RNA–Protein interactions for RNA: YHR111W

UBA4, Transcript of E1-like protein that activates Urm1p before urmylation, yeastyeast

Gene UBA4, Length 1,323 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UBA4YHR111W ATP19P81451 68 aa7.42□□□□□ -1.22
UBA4YHR111W PCC1Q3E833 88 aa7.42□□□□□ -1.22
UBA4YHR111W MRPL4P36517 319 aa7.41□□□□□ -1.22
UBA4YHR111W SNO1Q03144 224 aa7.41□□□□□ -1.22
UBA4YHR111W YOR105WQ08504 108 aa7.41□□□□□ -1.22
UBA4YHR111W YBR126W-AQ8TGU7 68 aa7.41□□□□□ -1.22
UBA4YHR111W ECM25P32525 599 aa7.4□□□□□ -1.22
UBA4YHR111W FZF1P32805 299 aa7.4□□□□□ -1.22
UBA4YHR111W HIT1P46973 164 aa7.4□□□□□ -1.22
UBA4YHR111W YMR253CQ04835 414 aa7.4□□□□□ -1.22
UBA4YHR111W POF1P25576 258 aa7.39□□□□□ -1.23
UBA4YHR111W POG1P40473 351 aa7.39□□□□□ -1.23
UBA4YHR111W YFR045WP43617 309 aa7.39□□□□□ -1.23
UBA4YHR111W COX16P47081 118 aa7.39□□□□□ -1.23
UBA4YHR111W Q0142Q9ZZW4 58 aa7.39□□□□□ -1.23
UBA4YHR111W SEC59P20048 519 aa7.38□□□□□ -1.23
UBA4YHR111W LDS1P31379 325 aa7.38□□□□□ -1.23
UBA4YHR111W SRP21P32342 167 aa7.38□□□□□ -1.23
UBA4YHR111W RPR2P40571 144 aa7.38□□□□□ -1.23
UBA4YHR111W PHS1P40857 217 aa7.38□□□□□ -1.23
UBA4YHR111W YDL183CP48569 320 aa7.38□□□□□ -1.23
UBA4YHR111W YPS5P53057 165 aa7.38□□□□□ -1.23
UBA4YHR111W YDR366CP87287 132 aa7.38□□□□□ -1.23
UBA4YHR111W NAT3Q06504 195 aa7.38□□□□□ -1.23
UBA4YHR111W TIR1P10863 254 aa7.37□□□□□ -1.23
UBA4YHR111W RPL16BP26785 198 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
UBA4YHR111W AGA1P32323 725 aa7.37□□□□□ -1.23
UBA4YHR111W SRB6P32570 121 aa7.37□□□□□ -1.23
UBA4YHR111W RRT13P40042 185 aa7.37□□□□□ -1.23
UBA4YHR111W DAD3P69850 94 aa7.37□□□□□ -1.23
UBA4YHR111W UPS3Q04006 179 aa7.37□□□□□ -1.23
UBA4YHR111W YBR200W-AQ3E755 54 aa7.37□□□□□ -1.23
UBA4YHR111W RPL12AP0CX53 165 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
UBA4YHR111W RPL12BP0CX54 165 aa7.36□□□□□ -1.23
UBA4YHR111W YCH1P42937 148 aa7.36□□□□□ -1.23
UBA4YHR111W BRP1P53194 125 aa7.36□□□□□ -1.23
UBA4YHR111W TIM22Q12328 207 aa7.36□□□□□ -1.23
UBA4YHR111W SRP14P38985 146 aa7.35□□□□□ -1.23
UBA4YHR111W PGD1P40356 397 aa7.35□□□□□ -1.23
UBA4YHR111W TIM21P53220 239 aa7.35□□□□□ -1.23
UBA4YHR111W DIA1P54005 336 aa7.35□□□□□ -1.23
UBA4YHR111W SMT3Q12306 101 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
UBA4YHR111W TY1A-DR3Q12441 440 aa7.35□□□□□ -1.23
UBA4YHR111W BNS1P50084 137 aa7.34□□□□□ -1.23
UBA4YHR111W YCL001W-BQ96VH2 84 aa7.34□□□□□ -1.23
UBA4YHR111W FMP49A0A023PZB3 126 aa7.33□□□□□ -1.24
UBA4YHR111W AIM34Q03673 198 aa7.33□□□□□ -1.24
UBA4YHR111W DCN1Q12395 269 aa7.33□□□□□ -1.24
UBA4YHR111W YGR240C-AQ3E786 66 aa7.33□□□□□ -1.24
UBA4YHR111W YPR053CQ6Q5F3 151 aa7.33□□□□□ -1.24
UBA4YHR111W MOG1P47123 218 aa7.32□□□□□ -1.24
