RNA–Protein interactions for RNA: YMR196W

YMR196W, Transcript of Putative protein of unknown function, yeastyeast

Gene YMR196W, Length 3,267 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YMR196WYMR196W RRT13P40042 185 aa3.6□□□□□ -1.83
YMR196WYMR196W SIM1P40472 476 aa3.6□□□□□ -1.83
YMR196WYMR196W YCL042WP25572 119 aa3.59□□□□□ -1.83
YMR196WYMR196W COX12Q01519 83 aa3.59□□□□□ -1.83
YMR196WYMR196W HAL1Q01766 294 aa3.59□□□□□ -1.83
YMR196WYMR196W SNF11P38956 169 aa3.59□□□□□ -1.83
YMR196WYMR196W SPI1P40092 148 aa3.59□□□□□ -1.83
YMR196WYMR196W RPS22BQ3E7Y3 130 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
YMR196WYMR196W YPI1P43587 155 aa3.59□□□□□ -1.84
YMR196WYMR196W SKI6P46948 246 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.84
YMR196WYMR196W YLR342W-AQ3E810 57 aa3.59□□□□□ -1.84
YMR196WYMR196W YML100W-AQ8TGT0 57 aa3.59□□□□□ -1.84
YMR196WYMR196W CCW14O13547 238 aa3.58□□□□□ -1.84
YMR196WYMR196W YNL217WP40152 326 aa3.58□□□□□ -1.84
YMR196WYMR196W YDR381C-AQ3E6R5 114 aa3.58□□□□□ -1.84
YMR196WYMR196W DDR48P18899 430 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
YMR196WYMR196W YAL064WP39711 94 aa3.58□□□□□ -1.84
YMR196WYMR196W HPA2Q06592 156 aa3.58□□□□□ -1.84
YMR196WYMR196W YKL023C-AQ2V2P3 75 aa3.58□□□□□ -1.84
YMR196WYMR196W SCS22Q6Q595 175 aa3.58□□□□□ -1.84
YMR196WYMR196W RPS8AP0CX39 200 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
YMR196WYMR196W RPS8BP0CX40 200 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
YMR196WYMR196W YNL200CP40165 246 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
YMR196WYMR196W YFR032C-BQ8TGU2 87 aa3.57□□□□□ -1.84
YMR196WYMR196W DYN1P36022 4092 aa3.57□□□□□ -1.84
YMR196WYMR196W YEL045CP32616 141 aa3.57□□□□□ -1.84
YMR196WYMR196W PET8P38921 284 aa3.57□□□□□ -1.84
YMR196WYMR196W TDA2P40045 126 aa3.57□□□□□ -1.84
YMR196WYMR196W YFL019CP43576 117 aa3.57□□□□□ -1.84
YMR196WYMR196W RPL23AP0CX41 137 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
YMR196WYMR196W RPL23BP0CX42 137 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
YMR196WYMR196W SPG1P50088 95 aa3.57□□□□□ -1.84
YMR196WYMR196W TDA8Q6B2U8 126 aa3.57□□□□□ -1.84
YMR196WYMR196W PAU7P39545 55 aa3.56□□□□□ -1.84
YMR196WYMR196W UTP20P35194 2493 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
YMR196WYMR196W BRP1P53194 125 aa3.56□□□□□ -1.84
YMR196WYMR196W PRM7Q12459 698 aa3.56□□□□□ -1.84
YMR196WYMR196W TAR1Q8TGM6 124 aa3.55□□□□□ -1.84
YMR196WYMR196W YNL146C-AQ3E7Z1 64 aa3.55□□□□□ -1.84
YMR196WYMR196W YHR022CP38763 256 aa3.55□□□□□ -1.84
YMR196WYMR196W YER135CP40082 130 aa3.55□□□□□ -1.84
YMR196WYMR196W CCW12Q12127 133 aa3.55□□□□□ -1.84
YMR196WYMR196W YKL044WP36092 106 aa3.54□□□□□ -1.84
YMR196WYMR196W ICY1Q04329 127 aa3.54□□□□□ -1.84
YMR196WYMR196W YOL014WQ08110 124 aa3.54□□□□□ -1.84
YMR196WYMR196W TIM22Q12328 207 aa3.54□□□□□ -1.84
YMR196WYMR196W YOR011W-AQ3E807 68 aa3.54□□□□□ -1.84
YMR196WYMR196W HUR1P45820 110 aa3.54□□□□□ -1.84
