RNA–Protein interactions for RNA: YOL054W

PSH1, Transcript of E3 ubiquitin ligase targeting centromere-binding protein Cse4p, yeast

Gene PSH1, Length 1,221 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PSH1	YOL054W	KRE1	P17260	313 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PSH1	YOL054W	MID2	P36027	376 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PSH1	YOL054W	NRG2	P38082	220 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PSH1	YOL054W	YHR130C	P38834	111 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PSH1	YOL054W	YEL008W	P40001	126 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PSH1	YOL054W	YIA6	P40556	373 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PSH1	YOL054W	YNL190W	P53872	204 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PSH1	YOL054W	YNL184C	P53876	108 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PSH1	YOL054W	YMR230W-A	Q3E7B5	62 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PSH1	YOL054W	URA2	P07259	2214 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
PSH1	YOL054W	YAL063C-A	Q3E791	96 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PSH1	YOL054W	YAR1	P46683	200 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PSH1	YOL054W	YFL041W-A	Q3E817	63 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PSH1	YOL054W	UBC5	P15732	148 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PSH1	YOL054W	YBR209W	P38311	105 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PSH1	YOL054W	DSE2	P38844	325 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PSH1	YOL054W	YAR029W	P39549	74 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PSH1	YOL054W	SKI6	P46948	246 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
PSH1	YOL054W	PMP3	P87284	55 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PSH1	YOL054W	COX12	Q01519	83 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PSH1	YOL054W	Q0297	Q9ZZV8	51 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PSH1	YOL054W	RPS11A	P0CX47	156 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
PSH1	YOL054W	RPS11B	P0CX48	156 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
PSH1	YOL054W	YFR035C	P43608	114 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PSH1	YOL054W	YGL088W	P53151	121 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PSH1	YOL054W	RGM1	Q00453	211 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PSH1	YOL054W	ABF2	Q02486	183 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PSH1	YOL054W	RPL2A	P0CX45	254 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
PSH1	YOL054W	RPL2B	P0CX46	254 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
PSH1	YOL054W	AIM19	P40502	157 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PSH1	YOL054W	HUR1	P45820	110 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PSH1	YOL054W	ALG13	P53178	202 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PSH1	YOL054W	TAR1	Q8TGM6	124 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PSH1	YOL054W	YOR304C-A	O14468	76 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PSH1	YOL054W	MRPL24	P36525	258 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
PSH1	YOL054W	YIL059C	P40520	121 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PSH1	YOL054W	YDR381C-A	Q3E6R5	114 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PSH1	YOL054W	YOR020W-A	Q3E824	90 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PSH1	YOL054W	MSA2	P36157	363 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PSH1	YOL054W	SVP26	P38869	228 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PSH1	YOL054W	CWP2	P43497	92 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PSH1	YOL054W	ARC15	P40518	154 aa	RIP-Chip data	4.09	□□□□□ -1.75	not detected
