RNA–Protein interactions for RNA: YPL119C

DBP1, Transcript of Putative ATP-dependent RNA helicase of the DEAD-box protein family, yeast

Gene DBP1, Length 1,854 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DBP1	YPL119C	YML122C	Q03207	126 aa		7.55	□□□□□ -1.2
DBP1	YPL119C	MRPL20	P22354	195 aa	Predicted RBP	7.55	□□□□□ -1.2
DBP1	YPL119C	YGR219W	P53307	113 aa		7.55	□□□□□ -1.2
DBP1	YPL119C	PRS4	P38063	326 aa	Predicted RBP	7.54	□□□□□ -1.2
DBP1	YPL119C	PAU7	P39545	55 aa		7.54	□□□□□ -1.2
DBP1	YPL119C	THG1	P53215	237 aa	Known RBP	7.54	□□□□□ -1.2
DBP1	YPL119C	CAB4	P53332	305 aa		7.54	□□□□□ -1.2
DBP1	YPL119C	FSF1	Q12029	327 aa	Known RBP	7.54	□□□□□ -1.2
DBP1	YPL119C	POM33	Q12164	279 aa		7.54	□□□□□ -1.2
DBP1	YPL119C	YOL160W	Q08321	113 aa		7.53	□□□□□ -1.2
DBP1	YPL119C	MDM10	P18409	493 aa		7.53	□□□□□ -1.2
DBP1	YPL119C	GSP1	P32835	219 aa	Known RBP	7.53	□□□□□ -1.2
DBP1	YPL119C	GSP2	P32836	220 aa	Known RBP	7.53	□□□□□ -1.2
DBP1	YPL119C	SEC72	P39742	193 aa	Known RBP	7.53	□□□□□ -1.2
DBP1	YPL119C	YGR017W	P53210	297 aa		7.53	□□□□□ -1.2
DBP1	YPL119C	PKR1	Q03880	122 aa	Known RBP	7.53	□□□□□ -1.2
DBP1	YPL119C	LCB3	P47013	409 aa		7.52	□□□□□ -1.21
DBP1	YPL119C	YJL028W	P47062	111 aa		7.52	□□□□□ -1.21
DBP1	YPL119C	ERS1	P17261	260 aa		7.51	□□□□□ -1.21
DBP1	YPL119C	TEM1	P38987	245 aa		7.51	□□□□□ -1.21
DBP1	YPL119C	PRE5	P40302	234 aa	Known RBP	7.51	□□□□□ -1.21
DBP1	YPL119C	YGR025W	P53216	100 aa		7.51	□□□□□ -1.21
DBP1	YPL119C	RPL15B	P54780	204 aa	Predicted RBP	7.51	□□□□□ -1.21
DBP1	YPL119C	ARC18	Q05933	178 aa	Known RBP	7.51	□□□□□ -1.21
DBP1	YPL119C	YGL118C	P53132	145 aa		7.51	□□□□□ -1.21
DBP1	YPL119C	ATG33	Q06485	197 aa		7.51	□□□□□ -1.21
DBP1	YPL119C	MHR1	Q06630	226 aa		7.51	□□□□□ -1.21
DBP1	YPL119C	FYV7	Q12247	151 aa		7.51	□□□□□ -1.21
DBP1	YPL119C	CMC1	P36064	111 aa		7.5	□□□□□ -1.21
DBP1	YPL119C	MIC12	P38341	106 aa		7.5	□□□□□ -1.21
DBP1	YPL119C	YNL200C	P40165	246 aa	Known RBP	7.5	□□□□□ -1.21
DBP1	YPL119C	GTO3	Q04806	366 aa		7.5	□□□□□ -1.21
DBP1	YPL119C	SRL1	Q08673	210 aa		7.5	□□□□□ -1.21
DBP1	YPL119C	INO2	P26798	304 aa		7.49	□□□□□ -1.21
DBP1	YPL119C	NAT5	Q08689	176 aa		7.49	□□□□□ -1.21
DBP1	YPL119C	PAU16	P35994	123 aa		7.49	□□□□□ -1.21
DBP1	YPL119C	SNF11	P38956	169 aa		7.49	□□□□□ -1.21
DBP1	YPL119C	TOS8	P53147	276 aa		7.49	□□□□□ -1.21
DBP1	YPL119C	NCE103	P53615	221 aa		7.49	□□□□□ -1.21
DBP1	YPL119C	MSC3	Q05812	728 aa		7.49	□□□□□ -1.21
DBP1	YPL119C	GEP3	Q08622	556 aa		7.49	□□□□□ -1.21
DBP1	YPL119C	YLR342W-A	Q3E810	57 aa		7.49	□□□□□ -1.21
DBP1	YPL119C	CUP1-1	P0CX80	61 aa		7.48	□□□□□ -1.21
DBP1	YPL119C	CUP1-2	P0CX81	61 aa		7.48	□□□□□ -1.21
DBP1	YPL119C	CPT1	P17898	393 aa		7.48	□□□□□ -1.21
DBP1	YPL119C	VPS55	P47111	140 aa		7.48	□□□□□ -1.21
DBP1	YPL119C	TPT1	Q12272	230 aa	Known RBP	7.48	□□□□□ -1.21
DBP1	YPL119C	MST28	P39552	234 aa		7.47	□□□□□ -1.21
