RNA–Protein interactions for RNA: YJL166W

QCR8, Transcript of Subunit 8 of ubiquinol cytochrome-c reductase (Complex III), yeast

Gene QCR8, Length 285 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
QCR8	YJL166W	YLR050C	Q12155	161 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
QCR8	YJL166W	TOR1	P35169	2470 aa		4.91	□□□□□ -1.62
QCR8	YJL166W	URA2	P07259	2214 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
QCR8	YJL166W	FYV4	P38783	130 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
QCR8	YJL166W	SPI1	P40092	148 aa		4.9	□□□□□ -1.63
QCR8	YJL166W	VPS55	P47111	140 aa		4.9	□□□□□ -1.63
QCR8	YJL166W	TOS8	P53147	276 aa		4.9	□□□□□ -1.63
QCR8	YJL166W	ATG39	Q06159	398 aa		4.9	□□□□□ -1.63
QCR8	YJL166W	SRL1	Q08673	210 aa		4.9	□□□□□ -1.63
QCR8	YJL166W	RPP2A	P05319	106 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
QCR8	YJL166W	RPL43A	P0CX25	92 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
QCR8	YJL166W	RPL43B	P0CX26	92 aa		4.89	□□□□□ -1.63
QCR8	YJL166W	YCR023C	P25351	611 aa		4.89	□□□□□ -1.63
QCR8	YJL166W	UTR5	P32630	166 aa		4.89	□□□□□ -1.63
QCR8	YJL166W	YNL194C	P40169	301 aa		4.89	□□□□□ -1.63
QCR8	YJL166W	SPG4	Q04438	115 aa		4.89	□□□□□ -1.63
QCR8	YJL166W	IZH3	Q07959	543 aa		4.89	□□□□□ -1.63
QCR8	YJL166W	YPR013C	Q12145	317 aa		4.89	□□□□□ -1.63
QCR8	YJL166W	TRA1	P38811	3744 aa		4.88	□□□□□ -1.63
QCR8	YJL166W	RPL27B	P0C2H7	136 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
QCR8	YJL166W	APS1	P35181	156 aa		4.88	□□□□□ -1.63
QCR8	YJL166W	MRPL49	P40858	161 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
QCR8	YJL166W	YDR042C	Q03205	200 aa		4.88	□□□□□ -1.63
QCR8	YJL166W	VPS71	Q03433	280 aa		4.88	□□□□□ -1.63
QCR8	YJL166W	BET5	Q03630	159 aa		4.88	□□□□□ -1.63
QCR8	YJL166W	HOR7	Q05827	59 aa		4.88	□□□□□ -1.63
QCR8	YJL166W	YKL069W	P36088	180 aa		4.87	□□□□□ -1.63
QCR8	YJL166W	MST28	P39552	234 aa		4.87	□□□□□ -1.63
QCR8	YJL166W	YER076C	P40049	302 aa		4.87	□□□□□ -1.63
QCR8	YJL166W	YIP3	P53633	176 aa		4.87	□□□□□ -1.63
QCR8	YJL166W	ATP23	P53722	227 aa		4.87	□□□□□ -1.63
QCR8	YJL166W	MOT3	P54785	490 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
QCR8	YJL166W	CWC27	Q02770	301 aa		4.87	□□□□□ -1.63
QCR8	YJL166W	TVP18	Q04767	167 aa		4.87	□□□□□ -1.63
QCR8	YJL166W	PRM7	Q12459	698 aa		4.87	□□□□□ -1.63
QCR8	YJL166W	YOR011W-A	Q3E807	68 aa		4.87	□□□□□ -1.63
QCR8	YJL166W	SAL1	D6W196	494 aa		4.86	□□□□□ -1.63
QCR8	YJL166W	PFY1	P07274	126 aa		4.86	□□□□□ -1.63
QCR8	YJL166W	PRE1	P22141	198 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
QCR8	YJL166W	AGA1	P32323	725 aa		4.86	□□□□□ -1.63
QCR8	YJL166W	KTI12	P34253	313 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
QCR8	YJL166W	YKR070W	P36151	352 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
QCR8	YJL166W	YHR022C	P38763	256 aa		4.86	□□□□□ -1.63
QCR8	YJL166W	CAX4	P53223	239 aa		4.86	□□□□□ -1.63
QCR8	YJL166W	MGR2	Q02889	113 aa		4.86	□□□□□ -1.63
QCR8	YJL166W	AQY1	P0CD91	305 aa		4.85	□□□□□ -1.63
QCR8	YJL166W	PCL2	P25693	308 aa		4.85	□□□□□ -1.63
QCR8	YJL166W	RPB9	P27999	122 aa		4.85	□□□□□ -1.63
QCR8	YJL166W	KEG1	P43614	200 aa		4.85	□□□□□ -1.63
QCR8	YJL166W	YMR103C	Q04436	120 aa		4.85	□□□□□ -1.63
