RNA–Protein interactions for RNA: YKR082W

NUP133, Transcript of Subunit of Nup84p subcomplex of nuclear pore complex (NPC), yeast

Gene NUP133, Length 3,474 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NUP133	YKR082W	YPL261C	Q08976	102 aa		3.19	□□□□□ -1.9
NUP133	YKR082W	YLR111W	Q12528	110 aa		3.19	□□□□□ -1.9
NUP133	YKR082W	YEL045C	P32616	141 aa		3.19	□□□□□ -1.9
NUP133	YKR082W	CTR2	P38865	189 aa		3.19	□□□□□ -1.9
NUP133	YKR082W	BNS1	P50084	137 aa		3.19	□□□□□ -1.9
NUP133	YKR082W	MPC3	P53311	146 aa		3.19	□□□□□ -1.9
NUP133	YKR082W	MET31	Q03081	177 aa		3.19	□□□□□ -1.9
NUP133	YKR082W	HPA2	Q06592	156 aa		3.19	□□□□□ -1.9
NUP133	YKR082W	YHR213W	P0CI67	198 aa		3.18	□□□□□ -1.9
NUP133	YKR082W	IGO1	P53897	168 aa		3.18	□□□□□ -1.9
NUP133	YKR082W	YMR175W-A	Q3E766	64 aa		3.18	□□□□□ -1.9
NUP133	YKR082W	ARC15	P40518	154 aa	RIP-Chip data	3.18	□□□□□ -1.9	not detected
NUP133	YKR082W	PAU15	P40585	124 aa		3.18	□□□□□ -1.9
NUP133	YKR082W	ICS3	P47034	131 aa		3.18	□□□□□ -1.9
NUP133	YKR082W	YHP1	Q04116	353 aa		3.18	□□□□□ -1.9
NUP133	YKR082W	YOR015W	Q12169	119 aa		3.18	□□□□□ -1.9
NUP133	YKR082W	PAU24	P38155	120 aa		3.18	□□□□□ -1.9
NUP133	YKR082W	YDR274C	P87283	123 aa		3.18	□□□□□ -1.9
NUP133	YKR082W	SOM1	Q05676	74 aa		3.17	□□□□□ -1.9
NUP133	YKR082W	YDR381C-A	Q3E6R5	114 aa		3.17	□□□□□ -1.9
NUP133	YKR082W	RPB7	P34087	171 aa		3.17	□□□□□ -1.9
NUP133	YKR082W	LST8	P41318	303 aa		3.17	□□□□□ -1.9
NUP133	YKR082W	YER187W	P40102	141 aa		3.17	□□□□□ -1.9
NUP133	YKR082W	PBA1	Q05778	276 aa		3.16	□□□□□ -1.9
NUP133	YKR082W	SLH1	P53327	1967 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
NUP133	YKR082W	PAU16	P35994	123 aa		3.16	□□□□□ -1.9
NUP133	YKR082W	PAU5	P43575	122 aa		3.16	□□□□□ -1.9
NUP133	YKR082W	TIM12	P32830	109 aa		3.16	□□□□□ -1.9
NUP133	YKR082W	IRC19	Q07843	230 aa		3.16	□□□□□ -1.9
NUP133	YKR082W	YPL038W-A	Q3E7B4	63 aa		3.16	□□□□□ -1.9
NUP133	YKR082W	RPL26A	P05743	127 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.9
NUP133	YKR082W	AYT1	Q12226	474 aa		3.15	□□□□□ -1.9
NUP133	YKR082W	PIR1	Q03178	341 aa		3.15	□□□□□ -1.91
NUP133	YKR082W	RPS22A	P0C0W1	130 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
NUP133	YKR082W	YJR085C	P47131	105 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
NUP133	YKR082W	YGL118C	P53132	145 aa		3.14	□□□□□ -1.91
NUP133	YKR082W	ECM19	Q06011	112 aa		3.14	□□□□□ -1.91
NUP133	YKR082W	YIL014C-A	Q02598	104 aa		3.14	□□□□□ -1.91
NUP133	YKR082W	YLR346C	Q06139	101 aa		3.14	□□□□□ -1.91
NUP133	YKR082W	CRC1	Q12289	327 aa		3.14	□□□□□ -1.91
NUP133	YKR082W	RPS22B	Q3E7Y3	130 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
NUP133	YKR082W	STT4	P37297	1900 aa		3.14	□□□□□ -1.91
NUP133	YKR082W	YBL059W	P34224	193 aa		3.14	□□□□□ -1.91
NUP133	YKR082W	LSM6	Q06406	86 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
NUP133	YKR082W	MRPL31	P14063	131 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
NUP133	YKR082W	FZF1	P32805	299 aa		3.13	□□□□□ -1.91
NUP133	YKR082W	YDL241W	Q07738	123 aa		3.13	□□□□□ -1.91
NUP133	YKR082W	YDR524C-B	Q3E6R4	66 aa		3.13	□□□□□ -1.91
NUP133	YKR082W	FPR2	P32472	135 aa		3.13	□□□□□ -1.91
NUP133	YKR082W	YPR096C	O13587	100 aa		3.12	□□□□□ -1.91
