RNA–Protein interactions for RNA: YHR014W

SPO13, Transcript of Meiotic regulator, yeast

Gene SPO13, Length 876 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SPO13	YHR014W	CMD1	P06787	147 aa	Known RBP	0.23	□□□□□ -2.37
SPO13	YHR014W	RPS11A	P0CX47	156 aa	Known RBP	0.23	□□□□□ -2.37
SPO13	YHR014W	RPS11B	P0CX48	156 aa	Known RBP	0.23	□□□□□ -2.37
SPO13	YHR014W	BUB2	P26448	306 aa	Predicted RBP	0.23	□□□□□ -2.37
SPO13	YHR014W	ARC19	P33204	171 aa	Known RBP	0.23	□□□□□ -2.37
SPO13	YHR014W	SRP102	P36057	244 aa	Predicted RBP	0.23	□□□□□ -2.37
SPO13	YHR014W	RGI1	P40043	161 aa	Predicted RBP	0.23	□□□□□ -2.37
SPO13	YHR014W	YPD1	Q07688	167 aa		0.23	□□□□□ -2.37
SPO13	YHR014W	YDR029W	Q12111	104 aa		0.23	□□□□□ -2.37
SPO13	YHR014W	HUT1	Q12520	339 aa		0.23	□□□□□ -2.37
SPO13	YHR014W	MHF2	Q3E829	80 aa		0.23	□□□□□ -2.37
SPO13	YHR014W	ATP5	P09457	212 aa		0.22	□□□□□ -2.37
SPO13	YHR014W	UBC4	P15731	148 aa		0.22	□□□□□ -2.37
SPO13	YHR014W	EGD2	P38879	174 aa	Known RBP	0.22	□□□□□ -2.37
SPO13	YHR014W	SNU13	P39990	126 aa	Known RBP	0.22	□□□□□ -2.37
SPO13	YHR014W	YGR025W	P53216	100 aa		0.22	□□□□□ -2.37
SPO13	YHR014W	ORM1	P53224	222 aa		0.22	□□□□□ -2.37
SPO13	YHR014W	ATG38	Q05789	226 aa	Known RBP	0.22	□□□□□ -2.37
SPO13	YHR014W	NMA1	Q06178	401 aa	Known RBP	0.22	□□□□□ -2.37
SPO13	YHR014W	YCR075W-A	Q3E830	75 aa		0.22	□□□□□ -2.37
SPO13	YHR014W	YOS1	Q3E834	85 aa		0.22	□□□□□ -2.37
SPO13	YHR014W	HTD2	P38790	280 aa	Known RBP	0.21	□□□□□ -2.38
SPO13	YHR014W	EMC5	P40540	141 aa		0.21	□□□□□ -2.38
SPO13	YHR014W	YGL101W	P53144	215 aa		0.21	□□□□□ -2.38
SPO13	YHR014W	YDR210W	Q03482	75 aa		0.21	□□□□□ -2.38
SPO13	YHR014W	RPL33A	P05744	107 aa	Known RBP	0.2	□□□□□ -2.38
SPO13	YHR014W	ADK1	P07170	222 aa	Known RBP	0.2	□□□□□ -2.38
SPO13	YHR014W	RPS1B	P23248	255 aa	Known RBP	0.2	□□□□□ -2.38
SPO13	YHR014W	POR2	P40478	281 aa		0.2	□□□□□ -2.38
SPO13	YHR014W	LST8	P41318	303 aa		0.2	□□□□□ -2.38
SPO13	YHR014W	YOR192C-C	Q3E736	78 aa		0.2	□□□□□ -2.38
SPO13	YHR014W	YKL018C-A	Q3E7A7	99 aa		0.2	□□□□□ -2.38
SPO13	YHR014W	KTI11	Q3E840	82 aa		0.2	□□□□□ -2.38
SPO13	YHR014W	YLR157W-E	P0CF00	54 aa		0.19	□□□□□ -2.38
SPO13	YHR014W	UBI4	P0CG63	381 aa	Known RBP	0.19	□□□□□ -2.38
SPO13	YHR014W	YBR013C	P38215	129 aa		0.19	□□□□□ -2.38
SPO13	YHR014W	GPI2	P46961	280 aa		0.19	□□□□□ -2.38
SPO13	YHR014W	DIE2	P50076	525 aa		0.19	□□□□□ -2.38
SPO13	YHR014W	MPC1	P53157	130 aa	Known RBP	0.19	□□□□□ -2.38
SPO13	YHR014W	SNA2	P56508	79 aa		0.19	□□□□□ -2.38
SPO13	YHR014W	TMA20	P89886	181 aa	Predicted RBP	0.19	□□□□□ -2.38
SPO13	YHR014W	RRT7	Q07829	113 aa		0.19	□□□□□ -2.38
SPO13	YHR014W	YOL118C	Q08259	102 aa		0.19	□□□□□ -2.38
SPO13	YHR014W	YGR240C-A	Q3E786	66 aa		0.19	□□□□□ -2.38
SPO13	YHR014W	DDP1	Q99321	188 aa	Known RBP	0.19	□□□□□ -2.38
SPO13	YHR014W	SRP21	P32342	167 aa		0.18	□□□□□ -2.38
SPO13	YHR014W	RPL14A	P36105	138 aa	Known RBP	0.18	□□□□□ -2.38
SPO13	YHR014W	RPL14B	P38754	138 aa	Known RBP	0.18	□□□□□ -2.38
