RNA–Protein interactions for RNA: YNL057W

YNL057W, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YNL057W, Length 333 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNL057W	YNL057W	MRS1	P07266	363 aa		2.9	□□□□□ -1.95
YNL057W	YNL057W	RPL31B	P0C2H9	113 aa	Known RBP	2.9	□□□□□ -1.95
YNL057W	YNL057W	SDO1	Q07953	250 aa	Known RBP	2.9	□□□□□ -1.95
YNL057W	YNL057W	YLR042C	Q07990	161 aa		2.9	□□□□□ -1.95
YNL057W	YNL057W	YDR010C	Q12426	110 aa		2.9	□□□□□ -1.95
YNL057W	YNL057W	YBR200W-A	Q3E755	54 aa		2.9	□□□□□ -1.95
YNL057W	YNL057W	ISN1	Q99312	450 aa		2.9	□□□□□ -1.95
YNL057W	YNL057W	YDR157W	A0A023PZE8	133 aa		2.89	□□□□□ -1.95
YNL057W	YNL057W	QCR9	P22289	66 aa		2.89	□□□□□ -1.95
YNL057W	YNL057W	TRS20	P38334	175 aa		2.89	□□□□□ -1.95
YNL057W	YNL057W	POG1	P40473	351 aa		2.89	□□□□□ -1.95
YNL057W	YNL057W	YKE4	P40544	346 aa		2.89	□□□□□ -1.95
YNL057W	YNL057W	PNC1	P53184	216 aa	Known RBP	2.89	□□□□□ -1.95
YNL057W	YNL057W	BET5	Q03630	159 aa		2.89	□□□□□ -1.95
YNL057W	YNL057W	RAV2	Q03956	351 aa		2.89	□□□□□ -1.95
YNL057W	YNL057W	YMR320W	Q04897	101 aa		2.89	□□□□□ -1.95
YNL057W	YNL057W	YCR023C	P25351	611 aa		2.88	□□□□□ -1.95
YNL057W	YNL057W	AHT1	P29589	182 aa		2.88	□□□□□ -1.95
YNL057W	YNL057W	YBR242W	P38331	238 aa		2.88	□□□□□ -1.95
YNL057W	YNL057W	YEA4	P40004	342 aa		2.88	□□□□□ -1.95
YNL057W	YNL057W	MRPL50	P53724	139 aa		2.88	□□□□□ -1.95
YNL057W	YNL057W	DAD4	P69851	72 aa		2.88	□□□□□ -1.95
YNL057W	YNL057W	YPR010C-A	A5Z2X5	72 aa		2.87	□□□□□ -1.95
YNL057W	YNL057W	HMX1	P32339	317 aa		2.87	□□□□□ -1.95
YNL057W	YNL057W	YBR013C	P38215	129 aa		2.87	□□□□□ -1.95
YNL057W	YNL057W	YIL059C	P40520	121 aa		2.87	□□□□□ -1.95
YNL057W	YNL057W	YJR111C	P47148	283 aa	Known RBP	2.87	□□□□□ -1.95
YNL057W	YNL057W	ERI1	P62651	68 aa	Known RBP	2.87	□□□□□ -1.95
YNL057W	YNL057W	YDR029W	Q12111	104 aa		2.87	□□□□□ -1.95
YNL057W	YNL057W	DAD1	Q12248	94 aa		2.87	□□□□□ -1.95
YNL057W	YNL057W	CAF40	P53829	373 aa		2.86	□□□□□ -1.95
YNL057W	YNL057W	DIA1	P54005	336 aa		2.86	□□□□□ -1.95
YNL057W	YNL057W	ORM2	Q06144	216 aa		2.86	□□□□□ -1.95
YNL057W	YNL057W	FCF2	Q12035	217 aa	Predicted RBP	2.86	□□□□□ -1.95
YNL057W	YNL057W	YLR342W-A	Q3E810	57 aa		2.86	□□□□□ -1.95
YNL057W	YNL057W	RPS0A	P32905	252 aa	Known RBP	2.85	□□□□□ -1.95
YNL057W	YNL057W	RPL14A	P36105	138 aa	Known RBP	2.85	□□□□□ -1.95
YNL057W	YNL057W	AME1	P38313	324 aa		2.85	□□□□□ -1.95
YNL057W	YNL057W	RPL14B	P38754	138 aa	Known RBP	2.85	□□□□□ -1.95
YNL057W	YNL057W	YHR173C	P38864	112 aa		2.85	□□□□□ -1.95
YNL057W	YNL057W	SUR2	P38992	349 aa		2.85	□□□□□ -1.95
YNL057W	YNL057W	URM1	P40554	99 aa	Predicted RBP	2.85	□□□□□ -1.95
YNL057W	YNL057W	RIB4	P50861	169 aa	Predicted RBP	2.85	□□□□□ -1.95
YNL057W	YNL057W	PMP3	P87284	55 aa		2.85	□□□□□ -1.95
YNL057W	YNL057W	SAR1	P20606	190 aa	Known RBP	2.84	□□□□□ -1.95
YNL057W	YNL057W	RPL16A	P26784	199 aa	Known RBP	2.84	□□□□□ -1.95
YNL057W	YNL057W	MIX23	P38162	196 aa		2.84	□□□□□ -1.95
YNL057W	YNL057W	PCC1	Q3E833	88 aa		2.84	□□□□□ -1.95
YNL057W	YNL057W	YMR122W-A	Q3E842	84 aa		2.84	□□□□□ -1.95