NUP133	YKR082W	UTH1	P36135	365 aa		3.12	□□□□□ -1.91
NUP133	YKR082W	SEC11	P15367	167 aa		3.12	□□□□□ -1.91
NUP133	YKR082W	IMP2	P46972	177 aa		3.12	□□□□□ -1.91
NUP133	YKR082W	OST5	Q92316	86 aa		3.12	□□□□□ -1.91
NUP133	YKR082W	RPL21A	Q02753	160 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
NUP133	YKR082W	RPL21B	Q12672	160 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
NUP133	YKR082W	YER078W-A	Q3E7A2	54 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NUP133	YKR082W	YHR125W	P38831	101 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NUP133	YKR082W	YMR244W	Q04018	355 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NUP133	YKR082W	HMRA2	P0CY13	119 aa		3.1	□□□□□ -1.91
NUP133	YKR082W	ROX3	P25046	220 aa		3.1	□□□□□ -1.91
NUP133	YKR082W	YCR043C	P25361	127 aa		3.1	□□□□□ -1.91
NUP133	YKR082W	ECO1	P43605	281 aa		3.1	□□□□□ -1.91
NUP133	YKR082W	VPS55	P47111	140 aa		3.1	□□□□□ -1.91
NUP133	YKR082W	YNL208W	P40159	199 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
NUP133	YKR082W	CRH1	P53301	507 aa		3.09	□□□□□ -1.91
NUP133	YKR082W	YMR254C	Q04838	102 aa		3.09	□□□□□ -1.91
NUP133	YKR082W	YLR194C	Q05777	254 aa		3.09	□□□□□ -1.91
NUP133	YKR082W	YHR214C-D	P0CX93	97 aa		3.09	□□□□□ -1.91
NUP133	YKR082W	DCV1	P43595	202 aa		3.09	□□□□□ -1.91
NUP133	YKR082W	COX12	Q01519	83 aa		3.09	□□□□□ -1.91
NUP133	YKR082W	YOR343C	Q12484	108 aa		3.09	□□□□□ -1.91
NUP133	YKR082W	YFL051C	P43552	160 aa		3.09	□□□□□ -1.92
NUP133	YKR082W	SPC1	P46965	94 aa		3.08	□□□□□ -1.92
NUP133	YKR082W	RGM1	Q00453	211 aa		3.08	□□□□□ -1.92
NUP133	YKR082W	API2	Q04413	109 aa		3.08	□□□□□ -1.92
NUP133	YKR082W	COX23	P38824	151 aa		3.08	□□□□□ -1.92
NUP133	YKR082W	YLR122C	Q12312	125 aa		3.07	□□□□□ -1.92
NUP133	YKR082W	BRR2	P32639	2163 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
NUP133	YKR082W	YHL005C	P38752	130 aa		3.07	□□□□□ -1.92
NUP133	YKR082W	PTH1	P38876	190 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
NUP133	YKR082W	RPR2	P40571	144 aa		3.07	□□□□□ -1.92
NUP133	YKR082W	RPL36B	O14455	100 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
NUP133	YKR082W	RPL36A	P05745	100 aa	Predicted RBP	3.07	□□□□□ -1.92
NUP133	YKR082W	YOL118C	Q08259	102 aa		3.07	□□□□□ -1.92
NUP133	YKR082W	SRX1	P36077	127 aa		3.06	□□□□□ -1.92
NUP133	YKR082W	CIS3	P47001	227 aa		3.06	□□□□□ -1.92
NUP133	YKR082W	IRC23	Q08416	157 aa		3.06	□□□□□ -1.92
NUP133	YKR082W	RPL42A	P0CX27	106 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
NUP133	YKR082W	RPL42B	P0CX28	106 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
NUP133	YKR082W	YBR209W	P38311	105 aa		3.06	□□□□□ -1.92
NUP133	YKR082W	YGR269W	P40326	108 aa		3.06	□□□□□ -1.92
NUP133	YKR082W	YOL029C	Q08187	201 aa		3.06	□□□□□ -1.92
NUP133	YKR082W	YOL085C	Q99345	113 aa		3.06	□□□□□ -1.92
NUP133	YKR082W	YSY6	P38374	65 aa		3.06	□□□□□ -1.92
NUP133	YKR082W	RNQ1	P25367	405 aa		3.05	□□□□□ -1.92
NUP133	YKR082W	YPI1	P43587	155 aa		3.05	□□□□□ -1.92
NUP133	YKR082W	PFY1	P07274	126 aa		3.05	□□□□□ -1.92
NUP133	YKR082W	DSE2	P38844	325 aa		3.05	□□□□□ -1.92
NUP133	YKR082W	FAS1	P07149	2051 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 56.6 ms