QCR8	YJL166W	RRG8	Q06109	277 aa		4.85	□□□□□ -1.63
QCR8	YJL166W	CCW12	Q12127	133 aa		4.85	□□□□□ -1.63
QCR8	YJL166W	YNL146C-A	Q3E7Z1	64 aa		4.85	□□□□□ -1.63
QCR8	YJL166W	YOL085C	Q99345	113 aa		4.85	□□□□□ -1.63
QCR8	YJL166W	YER145C-A	A0A023PYF4	145 aa		4.84	□□□□□ -1.63
QCR8	YJL166W	YER135C	P40082	130 aa		4.84	□□□□□ -1.63
QCR8	YJL166W	YDR366C	P87287	132 aa		4.84	□□□□□ -1.63
QCR8	YJL166W	FCF1	Q05498	189 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
QCR8	YJL166W	TMA7	Q3E764	64 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
QCR8	YJL166W	RPL42A	P0CX27	106 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
QCR8	YJL166W	RPL42B	P0CX28	106 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
QCR8	YJL166W	YKL044W	P36092	106 aa		4.83	□□□□□ -1.64
QCR8	YJL166W	YCR041W	P37265	110 aa		4.83	□□□□□ -1.64
QCR8	YJL166W	MIC26	P50087	233 aa		4.83	□□□□□ -1.64
QCR8	YJL166W	DUO1	P53168	247 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
QCR8	YJL166W	DGA1	Q08650	418 aa		4.83	□□□□□ -1.64
QCR8	YJL166W	VTS1	Q08831	523 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.83	□□□□□ -1.64	not detected
QCR8	YJL166W	PRM3	Q08931	133 aa		4.83	□□□□□ -1.64
QCR8	YJL166W	YLR363W-A	Q3E747	85 aa		4.83	□□□□□ -1.64
QCR8	YJL166W	VAR1	P02381	398 aa		4.82	□□□□□ -1.64
QCR8	YJL166W	MRP49	P32388	137 aa		4.82	□□□□□ -1.64
QCR8	YJL166W	ELF1	P36053	145 aa		4.82	□□□□□ -1.64
QCR8	YJL166W	SIM1	P40472	476 aa		4.82	□□□□□ -1.64
QCR8	YJL166W	TOS6	P48560	102 aa		4.82	□□□□□ -1.64
QCR8	YJL166W	GLO1	P50107	326 aa		4.82	□□□□□ -1.64
QCR8	YJL166W	YML079W	Q03629	201 aa		4.82	□□□□□ -1.64
QCR8	YJL166W	YLR112W	Q12130	139 aa		4.82	□□□□□ -1.64
QCR8	YJL166W	YBR200W-A	Q3E755	54 aa		4.82	□□□□□ -1.64
QCR8	YJL166W	Q0255	P03881	472 aa		4.81	□□□□□ -1.64
QCR8	YJL166W	HMRA2	P0CY13	119 aa		4.81	□□□□□ -1.64
QCR8	YJL166W	YPL073C	P40323	161 aa		4.81	□□□□□ -1.64
QCR8	YJL166W	MRPL23	Q12487	163 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
QCR8	YJL166W	YPR170W-B	P0C5R9	85 aa		4.8	□□□□□ -1.64
QCR8	YJL166W	RPF1	P38805	295 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
QCR8	YJL166W	MIG3	P39943	394 aa		4.8	□□□□□ -1.64
QCR8	YJL166W	YMR244W	Q04018	355 aa		4.8	□□□□□ -1.64
QCR8	YJL166W	COA3	Q3E7B2	85 aa		4.8	□□□□□ -1.64
QCR8	YJL166W	YOR008C-A	Q3E7B9	74 aa		4.8	□□□□□ -1.64
QCR8	YJL166W	MBF1	O14467	151 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
QCR8	YJL166W	RPL15A	P05748	204 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
QCR8	YJL166W	RPL16B	P26785	198 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
QCR8	YJL166W	YKL070W	P36087	169 aa		4.79	□□□□□ -1.64
QCR8	YJL166W	DCV1	P43595	202 aa		4.79	□□□□□ -1.64
QCR8	YJL166W	FIP1	P45976	327 aa		4.79	□□□□□ -1.64
QCR8	YJL166W	YPL261C	Q08976	102 aa		4.79	□□□□□ -1.64
QCR8	YJL166W	DFM1	Q12743	341 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
QCR8	YJL166W	PRY2	P36110	329 aa		4.78	□□□□□ -1.64
QCR8	YJL166W	URM1	P40554	99 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
QCR8	YJL166W	MRPS8	Q03799	155 aa		4.78	□□□□□ -1.64
QCR8	YJL166W	TAR1	Q8TGM6	124 aa		4.78	□□□□□ -1.64

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