RNA–Protein interactions for RNA: YJR147W

HMS2, Transcript of Protein with similarity to heat shock transcription factors, yeast

Gene HMS2, Length 1,077 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
HMS2	YJR147W	AGA1	P32323	725 aa		5.09	□□□□□ -1.59
HMS2	YJR147W	YBL071C	P38185	102 aa		5.09	□□□□□ -1.59
HMS2	YJR147W	YHL005C	P38752	130 aa		5.09	□□□□□ -1.59
HMS2	YJR147W	EDC2	P40023	145 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
HMS2	YJR147W	YFR035C	P43608	114 aa		5.09	□□□□□ -1.59
HMS2	YJR147W	YOL014W	Q08110	124 aa		5.09	□□□□□ -1.59
HMS2	YJR147W	CRC1	Q12289	327 aa		5.09	□□□□□ -1.59
HMS2	YJR147W	YLR111W	Q12528	110 aa		5.09	□□□□□ -1.59
HMS2	YJR147W	YML100W-A	Q8TGT0	57 aa		5.09	□□□□□ -1.59
HMS2	YJR147W	YLR156W	P0CE96	114 aa		5.08	□□□□□ -1.6
HMS2	YJR147W	YLR159W	P0CE97	114 aa		5.08	□□□□□ -1.6
HMS2	YJR147W	YLR161W	P0CE98	114 aa		5.08	□□□□□ -1.6
HMS2	YJR147W	RPB9	P27999	122 aa		5.08	□□□□□ -1.6
HMS2	YJR147W	IMP2	P46972	177 aa		5.08	□□□□□ -1.6
HMS2	YJR147W	MPC3	P53311	146 aa		5.08	□□□□□ -1.6
HMS2	YJR147W	YDR274C	P87283	123 aa		5.08	□□□□□ -1.6
HMS2	YJR147W	YDR246W-A	Q3E763	66 aa		5.08	□□□□□ -1.6
HMS2	YJR147W	CDC39	P25655	2108 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
HMS2	YJR147W	ERI1	P62651	68 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
HMS2	YJR147W	IRC21	Q04772	201 aa		5.07	□□□□□ -1.6
HMS2	YJR147W	YOR268C	Q08734	132 aa		5.07	□□□□□ -1.6
HMS2	YJR147W	YPL278C	Q08990	100 aa		5.07	□□□□□ -1.6
HMS2	YJR147W	VPS68	Q12016	184 aa		5.07	□□□□□ -1.6
HMS2	YJR147W	YDR182W-A	Q3E796	67 aa		5.07	□□□□□ -1.6
HMS2	YJR147W	YOR376W-A	Q3E805	51 aa		5.07	□□□□□ -1.6
HMS2	YJR147W	RPL26B	P53221	127 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
HMS2	YJR147W	RPL36B	O14455	100 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
HMS2	YJR147W	RPL36A	P05745	100 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
HMS2	YJR147W	ATP15	P21306	62 aa		5.05	□□□□□ -1.6
HMS2	YJR147W	YNL208W	P40159	199 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
HMS2	YJR147W	YMR141C	P40211	102 aa		5.05	□□□□□ -1.6
HMS2	YJR147W	YLR162W	Q06235	118 aa		5.05	□□□□□ -1.6
HMS2	YJR147W	NAG1	Q8TGN9	163 aa		5.05	□□□□□ -1.6
HMS2	YJR147W	QCR8	P08525	94 aa		5.03	□□□□□ -1.6
HMS2	YJR147W	YCR022C	P25620	114 aa		5.03	□□□□□ -1.6
HMS2	YJR147W	SHU1	P38751	150 aa		5.03	□□□□□ -1.6
HMS2	YJR147W	MIG3	P39943	394 aa		5.03	□□□□□ -1.6
HMS2	YJR147W	SRL1	Q08673	210 aa		5.03	□□□□□ -1.6
HMS2	YJR147W	PRM7	Q12459	698 aa		5.03	□□□□□ -1.6
HMS2	YJR147W	YGR121W-A	Q3E816	71 aa		5.03	□□□□□ -1.6
HMS2	YJR147W	OST5	Q92316	86 aa		5.03	□□□□□ -1.6
HMS2	YJR147W	HHF1	P02309	103 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
HMS2	YJR147W	COX14	P39103	70 aa		5.02	□□□□□ -1.61
HMS2	YJR147W	YNL190W	P53872	204 aa		5.02	□□□□□ -1.61
HMS2	YJR147W	YSF3	P0C074	85 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
HMS2	YJR147W	YJR107C-A	P0CT86	78 aa		5.01	□□□□□ -1.61
HMS2	YJR147W	MRPS12	P53732	153 aa		5.01	□□□□□ -1.61
HMS2	YJR147W	YOR020W-A	Q3E824	90 aa		5.01	□□□□□ -1.61
HMS2	YJR147W	YFL015C	P43578	164 aa		5	□□□□□ -1.61
HMS2	YJR147W	TAO3	P40468	2376 aa		4.99	□□□□□ -1.61
HMS2	YJR147W	HSP150	P32478	413 aa		4.98	□□□□□ -1.61
HMS2	YJR147W	YEL045C	P32616	141 aa		4.98	□□□□□ -1.61
HMS2	YJR147W	YAL064W	P39711	94 aa		4.98	□□□□□ -1.61
HMS2	YJR147W	YER135C	P40082	130 aa		4.98	□□□□□ -1.61
HMS2	YJR147W	ARC15	P40518	154 aa	RIP-Chip data	4.98	□□□□□ -1.61	not detected
HMS2	YJR147W	YMR122C	Q03879	124 aa		4.98	□□□□□ -1.61
