RNA–Protein interactions for RNA: YMR253C

YMR253C, Transcript of Putative protein of unknown function, yeastyeast

Gene YMR253C, Length 1,245 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YMR253CYMR253C YMR244WQ04018 355 aa5.4□□□□□ -1.54
YMR253CYMR253C TOS8P53147 276 aa5.39□□□□□ -1.55
YMR253CYMR253C YMR122W-AQ3E842 84 aa5.39□□□□□ -1.55
YMR253CYMR253C OST5Q92316 86 aa5.39□□□□□ -1.55
YMR253CYMR253C MRPS8Q03799 155 aa5.38□□□□□ -1.55
YMR253CYMR253C COX23P38824 151 aa5.37□□□□□ -1.55
YMR253CYMR253C BPH1P25356 2167 aa5.36□□□□□ -1.55
YMR253CYMR253C YOL014WQ08110 124 aa5.36□□□□□ -1.55
YMR253CYMR253C YBL081WP38180 368 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
YMR253CYMR253C YOR376W-AQ3E805 51 aa5.35□□□□□ -1.55
YMR253CYMR253C YEL045CP32616 141 aa5.34□□□□□ -1.55
YMR253CYMR253C YPR153WQ06537 140 aa5.34□□□□□ -1.55
YMR253CYMR253C YDL241WQ07738 123 aa5.33□□□□□ -1.56
YMR253CYMR253C YML100W-AQ8TGT0 57 aa5.33□□□□□ -1.56
YMR253CYMR253C YPR010C-AA5Z2X5 72 aa5.32□□□□□ -1.56
YMR253CYMR253C EDC2P40023 145 aaPredicted RBP5.32□□□□□ -1.56
YMR253CYMR253C LIP1Q03579 150 aa5.32□□□□□ -1.56
YMR253CYMR253C VPS13Q07878 3144 aa5.31□□□□□ -1.56
YMR253CYMR253C YNL162W-AQ3E7A8 72 aa5.31□□□□□ -1.56
YMR253CYMR253C MVB12P42939 101 aa5.3□□□□□ -1.56
YMR253CYMR253C YGL034CP53186 121 aa5.3□□□□□ -1.56
YMR253CYMR253C SPO24Q3E752 67 aa5.3□□□□□ -1.56
YMR253CYMR253C RPS11AP0CX47 156 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
YMR253CYMR253C RPS11BP0CX48 156 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
YMR253CYMR253C YIL102CP40488 101 aa5.29□□□□□ -1.56
YMR253CYMR253C FYV5P25585 152 aa5.28□□□□□ -1.56
YMR253CYMR253C HOT13P36078 116 aa5.28□□□□□ -1.56
YMR253CYMR253C YHR213W-BQ8TGK1 99 aa5.28□□□□□ -1.56
YMR253CYMR253C HFA1P32874 2273 aa5.27□□□□□ -1.57
YMR253CYMR253C YER145C-AA0A023PYF4 145 aa5.27□□□□□ -1.57
YMR253CYMR253C SPC1P46965 94 aa5.27□□□□□ -1.57
YMR253CYMR253C YGL193CP53097 103 aa5.26□□□□□ -1.57
YMR253CYMR253C HUB1Q6Q546 73 aa5.26□□□□□ -1.57
YMR253CYMR253C HOR7Q05827 59 aa5.25□□□□□ -1.57
YMR253CYMR253C YBR230W-AQ3E762 66 aa5.25□□□□□ -1.57
YMR253CYMR253C YJL133C-AQ3E7A3 74 aa5.25□□□□□ -1.57
YMR253CYMR253C TAO3P40468 2376 aa5.24□□□□□ -1.57
YMR253CYMR253C YOL013W-AP0C272 63 aaPredicted RBP5.24□□□□□ -1.57
YMR253CYMR253C SPG1P50088 95 aa5.24□□□□□ -1.57
YMR253CYMR253C TAR1Q8TGM6 124 aa5.24□□□□□ -1.57
YMR253CYMR253C YBL039W-BP0C268 59 aa5.23□□□□□ -1.57
YMR253CYMR253C YJL127C-BQ3E828 52 aa5.23□□□□□ -1.57
YMR253CYMR253C YAR023CD6VPM8 179 aa5.22□□□□□ -1.57
YMR253CYMR253C RPC10P40422 70 aa5.22□□□□□ -1.57
YMR253CYMR253C IRA2P19158 3079 aa5.21□□□□□ -1.58
YMR253CYMR253C AQY2P0CD90 149 aa5.21□□□□□ -1.58
YMR253CYMR253C YGR240C-AQ3E786 66 aa5.21□□□□□ -1.58
YMR253CYMR253C ECM19Q06011 112 aa5.2□□□□□ -1.58
YMR253CYMR253C RDS3Q06835 107 aaPredicted RBP5.2□□□□□ -1.58
YMR253CYMR253C YCR095W-AQ3E787 52 aa5.2□□□□□ -1.58
