RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559389.1

SNX1-206, Transcript of sorting nexin 1, humanhuman

TSL 5

Gene SNX1, Length 753 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX1-206ENST00000559389 CDH22Q9UJ99 828 aa23■■□□□ 1.27
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SNX1-206ENST00000559389 GRXCR2A6NFK2 248 aa22.99■■□□□ 1.27
SNX1-206ENST00000559389 TRIM66O15016 1216 aa22.99■■□□□ 1.27
SNX1-206ENST00000559389 AP1G2O75843 785 aa22.99■■□□□ 1.27
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SNX1-206ENST00000559389 BRD2P25440 801 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
SNX1-206ENST00000559389 USP8P40818 1118 aa22.99■■□□□ 1.27
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SNX1-206ENST00000559389 SCN4BQ8IWT1 228 aa22.99■■□□□ 1.27
SNX1-206ENST00000559389 SUSD6Q92537 303 aa22.99■■□□□ 1.27
SNX1-206ENST00000559389 C8orf48Q96LL4 319 aa22.99■■□□□ 1.27
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SNX1-206ENST00000559389 TTYH3Q9C0H2 523 aa22.99■■□□□ 1.27
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SNX1-206ENST00000559389 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
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SNX1-206ENST00000559389 TSPAN16Q9UKR8 245 aa22.98■■□□□ 1.27
SNX1-206ENST00000559389 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP22.98■■□□□ 1.27
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SNX1-206ENST00000559389 POMKQ9H5K3 350 aa22.95■■□□□ 1.26
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SNX1-206ENST00000559389 CSH1P0DML2 217 aa22.94■■□□□ 1.26
SNX1-206ENST00000559389 CSH2P0DML3 217 aa22.94■■□□□ 1.26
SNX1-206ENST00000559389 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
SNX1-206ENST00000559389 PTPN2P17706 415 aa22.94■■□□□ 1.26
SNX1-206ENST00000559389 MAP3K7CLP57077 242 aa22.94■■□□□ 1.26
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