RNA–Protein interactions for RNA: YKL163W

PIR3, Transcript of O-glycosylated covalently-bound cell wall protein, yeastyeast

Gene PIR3, Length 978 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PIR3YKL163W YMR122CQ03879 124 aa2.55□□□□□ -2
PIR3YKL163W YDR119W-AQ2V2P9 66 aa2.55□□□□□ -2
PIR3YKL163W YFL041W-AQ3E817 63 aa2.55□□□□□ -2
PIR3YKL163W YDR381C-AQ3E6R5 114 aa2.54□□□□□ -2
PIR3YKL163W HMRA2P0CY13 119 aa2.53□□□□□ -2
PIR3YKL163W YBR292CP38357 123 aa2.53□□□□□ -2
PIR3YKL163W ICS3P47034 131 aa2.53□□□□□ -2
PIR3YKL163W YPL038W-AQ3E7B4 63 aa2.53□□□□□ -2
PIR3YKL163W YIL134C-AQ45U18 67 aa2.53□□□□□ -2
PIR3YKL163W NHP2P32495 156 aaPredicted RBP2.52□□□□□ -2.01
PIR3YKL163W YBR219CP38317 127 aa2.52□□□□□ -2.01
PIR3YKL163W PAU5P43575 122 aa2.52□□□□□ -2.01
PIR3YKL163W IMP2P46972 177 aa2.52□□□□□ -2.01
PIR3YKL163W IRC21Q04772 201 aa2.52□□□□□ -2.01
PIR3YKL163W LSM6Q06406 86 aaKnown RBP2.52□□□□□ -2.01
PIR3YKL163W YOR105WQ08504 108 aa2.52□□□□□ -2.01
PIR3YKL163W YKL065W-AQ2V2P2 73 aa2.52□□□□□ -2.01
PIR3YKL163W YLR285C-AQ3E771 56 aa2.52□□□□□ -2.01
PIR3YKL163W YPR108W-AQ3E7B3 70 aa2.52□□□□□ -2.01
PIR3YKL163W YNR034W-AQ3E841 98 aa2.52□□□□□ -2.01
PIR3YKL163W YEL008WP40001 126 aa2.51□□□□□ -2.01
PIR3YKL163W SNA2P56508 79 aa2.51□□□□□ -2.01
PIR3YKL163W YLR162WQ06235 118 aa2.51□□□□□ -2.01
PIR3YKL163W YNL146C-AQ3E7Z1 64 aa2.51□□□□□ -2.01
PIR3YKL163W YIL163CP40448 117 aa2.5□□□□□ -2.01
PIR3YKL163W SGF11Q03067 99 aa2.5□□□□□ -2.01
PIR3YKL163W YIL102C-AQ2V2P5 75 aa2.5□□□□□ -2.01
PIR3YKL163W HUG1Q6Q5K6 68 aa2.5□□□□□ -2.01
PIR3YKL163W YCR095W-AQ3E787 52 aa2.49□□□□□ -2.01
PIR3YKL163W COA3Q3E7B2 85 aa2.49□□□□□ -2.01
PIR3YKL163W RPS22AP0C0W1 130 aaKnown RBP2.48□□□□□ -2.01
PIR3YKL163W YOR314WQ12506 109 aa2.48□□□□□ -2.01
PIR3YKL163W YOR011W-AQ3E807 68 aa2.48□□□□□ -2.01
PIR3YKL163W YNL198CP40166 100 aa2.47□□□□□ -2.01
PIR3YKL163W YDL012CQ12489 107 aa2.47□□□□□ -2.01
PIR3YKL163W YGL258W-AQ3E740 77 aa2.47□□□□□ -2.01
PIR3YKL163W YHR086W-AQ3E746 53 aa2.47□□□□□ -2.01
PIR3YKL163W YGL041C-BQ3E750 60 aa2.47□□□□□ -2.01
PIR3YKL163W YCR001WP25347 104 aa2.46□□□□□ -2.02
PIR3YKL163W AIM4P38305 123 aaPredicted RBP2.46□□□□□ -2.02
PIR3YKL163W YBL071CP38185 102 aa2.45□□□□□ -2.02
PIR3YKL163W YAL065CO13511 128 aa2.44□□□□□ -2.02
PIR3YKL163W YJL009WP47078 108 aa2.44□□□□□ -2.02
PIR3YKL163W LCL2Q08045 131 aa2.44□□□□□ -2.02
PIR3YKL163W YPR145C-AQ2V2P0 78 aa2.44□□□□□ -2.02
PIR3YKL163W RPS11AP0CX47 156 aaKnown RBP2.43□□□□□ -2.02
PIR3YKL163W RPS11BP0CX48 156 aaKnown RBP2.43□□□□□ -2.02
PIR3YKL163W YGR025WP53216 100 aa2.43□□□□□ -2.02