HMS2	YJR147W	YER188C-A	P0C0V2	99 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HMS2	YJR147W	DDR48	P18899	430 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
HMS2	YJR147W	RRT1	P38192	103 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HMS2	YJR147W	YIR020C	P40575	100 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HMS2	YJR147W	RGM1	Q00453	211 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HMS2	YJR147W	VPS13	Q07878	3144 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HMS2	YJR147W	RPS23A	P0CX29	145 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
HMS2	YJR147W	RPS23B	P0CX30	145 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HMS2	YJR147W	FYV12	Q08559	129 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HMS2	YJR147W	YGR035W-A	Q45U48	73 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HMS2	YJR147W	NOP10	Q6Q547	58 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
HMS2	YJR147W	EDC1	P53080	175 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
HMS2	YJR147W	ATP18	P81450	59 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HMS2	YJR147W	YLR236C	A0A023PZG4	107 aa		4.93	□□□□□ -1.62
HMS2	YJR147W	YCR043C	P25361	127 aa		4.93	□□□□□ -1.62
HMS2	YJR147W	FYV5	P25585	152 aa		4.93	□□□□□ -1.62
HMS2	YJR147W	RPL38	P49167	78 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
HMS2	YJR147W	SED1	Q01589	338 aa		4.93	□□□□□ -1.62
HMS2	YJR147W	UTH1	P36135	365 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HMS2	YJR147W	YHL037C	P38733	133 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HMS2	YJR147W	KRE9	P39005	276 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HMS2	YJR147W	REE1	P40893	198 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HMS2	YJR147W	YJR146W	P47174	117 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HMS2	YJR147W	RPS30A	P0CX33	63 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
HMS2	YJR147W	RPS30B	P0CX34	63 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
HMS2	YJR147W	MRPS8	Q03799	155 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HMS2	YJR147W	YPR153W	Q06537	140 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HMS2	YJR147W	HUB1	Q6Q546	73 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HMS2	YJR147W	YPR117W	Q06116	2489 aa		4.9	□□□□□ -1.62
HMS2	YJR147W	YMR244W	Q04018	355 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HMS2	YJR147W	YAR023C	D6VPM8	179 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HMS2	YJR147W	LIP1	Q03579	150 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HMS2	YJR147W	YOL166W-A	Q8TGJ1	51 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HMS2	YJR147W	TVP23	P38962	199 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HMS2	YJR147W	TMC1	Q08422	150 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
HMS2	YJR147W	YOR034C-A	Q3E735	80 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HMS2	YJR147W	QCR10	P37299	77 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HMS2	YJR147W	RPS27A	P35997	82 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
HMS2	YJR147W	RPS27B	P38711	82 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HMS2	YJR147W	RPR2	P40571	144 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HMS2	YJR147W	YCR095W-A	Q3E787	52 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HMS2	YJR147W	YJL027C	P47063	138 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
HMS2	YJR147W	YIL102C	P40488	101 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HMS2	YJR147W	HOT13	P36078	116 aa		4.82	□□□□□ -1.64

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