RNA–Protein interactions for RNA: YJL039C

NUP192, Transcript of Essential subunit of the inner ring of the nuclear pore complex (NPC), yeast

Gene NUP192, Length 5,052 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NUP192	YJL039C	PCL2	P25693	308 aa		0.86	□□□□□ -2.27
NUP192	YJL039C	TAD2	P47058	250 aa		0.86	□□□□□ -2.27
NUP192	YJL039C	YML054C-A	Q3E809	52 aa		0.86	□□□□□ -2.27
NUP192	YJL039C	YLR255C	O13574	117 aa		0.86	□□□□□ -2.27
NUP192	YJL039C	ERV14	P53173	138 aa		0.86	□□□□□ -2.27
NUP192	YJL039C	YBR182C-A	Q8TGU6	64 aa		0.86	□□□□□ -2.27
NUP192	YJL039C	YCL001W-B	Q96VH2	84 aa		0.86	□□□□□ -2.27
NUP192	YJL039C	ICY1	Q04329	127 aa		0.85	□□□□□ -2.27
NUP192	YJL039C	YBR219C	P38317	127 aa		0.85	□□□□□ -2.27
NUP192	YJL039C	SRP14	P38985	146 aa		0.85	□□□□□ -2.27
NUP192	YJL039C	POG1	P40473	351 aa		0.85	□□□□□ -2.27
NUP192	YJL039C	YGL230C	P53074	147 aa		0.85	□□□□□ -2.27
NUP192	YJL039C	YPL257W	Q08974	193 aa		0.85	□□□□□ -2.27
NUP192	YJL039C	PAU17	Q12370	124 aa		0.85	□□□□□ -2.27
NUP192	YJL039C	FMP49	A0A023PZB3	126 aa		0.85	□□□□□ -2.27
NUP192	YJL039C	YJR111C	P47148	283 aa	Known RBP	0.85	□□□□□ -2.27
NUP192	YJL039C	SMD1	Q02260	146 aa	Predicted RBP	0.85	□□□□□ -2.27
NUP192	YJL039C	YOR072W	Q08486	104 aa		0.85	□□□□□ -2.27
NUP192	YJL039C	YPR014C	Q6B0W2	109 aa		0.85	□□□□□ -2.27
NUP192	YJL039C	MSA2	P36157	363 aa		0.84	□□□□□ -2.27
NUP192	YJL039C	YML079W	Q03629	201 aa		0.84	□□□□□ -2.27
NUP192	YJL039C	CMC2	Q3E7A4	109 aa		0.84	□□□□□ -2.27
NUP192	YJL039C	YHR073W-A	P0C5N7	58 aa		0.84	□□□□□ -2.27
NUP192	YJL039C	YGL118C	P53132	145 aa		0.84	□□□□□ -2.27
NUP192	YJL039C	DAD3	P69850	94 aa		0.84	□□□□□ -2.27
NUP192	YJL039C	YAR1	P46683	200 aa		0.84	□□□□□ -2.28
NUP192	YJL039C	EOS1	P53938	366 aa		0.84	□□□□□ -2.28
NUP192	YJL039C	FYV7	Q12247	151 aa		0.84	□□□□□ -2.28
NUP192	YJL039C	YCR024C-B	Q3E7Z8	88 aa		0.84	□□□□□ -2.28
NUP192	YJL039C	NHP6A	P11632	93 aa	Known RBP	0.84	□□□□□ -2.28
NUP192	YJL039C	YBR209W	P38311	105 aa		0.84	□□□□□ -2.28
NUP192	YJL039C	YBR230W-A	Q3E762	66 aa		0.84	□□□□□ -2.28
NUP192	YJL039C	CKS1	P20486	150 aa	Known RBP	0.83	□□□□□ -2.28
NUP192	YJL039C	YCR007C	P25354	239 aa		0.83	□□□□□ -2.28
NUP192	YJL039C	YLL006W-A	Q3E814	58 aa		0.83	□□□□□ -2.28
NUP192	YJL039C	YER134C	P40081	178 aa		0.83	□□□□□ -2.28
NUP192	YJL039C	RPL27B	P0C2H7	136 aa	Known RBP	0.83	□□□□□ -2.28
NUP192	YJL039C	FYV5	P25585	152 aa		0.83	□□□□□ -2.28
NUP192	YJL039C	YDL012C	Q12489	107 aa		0.83	□□□□□ -2.28
NUP192	YJL039C	YJL127C-B	Q3E828	52 aa		0.83	□□□□□ -2.28
NUP192	YJL039C	YIL024C	P40543	189 aa		0.83	□□□□□ -2.28
NUP192	YJL039C	OST2	P46964	130 aa		0.83	□□□□□ -2.28
NUP192	YJL039C	GSP2	P32836	220 aa	Known RBP	0.82	□□□□□ -2.28
NUP192	YJL039C	YEL067C	P39978	195 aa		0.82	□□□□□ -2.28
NUP192	YJL039C	YGR164W	P53291	111 aa		0.82	□□□□□ -2.28
NUP192	YJL039C	YLR050C	Q12155	161 aa	Known RBP	0.82	□□□□□ -2.28
NUP192	YJL039C	ATP14	Q12349	124 aa		0.82	□□□□□ -2.28
NUP192	YJL039C	YGL194C-A	Q2V2P6	80 aa		0.82	□□□□□ -2.28