YMR253CYMR253C SDH6Q3E785 79 aa5.19□□□□□ -1.58
YMR253CYMR253C YLR307C-AQ3E825 87 aa5.19□□□□□ -1.58
YMR253CYMR253C CSF1Q12150 2958 aa5.17□□□□□ -1.58
YMR253CYMR253C YLR157W-DP0CE99 70 aa5.17□□□□□ -1.58
YMR253CYMR253C YAL064WP39711 94 aa5.17□□□□□ -1.58
YMR253CYMR253C YHR125WP38831 101 aa5.16□□□□□ -1.58
YMR253CYMR253C IGD1P43598 195 aa5.16□□□□□ -1.58
YMR253CYMR253C YDR010CQ12426 110 aa5.16□□□□□ -1.58
YMR253CYMR253C YNL042W-BQ3E7Z2 85 aa5.16□□□□□ -1.58
YMR253CYMR253C YMR001C-AQ8TGS9 76 aa5.16□□□□□ -1.58
YMR253CYMR253C YDR034W-BQ6Q5X2 51 aa5.15□□□□□ -1.59
YMR253CYMR253C YCR001WP25347 104 aa5.14□□□□□ -1.59
YMR253CYMR253C YIL156W-BQ2V2P4 73 aa5.14□□□□□ -1.59
YMR253CYMR253C YCR043CP25361 127 aa5.1□□□□□ -1.59
YMR253CYMR253C YGL149WP53116 101 aa5.1□□□□□ -1.59
YMR253CYMR253C DDR2P89113 61 aa5.1□□□□□ -1.59
YMR253CYMR253C AUA1P32450 94 aa5.09□□□□□ -1.59
YMR253CYMR253C YAR064WP39563 99 aa5.09□□□□□ -1.59
YMR253CYMR253C ATP17Q06405 101 aa5.09□□□□□ -1.59
YMR253CYMR253C TMC1Q08422 150 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
YMR253CYMR253C YCR041WP37265 110 aa5.08□□□□□ -1.6
YMR253CYMR253C YBR027CP38220 110 aa5.08□□□□□ -1.6
YMR253CYMR253C DDR48P18899 430 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
YMR253CYMR253C RPL33AP05744 107 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
YMR253CYMR253C RPL33BP41056 107 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
YMR253CYMR253C MRX7P53869 86 aa5.05□□□□□ -1.6
YMR253CYMR253C YOR072WQ08486 104 aa5.04□□□□□ -1.6
YMR253CYMR253C BSC4P53841 131 aa5.03□□□□□ -1.6
YMR253CYMR253C YDR115WQ04598 105 aa5.02□□□□□ -1.61
YMR253CYMR253C YHR007C-AQ07074 71 aa5.02□□□□□ -1.61
YMR253CYMR253C Q0032Q9ZZX7 96 aa5.02□□□□□ -1.61
YMR253CYMR253C YJL197C-AP0C5P0 93 aa5.01□□□□□ -1.61
YMR253CYMR253C QCR10P37299 77 aa5.01□□□□□ -1.61
YMR253CYMR253C YGL260WP53056 76 aa4.99□□□□□ -1.61
YMR253CYMR253C URA2P07259 2214 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
YMR253CYMR253C YHR212W-AP0CX91 67 aa4.98□□□□□ -1.61
YMR253CYMR253C LCL2Q08045 131 aa4.98□□□□□ -1.61
YMR253CYMR253C YFR032C-BQ8TGU2 87 aa4.97□□□□□ -1.61
YMR253CYMR253C FMP27Q06179 2628 aa4.96□□□□□ -1.61
YMR253CYMR253C GIS2P53849 153 aaKnown RBP RIP-Chip data4.96□□□□□ -1.62not detected
YMR253CYMR253C YNL122CP53921 115 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
YMR253CYMR253C SNA2P56508 79 aa4.95□□□□□ -1.62
YMR253CYMR253C TRA1P38811 3744 aa4.94□□□□□ -1.62
YMR253CYMR253C SGF11Q03067 99 aa4.93□□□□□ -1.62
YMR253CYMR253C YGL041C-BQ3E750 60 aa4.93□□□□□ -1.62
YMR253CYMR253C YPL278CQ08990 100 aa4.92□□□□□ -1.62
YMR253CYMR253C YDL012CQ12489 107 aa4.92□□□□□ -1.62
YMR253CYMR253C YLL066W-BQ8TGJ7 56 aa4.92□□□□□ -1.62
YMR253CYMR253C SOM1Q05676 74 aa4.91□□□□□ -1.62
YMR253CYMR253C Q0297Q9ZZV8 51 aa4.89□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 12.7 ms