RNA–Protein interactions for RNA: YJL033W

HCA4, Transcript of DEAD box RNA helicase, yeastyeast

Gene HCA4, Length 2,313 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HCA4YJL033W MRPL39P36533 70 aa2.92□□□□□ -1.94
HCA4YJL033W YAR029WP39549 74 aa2.92□□□□□ -1.94
HCA4YJL033W YER187WP40102 141 aa2.92□□□□□ -1.94
HCA4YJL033W EMC6Q12431 108 aa2.92□□□□□ -1.94
HCA4YJL033W RPL16BP26785 198 aaKnown RBP2.92□□□□□ -1.94
HCA4YJL033W TOS6P48560 102 aa2.92□□□□□ -1.94
HCA4YJL033W YGR018CP53211 109 aa2.92□□□□□ -1.94
HCA4YJL033W YNL277W-AQ3E7Z0 62 aa2.92□□□□□ -1.94
HCA4YJL033W YMR105W-AQ8TGS8 64 aa2.91□□□□□ -1.94
HCA4YJL033W RPL28P02406 149 aaKnown RBP2.91□□□□□ -1.94
HCA4YJL033W YBL071CP38185 102 aa2.91□□□□□ -1.94
HCA4YJL033W YGR164WP53291 111 aa2.91□□□□□ -1.94
HCA4YJL033W TMC1Q08422 150 aaPredicted RBP2.91□□□□□ -1.94
HCA4YJL033W UBC4P15731 148 aa2.9□□□□□ -1.95
HCA4YJL033W ATP15P21306 62 aa2.9□□□□□ -1.95
HCA4YJL033W YGR025WP53216 100 aa2.9□□□□□ -1.95
HCA4YJL033W HAL1Q01766 294 aa2.9□□□□□ -1.95
HCA4YJL033W RRT15Q3E811 62 aa2.9□□□□□ -1.95
HCA4YJL033W URA2P07259 2214 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
HCA4YJL033W SPI1P40092 148 aa2.9□□□□□ -1.95
HCA4YJL033W YKR045CP36138 183 aa2.89□□□□□ -1.95
HCA4YJL033W YFL019CP43576 117 aa2.89□□□□□ -1.95
HCA4YJL033W SED1Q01589 338 aa2.89□□□□□ -1.95
HCA4YJL033W SPS100P13130 326 aa2.88□□□□□ -1.95
HCA4YJL033W MPC2P38857 129 aa2.88□□□□□ -1.95
HCA4YJL033W PEX22P39718 180 aa2.88□□□□□ -1.95
HCA4YJL033W MMS2P53152 137 aa2.88□□□□□ -1.95
HCA4YJL033W YCL048W-AQ2V2Q2 79 aa2.88□□□□□ -1.95
HCA4YJL033W YOR032W-AQ8TGS1 66 aa2.88□□□□□ -1.95
HCA4YJL033W HUR1P45820 110 aa2.88□□□□□ -1.95
HCA4YJL033W YDR246W-AQ3E763 66 aa2.88□□□□□ -1.95
HCA4YJL033W YLR285C-AQ3E771 56 aa2.88□□□□□ -1.95
HCA4YJL033W YLR342W-AQ3E810 57 aa2.88□□□□□ -1.95
HCA4YJL033W DCV1P43595 202 aa2.87□□□□□ -1.95
HCA4YJL033W YOR268CQ08734 132 aa2.87□□□□□ -1.95
HCA4YJL033W YOR008C-AQ3E7B9 74 aa2.87□□□□□ -1.95
HCA4YJL033W MEC1P38111 2368 aa2.87□□□□□ -1.95
HCA4YJL033W MSA2P36157 363 aa2.87□□□□□ -1.95
HCA4YJL033W IMP2P46972 177 aa2.87□□□□□ -1.95
HCA4YJL033W MRPS12P53732 153 aa2.87□□□□□ -1.95
HCA4YJL033W TDA8Q6B2U8 126 aa2.87□□□□□ -1.95
HCA4YJL033W YHR213WP0CI67 198 aa2.86□□□□□ -1.95
HCA4YJL033W ICY1Q04329 127 aa2.86□□□□□ -1.95
HCA4YJL033W PBP4Q07362 185 aaKnown RBP2.86□□□□□ -1.95
HCA4YJL033W YLR156WP0CE96 114 aa2.86□□□□□ -1.95
HCA4YJL033W YLR159WP0CE97 114 aa2.86□□□□□ -1.95
HCA4YJL033W YLR161WP0CE98 114 aa2.86□□□□□ -1.95
HCA4YJL033W YHR022CP38763 256 aa2.86□□□□□ -1.95
HCA4YJL033W KEG1P43614 200 aa2.86□□□□□ -1.95
HCA4YJL033W CCW14O13547 238 aa2.85□□□□□ -1.95
HCA4YJL033W RPS23AP0CX29 145 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
HCA4YJL033W RPS23BP0CX30 145 aa2.85□□□□□ -1.95