PSH1	YOL054W	YPL080C	Q02826	108 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PSH1	YOL054W	YMR295C	Q03559	197 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PSH1	YOL054W	YHR139C-A	O13536	103 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PSH1	YOL054W	PBI2	P0CT04	75 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
PSH1	YOL054W	YPS5	P53057	165 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PSH1	YOL054W	YPL229W	Q99395	206 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PSH1	YOL054W	RPB9	P27999	122 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PSH1	YOL054W	YBR219C	P38317	127 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PSH1	YOL054W	MPC2	P38857	129 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PSH1	YOL054W	VAM10	Q08474	114 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PSH1	YOL054W	YMR122W-A	Q3E842	84 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PSH1	YOL054W	YLR236C	A0A023PZG4	107 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PSH1	YOL054W	SHH4	Q06236	168 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PSH1	YOL054W	YGR240C-A	Q3E786	66 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PSH1	YOL054W	ENV10	Q99382	181 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PSH1	YOL054W	YHR212W-A	P0CX91	67 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PSH1	YOL054W	ERI1	P62651	68 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
PSH1	YOL054W	YDR119W-A	Q2V2P9	66 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PSH1	YOL054W	YIR021W-A	Q3E739	70 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PSH1	YOL054W	YLL006W-A	Q3E814	58 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PSH1	YOL054W	DYN1	P36022	4092 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PSH1	YOL054W	SMP1	P38128	452 aa		4.04	□□□□□ -1.76
PSH1	YOL054W	YHL042W	P38729	150 aa		4.04	□□□□□ -1.76
PSH1	YOL054W	YGR039W	P53225	103 aa		4.04	□□□□□ -1.76
PSH1	YOL054W	RAD6	P06104	172 aa		4.03	□□□□□ -1.76
PSH1	YOL054W	COF1	Q03048	143 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
PSH1	YOL054W	YDL241W	Q07738	123 aa		4.03	□□□□□ -1.76
PSH1	YOL054W	EMC6	Q12431	108 aa		4.03	□□□□□ -1.76
PSH1	YOL054W	YAL065C	O13511	128 aa		4.02	□□□□□ -1.77
PSH1	YOL054W	YJR107C-A	P0CT86	78 aa		4.02	□□□□□ -1.77
PSH1	YOL054W	ERG28	P40030	148 aa		4.02	□□□□□ -1.77
PSH1	YOL054W	IRC21	Q04772	201 aa		4.02	□□□□□ -1.77
PSH1	YOL054W	YOR034C-A	Q3E735	80 aa		4.02	□□□□□ -1.77
PSH1	YOL054W	YMR175W-A	Q3E766	64 aa		4.02	□□□□□ -1.77
PSH1	YOL054W	YPL038W-A	Q3E7B4	63 aa		4.02	□□□□□ -1.77
PSH1	YOL054W	RPL29	P05747	59 aa	Predicted RBP	4.01	□□□□□ -1.77
PSH1	YOL054W	PEX22	P39718	180 aa		4.01	□□□□□ -1.77
PSH1	YOL054W	KNH1	P50112	268 aa		4.01	□□□□□ -1.77
PSH1	YOL054W	YDR274C	P87283	123 aa		4.01	□□□□□ -1.77
PSH1	YOL054W	HAL1	Q01766	294 aa		4.01	□□□□□ -1.77
PSH1	YOL054W	ICY1	Q04329	127 aa		4.01	□□□□□ -1.77
PSH1	YOL054W	RDS3	Q06835	107 aa	Predicted RBP	4.01	□□□□□ -1.77
PSH1	YOL054W	YBL112C	Q3E7Y4	105 aa		4	□□□□□ -1.77
PSH1	YOL054W	GAT4	P40569	121 aa		3.99	□□□□□ -1.77
PSH1	YOL054W	TOM6	P33448	61 aa		3.98	□□□□□ -1.77
PSH1	YOL054W	YSY6	P38374	65 aa		3.98	□□□□□ -1.77
PSH1	YOL054W	IGD1	P43598	195 aa		3.98	□□□□□ -1.77
PSH1	YOL054W	YPR010C-A	A5Z2X5	72 aa		3.97	□□□□□ -1.77
PSH1	YOL054W	YCR001W	P25347	104 aa		3.97	□□□□□ -1.77
PSH1	YOL054W	RPC10	P40422	70 aa		3.97	□□□□□ -1.77
PSH1	YOL054W	YDR115W	Q04598	105 aa		3.97	□□□□□ -1.77
PSH1	YOL054W	YDR029W	Q12111	104 aa		3.97	□□□□□ -1.77
PSH1	YOL054W	MVB12	P42939	101 aa		3.96	□□□□□ -1.78
PSH1	YOL054W	MPC3	P53311	146 aa		3.96	□□□□□ -1.78
PSH1	YOL054W	RSM19	P53733	91 aa	Predicted RBP	3.96	□□□□□ -1.78
PSH1	YOL054W	ATP18	P81450	59 aa		3.96	□□□□□ -1.78
PSH1	YOL054W	YEL045C	P32616	141 aa		3.95	□□□□□ -1.78
PSH1	YOL054W	YHL018W	P38744	120 aa	Predicted RBP	3.95	□□□□□ -1.78

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