99
TYW1	YPL207W	PAU4	P53427	120 aa		2.61	□□□□□ -1.99
TYW1	YPL207W	PAU10	Q03050	120 aa		2.61	□□□□□ -1.99
TYW1	YPL207W	YDR210W	Q03482	75 aa		2.61	□□□□□ -1.99
TYW1	YPL207W	YLR146W-A	Q2V2P1	62 aa		2.61	□□□□□ -1.99
TYW1	YPL207W	PAU9	Q3E770	120 aa		2.61	□□□□□ -1.99
TYW1	YPL207W	MEC1	P38111	2368 aa		2.61	□□□□□ -1.99
TYW1	YPL207W	YPL038W-A	Q3E7B4	63 aa		2.61	□□□□□ -1.99
TYW1	YPL207W	COA2	Q3E823	68 aa		2.6	□□□□□ -1.99
TYW1	YPL207W	MPC2	P38857	129 aa		2.59	□□□□□ -1.99
TYW1	YPL207W	YGR240C-A	Q3E786	66 aa		2.59	□□□□□ -1.99
TYW1	YPL207W	Q0297	Q9ZZV8	51 aa		2.59	□□□□□ -1.99
TYW1	YPL207W	SWM2	P40342	146 aa		2.59	□□□□□ -2
TYW1	YPL207W	PAU23	Q07987	124 aa		2.59	□□□□□ -2
TYW1	YPL207W	PAU17	Q12370	124 aa		2.59	□□□□□ -2
TYW1	YPL207W	YER188C-A	P0C0V2	99 aa		2.58	□□□□□ -2
TYW1	YPL207W	YOR105W	Q08504	108 aa		2.58	□□□□□ -2
TYW1	YPL207W	BSC4	P53841	131 aa		2.57	□□□□□ -2
TYW1	YPL207W	GIS2	P53849	153 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.57	□□□□□ -2	RIP-Chip
TYW1	YPL207W	BPH1	P25356	2167 aa		2.56	□□□□□ -2
TYW1	YPL207W	YLR255C	O13574	117 aa		2.56	□□□□□ -2
TYW1	YPL207W	AQY2	P0CD90	149 aa		2.56	□□□□□ -2
TYW1	YPL207W	PAU1	P0CE88	120 aa		2.56	□□□□□ -2
TYW1	YPL207W	PAU14	P0CE89	120 aa		2.56	□□□□□ -2
TYW1	YPL207W	YDR010C	Q12426	110 aa		2.56	□□□□□ -2
TYW1	YPL207W	YOR314W	Q12506	109 aa		2.56	□□□□□ -2
TYW1	YPL207W	YFL041W-A	Q3E817	63 aa		2.54	□□□□□ -2
TYW1	YPL207W	COX12	Q01519	83 aa		2.54	□□□□□ -2
TYW1	YPL207W	PAU20	Q08322	120 aa		2.54	□□□□□ -2
TYW1	YPL207W	YGL258W-A	Q3E740	77 aa		2.54	□□□□□ -2
TYW1	YPL207W	VMA9	Q3E7B6	73 aa		2.54	□□□□□ -2
TYW1	YPL207W	YMR007W	Q03675	126 aa		2.53	□□□□□ -2
TYW1	YPL207W	YIL156W-B	Q2V2P4	73 aa		2.53	□□□□□ -2
TYW1	YPL207W	COX19	Q3E731	98 aa		2.53	□□□□□ -2
TYW1	YPL207W	RPS11A	P0CX47	156 aa	Known RBP	2.53	□□□□□ -2
TYW1	YPL207W	RPS11B	P0CX48	156 aa	Known RBP	2.53	□□□□□ -2
TYW1	YPL207W	YHR212W-A	P0CX91	67 aa		2.53	□□□□□ -2
TYW1	YPL207W	YNL198C	P40166	100 aa		2.52	□□□□□ -2.01
TYW1	YPL207W	AIM19	P40502	157 aa		2.52	□□□□□ -2.01
TYW1	YPL207W	YNL122C	P53921	115 aa	Predicted RBP	2.52	□□□□□ -2.01
TYW1	YPL207W	YAL065C	O13511	128 aa		2.52	□□□□□ -2.01