HCA4YJL033W COX14P39103 70 aa2.85□□□□□ -1.95
HCA4YJL033W ERI1P62651 68 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
HCA4YJL033W RSM19P53733 91 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
HCA4YJL033W YOR034C-AQ3E735 80 aa2.85□□□□□ -1.95
HCA4YJL033W MIC10Q96VH5 97 aa2.85□□□□□ -1.95
HCA4YJL033W TOR1P35169 2470 aa2.84□□□□□ -1.95
HCA4YJL033W AIM4P38305 123 aaPredicted RBP2.84□□□□□ -1.95
HCA4YJL033W EDC1P53080 175 aaPredicted RBP2.84□□□□□ -1.95
HCA4YJL033W SPT4P32914 102 aaPredicted RBP2.84□□□□□ -1.96
HCA4YJL033W SHU1P38751 150 aa2.84□□□□□ -1.96
HCA4YJL033W ICS3P47034 131 aa2.84□□□□□ -1.96
HCA4YJL033W YJR085CP47131 105 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.96
HCA4YJL033W YNL046WP53956 172 aa2.84□□□□□ -1.96
HCA4YJL033W ATP20Q12233 115 aa2.84□□□□□ -1.96
HCA4YJL033W YOL085CQ99345 113 aa2.84□□□□□ -1.96
HCA4YJL033W RPL16AP26784 199 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
HCA4YJL033W YBL081WP38180 368 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
HCA4YJL033W RRT1P38192 103 aa2.83□□□□□ -1.96
HCA4YJL033W MIG3P39943 394 aa2.83□□□□□ -1.96
HCA4YJL033W PEX17P40155 199 aa2.83□□□□□ -1.96
HCA4YJL033W GAT4P40569 121 aa2.82□□□□□ -1.96
HCA4YJL033W YMR295CQ03559 197 aa2.82□□□□□ -1.96
HCA4YJL033W IRC21Q04772 201 aa2.82□□□□□ -1.96
HCA4YJL033W ARC15P40518 154 aaRIP-Chip data2.82□□□□□ -1.96not detected
HCA4YJL033W YJL027CP47063 138 aaPredicted RBP2.82□□□□□ -1.96
HCA4YJL033W YJR146WP47174 117 aa2.82□□□□□ -1.96
HCA4YJL033W YOR376W-AQ3E805 51 aa2.82□□□□□ -1.96
HCA4YJL033W NUM1Q00402 2748 aa2.81□□□□□ -1.96
HCA4YJL033W MRPL38P35996 138 aaPredicted RBP2.81□□□□□ -1.96
HCA4YJL033W YDR274CP87283 123 aa2.81□□□□□ -1.96
HCA4YJL033W RGM1Q00453 211 aa2.81□□□□□ -1.96
HCA4YJL033W YOL160WQ08321 113 aa2.81□□□□□ -1.96
HCA4YJL033W YOR381W-AQ3E804 55 aa2.81□□□□□ -1.96
HCA4YJL033W YAL065CO13511 128 aa2.8□□□□□ -1.96
HCA4YJL033W YJR107C-AP0CT86 78 aa2.8□□□□□ -1.96
HCA4YJL033W RSM18P40033 138 aa2.8□□□□□ -1.96
HCA4YJL033W RPL26AP05743 127 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
HCA4YJL033W YHL037CP38733 133 aa2.8□□□□□ -1.96
HCA4YJL033W RPL26BP53221 127 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
HCA4YJL033W SMD1Q02260 146 aaPredicted RBP2.8□□□□□ -1.96
HCA4YJL033W YGL088WP53151 121 aa2.79□□□□□ -1.96
HCA4YJL033W SPO24Q3E752 67 aa2.79□□□□□ -1.96
HCA4YJL033W YGR121W-AQ3E816 71 aa2.79□□□□□ -1.96
HCA4YJL033W NOP10Q6Q547 58 aaPredicted RBP2.79□□□□□ -1.96
HCA4YJL033W QCR8P08525 94 aa2.79□□□□□ -1.96
HCA4YJL033W YGL034CP53186 121 aa2.79□□□□□ -1.96
HCA4YJL033W RPB9P27999 122 aa2.78□□□□□ -1.96
HCA4YJL033W RPL38P49167 78 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
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