RNA–Protein interactions for RNA: YHR143W-A

RPC10, Transcript of RNA polymerase subunit ABC10-alpha, found in RNA pol I, II, and III, yeastyeast

Gene RPC10, Length 213 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPC10YHR143W-A SOM1Q05676 74 aa0.19□□□□□ -2.38
RPC10YHR143W-A DYN1P36022 4092 aa0.18□□□□□ -2.38
RPC10YHR143W-A GSC2P40989 1895 aa0.18□□□□□ -2.38
RPC10YHR143W-A YBR013CP38215 129 aa0.18□□□□□ -2.38
RPC10YHR143W-A YPL067CQ02754 198 aa0.18□□□□□ -2.38
RPC10YHR143W-A RAF1Q06891 181 aa0.18□□□□□ -2.38
RPC10YHR143W-A TOR2P32600 2474 aaKnown RBP0.18□□□□□ -2.38
RPC10YHR143W-A SFT2P38166 215 aa0.17□□□□□ -2.38
RPC10YHR143W-A YGR201CP42936 225 aa0.17□□□□□ -2.38
RPC10YHR143W-A LSM1P47017 172 aaKnown RBP0.17□□□□□ -2.38
RPC10YHR143W-A MIC27P50945 234 aa0.17□□□□□ -2.38
RPC10YHR143W-A TOM1Q03280 3268 aa0.17□□□□□ -2.38
RPC10YHR143W-A VPS13Q07878 3144 aa0.17□□□□□ -2.38
RPC10YHR143W-A IRA2P19158 3079 aa0.16□□□□□ -2.38
RPC10YHR143W-A LSM8P47093 109 aaKnown RBP0.16□□□□□ -2.38
RPC10YHR143W-A MED11Q99278 115 aa0.16□□□□□ -2.38
RPC10YHR143W-A DDP1Q99321 188 aaKnown RBP0.16□□□□□ -2.38
RPC10YHR143W-A TOR1P35169 2470 aa0.16□□□□□ -2.38
RPC10YHR143W-A IRA1P18963 3092 aa0.16□□□□□ -2.38
RPC10YHR143W-A CSF1Q12150 2958 aa0.15□□□□□ -2.38
RPC10YHR143W-A PFY1P07274 126 aa0.15□□□□□ -2.39
RPC10YHR143W-A AIM4P38305 123 aaPredicted RBP0.15□□□□□ -2.39
RPC10YHR143W-A RPS29BP41058 56 aaKnown RBP0.15□□□□□ -2.39
RPC10YHR143W-A BLM10P43583 2143 aa0.15□□□□□ -2.39
RPC10YHR143W-A YGL149WP53116 101 aa0.15□□□□□ -2.39
RPC10YHR143W-A RAV2Q03956 351 aa0.15□□□□□ -2.39
RPC10YHR143W-A URA2P07259 2214 aaKnown RBP0.15□□□□□ -2.39
RPC10YHR143W-A TY4B-JP47024 1803 aa0.15□□□□□ -2.39
RPC10YHR143W-A MRPL44P19956 98 aa0.14□□□□□ -2.39
RPC10YHR143W-A SUI1P32911 108 aaKnown RBP0.14□□□□□ -2.39
RPC10YHR143W-A UTP20P35194 2493 aaKnown RBP0.13□□□□□ -2.39
RPC10YHR143W-A YSF3P0C074 85 aaPredicted RBP0.13□□□□□ -2.39
RPC10YHR143W-A FIG1P38224 298 aa0.13□□□□□ -2.39
RPC10YHR143W-A POR2P40478 281 aa0.13□□□□□ -2.39
RPC10YHR143W-A SPG1P50088 95 aa0.13□□□□□ -2.39
RPC10YHR143W-A PKR1Q03880 122 aaKnown RBP0.13□□□□□ -2.39
RPC10YHR143W-A YLR296WQ05898 108 aa0.13□□□□□ -2.39
RPC10YHR143W-A YOR385WQ08909 290 aa0.13□□□□□ -2.39
RPC10YHR143W-A PET20Q99373 253 aa0.13□□□□□ -2.39
RPC10YHR143W-A BNI1P41832 1953 aa0.13□□□□□ -2.39
RPC10YHR143W-A MRPL31P14063 131 aaPredicted RBP0.12□□□□□ -2.39
RPC10YHR143W-A RME1P32338 300 aaKnown RBP0.12□□□□□ -2.39
RPC10YHR143W-A MRPL11P36521 249 aaPredicted RBP0.12□□□□□ -2.39
RPC10YHR143W-A BRP1P53194 125 aa0.12□□□□□ -2.39
RPC10YHR143W-A LDB18Q07887 179 aa0.12□□□□□ -2.39
RPC10YHR143W-A ATP14Q12349 124 aa0.12□□□□□ -2.39
RPC10YHR143W-A GTT2Q12390 233 aa0.12□□□□□ -2.39
RPC10YHR143W-A YRF1-3P0CX14 1859 aa0.12□□□□□ -2.39
RPC10YHR143W-A YRF1-7P0CX15 1859 aa0.12□□□□□ -2.39
