RNA–Protein interactions for RNA: YOR104W

PIN2, Transcript of Exomer-dependent cargo protein, yeast

Gene PIN2, Length 849 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PIN2	YOR104W	YBR090C	P38253	122 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PIN2	YOR104W	CDC40	P40968	455 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
PIN2	YOR104W	Q0255	P03881	472 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PIN2	YOR104W	MRPL31	P14063	131 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
PIN2	YOR104W	FZF1	P32805	299 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PIN2	YOR104W	NRG2	P38082	220 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PIN2	YOR104W	RPB11	P38902	120 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PIN2	YOR104W	PAU7	P39545	55 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PIN2	YOR104W	YCH1	P42937	148 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PIN2	YOR104W	PAU5	P43575	122 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PIN2	YOR104W	YGR026W	P53217	278 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PIN2	YOR104W	HHO1	P53551	258 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PIN2	YOR104W	SGF11	Q03067	99 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PIN2	YOR104W	SCW10	Q04951	389 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PIN2	YOR104W	POM33	Q12164	279 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PIN2	YOR104W	YNR034W-A	Q3E841	98 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PIN2	YOR104W	RPL27A	P0C2H6	136 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
PIN2	YOR104W	CUP2	P15315	225 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PIN2	YOR104W	AGA1	P32323	725 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PIN2	YOR104W	AUA1	P32450	94 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PIN2	YOR104W	YRA2	P36036	203 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.1	□□□□□ -1.75	not detected
PIN2	YOR104W	RPL32	P38061	130 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
PIN2	YOR104W	DAN1	P47178	298 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PIN2	YOR104W	THG1	P53215	237 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
PIN2	YOR104W	VAM10	Q08474	114 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PIN2	YOR104W	YOL085C	Q99345	113 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PIN2	YOR104W	MIX23	P38162	196 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PIN2	YOR104W	YHR140W	P38842	239 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PIN2	YOR104W	YFR035C	P43608	114 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PIN2	YOR104W	DYN1	P36022	4092 aa		4.09	□□□□□ -1.76
PIN2	YOR104W	YCR001W	P25347	104 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PIN2	YOR104W	SUR2	P38992	349 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PIN2	YOR104W	GTT1	P40582	234 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PIN2	YOR104W	BRP1	P53194	125 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PIN2	YOR104W	HAL1	Q01766	294 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PIN2	YOR104W	RDS3	Q06835	107 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
PIN2	YOR104W	YBR200W-A	Q3E755	54 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PIN2	YOR104W	PAU19	P0CE85	124 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PIN2	YOR104W	PAU21	P0CE86	164 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PIN2	YOR104W	PAU22	P0CE87	164 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PIN2	YOR104W	PAU3	P25610	124 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PIN2	YOR104W	RPL16B	P26785	198 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
PIN2	YOR104W	ZRT1	P32804	376 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PIN2	YOR104W	NSE4	P43124	402 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PIN2	YOR104W	YGR017W	P53210	297 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PIN2	YOR104W	AIM34	Q03673	198 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PIN2	YOR104W	YML108W	Q03759	105 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PIN2	YOR104W	GPI19	Q04082	140 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PIN2	YOR104W	PAM17	P36147	197 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PIN2	YOR104W	RRT13	P40042	185 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PIN2	YOR104W	YAR1	P46683	200 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PIN2	YOR104W	YPS5	P53057	165 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PIN2	YOR104W	TVP18	Q04767	167 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PIN2	YOR104W	ARC18	Q05933	178 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
PIN2	YOR104W	YGR240C-A	Q3E786	66 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PIN2	YOR104W	CMC2	Q3E7A4	109 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PIN2	YOR104W	RPS22B	Q3E7Y3	130 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
PIN2	YOR104W	RPL18A	P0CX49	186 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
PIN2	YOR104W	RPL18B	P0CX50	186 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
PIN2	YOR104W	AIM29	P36154	155 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PIN2	YOR104W	MRPL28	P36527	147 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PIN2	YOR104W	TEM1	P38987	245 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PIN2	YOR104W	SDS23	P53172	527 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PIN2	YOR104W	DXO1	Q06349	442 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PIN2	YOR104W	WIP1	Q2V2P8	89 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PIN2	YOR104W	RPL23A	P0CX41	137 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
PIN2	YOR104W	RPL23B	P0CX42	137 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
PIN2	YOR104W	YBR013C	P38215	129 aa		4.04	□□□□□ -1.76
PIN2	YOR104W	RPL42A	P0CX27	106 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
PIN2	YOR104W	RPL42B	P0CX28	106 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
PIN2	YOR104W	YNL217W	P40152	326 aa		4.03	□□□□□ -1.76
PIN2	YOR104W	ATP23	P53722	227 aa		4.03	□□□□□ -1.76
PIN2	YOR104W	YLR042C	Q07990	161 aa		4.03	□□□□□ -1.76
PIN2	YOR104W	POR1	P04840	283 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
PIN2	YOR104W	KTI12	P34253	313 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
PIN2	YOR104W	SEC72	P39742	193 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
PIN2	YOR104W	AQY1	P0CD91	305 aa		4.01	□□□□□ -1.77
PIN2	YOR104W	KRE9	P39005	276 aa		4.01	□□□□□ -1.77
PIN2	YOR104W	SPC1	P46965	94 aa		4.01	□□□□□ -1.77
PIN2	YOR104W	PMP3	P87284	55 aa		4.01	□□□□□ -1.77
PIN2	YOR104W	DGA1	Q08650	418 aa		4.01	□□□□□ -1.77
PIN2	YOR104W	FSF1	Q12029	327 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
PIN2	YOR104W	CRC1	Q12289	327 aa		4.01	□□□□□ -1.77
PIN2	YOR104W	ADH2	P00331	348 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
PIN2	YOR104W	SEC4	P07560	215 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
PIN2	YOR104W	YCR023C	P25351	611 aa		4	□□□□□ -1.77
PIN2	YOR104W	YGL118C	P53132	145 aa		4	□□□□□ -1.77
PIN2	YOR104W	ERI1	P62651	68 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
PIN2	YOR104W	CYT2	Q00873	224 aa		4	□□□□□ -1.77
PIN2	YOR104W	YCR024C-B	Q3E7Z8	88 aa		4	□□□□□ -1.77
PIN2	YOR104W	HTL1	Q9URQ5	78 aa		4	□□□□□ -1.77
PIN2	YOR104W	RPR2	P40571	144 aa		3.99	□□□□□ -1.77
PIN2	YOR104W	DCV1	P43595	202 aa		3.99	□□□□□ -1.77
PIN2	YOR104W	SAL1	D6W196	494 aa		3.98	□□□□□ -1.77
PIN2	YOR104W	YKR032W	P36127	104 aa		3.98	□□□□□ -1.77
PIN2	YOR104W	YKR070W	P36151	352 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
PIN2	YOR104W	ARL3	Q02804	198 aa		3.98	□□□□□ -1.77
PIN2	YOR104W	PFY1	P07274	126 aa		3.97	□□□□□ -1.77
PIN2	YOR104W	UBC5	P15732	148 aa		3.97	□□□□□ -1.77
PIN2	YOR104W	ERV14	P53173	138 aa		3.97	□□□□□ -1.77

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