RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439830.5

ANKRD28-203, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 5

Gene ANKRD28, Length 592 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-203ENST00000439830 KMT5BQ4FZB7 885 aa26.9■■□□□ 1.9
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ANKRD28-203ENST00000439830 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP26.9■■□□□ 1.9
ANKRD28-203ENST00000439830 OSCP1Q8WVF1 389 aa26.9■■□□□ 1.9
ANKRD28-203ENST00000439830 ELOVL4Q9GZR5 314 aa26.9■■□□□ 1.9
ANKRD28-203ENST00000439830 XYLT2Q9H1B5 865 aa26.9■■□□□ 1.9
ANKRD28-203ENST00000439830 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
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ANKRD28-203ENST00000439830 ZNF699Q32M78 642 aa26.89■■□□□ 1.9
ANKRD28-203ENST00000439830 PRR23BQ6ZRT6 265 aa26.89■■□□□ 1.9
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ANKRD28-203ENST00000439830 SPATA32Q96LK8 384 aa26.89■■□□□ 1.9
ANKRD28-203ENST00000439830 C8orf48Q96LL4 319 aa26.89■■□□□ 1.9
ANKRD28-203ENST00000439830 TTLL2Q9BWV7 592 aa26.89■■□□□ 1.9
ANKRD28-203ENST00000439830 DPEP3Q9H4B8 488 aa26.89■■□□□ 1.9
ANKRD28-203ENST00000439830 VRTNQ9H8Y1 702 aa26.89■■□□□ 1.9
ANKRD28-203ENST00000439830 C2orf42Q9NWW7 574 aa26.89■■□□□ 1.9
ANKRD28-203ENST00000439830 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa26.89■■□□□ 1.9
ANKRD28-203ENST00000439830 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa26.89■■□□□ 1.9
ANKRD28-203ENST00000439830 MYOFQ9NZM1 2061 aa26.89■■□□□ 1.89
ANKRD28-203ENST00000439830 SDK1Q7Z5N4 2213 aa26.89■■□□□ 1.89
ANKRD28-203ENST00000439830 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
ANKRD28-203ENST00000439830 A8MXQ7 604 aa26.88■■□□□ 1.89
ANKRD28-203ENST00000439830 CNR2P34972 360 aa26.88■■□□□ 1.89
ANKRD28-203ENST00000439830 LPAL2Q16609 132 aa26.88■■□□□ 1.89
ANKRD28-203ENST00000439830 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
ANKRD28-203ENST00000439830 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
ANKRD28-203ENST00000439830 LAIR1Q6GTX8 287 aa26.88■■□□□ 1.89
ANKRD28-203ENST00000439830 SLC9A9Q8IVB4 645 aa26.88■■□□□ 1.89
ANKRD28-203ENST00000439830 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa26.88■■□□□ 1.89
ANKRD28-203ENST00000439830 SH3RF2Q8TEC5 729 aa26.88■■□□□ 1.89
ANKRD28-203ENST00000439830 PARD3BQ8TEW8 1205 aa26.88■■□□□ 1.89
ANKRD28-203ENST00000439830 ATP2A3Q93084 1043 aa26.88■■□□□ 1.89
ANKRD28-203ENST00000439830 ECT2Q9H8V3 914 aa26.88■■□□□ 1.89
ANKRD28-203ENST00000439830 WNT6Q9Y6F9 365 aa26.88■■□□□ 1.89
ANKRD28-203ENST00000439830 TCF3P15923 654 aa26.87■■□□□ 1.89
ANKRD28-203ENST00000439830 HOXA6P31267 233 aa26.87■■□□□ 1.89
ANKRD28-203ENST00000439830 GJA4P35212 333 aa26.87■■□□□ 1.89
ANKRD28-203ENST00000439830 CLDN10P78369 228 aa26.87■■□□□ 1.89
ANKRD28-203ENST00000439830 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
ANKRD28-203ENST00000439830 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP26.87■■□□□ 1.89