YNL057W	YNL057W	SEC59	P20048	519 aa		2.83	□□□□□ -1.96
YNL057W	YNL057W	POF1	P25576	258 aa		2.83	□□□□□ -1.96
YNL057W	YNL057W	DUT1	P33317	147 aa		2.83	□□□□□ -1.96
YNL057W	YNL057W	YBL081W	P38180	368 aa	Known RBP	2.83	□□□□□ -1.96
YNL057W	YNL057W	TEM1	P38987	245 aa		2.83	□□□□□ -1.96
YNL057W	YNL057W	COX16	P47081	118 aa		2.83	□□□□□ -1.96
YNL057W	YNL057W	YGL117W	P53133	265 aa		2.83	□□□□□ -1.96
YNL057W	YNL057W	YNR066C	P53752	436 aa		2.83	□□□□□ -1.96
YNL057W	YNL057W	SNA2	P56508	79 aa		2.83	□□□□□ -1.96
YNL057W	YNL057W	MRPS16	Q02608	121 aa		2.83	□□□□□ -1.96
YNL057W	YNL057W	TIM22	Q12328	207 aa		2.83	□□□□□ -1.96
YNL057W	YNL057W	UBC5	P15732	148 aa		2.82	□□□□□ -1.96
YNL057W	YNL057W	HYP2	P23301	157 aa	Known RBP	2.82	□□□□□ -1.96
YNL057W	YNL057W	SMP1	P38128	452 aa		2.82	□□□□□ -1.96
YNL057W	YNL057W	YPT10	P38146	199 aa		2.82	□□□□□ -1.96
YNL057W	YNL057W	YIL163C	P40448	117 aa		2.82	□□□□□ -1.96
YNL057W	YNL057W	ARC15	P40518	154 aa	RIP-Chip data	2.82	□□□□□ -1.96	not detected
YNL057W	YNL057W	DXO1	Q06349	442 aa		2.82	□□□□□ -1.96
YNL057W	YNL057W	YOR015W	Q12169	119 aa		2.82	□□□□□ -1.96
YNL057W	YNL057W	UTP23	Q12339	254 aa	Known RBP	2.82	□□□□□ -1.96
YNL057W	YNL057W	TIR1	P10863	254 aa		2.81	□□□□□ -1.96
YNL057W	YNL057W	ACP1	P32463	125 aa		2.81	□□□□□ -1.96
YNL057W	YNL057W	YAL064W	P39711	94 aa		2.81	□□□□□ -1.96
YNL057W	YNL057W	LOC1	P43586	204 aa	Predicted RBP	2.81	□□□□□ -1.96
YNL057W	YNL057W	UPS3	Q04006	179 aa		2.81	□□□□□ -1.96
YNL057W	YNL057W	RPL12A	P0CX53	165 aa	Known RBP	2.8	□□□□□ -1.96
YNL057W	YNL057W	RPL12B	P0CX54	165 aa		2.8	□□□□□ -1.96
YNL057W	YNL057W	CKS1	P20486	150 aa	Known RBP	2.8	□□□□□ -1.96
YNL057W	YNL057W	ACB1	P31787	87 aa		2.8	□□□□□ -1.96
YNL057W	YNL057W	FZF1	P32805	299 aa		2.8	□□□□□ -1.96
YNL057W	YNL057W	PGD1	P40356	397 aa		2.8	□□□□□ -1.96
YNL057W	YNL057W	AIM19	P40502	157 aa		2.8	□□□□□ -1.96
YNL057W	YNL057W	YFR045W	P43617	309 aa		2.8	□□□□□ -1.96
YNL057W	YNL057W	YGL185C	P53100	379 aa		2.8	□□□□□ -1.96
YNL057W	YNL057W	TIM21	P53220	239 aa		2.8	□□□□□ -1.96
YNL057W	YNL057W	EOS1	P53938	366 aa		2.8	□□□□□ -1.96
YNL057W	YNL057W	MRPS17	Q03246	237 aa	Predicted RBP	2.8	□□□□□ -1.96
YNL057W	YNL057W	YBL112C	Q3E7Y4	105 aa		2.8	□□□□□ -1.96
YNL057W	YNL057W	RPL32	P38061	130 aa	Known RBP	2.79	□□□□□ -1.96
YNL057W	YNL057W	YBR090C	P38253	122 aa		2.79	□□□□□ -1.96
YNL057W	YNL057W	YBR292C	P38357	123 aa		2.79	□□□□□ -1.96
YNL057W	YNL057W	ERG28	P40030	148 aa		2.79	□□□□□ -1.96
YNL057W	YNL057W	CIN5	P40917	295 aa		2.79	□□□□□ -1.96
YNL057W	YNL057W	JAC1	P53193	184 aa		2.79	□□□□□ -1.96
YNL057W	YNL057W	YGR026W	P53217	278 aa		2.79	□□□□□ -1.96
YNL057W	YNL057W	ADD37	Q03233	198 aa		2.79	□□□□□ -1.96
YNL057W	YNL057W	PLP1	Q04004	230 aa		2.79	□□□□□ -1.96
YNL057W	YNL057W	YLR194C	Q05777	254 aa		2.79	□□□□□ -1.96
YNL057W	YNL057W	MHR1	Q06630	226 aa		2.79	□□□□□ -1.96
YNL057W	YNL057W	SME1	Q12330	94 aa	Predicted RBP	2.79	□□□□□ -1.96
YNL057W	YNL057W	YGL194C-A	Q2V2P6	80 aa		2.79	□□□□□ -1.96

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 19.2 ms