RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439830.5

ANKRD28-203, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 5

Gene ANKRD28, Length 592 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-203ENST00000439830 NISCHQ9Y2I1 1504 aa62.89■■■■■ 7.66
ANKRD28-203ENST00000439830 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa56.47■■■■■ 6.63
ANKRD28-203ENST00000439830 ABCC9O60706 1549 aa55.94■■■■■ 6.55
ANKRD28-203ENST00000439830 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa53.5■■■■■ 6.16
ANKRD28-203ENST00000439830 NACADO15069 1562 aa53.2■■■■■ 6.11
ANKRD28-203ENST00000439830 DCAF8L2P0C7V8 631 aa52.78■■■■■ 6.04
ANKRD28-203ENST00000439830 MYO15BQ96JP2 1530 aa52.57■■■■■ 6.01
ANKRD28-203ENST00000439830 UNC13AQ9UPW8 1703 aa52.43■■■■■ 5.98
ANKRD28-203ENST00000439830 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP52.23■■■■■ 5.95
ANKRD28-203ENST00000439830 DNAJC5BQ9UF47 199 aa52.03■■■■■ 5.92
ANKRD28-203ENST00000439830 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP52.02■■■■■ 5.92
ANKRD28-203ENST00000439830 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa52.02■■■■■ 5.92
ANKRD28-203ENST00000439830 BICRAQ9NZM4 1560 aa51.89■■■■■ 5.9
ANKRD28-203ENST00000439830 SCRIBQ14160 1630 aa51.38■■■■■ 5.82
ANKRD28-203ENST00000439830 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa51.29■■■■■ 5.8
ANKRD28-203ENST00000439830 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa50.64■■■■■ 5.7
ANKRD28-203ENST00000439830 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP50.61■■■■■ 5.69
ANKRD28-203ENST00000439830 CECR2Q9BXF3 1484 aa50.37■■■■■ 5.65
ANKRD28-203ENST00000439830 SMARCA4P51532 1647 aa49.06■■■■■ 5.44
ANKRD28-203ENST00000439830 NCAPD3P42695 1498 aa49.02■■■■■ 5.44
ANKRD28-203ENST00000439830 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa48.93■■■■■ 5.42
ANKRD28-203ENST00000439830 SMARCA2P51531 1590 aa48.9■■■■■ 5.42
ANKRD28-203ENST00000439830 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP48.85■■■■■ 5.41
ANKRD28-203ENST00000439830 HMGXB3Q12766 1538 aa48.79■■■■■ 5.4
ANKRD28-203ENST00000439830 PEG3Q9GZU2 1588 aa48.58■■■■■ 5.37
ANKRD28-203ENST00000439830 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP48.52■■■■■ 5.36
ANKRD28-203ENST00000439830 MROH2BQ7Z745 1585 aa48.45■■■■■ 5.35
ANKRD28-203ENST00000439830 ERCC6Q03468 1493 aa48.32■■■■■ 5.33
ANKRD28-203ENST00000439830 NESP48681 1621 aa48.15■■■■■ 5.3
ANKRD28-203ENST00000439830 CUX2O14529 1486 aa48.14■■■■■ 5.3
ANKRD28-203ENST00000439830 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa47.97■■■■■ 5.27
ANKRD28-203ENST00000439830 WIZO95785 1651 aa47.96■■■■■ 5.27
ANKRD28-203ENST00000439830 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP47.72■■■■■ 5.23
ANKRD28-203ENST00000439830 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa47.7■■■■■ 5.23
ANKRD28-203ENST00000439830 PDS5BQ9NTI5 1447 aa47.59■■■■■ 5.21
ANKRD28-203ENST00000439830 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa47.59■■■■■ 5.21
ANKRD28-203ENST00000439830 CADPSQ9ULU8 1353 aa47.52■■■■■ 5.2
ANKRD28-203ENST00000439830 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP47.52■■■■■ 5.2
ANKRD28-203ENST00000439830 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP47.37■■■■■ 5.17
ANKRD28-203ENST00000439830 MRC2Q9UBG0 1479 aa47.21■■■■■ 5.15
ANKRD28-203ENST00000439830 WDR62O43379 1518 aa47.11■■■■■ 5.13
ANKRD28-203ENST00000439830 CFTRP13569 1480 aa47.09■■■■■ 5.13
ANKRD28-203ENST00000439830 CEP164Q9UPV0 1460 aa47.09■■■■■ 5.13
ANKRD28-203ENST00000439830 FANCD2Q9BXW9 1451 aa47.03■■■■■ 5.12
ANKRD28-203ENST00000439830 PRDM2Q13029 1718 aa46.93■■■■■ 5.1
ANKRD28-203ENST00000439830 CCDC88BA6NC98 1476 aa46.74■■■■■ 5.07
ANKRD28-203ENST00000439830 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP46.63■■■■■ 5.05
ANKRD28-203ENST00000439830 TOPBP1Q92547 1522 aa46.2■■■■■ 4.99
ANKRD28-203ENST00000439830 ABCC8Q09428 1581 aa46.14■■■■■ 4.98