DBP1	YPL119C	MST27	P53176	234 aa		7.47	□□□□□ -1.21
DBP1	YPL119C	YKL102C	P34249	101 aa		7.47	□□□□□ -1.21
DBP1	YPL119C	BRP1	P53194	125 aa		7.47	□□□□□ -1.21
DBP1	YPL119C	UPS3	Q04006	179 aa		7.47	□□□□□ -1.21
DBP1	YPL119C	SPG4	Q04438	115 aa		7.47	□□□□□ -1.21
DBP1	YPL119C	RPL27A	P0C2H6	136 aa	Known RBP	7.46	□□□□□ -1.22
DBP1	YPL119C	YPI1	P43587	155 aa		7.46	□□□□□ -1.22
DBP1	YPL119C	TIM22	Q12328	207 aa		7.46	□□□□□ -1.22
DBP1	YPL119C	SCS22	Q6Q595	175 aa		7.46	□□□□□ -1.22
DBP1	YPL119C	YER188W	P40103	239 aa		7.45	□□□□□ -1.22
DBP1	YPL119C	HOR7	Q05827	59 aa		7.45	□□□□□ -1.22
DBP1	YPL119C	CNL1	Q06333	122 aa		7.45	□□□□□ -1.22
DBP1	YPL119C	YPR013C	Q12145	317 aa		7.45	□□□□□ -1.22
DBP1	YPL119C	UTP23	Q12339	254 aa	Known RBP	7.45	□□□□□ -1.22
DBP1	YPL119C	RPB9	P27999	122 aa		7.45	□□□□□ -1.22
DBP1	YPL119C	SAE3	P89114	91 aa		7.45	□□□□□ -1.22
DBP1	YPL119C	YPR014C	Q6B0W2	109 aa		7.45	□□□□□ -1.22
DBP1	YPL119C	ATP5	P09457	212 aa		7.44	□□□□□ -1.22
DBP1	YPL119C	CAX4	P53223	239 aa		7.44	□□□□□ -1.22
DBP1	YPL119C	DIA1	P54005	336 aa		7.44	□□□□□ -1.22
DBP1	YPL119C	GPI19	Q04082	140 aa		7.44	□□□□□ -1.22
DBP1	YPL119C	YDL085C-A	Q3E7B7	68 aa	Known RBP	7.44	□□□□□ -1.22
DBP1	YPL119C	YOR011W-A	Q3E807	68 aa		7.44	□□□□□ -1.22
DBP1	YPL119C	RPL12A	P0CX53	165 aa	Known RBP	7.43	□□□□□ -1.22
DBP1	YPL119C	RPL12B	P0CX54	165 aa		7.43	□□□□□ -1.22
DBP1	YPL119C	VMA16	P23968	213 aa		7.43	□□□□□ -1.22
DBP1	YPL119C	YKR032W	P36127	104 aa		7.43	□□□□□ -1.22
DBP1	YPL119C	YCR041W	P37265	110 aa		7.43	□□□□□ -1.22
DBP1	YPL119C	YHR140W	P38842	239 aa		7.43	□□□□□ -1.22
DBP1	YPL119C	PET8	P38921	284 aa		7.43	□□□□□ -1.22
DBP1	YPL119C	POP3	P53833	195 aa	Predicted RBP	7.43	□□□□□ -1.22
DBP1	YPL119C	MIG1	P27705	504 aa		7.43	□□□□□ -1.22
DBP1	YPL119C	YNL194C	P40169	301 aa		7.43	□□□□□ -1.22
DBP1	YPL119C	PRM7	Q12459	698 aa		7.43	□□□□□ -1.22
DBP1	YPL119C	HAC1	P41546	238 aa		7.42	□□□□□ -1.22
DBP1	YPL119C	YIL014C-A	Q02598	104 aa		7.41	□□□□□ -1.22
DBP1	YPL119C	DPP1	Q05521	289 aa		7.41	□□□□□ -1.22
DBP1	YPL119C	YDL157C	Q12082	118 aa		7.41	□□□□□ -1.22
DBP1	YPL119C	YOL085C	Q99345	113 aa		7.41	□□□□□ -1.22
DBP1	YPL119C	YFL068W	P0CX99	160 aa		7.41	□□□□□ -1.22
DBP1	YPL119C	YLL066W-A	P0CY00	160 aa		7.41	□□□□□ -1.22
DBP1	YPL119C	YLL067W-A	P0CY01	160 aa		7.41	□□□□□ -1.22
DBP1	YPL119C	AGE2	P40529	298 aa		7.41	□□□□□ -1.22
DBP1	YPL119C	YJR096W	P47137	282 aa		7.41	□□□□□ -1.22
DBP1	YPL119C	ATG39	Q06159	398 aa		7.41	□□□□□ -1.22
DBP1	YPL119C	YER145C-A	A0A023PYF4	145 aa		7.4	□□□□□ -1.23
DBP1	YPL119C	GLC8	P41818	229 aa		7.4	□□□□□ -1.23
DBP1	YPL119C	COX16	P47081	118 aa		7.4	□□□□□ -1.23
DBP1	YPL119C	YIP3	P53633	176 aa		7.4	□□□□□ -1.23
DBP1	YPL119C	IZH3	Q07959	543 aa		7.4	□□□□□ -1.23
DBP1	YPL119C	HTL1	Q9URQ5	78 aa		7.4	□□□□□ -1.23
DBP1	YPL119C	SEC11	P15367	167 aa		7.39	□□□□□ -1.23

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