UBA4YHR111W YGR026WP53217 278 aa7.32□□□□□ -1.24
UBA4YHR111W ORM2Q06144 216 aa7.32□□□□□ -1.24
UBA4YHR111W MRPL31P14063 131 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
UBA4YHR111W LAC1P28496 418 aa7.31□□□□□ -1.24
UBA4YHR111W QRI5P32344 111 aa7.31□□□□□ -1.24
UBA4YHR111W ELF1P36053 145 aa7.31□□□□□ -1.24
UBA4YHR111W MRPL28P36527 147 aa7.3□□□□□ -1.24
UBA4YHR111W KRE9P39005 276 aa7.3□□□□□ -1.24
UBA4YHR111W SIT1P39980 628 aa7.3□□□□□ -1.24
UBA4YHR111W YNL217WP40152 326 aa7.3□□□□□ -1.24
UBA4YHR111W YIL024CP40543 189 aa7.3□□□□□ -1.24
UBA4YHR111W GIM5Q04493 163 aa7.3□□□□□ -1.24
UBA4YHR111W YGR017WP53210 297 aa7.29□□□□□ -1.24
UBA4YHR111W ATP23P53722 227 aa7.29□□□□□ -1.24
UBA4YHR111W CRC1Q12289 327 aa7.29□□□□□ -1.24
UBA4YHR111W MRPS9P38120 278 aa7.28□□□□□ -1.24
UBA4YHR111W RPB11P38902 120 aa7.28□□□□□ -1.24
UBA4YHR111W CSM4Q08955 156 aa7.28□□□□□ -1.24
UBA4YHR111W ATG33Q06485 197 aa7.27□□□□□ -1.24
UBA4YHR111W YLR042CQ07990 161 aa7.27□□□□□ -1.24
UBA4YHR111W NTF2P33331 125 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
UBA4YHR111W HSP10P38910 106 aa7.27□□□□□ -1.25
UBA4YHR111W SUR2P38992 349 aa7.27□□□□□ -1.25
UBA4YHR111W IRC22P40006 225 aa7.27□□□□□ -1.25
UBA4YHR111W YCR023CP25351 611 aa7.26□□□□□ -1.25
UBA4YHR111W MIX23P38162 196 aa7.26□□□□□ -1.25
UBA4YHR111W YHR140WP38842 239 aa7.26□□□□□ -1.25
UBA4YHR111W CUP2P15315 225 aa7.25□□□□□ -1.25
UBA4YHR111W YGL010WP25338 174 aa7.25□□□□□ -1.25
UBA4YHR111W YPT53P36019 220 aa7.25□□□□□ -1.25
UBA4YHR111W SPC1P46965 94 aa7.25□□□□□ -1.25
UBA4YHR111W DXO1Q06349 442 aa7.25□□□□□ -1.25
UBA4YHR111W ADH3P07246 375 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
UBA4YHR111W HMRA1P0CY11 126 aa7.24□□□□□ -1.25
UBA4YHR111W FRS1P15624 595 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
UBA4YHR111W MGA1P53050 456 aa7.24□□□□□ -1.25
UBA4YHR111W THG1P53215 237 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
UBA4YHR111W GPI19Q04082 140 aa7.24□□□□□ -1.25
UBA4YHR111W DGA1Q08650 418 aa7.24□□□□□ -1.25
UBA4YHR111W RPL27AP0C2H6 136 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
UBA4YHR111W APS2Q00381 147 aa7.23□□□□□ -1.25
UBA4YHR111W ARC18Q05933 178 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
UBA4YHR111W NHP6AP11632 93 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
UBA4YHR111W ZRT1P32804 376 aa7.22□□□□□ -1.25
UBA4YHR111W PAU7P39545 55 aa7.22□□□□□ -1.25
UBA4YHR111W PAU5P43575 122 aa7.22□□□□□ -1.25
UBA4YHR111W YLR118CQ12354 227 aa7.22□□□□□ -1.25
UBA4YHR111W YNR034W-AQ3E841 98 aa7.22□□□□□ -1.25
UBA4YHR111W KTI12P34253 313 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
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