ANKRD28-203ENST00000439830 DNMBPQ6XZF7 1577 aa46.12■■■■■ 4.97
ANKRD28-203ENST00000439830 IFT140Q96RY7 1462 aa46.12■■■■■ 4.97
ANKRD28-203ENST00000439830 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP45.98■■■■■ 4.95
ANKRD28-203ENST00000439830 OSCARQ8IYS5 282 aa45.87■■■■■ 4.93
ANKRD28-203ENST00000439830 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP45.87■■■■■ 4.93
ANKRD28-203ENST00000439830 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP45.81■■■■■ 4.92
ANKRD28-203ENST00000439830 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP45.74■■■■■ 4.91
ANKRD28-203ENST00000439830 TRIM41Q8WV44 630 aa45.65■■■■■ 4.9
ANKRD28-203ENST00000439830 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP45.59■■■■■ 4.89
ANKRD28-203ENST00000439830 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP45.56■■■■■ 4.88
ANKRD28-203ENST00000439830 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa45.52■■■■■ 4.88
ANKRD28-203ENST00000439830 CHD1O14646 1710 aa45.52■■■■■ 4.88
ANKRD28-203ENST00000439830 CUX1P39880 1505 aa45.52■■■■■ 4.88
ANKRD28-203ENST00000439830 FGD5Q6ZNL6 1462 aa45.51■■■■■ 4.88
ANKRD28-203ENST00000439830 SOGA1O94964 1423 aa45.48■■■■■ 4.87
ANKRD28-203ENST00000439830 WDR97A6NE52 1622 aa45.44■■■■■ 4.86
ANKRD28-203ENST00000439830 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa45.4■■■■■ 4.86
ANKRD28-203ENST00000439830 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa45.4■■■■■ 4.86
ANKRD28-203ENST00000439830 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa45.4■■■■■ 4.86
ANKRD28-203ENST00000439830 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP45.32■■■■■ 4.84
ANKRD28-203ENST00000439830 ARHGEF11O15085 1522 aa45.25■■■■■ 4.83
ANKRD28-203ENST00000439830 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa45.18■■■■■ 4.82
ANKRD28-203ENST00000439830 FBLN2P98095 1184 aa45.16■■■■■ 4.82
ANKRD28-203ENST00000439830 PBRM1Q86U86 1689 aa45.12■■■■■ 4.81
ANKRD28-203ENST00000439830 GRIN2BQ13224 1484 aa45.1■■■■■ 4.81
ANKRD28-203ENST00000439830 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP45.1■■■■■ 4.81
ANKRD28-203ENST00000439830 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa45.01■■■■■ 4.8
ANKRD28-203ENST00000439830 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa45■■■■■ 4.79
ANKRD28-203ENST00000439830 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa44.99■■■■■ 4.79
ANKRD28-203ENST00000439830 GAPVD1Q14C86 1478 aa44.98■■■■■ 4.79
ANKRD28-203ENST00000439830 SYNJ1O43426 1573 aa44.94■■■■■ 4.78
ANKRD28-203ENST00000439830 TOP2BQ02880 1626 aa44.93■■■■■ 4.78
ANKRD28-203ENST00000439830 SYNJ2O15056 1496 aa44.93■■■■■ 4.78
ANKRD28-203ENST00000439830 CLASP1Q7Z460 1538 aa44.91■■■■■ 4.78
ANKRD28-203ENST00000439830 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP44.9■■■■■ 4.78
ANKRD28-203ENST00000439830 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP44.86■■■■■ 4.77
ANKRD28-203ENST00000439830 ARAP1Q96P48 1450 aa44.8■■■■■ 4.76
ANKRD28-203ENST00000439830 CYB5RLQ6IPT4 315 aa44.75■■■■■ 4.75
ANKRD28-203ENST00000439830 ADAMTS12P58397 1594 aa44.64■■■■■ 4.74
ANKRD28-203ENST00000439830 GRIN2AQ12879 1464 aa44.54■■■■■ 4.72
ANKRD28-203ENST00000439830 ERICH3Q5RHP9 1530 aa44.49■■■■■ 4.71
ANKRD28-203ENST00000439830 FHAD1B1AJZ9 1412 aa44.41■■■■■ 4.7
ANKRD28-203ENST00000439830 CEP170Q5SW79 1584 aa44.39■■■■■ 4.7
ANKRD28-203ENST00000439830 NUP160Q12769 1436 aa44.36■■■■■ 4.69
ANKRD28-203ENST00000439830 SHROOM2Q13796 1616 aa44.22■■■■■ 4.67
ANKRD28-203ENST00000439830 ERCC6L2Q5T890 1561 aa44.18■■■■■ 4.66
ANKRD28-203ENST00000439830 TRHP20396 242 aaPredicted RBP44.17■■■■■ 4.66
ANKRD28-203ENST00000439830 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa44.01■■■■■ 4.64
ANKRD28-203ENST00000439830 KIF27Q86VH2 1401 aa43.99■■■■■ 4.63
ANKRD28-203ENST00000439830 CUL7Q14999 1698 aa43.99■■■■■ 4.63
ANKRD28-203ENST00000439830 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP43.87■■■■■ 4.61
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