RNA–Protein interactions for RNA: YMR023C

MSS1, Transcript of Mitochondrial protein, yeast

Gene MSS1, Length 1,581 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MSS1	YMR023C	NCA3	P46955	337 aa		4.65	□□□□□ -1.66
MSS1	YMR023C	YJR085C	P47131	105 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
MSS1	YMR023C	YDR274C	P87283	123 aa		4.65	□□□□□ -1.66
MSS1	YMR023C	MIX14	Q04341	121 aa		4.65	□□□□□ -1.66
MSS1	YMR023C	ODC2	Q99297	307 aa		4.65	□□□□□ -1.66
MSS1	YMR023C	ROM2	P51862	1356 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
MSS1	YMR023C	POR1	P04840	283 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
MSS1	YMR023C	YOL162W	P0CF19	215 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MSS1	YMR023C	YKL044W	P36092	106 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MSS1	YMR023C	ARC15	P40518	154 aa	RIP-Chip data	4.65	□□□□□ -1.67	not detected
MSS1	YMR023C	LIP1	Q03579	150 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MSS1	YMR023C	RIM9	Q04734	239 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MSS1	YMR023C	ELP6	Q04868	273 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MSS1	YMR023C	POC4	Q12245	148 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
MSS1	YMR023C	RPL21B	Q12672	160 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
MSS1	YMR023C	DFM1	Q12743	341 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
MSS1	YMR023C	UMP1	P38293	148 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MSS1	YMR023C	HYR1	P40581	163 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
MSS1	YMR023C	ATG18	P43601	500 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MSS1	YMR023C	THG1	P53215	237 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
MSS1	YMR023C	YOR385W	Q08909	290 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MSS1	YMR023C	SMT3	Q12306	101 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
MSS1	YMR023C	YPL247C	Q12523	523 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MSS1	YMR023C	SCS22	Q6Q595	175 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MSS1	YMR023C	RPS13	P05756	151 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
MSS1	YMR023C	RPS25B	P0C0T4	108 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
MSS1	YMR023C	RPA12	P32529	125 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
MSS1	YMR023C	PEP8	P40335	379 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MSS1	YMR023C	SMD3	P43321	101 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
MSS1	YMR023C	BNS1	P50084	137 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MSS1	YMR023C	CRH1	P53301	507 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MSS1	YMR023C	RSM19	P53733	91 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
MSS1	YMR023C	YMR244W	Q04018	355 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MSS1	YMR023C	KRE1	P17260	313 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MSS1	YMR023C	YEL045C	P32616	141 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MSS1	YMR023C	CTR2	P38865	189 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MSS1	YMR023C	YEL073C	P39974	107 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MSS1	YMR023C	YDR042C	Q03205	200 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MSS1	YMR023C	YML122C	Q03207	126 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MSS1	YMR023C	YLR296W	Q05898	108 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MSS1	YMR023C	NMA1	Q06178	401 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
MSS1	YMR023C	RRT15	Q3E811	62 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MSS1	YMR023C	ENV10	Q99382	181 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MSS1	YMR023C	DUR1,2	P32528	1835 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
MSS1	YMR023C	NUP170	P38181	1502 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MSS1	YMR023C	RRT1	P38192	103 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MSS1	YMR023C	RPL21A	Q02753	160 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
MSS1	YMR023C	RPB9	P27999	122 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MSS1	YMR023C	QCR10	P37299	77 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MSS1	YMR023C	DIM1	P41819	318 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
MSS1	YMR023C	HUR1	P45820	110 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MSS1	YMR023C	IRC25	Q07951	179 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MSS1	YMR023C	SRL1	Q08673	210 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MSS1	YMR023C	TVP23	P38962	199 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSS1	YMR023C	PAU23	Q07987	124 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSS1	YMR023C	PAU17	Q12370	124 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSS1	YMR023C	YMR175W-A	Q3E766	64 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSS1	YMR023C	YIL134C-A	Q45U18	67 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSS1	YMR023C	SUS1	Q6WNK7	96 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSS1	YMR023C	BPT1	P14772	1559 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MSS1	YMR023C	FYV5	P25585	152 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MSS1	YMR023C	UTR5	P32630	166 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MSS1	YMR023C	YHR138C	P38841	114 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MSS1	YMR023C	TVP15	Q03860	143 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MSS1	YMR023C	AYT1	Q12226	474 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MSS1	YMR023C	ESP1	Q03018	1630 aa		4.59	□□□□□ -1.68
MSS1	YMR023C	RPL42A	P0CX27	106 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MSS1	YMR023C	RPL42B	P0CX28	106 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MSS1	YMR023C	YKR045C	P36138	183 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MSS1	YMR023C	MZM1	Q03429	123 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MSS1	YMR023C	YHP1	Q04116	353 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MSS1	YMR023C	YOL029C	Q08187	201 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MSS1	YMR023C	EMC6	Q12431	108 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MSS1	YMR023C	PCC1	Q3E833	88 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MSS1	YMR023C	YNR034W-A	Q3E841	98 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MSS1	YMR023C	YLR422W	Q06409	1932 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MSS1	YMR023C	UBR1	P19812	1950 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MSS1	YMR023C	HSP26	P15992	214 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.57	□□□□□ -1.68	not detected
MSS1	YMR023C	YNL217W	P40152	326 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MSS1	YMR023C	YGL118C	P53132	145 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MSS1	YMR023C	ATP19	P81451	68 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MSS1	YMR023C	YMR295C	Q03559	197 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MSS1	YMR023C	YDR115W	Q04598	105 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MSS1	YMR023C	YDR119W-A	Q2V2P9	66 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MSS1	YMR023C	YLR363W-A	Q3E747	85 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MSS1	YMR023C	MDM35	O60200	86 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MSS1	YMR023C	ATX1	P38636	73 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MSS1	YMR023C	SOM1	Q05676	74 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MSS1	YMR023C	NAT5	Q08689	176 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MSS1	YMR023C	POL1	P13382	1468 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MSS1	YMR023C	PAN1	P32521	1480 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MSS1	YMR023C	TOM6	P33448	61 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MSS1	YMR023C	ECM34	P38728	170 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MSS1	YMR023C	VMA21	P41806	77 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MSS1	YMR023C	API2	Q04413	109 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MSS1	YMR023C	DAD1	Q12248	94 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MSS1	YMR023C	SNQ2	P32568	1501 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MSS1	YMR023C	PDR12	Q02785	1511 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MSS1	YMR023C	IRC20	Q06554	1556 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MSS1	YMR023C	ULS1	Q08562	1619 aa		4.55	□□□□□ -1.68

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