TYW1	YPL207W	LCL1	Q02786	101 aa		2.52	□□□□□ -2.01
TYW1	YPL207W	YKL065W-A	Q2V2P2	73 aa		2.52	□□□□□ -2.01
TYW1	YPL207W	FPR2	P32472	135 aa		2.51	□□□□□ -2.01
TYW1	YPL207W	YJL009W	P47078	108 aa		2.51	□□□□□ -2.01
TYW1	YPL207W	YGR121W-A	Q3E816	71 aa		2.51	□□□□□ -2.01
TYW1	YPL207W	NOP10	Q6Q547	58 aa	Predicted RBP	2.51	□□□□□ -2.01
TYW1	YPL207W	MRPL31	P14063	131 aa	Predicted RBP	2.5	□□□□□ -2.01
TYW1	YPL207W	QCR9	P22289	66 aa		2.5	□□□□□ -2.01
TYW1	YPL207W	YHR173C	P38864	112 aa		2.5	□□□□□ -2.01
TYW1	YPL207W	YIL134C-A	Q45U18	67 aa		2.5	□□□□□ -2.01
TYW1	YPL207W	HUA1	P40325	198 aa		2.5	□□□□□ -2.01
TYW1	YPL207W	TOM7	P53507	60 aa		2.47	□□□□□ -2.01
TYW1	YPL207W	YOL013W-A	P0C272	63 aa	Predicted RBP	2.47	□□□□□ -2.01
TYW1	YPL207W	YGR025W	P53216	100 aa		2.47	□□□□□ -2.01
TYW1	YPL207W	DYN1	P36022	4092 aa		2.46	□□□□□ -2.02
TYW1	YPL207W	HOR7	Q05827	59 aa		2.46	□□□□□ -2.02
TYW1	YPL207W	URA2	P07259	2214 aa	Known RBP	2.46	□□□□□ -2.02
TYW1	YPL207W	YCR001W	P25347	104 aa		2.45	□□□□□ -2.02
TYW1	YPL207W	YMR141C	P40211	102 aa		2.44	□□□□□ -2.02
TYW1	YPL207W	MVB12	P42939	101 aa		2.44	□□□□□ -2.02
TYW1	YPL207W	SHU1	P38751	150 aa		2.44	□□□□□ -2.02
TYW1	YPL207W	YGR035W-A	Q45U48	73 aa		2.43	□□□□□ -2.02
TYW1	YPL207W	YOR011W-A	Q3E807	68 aa		2.43	□□□□□ -2.02
TYW1	YPL207W	YDL022C-A	P0C5L6	82 aa		2.42	□□□□□ -2.02
TYW1	YPL207W	YAR064W	P39563	99 aa		2.42	□□□□□ -2.02
TYW1	YPL207W	ERI1	P62651	68 aa	Known RBP	2.42	□□□□□ -2.02
TYW1	YPL207W	MGR2	Q02889	113 aa		2.42	□□□□□ -2.02
TYW1	YPL207W	YMR122W-A	Q3E842	84 aa		2.41	□□□□□ -2.02
TYW1	YPL207W	YOR072W	Q08486	104 aa		2.4	□□□□□ -2.02
TYW1	YPL207W	YIL102C-A	Q2V2P5	75 aa		2.4	□□□□□ -2.03
TYW1	YPL207W	YBR201C-A	Q2V2Q3	67 aa		2.39	□□□□□ -2.03
TYW1	YPL207W	YNL042W-B	Q3E7Z2	85 aa		2.39	□□□□□ -2.03
TYW1	YPL207W	YLR342W-A	Q3E810	57 aa		2.38	□□□□□ -2.03
TYW1	YPL207W	SPI1	P40092	148 aa		2.37	□□□□□ -2.03
TYW1	YPL207W	Q0032	Q9ZZX7	96 aa		2.37	□□□□□ -2.03
TYW1	YPL207W	UTP20	P35194	2493 aa	Known RBP	2.36	□□□□□ -2.03
TYW1	YPL207W	YSY6	P38374	65 aa		2.36	□□□□□ -2.03

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