RNA–Protein interactions for RNA: YHR098C

SFB3, Transcript of Component of the Sec23p-Sfb3p heterodimer of the COPII vesicle coat, yeast

Gene SFB3, Length 2,790 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SFB3	YHR098C	IRC19	Q07843	230 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SFB3	YHR098C	YLR415C	O13578	112 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SFB3	YHR098C	YKL044W	P36092	106 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SFB3	YHR098C	TOM7	P53507	60 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SFB3	YHR098C	YHP1	Q04116	353 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SFB3	YHR098C	FCY1	Q12178	158 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SFB3	YHR098C	YOR029W	Q12243	111 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SFB3	YHR098C	APS1	P35181	156 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SFB3	YHR098C	YKR041W	P36134	250 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SFB3	YHR098C	CCS1	P40202	249 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
SFB3	YHR098C	YFR045W	P43617	309 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SFB3	YHR098C	MRX11	Q03079	207 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SFB3	YHR098C	HPA2	Q06592	156 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SFB3	YHR098C	YPS1	P32329	569 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SFB3	YHR098C	RPA12	P32529	125 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
SFB3	YHR098C	FMP46	P36141	133 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
SFB3	YHR098C	YER076C	P40049	302 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SFB3	YHR098C	YPL073C	P40323	161 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SFB3	YHR098C	LST8	P41318	303 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SFB3	YHR098C	CWP2	P43497	92 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SFB3	YHR098C	YDL186W	P48568	277 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SFB3	YHR098C	SUN4	P53616	420 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SFB3	YHR098C	USB1	Q12208	290 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
SFB3	YHR098C	MRPL31	P14063	131 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
SFB3	YHR098C	MRPL24	P36525	258 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
SFB3	YHR098C	YHR173C	P38864	112 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SFB3	YHR098C	HPF1	Q05164	967 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SFB3	YHR098C	KRE1	P17260	313 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SFB3	YHR098C	TIR2	P33890	251 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SFB3	YHR098C	PET8	P38921	284 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SFB3	YHR098C	YJL193W	P39542	402 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SFB3	YHR098C	YER181C	P40097	107 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SFB3	YHR098C	YRA1	Q12159	226 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
SFB3	YHR098C	SUT2	Q12286	268 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SFB3	YHR098C	MXR2	P25566	168 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SFB3	YHR098C	RNH203	Q12338	110 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SFB3	YHR098C	YAL063C-A	Q3E791	96 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SFB3	YHR098C	YHR214C-E	Q8TGK0	99 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SFB3	YHR098C	HTL1	Q9URQ5	78 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SFB3	YHR098C	MDM10	P18409	493 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SFB3	YHR098C	HSP150	P32478	413 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SFB3	YHR098C	CSH1	P38287	376 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SFB3	YHR098C	TOM1	Q03280	3268 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SFB3	YHR098C	YEL067C	P39978	195 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SFB3	YHR098C	YIP3	P53633	176 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SFB3	YHR098C	YDR042C	Q03205	200 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SFB3	YHR098C	YPS3	Q12303	508 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SFB3	YHR098C	MPD1	Q12404	318 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
SFB3	YHR098C	BOL1	Q3E793	110 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SFB3	YHR098C	CYC3	P06182	269 aa		4.65	□□□□□ -1.66
SFB3	YHR098C	RPL27B	P0C2H7	136 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
SFB3	YHR098C	YER039C-A	P0CD97	72 aa		4.65	□□□□□ -1.66
SFB3	YHR098C	YFR057W	P43625	151 aa		4.65	□□□□□ -1.66
SFB3	YHR098C	YMR103C	Q04436	120 aa		4.65	□□□□□ -1.66
SFB3	YHR098C	FIT2	Q08906	153 aa		4.65	□□□□□ -1.66
SFB3	YHR098C	SPO24	Q3E752	67 aa		4.65	□□□□□ -1.66
SFB3	YHR098C	PAU7	P39545	55 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SFB3	YHR098C	YER079W	P40052	210 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
SFB3	YHR098C	SBH2	P52871	88 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SFB3	YHR098C	RAF1	Q06891	181 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SFB3	YHR098C	YDR524C-B	Q3E6R4	66 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SFB3	YHR098C	YAL064W-B	O13512	126 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SFB3	YHR098C	MDM35	O60200	86 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SFB3	YHR098C	YSF3	P0C074	85 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
SFB3	YHR098C	ARF1	P11076	181 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
SFB3	YHR098C	HSP12	P22943	109 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
SFB3	YHR098C	LYS1	P38998	373 aa	RIP-Chip data	4.65	□□□□□ -1.67	not detected
SFB3	YHR098C	PRY1	P47032	299 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SFB3	YHR098C	UBC7	Q02159	165 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SFB3	YHR098C	YOR376W	Q08900	122 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SFB3	YHR098C	YIL059C	P40520	121 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SFB3	YHR098C	RFM1	Q12192	310 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SFB3	YHR098C	YDR119W-A	Q2V2P9	66 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SFB3	YHR098C	VMA11	P32842	164 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SFB3	YHR098C	YKL097C	P34245	136 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SFB3	YHR098C	YKR032W	P36127	104 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SFB3	YHR098C	CYR1	P08678	2026 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SFB3	YHR098C	IMP1	P28627	190 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SFB3	YHR098C	NRG2	P38082	220 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SFB3	YHR098C	MBB1	P39534	108 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SFB3	YHR098C	UBC13	P52490	153 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SFB3	YHR098C	YOR097C	Q12274	175 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SFB3	YHR098C	YFL041W-A	Q3E817	63 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SFB3	YHR098C	ENV10	Q99382	181 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SFB3	YHR098C	PIS1	P06197	220 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SFB3	YHR098C	TOM40	P23644	387 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SFB3	YHR098C	ROX3	P25046	220 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SFB3	YHR098C	OST1	P41543	476 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SFB3	YHR098C	YTH1	Q06102	208 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SFB3	YHR098C	RPL18A	P0CX49	186 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SFB3	YHR098C	RPL18B	P0CX50	186 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SFB3	YHR098C	TIF34	P40217	347 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SFB3	YHR098C	YIP1	P53039	248 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SFB3	YHR098C	YNR077C	P53758	84 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SFB3	YHR098C	RDL2	Q08742	149 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SFB3	YHR098C	KNH1	P50112	268 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SFB3	YHR098C	YMR254C	Q04838	102 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SFB3	YHR098C	LSM6	Q06406	86 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SFB3	YHR098C	RXT3	Q07458	294 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SFB3	YHR098C	YDL022C-A	P0C5L6	82 aa		4.61	□□□□□ -1.67

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