YMR196WYMR196W YOR268CQ08734 132 aa3.54□□□□□ -1.84
YMR196WYMR196W YOL085CQ99345 113 aa3.54□□□□□ -1.84
YMR196WYMR196W YKR032WP36127 104 aa3.53□□□□□ -1.84
YMR196WYMR196W LSM6Q06406 86 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
YMR196WYMR196W YHR212W-AP0CX91 67 aa3.53□□□□□ -1.84
YMR196WYMR196W YGL118CP53132 145 aa3.53□□□□□ -1.84
YMR196WYMR196W YMR295CQ03559 197 aa3.53□□□□□ -1.84
YMR196WYMR196W EDC2P40023 145 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
YMR196WYMR196W AGA1P32323 725 aa3.52□□□□□ -1.85
YMR196WYMR196W ICS3P47034 131 aa3.52□□□□□ -1.85
YMR196WYMR196W MRP10O75012 95 aa3.52□□□□□ -1.85
YMR196WYMR196W RSM18P40033 138 aa3.52□□□□□ -1.85
YMR196WYMR196W YMR244WQ04018 355 aa3.52□□□□□ -1.85
YMR196WYMR196W MIG3P39943 394 aa3.51□□□□□ -1.85
YMR196WYMR196W YDR274CP87283 123 aa3.51□□□□□ -1.85
YMR196WYMR196W YIL014C-AQ02598 104 aa3.51□□□□□ -1.85
YMR196WYMR196W MRPS8Q03799 155 aa3.51□□□□□ -1.85
YMR196WYMR196W YBR200W-AQ3E755 54 aa3.5□□□□□ -1.85
YMR196WYMR196W YBL008W-AQ3E821 79 aa3.5□□□□□ -1.85
YMR196WYMR196W FYV5P25585 152 aa3.5□□□□□ -1.85
YMR196WYMR196W YER187WP40102 141 aa3.5□□□□□ -1.85
YMR196WYMR196W MGR2Q02889 113 aa3.5□□□□□ -1.85
YMR196WYMR196W FYV12Q08559 129 aa3.5□□□□□ -1.85
YMR196WYMR196W HHF1P02309 103 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
YMR196WYMR196W MPC2P38857 129 aa3.49□□□□□ -1.85
YMR196WYMR196W VTC1P40046 129 aaRIP-Chip data3.49□□□□□ -1.85not detected
YMR196WYMR196W YGR035W-AQ45U48 73 aa3.49□□□□□ -1.85
YMR196WYMR196W PBA1Q05778 276 aa3.48□□□□□ -1.85
YMR196WYMR196W YPR053CQ6Q5F3 151 aa3.48□□□□□ -1.85
YMR196WYMR196W PFY1P07274 126 aa3.47□□□□□ -1.85
YMR196WYMR196W YHL005CP38752 130 aa3.47□□□□□ -1.85
YMR196WYMR196W RPL26AP05743 127 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
YMR196WYMR196W RPL42AP0CX27 106 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
YMR196WYMR196W RPL42BP0CX28 106 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
YMR196WYMR196W CRC1Q12289 327 aa3.46□□□□□ -1.86
YMR196WYMR196W ATP15P21306 62 aa3.45□□□□□ -1.86
YMR196WYMR196W QCR10P37299 77 aa3.45□□□□□ -1.86
YMR196WYMR196W SAP30P38429 201 aa3.45□□□□□ -1.86
YMR196WYMR196W TOS6P48560 102 aa3.45□□□□□ -1.86
YMR196WYMR196W YGL015CP33199 130 aa3.45□□□□□ -1.86
YMR196WYMR196W RPS11AP0CX47 156 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
YMR196WYMR196W RPS11BP0CX48 156 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
YMR196WYMR196W YSY6P38374 65 aa3.45□□□□□ -1.86
YMR196WYMR196W YAR023CD6VPM8 179 aa3.44□□□□□ -1.86
YMR196WYMR196W COA3Q3E7B2 85 aa3.44□□□□□ -1.86
YMR196WYMR196W YOR381W-AQ3E804 55 aa3.44□□□□□ -1.86
YMR196WYMR196W DCV1P43595 202 aa3.43□□□□□ -1.86
YMR196WYMR196W PPT2Q12036 173 aa3.43□□□□□ -1.86
YMR196WYMR196W YLR156WP0CE96 114 aa3.43□□□□□ -1.86
YMR196WYMR196W YLR159WP0CE97 114 aa3.43□□□□□ -1.86
YMR196WYMR196W YLR161WP0CE98 114 aa3.43□□□□□ -1.86
YMR196WYMR196W LIP1Q03579 150 aa3.43□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 79.9 ms