RNA–Protein interactions for RNA: YMR241W

YHM2, Transcript of Citrate and oxoglutarate carrier protein, yeast

Gene YHM2, Length 945 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YHM2	YMR241W	DAD4	P69851	72 aa		4.72	□□□□□ -1.65
YHM2	YMR241W	CYT2	Q00873	224 aa		4.72	□□□□□ -1.65
YHM2	YMR241W	UTP23	Q12339	254 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
YHM2	YMR241W	RPS22B	Q3E7Y3	130 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
YHM2	YMR241W	BPH1	P25356	2167 aa		4.71	□□□□□ -1.65
YHM2	YMR241W	SAL1	D6W196	494 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YHM2	YMR241W	POR1	P04840	283 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
YHM2	YMR241W	PAM17	P36147	197 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YHM2	YMR241W	GLE2	P40066	365 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YHM2	YMR241W	HUA1	P40325	198 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YHM2	YMR241W	CUE4	Q04201	117 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
YHM2	YMR241W	YPR063C	Q12160	140 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YHM2	YMR241W	CCW14	O13547	238 aa		4.7	□□□□□ -1.66
YHM2	YMR241W	MRPL31	P14063	131 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
YHM2	YMR241W	PAU7	P39545	55 aa		4.7	□□□□□ -1.66
YHM2	YMR241W	LSM4	P40070	187 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
YHM2	YMR241W	YMR141C	P40211	102 aa		4.7	□□□□□ -1.66
YHM2	YMR241W	LSM8	P47093	109 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
YHM2	YMR241W	CSM4	Q08955	156 aa		4.7	□□□□□ -1.66
YHM2	YMR241W	POM33	Q12164	279 aa		4.7	□□□□□ -1.66
YHM2	YMR241W	YDL012C	Q12489	107 aa		4.7	□□□□□ -1.66
YHM2	YMR241W	YLR342W-A	Q3E810	57 aa		4.7	□□□□□ -1.66
YHM2	YMR241W	COA6	Q3E846	104 aa		4.7	□□□□□ -1.66
YHM2	YMR241W	FZF1	P32805	299 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YHM2	YMR241W	COX16	P47081	118 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YHM2	YMR241W	UPS3	Q04006	179 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YHM2	YMR241W	RRG8	Q06109	277 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YHM2	YMR241W	PRM3	Q08931	133 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YHM2	YMR241W	STF1	P01098	86 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YHM2	YMR241W	RPL18A	P0CX49	186 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
YHM2	YMR241W	RPL18B	P0CX50	186 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
YHM2	YMR241W	TDA4	P47153	279 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YHM2	YMR241W	YOL160W	Q08321	113 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YHM2	YMR241W	YPL162C	Q12042	273 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YHM2	YMR241W	YOL085C	Q99345	113 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YHM2	YMR241W	CPT1	P17898	393 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YHM2	YMR241W	ZRT1	P32804	376 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YHM2	YMR241W	MRPL11	P36521	249 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
YHM2	YMR241W	RPA43	P46669	326 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YHM2	YMR241W	SDS23	P53172	527 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YHM2	YMR241W	GTO3	Q04806	366 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YHM2	YMR241W	ATG39	Q06159	398 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YHM2	YMR241W	SEC72	P39742	193 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
YHM2	YMR241W	OST3	P48439	350 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YHM2	YMR241W	YGL118C	P53132	145 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YHM2	YMR241W	THG1	P53215	237 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
YHM2	YMR241W	SEN15	Q04675	128 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YHM2	YMR241W	MRPL23	Q12487	163 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
YHM2	YMR241W	WIP1	Q2V2P8	89 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YHM2	YMR241W	SEC4	P07560	215 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
YHM2	YMR241W	RRT13	P40042	185 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YHM2	YMR241W	CAX4	P53223	239 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YHM2	YMR241W	YIP3	P53633	176 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YHM2	YMR241W	YOR097C	Q12274	175 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
YHM2	YMR241W	YIL134C-A	Q45U18	67 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YHM2	YMR241W	URA2	P07259	2214 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
YHM2	YMR241W	RPL27A	P0C2H6	136 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
YHM2	YMR241W	YGR017W	P53210	297 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YHM2	YMR241W	DIA1	P54005	336 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YHM2	YMR241W	FSF1	Q12029	327 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
YHM2	YMR241W	TIM22	Q12328	207 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YHM2	YMR241W	YNL146C-A	Q3E7Z1	64 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YHM2	YMR241W	PRY2	P36110	329 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YHM2	YMR241W	TEM1	P38987	245 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YHM2	YMR241W	FIP1	P45976	327 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YHM2	YMR241W	GPI19	Q04082	140 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YHM2	YMR241W	ARC18	Q05933	178 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YHM2	YMR241W	CCW12	Q12127	133 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YHM2	YMR241W	YPR013C	Q12145	317 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YHM2	YMR241W	PRM7	Q12459	698 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YHM2	YMR241W	YOR011W-A	Q3E807	68 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YHM2	YMR241W	YHR022C	P38763	256 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YHM2	YMR241W	YHR140W	P38842	239 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YHM2	YMR241W	SPI1	P40092	148 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YHM2	YMR241W	MRPL49	P40858	161 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YHM2	YMR241W	ERV14	P53173	138 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YHM2	YMR241W	UTR5	P32630	166 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YHM2	YMR241W	GSP1	P32835	219 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YHM2	YMR241W	GSP2	P32836	220 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YHM2	YMR241W	YER134C	P40081	178 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YHM2	YMR241W	ALG13	P53178	202 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YHM2	YMR241W	YGR025W	P53216	100 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YHM2	YMR241W	CNL1	Q06333	122 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YHM2	YMR241W	YGR035W-A	Q45U48	73 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YHM2	YMR241W	YAL067W-A	Q8TGK6	75 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YHM2	YMR241W	YHR212W-A	P0CX91	67 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YHM2	YMR241W	FUN14	P18411	198 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YHM2	YMR241W	YKL102C	P34249	101 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YHM2	YMR241W	KTI12	P34253	313 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YHM2	YMR241W	PAU16	P35994	123 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YHM2	YMR241W	CDC40	P40968	455 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YHM2	YMR241W	MSA1	Q08471	629 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YHM2	YMR241W	LSO2	Q3E772	92 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YHM2	YMR241W	HTL1	Q9URQ5	78 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YHM2	YMR241W	YER135C	P40082	130 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YHM2	YMR241W	BRP1	P53194	125 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YHM2	YMR241W	YMR244W	Q04018	355 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YHM2	YMR241W	FYV7	Q12247	151 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YHM2	YMR241W	MRPL44	P19956	98 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YHM2	YMR241W	SCM4	P32564	187 aa		4.58	□□□□□ -1.68

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