SPO13	YHR014W	SNF11	P38956	169 aa		0.18	□□□□□ -2.38
SPO13	YHR014W	YLR194C	Q05777	254 aa		0.18	□□□□□ -2.38
SPO13	YHR014W	YOL131W	Q08270	108 aa		0.18	□□□□□ -2.38
SPO13	YHR014W	SPC3	Q12133	184 aa		0.18	□□□□□ -2.38
SPO13	YHR014W	YHR140W	P38842	239 aa		0.17	□□□□□ -2.38
SPO13	YHR014W	YGR201C	P42936	225 aa		0.17	□□□□□ -2.38
SPO13	YHR014W	KSH1	Q8TGJ3	72 aa		0.17	□□□□□ -2.38
SPO13	YHR014W	ECM12	O13529	151 aa		0.16	□□□□□ -2.38
SPO13	YHR014W	YGL041W-A	P0C5N3	154 aa		0.16	□□□□□ -2.38
SPO13	YHR014W	YHR213W	P0CI67	198 aa		0.16	□□□□□ -2.38
SPO13	YHR014W	PHO13	P19881	312 aa		0.16	□□□□□ -2.38
SPO13	YHR014W	YAL064W	P39711	94 aa		0.16	□□□□□ -2.38
SPO13	YHR014W	YMR320W	Q04897	101 aa		0.16	□□□□□ -2.38
SPO13	YHR014W	GPI11	Q06636	219 aa		0.16	□□□□□ -2.38
SPO13	YHR014W	YPR010C-A	A5Z2X5	72 aa		0.15	□□□□□ -2.39
SPO13	YHR014W	BUD23	P25627	275 aa	Predicted RBP	0.15	□□□□□ -2.39
SPO13	YHR014W	DLS1	P40366	167 aa		0.15	□□□□□ -2.39
SPO13	YHR014W	YJL009W	P47078	108 aa		0.15	□□□□□ -2.39
SPO13	YHR014W	YGL193C	P53097	103 aa		0.15	□□□□□ -2.39
SPO13	YHR014W	RDI1	Q12434	202 aa		0.15	□□□□□ -2.39
SPO13	YHR014W	Q0017	Q9ZZX8	53 aa		0.15	□□□□□ -2.39
SPO13	YHR014W	UBC5	P15732	148 aa		0.14	□□□□□ -2.39
SPO13	YHR014W	YCR101C	P25607	182 aa		0.14	□□□□□ -2.39
SPO13	YHR014W	YBL071C	P38185	102 aa		0.14	□□□□□ -2.39
SPO13	YHR014W	DER1	P38307	211 aa		0.14	□□□□□ -2.39
SPO13	YHR014W	YHR173C	P38864	112 aa		0.14	□□□□□ -2.39
SPO13	YHR014W	IMP2	P46972	177 aa		0.14	□□□□□ -2.39
SPO13	YHR014W	ERI1	P62651	68 aa	Known RBP	0.14	□□□□□ -2.39
SPO13	YHR014W	YPR153W	Q06537	140 aa		0.14	□□□□□ -2.39
SPO13	YHR014W	YLR042C	Q07990	161 aa		0.14	□□□□□ -2.39
SPO13	YHR014W	YLR053C	Q12026	108 aa		0.14	□□□□□ -2.39
SPO13	YHR014W	YGL014C-A	P0C5N1	53 aa		0.13	□□□□□ -2.39
SPO13	YHR014W	RPS20	P38701	121 aa	Known RBP	0.13	□□□□□ -2.39
SPO13	YHR014W	YJR128W	P47162	119 aa		0.13	□□□□□ -2.39
SPO13	YHR014W	RPL22B	P56628	122 aa	Known RBP	0.13	□□□□□ -2.39
SPO13	YHR014W	GIM5	Q04493	163 aa		0.13	□□□□□ -2.39
SPO13	YHR014W	SLM6	P38343	150 aa		0.12	□□□□□ -2.39
SPO13	YHR014W	YHR138C	P38841	114 aa	Predicted RBP	0.12	□□□□□ -2.39
SPO13	YHR014W	MVB12	P42939	101 aa		0.12	□□□□□ -2.39
SPO13	YHR014W	GNA1	P43577	159 aa	Predicted RBP	0.12	□□□□□ -2.39
SPO13	YHR014W	YOR034C-A	Q3E735	80 aa		0.12	□□□□□ -2.39
SPO13	YHR014W	NHP6A	P11632	93 aa	Known RBP	0.11	□□□□□ -2.39
SPO13	YHR014W	SEC59	P20048	519 aa		0.11	□□□□□ -2.39
SPO13	YHR014W	MRPL24	P36525	258 aa	Predicted RBP	0.11	□□□□□ -2.39
SPO13	YHR014W	YIL163C	P40448	117 aa		0.11	□□□□□ -2.39
SPO13	YHR014W	CWP2	P43497	92 aa		0.11	□□□□□ -2.39
SPO13	YHR014W	DYN2	Q02647	92 aa		0.11	□□□□□ -2.39
SPO13	YHR014W	YMR082C	Q04276	118 aa		0.11	□□□□□ -2.39
SPO13	YHR014W	YGL041C-B	Q3E750	60 aa		0.11	□□□□□ -2.39
SPO13	YHR014W	YMR122W-A	Q3E842	84 aa		0.11	□□□□□ -2.39
SPO13	YHR014W	HUG1	Q6Q5K6	68 aa		0.11	□□□□□ -2.39
SPO13	YHR014W	EMP24	P32803	203 aa	Known RBP	0.1	□□□□□ -2.39

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 30.5 ms