NUP192	YJL039C	UBC12	P52491	188 aa		0.82	□□□□□ -2.28
NUP192	YJL039C	AIM4	P38305	123 aa	Predicted RBP	0.81	□□□□□ -2.28
NUP192	YJL039C	CWC27	Q02770	301 aa		0.81	□□□□□ -2.28
NUP192	YJL039C	HIT1	P46973	164 aa		0.81	□□□□□ -2.28
NUP192	YJL039C	YJL009W	P47078	108 aa		0.81	□□□□□ -2.28
NUP192	YJL039C	YJR128W	P47162	119 aa		0.81	□□□□□ -2.28
NUP192	YJL039C	PAU23	Q07987	124 aa		0.81	□□□□□ -2.28
NUP192	YJL039C	PRE1	P22141	198 aa	Known RBP	0.81	□□□□□ -2.28
NUP192	YJL039C	YBR016W	P38216	128 aa		0.81	□□□□□ -2.28
NUP192	YJL039C	ADD37	Q03233	198 aa		0.81	□□□□□ -2.28
NUP192	YJL039C	YML108W	Q03759	105 aa		0.81	□□□□□ -2.28
NUP192	YJL039C	TDA8	Q6B2U8	126 aa		0.81	□□□□□ -2.28
NUP192	YJL039C	FYV4	P38783	130 aa	Predicted RBP	0.8	□□□□□ -2.28
NUP192	YJL039C	YER085C	P40058	173 aa		0.8	□□□□□ -2.28
NUP192	YJL039C	YKL044W	P36092	106 aa		0.8	□□□□□ -2.28
NUP192	YJL039C	IGO2	Q9P305	131 aa		0.8	□□□□□ -2.28
NUP192	YJL039C	RPL36B	O14455	100 aa	Known RBP	0.8	□□□□□ -2.28
NUP192	YJL039C	YNL184C	P53876	108 aa		0.8	□□□□□ -2.28
NUP192	YJL039C	TPT1	Q12272	230 aa	Known RBP	0.8	□□□□□ -2.28
NUP192	YJL039C	HOT13	P36078	116 aa		0.79	□□□□□ -2.28
NUP192	YJL039C	ISD11	Q6Q560	94 aa		0.79	□□□□□ -2.28
NUP192	YJL039C	RPL23A	P0CX41	137 aa	Known RBP	0.79	□□□□□ -2.28
NUP192	YJL039C	RPL23B	P0CX42	137 aa	Known RBP	0.79	□□□□□ -2.28
NUP192	YJL039C	MPC3	P53311	146 aa		0.79	□□□□□ -2.28
NUP192	YJL039C	YDL157C	Q12082	118 aa		0.79	□□□□□ -2.28
NUP192	YJL039C	BSC4	P53841	131 aa		0.79	□□□□□ -2.28
NUP192	YJL039C	TSC3	Q3E790	80 aa		0.79	□□□□□ -2.28
NUP192	YJL039C	ATP5	P09457	212 aa		0.78	□□□□□ -2.28
NUP192	YJL039C	MRPL11	P36521	249 aa	Predicted RBP	0.78	□□□□□ -2.28
NUP192	YJL039C	YHR130C	P38834	111 aa		0.78	□□□□□ -2.28
NUP192	YJL039C	AIM11	P87275	137 aa		0.78	□□□□□ -2.28
NUP192	YJL039C	IRC21	Q04772	201 aa		0.78	□□□□□ -2.28
NUP192	YJL039C	YIA6	P40556	373 aa		0.78	□□□□□ -2.28
NUP192	YJL039C	YNR034W-A	Q3E841	98 aa		0.78	□□□□□ -2.28
NUP192	YJL039C	BET1	P22804	142 aa		0.78	□□□□□ -2.29
NUP192	YJL039C	YFR057W	P43625	151 aa		0.78	□□□□□ -2.29
NUP192	YJL039C	YGL088W	P53151	121 aa		0.78	□□□□□ -2.29
NUP192	YJL039C	RSM19	P53733	91 aa	Predicted RBP	0.77	□□□□□ -2.29
NUP192	YJL039C	HPA2	Q06592	156 aa		0.77	□□□□□ -2.29
NUP192	YJL039C	MRPS12	P53732	153 aa		0.77	□□□□□ -2.29
NUP192	YJL039C	VMA9	Q3E7B6	73 aa		0.77	□□□□□ -2.29
NUP192	YJL039C	SRB6	P32570	121 aa		0.77	□□□□□ -2.29
NUP192	YJL039C	GSP1	P32835	219 aa	Known RBP	0.77	□□□□□ -2.29
NUP192	YJL039C	YBR027C	P38220	110 aa		0.77	□□□□□ -2.29
NUP192	YJL039C	HUA1	P40325	198 aa		0.77	□□□□□ -2.29
NUP192	YJL039C	YOR304C-A	O14468	76 aa		0.77	□□□□□ -2.29
NUP192	YJL039C	YIL014C-A	Q02598	104 aa		0.77	□□□□□ -2.29
NUP192	YJL039C	ZEO1	Q08245	113 aa		0.77	□□□□□ -2.29
NUP192	YJL039C	COF1	Q03048	143 aa	Known RBP	0.76	□□□□□ -2.29
NUP192	YJL039C	WIP1	Q2V2P8	89 aa		0.76	□□□□□ -2.29
NUP192	YJL039C	YHR139C-A	O13536	103 aa		0.76	□□□□□ -2.29
NUP192	YJL039C	SEC11	P15367	167 aa		0.76	□□□□□ -2.29

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