RPC10YHR143W-A HAP3P13434 144 aa0.11□□□□□ -2.39
RPC10YHR143W-A YLR194CQ05777 254 aa0.11□□□□□ -2.39
RPC10YHR143W-A TAO3P40468 2376 aa0.11□□□□□ -2.39
RPC10YHR143W-A SNT2P53127 1403 aa0.11□□□□□ -2.39
RPC10YHR143W-A SNF2P22082 1703 aa0.1□□□□□ -2.39
RPC10YHR143W-A PET54P10834 293 aa0.1□□□□□ -2.39
RPC10YHR143W-A RPS1AP33442 255 aaKnown RBP0.1□□□□□ -2.39
RPC10YHR143W-A YDR366CP87287 132 aa0.1□□□□□ -2.39
RPC10YHR143W-A YMR320WQ04897 101 aa0.1□□□□□ -2.39
RPC10YHR143W-A SRX1P36077 127 aa0.09□□□□□ -2.4
RPC10YHR143W-A QCR10P37299 77 aa0.09□□□□□ -2.4
RPC10YHR143W-A MOG1P47123 218 aa0.09□□□□□ -2.4
RPC10YHR143W-A TY1B-HO13535 1793 aa0.09□□□□□ -2.4
RPC10YHR143W-A FAS2P19097 1887 aaKnown RBP0.08□□□□□ -2.4
RPC10YHR143W-A RTC6O14464 93 aa0.08□□□□□ -2.4
RPC10YHR143W-A YJR128WP47162 119 aa0.08□□□□□ -2.4
RPC10YHR143W-A TLG1Q03322 224 aa0.08□□□□□ -2.4
RPC10YHR143W-A YOR1P53049 1477 aa0.08□□□□□ -2.4
RPC10YHR143W-A MYO1P08964 1928 aa0.07□□□□□ -2.4
RPC10YHR143W-A EMP24P32803 203 aaKnown RBP0.07□□□□□ -2.4
RPC10YHR143W-A GSP1P32835 219 aaKnown RBP0.07□□□□□ -2.4
RPC10YHR143W-A AIM18P38884 321 aa0.07□□□□□ -2.4
RPC10YHR143W-A HSP10P38910 106 aa0.07□□□□□ -2.4
RPC10YHR143W-A YGR039WP53225 103 aa0.07□□□□□ -2.4
RPC10YHR143W-A HHO1P53551 258 aa0.07□□□□□ -2.4
RPC10YHR143W-A COF1Q03048 143 aaKnown RBP0.07□□□□□ -2.4
RPC10YHR143W-A SDH7Q04401 133 aa0.07□□□□□ -2.4
RPC10YHR143W-A FCF2Q12035 217 aaPredicted RBP0.07□□□□□ -2.4
RPC10YHR143W-A PRS3P38689 320 aaKnown RBP0.06□□□□□ -2.4
RPC10YHR143W-A RBL2P48606 106 aaKnown RBP0.06□□□□□ -2.4
RPC10YHR143W-A ARL3Q02804 198 aa0.06□□□□□ -2.4
RPC10YHR143W-A SPC3Q12133 184 aa0.06□□□□□ -2.4
RPC10YHR143W-A MEC1P38111 2368 aa0.06□□□□□ -2.4
RPC10YHR143W-A RPL36BO14455 100 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
RPC10YHR143W-A RPL36AP05745 100 aaPredicted RBP0.05□□□□□ -2.4
RPC10YHR143W-A PAU21P0CE86 164 aa0.05□□□□□ -2.4
RPC10YHR143W-A PAU22P0CE87 164 aa0.05□□□□□ -2.4
RPC10YHR143W-A YCR050CP25630 102 aa0.05□□□□□ -2.4
RPC10YHR143W-A RPC19P28000 142 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
RPC10YHR143W-A YAL064WP39711 94 aa0.05□□□□□ -2.4
RPC10YHR143W-A HPM1P40481 377 aa0.05□□□□□ -2.4
RPC10YHR143W-A SMD2Q06217 110 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
RPC10YHR143W-A BRR2P32639 2163 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
RPC10YHR143W-A SEC16P48415 2195 aaKnown RBP0.04□□□□□ -2.4
RPC10YHR143W-A SUA7P29055 345 aaPredicted RBP0.04□□□□□ -2.4
RPC10YHR143W-A YIL163CP40448 117 aa0.04□□□□□ -2.4
RPC10YHR143W-A YFR035CP43608 114 aa0.04□□□□□ -2.4
RPC10YHR143W-A AUA1P32450 94 aa0.03□□□□□ -2.4
RPC10YHR143W-A ARC19P33204 171 aaKnown RBP0.03□□□□□ -2.4
RPC10YHR143W-A RPL14AP36105 138 aaKnown RBP0.03□□□□□ -2.4
RPC10YHR143W-A RPL14BP38754 138 aaKnown RBP0.03□□□□□ -2.4
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 30.1 ms