PIR3YKL163W MRPL31P14063 131 aaPredicted RBP2.42□□□□□ -2.02
PIR3YKL163W QCR9P22289 66 aa2.42□□□□□ -2.02
PIR3YKL163W AIM19P40502 157 aa2.42□□□□□ -2.02
PIR3YKL163W MRX7P53869 86 aa2.42□□□□□ -2.02
PIR3YKL163W YKL023C-AQ2V2P3 75 aa2.42□□□□□ -2.02
PIR3YKL163W RPS22BQ3E7Y3 130 aaKnown RBP2.42□□□□□ -2.02
PIR3YKL163W YER188C-AP0C0V2 99 aa2.41□□□□□ -2.02
PIR3YKL163W YSY6P38374 65 aa2.41□□□□□ -2.02
PIR3YKL163W BSC4P53841 131 aa2.41□□□□□ -2.02
PIR3YKL163W CCW12Q12127 133 aa2.41□□□□□ -2.02
PIR3YKL163W SPI1P40092 148 aa2.4□□□□□ -2.03
PIR3YKL163W SPC1P46965 94 aa2.4□□□□□ -2.03
PIR3YKL163W FPR2P32472 135 aa2.39□□□□□ -2.03
PIR3YKL163W YGR240C-AQ3E786 66 aa2.39□□□□□ -2.03
PIR3YKL163W YHR173CP38864 112 aa2.38□□□□□ -2.03
PIR3YKL163W PAU4P53427 120 aa2.38□□□□□ -2.03
PIR3YKL163W TOM7P53507 60 aa2.38□□□□□ -2.03
PIR3YKL163W YNL122CP53921 115 aaPredicted RBP2.38□□□□□ -2.03
PIR3YKL163W COX19Q3E731 98 aa2.38□□□□□ -2.03
PIR3YKL163W PAU1P0CE88 120 aa2.37□□□□□ -2.03
PIR3YKL163W PAU14P0CE89 120 aa2.37□□□□□ -2.03
PIR3YKL163W PAU6P0CE90 120 aa2.37□□□□□ -2.03
PIR3YKL163W PAU18P0CE91 120 aa2.37□□□□□ -2.03
PIR3YKL163W PAU8P0CE92 120 aa2.37□□□□□ -2.03
PIR3YKL163W PAU11P0CE93 120 aa2.37□□□□□ -2.03
PIR3YKL163W PAU13P38725 120 aa2.37□□□□□ -2.03
PIR3YKL163W PAU10Q03050 120 aa2.37□□□□□ -2.03
PIR3YKL163W PAU9Q3E770 120 aa2.37□□□□□ -2.03
PIR3YKL163W YOR072WQ08486 104 aa2.36□□□□□ -2.03
PIR3YKL163W YGR121W-AQ3E816 71 aa2.36□□□□□ -2.03
PIR3YKL163W PAU7P39545 55 aa2.35□□□□□ -2.03
PIR3YKL163W MRPS12P53732 153 aa2.34□□□□□ -2.03
PIR3YKL163W YDR210WQ03482 75 aa2.34□□□□□ -2.03
PIR3YKL163W YLL066W-BQ8TGJ7 56 aa2.34□□□□□ -2.03
PIR3YKL163W YDR034C-AP0C289 58 aa2.33□□□□□ -2.04
PIR3YKL163W PAU20Q08322 120 aa2.33□□□□□ -2.04
PIR3YKL163W YDR010CQ12426 110 aa2.33□□□□□ -2.04
PIR3YKL163W YDR182W-AQ3E796 67 aa2.32□□□□□ -2.04
PIR3YKL163W COA2Q3E823 68 aa2.32□□□□□ -2.04
PIR3YKL163W YAR064WP39563 99 aa2.31□□□□□ -2.04
PIR3YKL163W HUB1Q6Q546 73 aa2.3□□□□□ -2.04
PIR3YKL163W NOP10Q6Q547 58 aaPredicted RBP2.3□□□□□ -2.04
PIR3YKL163W ERI1P62651 68 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
PIR3YKL163W LCL1Q02786 101 aa2.28□□□□□ -2.04
PIR3YKL163W MGR2Q02889 113 aa2.27□□□□□ -2.05
PIR3YKL163W YLR146W-AQ2V2P1 62 aa2.27□□□□□ -2.05
PIR3YKL163W YOL097W-AQ3E7Y9 61 aa2.27□□□□□ -2.05
PIR3YKL163W YLR255CO13574 117 aa2.26□□□□□ -2.05
PIR3YKL163W YMR007WQ03675 126 aa2.26□□□□□ -2.05
PIR3YKL163W YIL156W-BQ2V2P4 73 aa2.26□□□□□ -2.05
PIR3YKL163W YDR246W-AQ3E763 66 aa2.26□□□□□ -2.05
PIR3YKL163W YLR307C-AQ3E825 87 aa2.26□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 29.7 ms