RNA–Protein interactions for RNA: YHL024W

RIM4, Transcript of Putative RNA-binding protein, yeast

Gene RIM4, Length 2,142 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RIM4	YHL024W	HTL1	Q9URQ5	78 aa		3.01	□□□□□ -1.93
RIM4	YHL024W	YKL044W	P36092	106 aa		3.01	□□□□□ -1.93
RIM4	YHL024W	RPR2	P40571	144 aa		3.01	□□□□□ -1.93
RIM4	YHL024W	SWS2	P53937	143 aa		3.01	□□□□□ -1.93
RIM4	YHL024W	MIX14	Q04341	121 aa		3.01	□□□□□ -1.93
RIM4	YHL024W	YPL261C	Q08976	102 aa		3.01	□□□□□ -1.93
RIM4	YHL024W	HSP12	P22943	109 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
RIM4	YHL024W	PGU1	P47180	361 aa		3	□□□□□ -1.93
RIM4	YHL024W	YMR295C	Q03559	197 aa		3	□□□□□ -1.93
RIM4	YHL024W	ICY1	Q04329	127 aa		3	□□□□□ -1.93
RIM4	YHL024W	YMR230W-A	Q3E7B5	62 aa		3	□□□□□ -1.93
RIM4	YHL024W	SPS100	P13130	326 aa		2.99	□□□□□ -1.93
RIM4	YHL024W	LST8	P41318	303 aa		2.99	□□□□□ -1.93
RIM4	YHL024W	ICS3	P47034	131 aa		2.99	□□□□□ -1.93
RIM4	YHL024W	YLR365W	Q7LIF2	110 aa		2.99	□□□□□ -1.93
RIM4	YHL024W	YHR214C-E	Q8TGK0	99 aa		2.99	□□□□□ -1.93
RIM4	YHL024W	MDM35	O60200	86 aa		2.99	□□□□□ -1.93
RIM4	YHL024W	YKR045C	P36138	183 aa		2.99	□□□□□ -1.93
RIM4	YHL024W	YAL064W	P39711	94 aa		2.99	□□□□□ -1.93
RIM4	YHL024W	TDA2	P40045	126 aa		2.99	□□□□□ -1.93
RIM4	YHL024W	YIA6	P40556	373 aa		2.99	□□□□□ -1.93
RIM4	YHL024W	YGL088W	P53151	121 aa		2.99	□□□□□ -1.93
RIM4	YHL024W	RPS14A	P06367	137 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
RIM4	YHL024W	RPL23A	P0CX41	137 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
RIM4	YHL024W	RPL23B	P0CX42	137 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
RIM4	YHL024W	RPB9	P27999	122 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RIM4	YHL024W	YBR209W	P38311	105 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RIM4	YHL024W	YSY6	P38374	65 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RIM4	YHL024W	SIM1	P40472	476 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RIM4	YHL024W	UBC13	P52490	153 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RIM4	YHL024W	YGL260W	P53056	76 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RIM4	YHL024W	YPS5	P53057	165 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RIM4	YHL024W	YGL193C	P53097	103 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RIM4	YHL024W	YOL029C	Q08187	201 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RIM4	YHL024W	VPS68	Q12016	184 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RIM4	YHL024W	ARF1	P11076	181 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
RIM4	YHL024W	YEL045C	P32616	141 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RIM4	YHL024W	YGR050C	P53231	118 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RIM4	YHL024W	YDR274C	P87283	123 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RIM4	YHL024W	YMR007W	Q03675	126 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RIM4	YHL024W	SPG4	Q04438	115 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RIM4	YHL024W	IRC23	Q08416	157 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RIM4	YHL024W	YML100W-A	Q8TGT0	57 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RIM4	YHL024W	DDR48	P18899	430 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
