RNA–Protein interactions for RNA: YEL009C

GCN4, Transcript of bZIP transcriptional activator of amino acid biosynthetic genes, yeastyeast

Gene GCN4, Length 846 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GCN4YEL009C YBL112CQ3E7Y4 105 aa1.4□□□□□ -2.19
GCN4YEL009C YJL127C-BQ3E828 52 aa1.4□□□□□ -2.19
GCN4YEL009C YLR236CA0A023PZG4 107 aa1.39□□□□□ -2.19
GCN4YEL009C FYV5P25585 152 aa1.39□□□□□ -2.19
GCN4YEL009C SPT4P32914 102 aaPredicted RBP1.39□□□□□ -2.19
GCN4YEL009C MSA2P36157 363 aa1.39□□□□□ -2.19
GCN4YEL009C EDC2P40023 145 aaPredicted RBP1.39□□□□□ -2.19
GCN4YEL009C MPC3P53311 146 aa1.39□□□□□ -2.19
GCN4YEL009C BET1P22804 142 aa1.38□□□□□ -2.19
GCN4YEL009C HYP2P23301 157 aaKnown RBP1.38□□□□□ -2.19
GCN4YEL009C SPG1P50088 95 aa1.38□□□□□ -2.19
GCN4YEL009C YGL149WP53116 101 aa1.38□□□□□ -2.19
GCN4YEL009C BSC4P53841 131 aa1.38□□□□□ -2.19
GCN4YEL009C YHR007C-AQ07074 71 aa1.38□□□□□ -2.19
GCN4YEL009C YGR121W-AQ3E816 71 aa1.38□□□□□ -2.19
GCN4YEL009C YJR107C-AP0CT86 78 aa1.37□□□□□ -2.19
GCN4YEL009C DSE2P38844 325 aa1.37□□□□□ -2.19
GCN4YEL009C SFT1P43682 97 aa1.37□□□□□ -2.19
GCN4YEL009C YOR072WQ08486 104 aa1.37□□□□□ -2.19
GCN4YEL009C YOR268CQ08734 132 aa1.37□□□□□ -2.19
GCN4YEL009C YHR139C-AO13536 103 aa1.36□□□□□ -2.19
GCN4YEL009C RPL36BO14455 100 aaKnown RBP1.36□□□□□ -2.19
GCN4YEL009C OST2P46964 130 aa1.36□□□□□ -2.19
GCN4YEL009C ATP18P81450 59 aa1.36□□□□□ -2.19
GCN4YEL009C YDR010CQ12426 110 aa1.36□□□□□ -2.19
GCN4YEL009C TSC3Q3E790 80 aa1.36□□□□□ -2.19
GCN4YEL009C KRE1P17260 313 aa1.35□□□□□ -2.19
GCN4YEL009C YAR1P46683 200 aa1.35□□□□□ -2.19
GCN4YEL009C YFR009W-AP0C5M9 85 aa1.34□□□□□ -2.19
GCN4YEL009C RPA12P32529 125 aaKnown RBP1.34□□□□□ -2.19
GCN4YEL009C YBR027CP38220 110 aa1.34□□□□□ -2.19
GCN4YEL009C RSM18P40033 138 aa1.34□□□□□ -2.19
GCN4YEL009C YNL184CP53876 108 aa1.34□□□□□ -2.19
GCN4YEL009C KTI11Q3E840 82 aa1.34□□□□□ -2.19
GCN4YEL009C KSH1Q8TGJ3 72 aa1.34□□□□□ -2.19
GCN4YEL009C PBI2P0CT04 75 aaKnown RBP1.33□□□□□ -2.2
GCN4YEL009C ICS3P47034 131 aa1.33□□□□□ -2.2
GCN4YEL009C RSM19P53733 91 aaPredicted RBP1.33□□□□□ -2.2
GCN4YEL009C YDR381C-AQ3E6R5 114 aa1.33□□□□□ -2.2
GCN4YEL009C TDA8Q6B2U8 126 aa1.33□□□□□ -2.2
GCN4YEL009C YHR213W-BQ8TGK1 99 aa1.33□□□□□ -2.2
GCN4YEL009C YJL197C-AP0C5P0 93 aa1.32□□□□□ -2.2
GCN4YEL009C EDC1P53080 175 aaPredicted RBP1.32□□□□□ -2.2
GCN4YEL009C ECM19Q06011 112 aa1.32□□□□□ -2.2
GCN4YEL009C SHH4Q06236 168 aa1.32□□□□□ -2.2
GCN4YEL009C YJL133C-AQ3E7A3 74 aa1.32□□□□□ -2.2
GCN4YEL009C YLR157W-DP0CE99 70 aa1.31□□□□□ -2.2
GCN4YEL009C YCR085WP25650 117 aa1.31□□□□□ -2.2
GCN4YEL009C ATX1P38636 73 aa1.31□□□□□ -2.2