ANKRD28-203ENST00000439830 TMEM174Q8WUU8 243 aa26.87■■□□□ 1.89
ANKRD28-203ENST00000439830 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa26.87■■□□□ 1.89
ANKRD28-203ENST00000439830 KCTD10Q9H3F6 313 aa26.87■■□□□ 1.89
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ANKRD28-203ENST00000439830 DMAC2Q9NW81 257 aa26.87■■□□□ 1.89
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ANKRD28-203ENST00000439830 PPP3CCP48454 512 aa26.86■■□□□ 1.89
ANKRD28-203ENST00000439830 NCOA4Q13772 614 aa26.86■■□□□ 1.89
ANKRD28-203ENST00000439830 EML3Q32P44 896 aa26.86■■□□□ 1.89
ANKRD28-203ENST00000439830 ZNF667Q5HYK9 610 aa26.86■■□□□ 1.89
ANKRD28-203ENST00000439830 P2RY13Q9BPV8 354 aa26.86■■□□□ 1.89
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ANKRD28-203ENST00000439830 EGFP01133 1207 aa26.85■■□□□ 1.89
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ANKRD28-203ENST00000439830 CACNA2D1P54289 1103 aa26.85■■□□□ 1.89
ANKRD28-203ENST00000439830 LMNB2Q03252 620 aa26.85■■□□□ 1.89
ANKRD28-203ENST00000439830 PKN3Q6P5Z2 889 aa26.85■■□□□ 1.89
ANKRD28-203ENST00000439830 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa26.85■■□□□ 1.89
ANKRD28-203ENST00000439830 SLITRK1Q96PX8 696 aa26.85■■□□□ 1.89
ANKRD28-203ENST00000439830 DLL3Q9NYJ7 618 aa26.85■■□□□ 1.89
ANKRD28-203ENST00000439830 ATP8B3O60423 1300 aa26.85■■□□□ 1.89
ANKRD28-203ENST00000439830 ZNF840PA6NDX5 716 aa26.84■■□□□ 1.89
ANKRD28-203ENST00000439830 HRO43593 1189 aa26.84■■□□□ 1.89
ANKRD28-203ENST00000439830 RNF40O75150 1001 aa26.84■■□□□ 1.89
ANKRD28-203ENST00000439830 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
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ANKRD28-203ENST00000439830 SYKP43405 635 aa26.84■■□□□ 1.89
ANKRD28-203ENST00000439830 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
ANKRD28-203ENST00000439830 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa26.84■■□□□ 1.89
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ANKRD28-203ENST00000439830 CHAMP1Q96JM3 812 aa26.84■■□□□ 1.89
ANKRD28-203ENST00000439830 B3GNT5Q9BYG0 378 aa26.84■■□□□ 1.89
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ANKRD28-203ENST00000439830 ZDHHC9Q9Y397 364 aa26.84■■□□□ 1.89
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ANKRD28-203ENST00000439830 RETP07949 1114 aa26.83■■□□□ 1.89
ANKRD28-203ENST00000439830 RAP1GAPP47736 663 aa26.83■■□□□ 1.89
ANKRD28-203ENST00000439830 GALK1P51570 392 aa26.83■■□□□ 1.89
ANKRD28-203ENST00000439830 CDH8P55286 799 aa26.83■■□□□ 1.89
ANKRD28-203ENST00000439830 NR1H3Q13133 447 aa26.83■■□□□ 1.89
ANKRD28-203ENST00000439830 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP26.83■■□□□ 1.89
ANKRD28-203ENST00000439830 FBXO43Q4G163 708 aa26.83■■□□□ 1.89
ANKRD28-203ENST00000439830 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP26.83■■□□□ 1.89
ANKRD28-203ENST00000439830 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
ANKRD28-203ENST00000439830 TNIP3Q96KP6 325 aa26.83■■□□□ 1.89
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