RIM4	YHL024W	QCR9	P22289	66 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RIM4	YHL024W	ROX3	P25046	220 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RIM4	YHL024W	LDB16	P25587	256 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RIM4	YHL024W	ERG2	P32352	222 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RIM4	YHL024W	RSM18	P40033	138 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RIM4	YHL024W	YFL051C	P43552	160 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RIM4	YHL024W	YMR181C	Q03231	154 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RIM4	YHL024W	TOR1	P35169	2470 aa		2.96	□□□□□ -1.93
RIM4	YHL024W	YHR214C-D	P0CX93	97 aa		2.96	□□□□□ -1.93
RIM4	YHL024W	YHR173C	P38864	112 aa		2.96	□□□□□ -1.93
RIM4	YHL024W	YHR180W	P38868	163 aa		2.96	□□□□□ -1.93
RIM4	YHL024W	YEL067C	P39978	195 aa		2.96	□□□□□ -1.93
RIM4	YHL024W	CDC39	P25655	2108 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.94
RIM4	YHL024W	PFY1	P07274	126 aa		2.96	□□□□□ -1.94
RIM4	YHL024W	YPI1	P43587	155 aa		2.96	□□□□□ -1.94
RIM4	YHL024W	RPL26A	P05743	127 aa	Known RBP	2.95	□□□□□ -1.94
RIM4	YHL024W	AGA1	P32323	725 aa		2.95	□□□□□ -1.94
RIM4	YHL024W	KRE9	P39005	276 aa		2.95	□□□□□ -1.94
RIM4	YHL024W	NCE101	Q02820	53 aa		2.95	□□□□□ -1.94
RIM4	YHL024W	PBA1	Q05778	276 aa		2.95	□□□□□ -1.94
RIM4	YHL024W	PPT2	Q12036	173 aa		2.95	□□□□□ -1.94
RIM4	YHL024W	YKL097C	P34245	136 aa		2.95	□□□□□ -1.94
RIM4	YHL024W	YGR269W	P40326	108 aa		2.95	□□□□□ -1.94
RIM4	YHL024W	YNR077C	P53758	84 aa		2.95	□□□□□ -1.94
RIM4	YHL024W	IRC19	Q07843	230 aa		2.95	□□□□□ -1.94
RIM4	YHL024W	YDR524C-B	Q3E6R4	66 aa		2.95	□□□□□ -1.94
RIM4	YHL024W	YOR192C-C	Q3E736	78 aa		2.95	□□□□□ -1.94
RIM4	YHL024W	YDR246W-A	Q3E763	66 aa		2.95	□□□□□ -1.94
RIM4	YHL024W	YOR381W-A	Q3E804	55 aa		2.95	□□□□□ -1.94
RIM4	YHL024W	RPS8A	P0CX39	200 aa	Known RBP	2.94	□□□□□ -1.94
RIM4	YHL024W	RPS8B	P0CX40	200 aa	Known RBP	2.94	□□□□□ -1.94
RIM4	YHL024W	HUR1	P45820	110 aa		2.94	□□□□□ -1.94
RIM4	YHL024W	PCP1	P53259	346 aa		2.94	□□□□□ -1.94
RIM4	YHL024W	YOR343C	Q12484	108 aa		2.94	□□□□□ -1.94
RIM4	YHL024W	AIM4	P38305	123 aa	Predicted RBP	2.93	□□□□□ -1.94
RIM4	YHL024W	ERI1	P62651	68 aa	Known RBP	2.93	□□□□□ -1.94
RIM4	YHL024W	HUG1	Q6Q5K6	68 aa		2.93	□□□□□ -1.94
RIM4	YHL024W	HHF1	P02309	103 aa	Known RBP	2.93	□□□□□ -1.94
RIM4	YHL024W	SRX1	P36077	127 aa		2.93	□□□□□ -1.94
RIM4	YHL024W	YER135C	P40082	130 aa		2.93	□□□□□ -1.94
RIM4	YHL024W	YPR108W-A	Q3E7B3	70 aa		2.93	□□□□□ -1.94
RIM4	YHL024W	PET8	P38921	284 aa		2.92	□□□□□ -1.94
RIM4	YHL024W	VTC1	P40046	129 aa	RIP-Chip data	2.92	□□□□□ -1.94	not detected
RIM4	YHL024W	YAL064W-B	O13512	126 aa		2.92	□□□□□ -1.94
RIM4	YHL024W	YDL022C-A	P0C5L6	82 aa		2.92	□□□□□ -1.94
RIM4	YHL024W	YCR041W	P37265	110 aa		2.92	□□□□□ -1.94
RIM4	YHL024W	YNL208W	P40159	199 aa	Known RBP	2.92	□□□□□ -1.94
RIM4	YHL024W	HUA1	P40325	198 aa		2.92	□□□□□ -1.94
RIM4	YHL024W	AIM19	P40502	157 aa		2.92	□□□□□ -1.94
RIM4	YHL024W	IMP2	P46972	177 aa		2.92	□□□□□ -1.94
RIM4	YHL024W	YGR018C	P53211	109 aa		2.92	□□□□□ -1.94
RIM4	YHL024W	TOM1	Q03280	3268 aa		2.92	□□□□□ -1.94
RIM4	YHL024W	YSF3	P0C074	85 aa	Predicted RBP	2.91	□□□□□ -1.94
RIM4	YHL024W	FYV5	P25585	152 aa		2.91	□□□□□ -1.94
RIM4	YHL024W	WWM1	P43582	211 aa	Known RBP	2.91	□□□□□ -1.94
RIM4	YHL024W	YGR121W-A	Q3E816	71 aa		2.91	□□□□□ -1.94

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