GCN4YEL009C YHL005CP38752 130 aa1.31□□□□□ -2.2
GCN4YEL009C COX23P38824 151 aa1.31□□□□□ -2.2
GCN4YEL009C TDA2P40045 126 aa1.31□□□□□ -2.2
GCN4YEL009C RPL38P49167 78 aaKnown RBP1.31□□□□□ -2.2
GCN4YEL009C YLR162WQ06235 118 aa1.31□□□□□ -2.2
GCN4YEL009C YOL014WQ08110 124 aa1.31□□□□□ -2.2
GCN4YEL009C YOL097W-AQ3E7Y9 61 aa1.31□□□□□ -2.2
GCN4YEL009C MIC10Q96VH5 97 aa1.31□□□□□ -2.2
GCN4YEL009C RAD6P06104 172 aa1.3□□□□□ -2.2
GCN4YEL009C YHL018WP38744 120 aaPredicted RBP1.3□□□□□ -2.2
GCN4YEL009C SKI6P46948 246 aaPredicted RBP1.3□□□□□ -2.2
GCN4YEL009C YAL063C-AQ3E791 96 aa1.3□□□□□ -2.2
GCN4YEL009C ISD11Q6Q560 94 aa1.3□□□□□ -2.2
GCN4YEL009C INO4P13902 151 aa1.29□□□□□ -2.2
GCN4YEL009C COF1Q03048 143 aaKnown RBP1.29□□□□□ -2.2
GCN4YEL009C ATP20Q12233 115 aa1.29□□□□□ -2.2
GCN4YEL009C CMC4Q3E7A9 73 aa1.29□□□□□ -2.2
GCN4YEL009C YOR304C-AO14468 76 aa1.28□□□□□ -2.2
GCN4YEL009C YHL042WP38729 150 aa1.28□□□□□ -2.2
GCN4YEL009C EMC6Q12431 108 aa1.28□□□□□ -2.2
GCN4YEL009C SLO1Q3E784 85 aa1.28□□□□□ -2.2
GCN4YEL009C COX7P10174 60 aa1.27□□□□□ -2.21
GCN4YEL009C YCR050CP25630 102 aa1.27□□□□□ -2.21
GCN4YEL009C YNL122CP53921 115 aaPredicted RBP1.27□□□□□ -2.21
GCN4YEL009C YSY6P38374 65 aa1.26□□□□□ -2.21
GCN4YEL009C YAR064WP39563 99 aa1.26□□□□□ -2.21
GCN4YEL009C YLR285C-AQ3E771 56 aa1.26□□□□□ -2.21
GCN4YEL009C YFL041W-AQ3E817 63 aa1.26□□□□□ -2.21
GCN4YEL009C RPL36AP05745 100 aaPredicted RBP1.25□□□□□ -2.21
GCN4YEL009C YHR073W-AP0C5N7 58 aa1.25□□□□□ -2.21
GCN4YEL009C YER187WP40102 141 aa1.25□□□□□ -2.21
GCN4YEL009C YFL065CP43539 102 aa1.25□□□□□ -2.21
GCN4YEL009C YPR203WQ08994 102 aa1.25□□□□□ -2.21
GCN4YEL009C RPL37BP51402 88 aaKnown RBP1.24□□□□□ -2.21
GCN4YEL009C YPL080CQ02826 108 aa1.24□□□□□ -2.21
GCN4YEL009C RUB1Q03919 77 aa1.24□□□□□ -2.21
GCN4YEL009C YKL183C-AQ3E765 70 aa1.24□□□□□ -2.21
GCN4YEL009C YLR361C-AQ3E795 98 aa1.24□□□□□ -2.21
GCN4YEL009C YPR153WQ06537 140 aa1.23□□□□□ -2.21
GCN4YEL009C YOL013W-AP0C272 63 aaPredicted RBP1.22□□□□□ -2.21
GCN4YEL009C YIL102CP40488 101 aa1.22□□□□□ -2.21
GCN4YEL009C YJR128WP47162 119 aa1.22□□□□□ -2.21
GCN4YEL009C YGR039WP53225 103 aa1.22□□□□□ -2.21
GCN4YEL009C YGR164WP53291 111 aa1.22□□□□□ -2.21
GCN4YEL009C YOR314WQ12506 109 aa1.22□□□□□ -2.21
GCN4YEL009C YOR316C-AQ3E806 69 aa1.22□□□□□ -2.21
GCN4YEL009C LIP1Q03579 150 aa1.21□□□□□ -2.22
GCN4YEL009C NOP10Q6Q547 58 aaPredicted RBP1.21□□□□□ -2.22
GCN4YEL009C YDR119W-AQ2V2P9 66 aa1.2□□□□□ -2.22
GCN4YEL009C YPL038W-AQ3E7B4 63 aa1.2□□□□□ -2.22
GCN4YEL009C YAL067W-AQ8TGK6 75 aa1.2□□□□□ -2.22
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