RNA–Protein interactions for RNA: YMR234W

RNH1, Transcript of Ribonuclease H1, yeast

Gene RNH1, Length 1,047 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RNH1	YMR234W	PAU7	P39545	55 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RNH1	YMR234W	PAU5	P43575	122 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RNH1	YMR234W	YDR366C	P87287	132 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RNH1	YMR234W	POM33	Q12164	279 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RNH1	YMR234W	MRPL31	P14063	131 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RNH1	YMR234W	DAD2	P36162	133 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RNH1	YMR234W	RPB11	P38902	120 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RNH1	YMR234W	DAN1	P47178	298 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RNH1	YMR234W	YGR026W	P53217	278 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RNH1	YMR234W	HHO1	P53551	258 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RNH1	YMR234W	YNR034W-A	Q3E841	98 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RNH1	YMR234W	CUP2	P15315	225 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RNH1	YMR234W	YCH1	P42937	148 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RNH1	YMR234W	SGF11	Q03067	99 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RNH1	YMR234W	SCW10	Q04951	389 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RNH1	YMR234W	YOL085C	Q99345	113 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RNH1	YMR234W	RPL27A	P0C2H6	136 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RNH1	YMR234W	AGA1	P32323	725 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RNH1	YMR234W	YRA2	P36036	203 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.92	□□□□□ -1.62	not detected
RNH1	YMR234W	NRG2	P38082	220 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RNH1	YMR234W	MIX23	P38162	196 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RNH1	YMR234W	YHR140W	P38842	239 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RNH1	YMR234W	THG1	P53215	237 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RNH1	YMR234W	AUA1	P32450	94 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RNH1	YMR234W	VHS2	P40463	436 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RNH1	YMR234W	GTT1	P40582	234 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RNH1	YMR234W	YGR017W	P53210	297 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RNH1	YMR234W	GTO3	Q04806	366 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RNH1	YMR234W	VAM10	Q08474	114 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RNH1	YMR234W	PAU19	P0CE85	124 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RNH1	YMR234W	PAU21	P0CE86	164 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RNH1	YMR234W	PAU22	P0CE87	164 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RNH1	YMR234W	YCR001W	P25347	104 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RNH1	YMR234W	PAU3	P25610	124 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RNH1	YMR234W	SUR2	P38992	349 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RNH1	YMR234W	NSE4	P43124	402 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RNH1	YMR234W	YFR035C	P43608	114 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RNH1	YMR234W	BRP1	P53194	125 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RNH1	YMR234W	YML108W	Q03759	105 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RNH1	YMR234W	GPI19	Q04082	140 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RNH1	YMR234W	RDS3	Q06835	107 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RNH1	YMR234W	YBR200W-A	Q3E755	54 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RNH1	YMR234W	RPL16B	P26785	198 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RNH1	YMR234W	ZRT1	P32804	376 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RNH1	YMR234W	PAM17	P36147	197 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RNH1	YMR234W	YGR149W	P48236	432 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RNH1	YMR234W	HAL1	Q01766	294 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RNH1	YMR234W	AIM34	Q03673	198 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RNH1	YMR234W	TVP18	Q04767	167 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RNH1	YMR234W	WIP1	Q2V2P8	89 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RNH1	YMR234W	RPS22B	Q3E7Y3	130 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RNH1	YMR234W	MRPL28	P36527	147 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RNH1	YMR234W	RRT13	P40042	185 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RNH1	YMR234W	YPS5	P53057	165 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RNH1	YMR234W	SDS23	P53172	527 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RNH1	YMR234W	ARC18	Q05933	178 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RNH1	YMR234W	DXO1	Q06349	442 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RNH1	YMR234W	YGR240C-A	Q3E786	66 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RNH1	YMR234W	YBR013C	P38215	129 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RNH1	YMR234W	TEM1	P38987	245 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RNH1	YMR234W	RPL23A	P0CX41	137 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RNH1	YMR234W	RPL23B	P0CX42	137 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RNH1	YMR234W	YLR042C	Q07990	161 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RNH1	YMR234W	YNL217W	P40152	326 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RNH1	YMR234W	TIM11	P81449	96 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RNH1	YMR234W	POR1	P04840	283 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RNH1	YMR234W	YCR007C	P25354	239 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RNH1	YMR234W	KTI12	P34253	313 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RNH1	YMR234W	SEC72	P39742	193 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RNH1	YMR234W	PMP3	P87284	55 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RNH1	YMR234W	DGA1	Q08650	418 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RNH1	YMR234W	FSF1	Q12029	327 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RNH1	YMR234W	SEC4	P07560	215 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
RNH1	YMR234W	YCR023C	P25351	611 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RNH1	YMR234W	KRE9	P39005	276 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RNH1	YMR234W	SPC1	P46965	94 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RNH1	YMR234W	YGL118C	P53132	145 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RNH1	YMR234W	CYT2	Q00873	224 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RNH1	YMR234W	YCR024C-B	Q3E7Z8	88 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RNH1	YMR234W	DCV1	P43595	202 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RNH1	YMR234W	ERI1	P62651	68 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
RNH1	YMR234W	HTL1	Q9URQ5	78 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RNH1	YMR234W	SAL1	D6W196	494 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RNH1	YMR234W	YKR032W	P36127	104 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RNH1	YMR234W	YKR070W	P36151	352 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
RNH1	YMR234W	CDC40	P40968	455 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
RNH1	YMR234W	RPR2	P40571	144 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RNH1	YMR234W	ARL3	Q02804	198 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RNH1	YMR234W	PFY1	P07274	126 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RNH1	YMR234W	YER076C	P40049	302 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RNH1	YMR234W	ERV14	P53173	138 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RNH1	YMR234W	ATP16	Q12165	160 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RNH1	YMR234W	CMC2	Q3E7A4	109 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RNH1	YMR234W	YPR014C	Q6B0W2	109 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RNH1	YMR234W	YPR010C-A	A5Z2X5	72 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RNH1	YMR234W	UBC5	P15732	148 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RNH1	YMR234W	MGR2	Q02889	113 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RNH1	YMR234W	YOR008C-A	Q3E7B9	74 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RNH1	YMR234W	YMR122W-A	Q3E842	84 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RNH1	YMR234W	MRP49	P32388	137 aa		4.75	□□□□□ -1.65

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