RNA–Protein interactions for RNA: YGR247W

CPD1, Transcript of Cyclic nucleotide phosphodiesterase, yeastyeast

Gene CPD1, Length 720 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CPD1YGR247W ADD37Q03233 198 aa6.14□□□□□ -1.43
CPD1YGR247W DGA1Q08650 418 aa6.14□□□□□ -1.43
CPD1YGR247W TY1A-NL2Q12470 440 aa6.14□□□□□ -1.43
CPD1YGR247W DFM1Q12743 341 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
CPD1YGR247W GCV3P39726 170 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
CPD1YGR247W POG1P40473 351 aa6.13□□□□□ -1.43
CPD1YGR247W TIM21P53220 239 aa6.13□□□□□ -1.43
CPD1YGR247W DIA1P54005 336 aa6.13□□□□□ -1.43
CPD1YGR247W ERI1P62651 68 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
CPD1YGR247W TIM22Q12328 207 aa6.13□□□□□ -1.43
CPD1YGR247W RRT15Q3E811 62 aa6.13□□□□□ -1.43
CPD1YGR247W DIF1O13577 133 aa6.12□□□□□ -1.43
CPD1YGR247W YCR023CP25351 611 aa6.12□□□□□ -1.43
CPD1YGR247W UPS3Q04006 179 aa6.12□□□□□ -1.43
CPD1YGR247W SME1Q12330 94 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
CPD1YGR247W YGL194C-AQ2V2P6 80 aa6.12□□□□□ -1.43
CPD1YGR247W RPL12AP0CX53 165 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
CPD1YGR247W RPL12BP0CX54 165 aa6.11□□□□□ -1.43
CPD1YGR247W SUR2P38992 349 aa6.11□□□□□ -1.43
CPD1YGR247W YFL067WP43537 175 aa6.11□□□□□ -1.43
CPD1YGR247W YPR010C-AA5Z2X5 72 aa6.1□□□□□ -1.43
CPD1YGR247W PAU4P53427 120 aa6.1□□□□□ -1.43
CPD1YGR247W RPL14AP36105 138 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
CPD1YGR247W YBR013CP38215 129 aa6.09□□□□□ -1.43
CPD1YGR247W RPL14BP38754 138 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
CPD1YGR247W YIL163CP40448 117 aa6.09□□□□□ -1.43
CPD1YGR247W YDR115WQ04598 105 aa6.09□□□□□ -1.43
CPD1YGR247W PCC1Q3E833 88 aa6.09□□□□□ -1.43
CPD1YGR247W SPC25P40014 221 aa6.08□□□□□ -1.44
CPD1YGR247W CYB5P40312 120 aa6.08□□□□□ -1.44
CPD1YGR247W FCF1Q05498 189 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
CPD1YGR247W TEM1P38987 245 aa6.07□□□□□ -1.44
CPD1YGR247W YFR045WP43617 309 aa6.07□□□□□ -1.44
CPD1YGR247W PMP3P87284 55 aa6.07□□□□□ -1.44
CPD1YGR247W ATG33Q06485 197 aa6.07□□□□□ -1.44
CPD1YGR247W YMR122W-AQ3E842 84 aa6.07□□□□□ -1.44
CPD1YGR247W YAR023CD6VPM8 179 aa6.06□□□□□ -1.44
CPD1YGR247W RPS22AP0C0W1 130 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
CPD1YGR247W PAU1P0CE88 120 aa6.06□□□□□ -1.44
CPD1YGR247W PAU14P0CE89 120 aa6.06□□□□□ -1.44
CPD1YGR247W PAU6P0CE90 120 aa6.06□□□□□ -1.44
CPD1YGR247W PAU18P0CE91 120 aa6.06□□□□□ -1.44
CPD1YGR247W PAU8P0CE92 120 aa6.06□□□□□ -1.44
CPD1YGR247W PAU11P0CE93 120 aa6.06□□□□□ -1.44
CPD1YGR247W PAU13P38725 120 aa6.06□□□□□ -1.44
CPD1YGR247W YGR026WP53217 278 aa6.06□□□□□ -1.44
CPD1YGR247W ATP19P81451 68 aa6.06□□□□□ -1.44
CPD1YGR247W PAU10Q03050 120 aa6.06□□□□□ -1.44
CPD1YGR247W BET5Q03630 159 aa6.06□□□□□ -1.44
CPD1YGR247W PAU20Q08322 120 aa6.06□□□□□ -1.44
CPD1YGR247W YOR105WQ08504 108 aa6.06□□□□□ -1.44
CPD1YGR247W PAU9Q3E770 120 aa6.06□□□□□ -1.44
CPD1YGR247W YJL197C-AP0C5P0 93 aa6.05□□□□□ -1.44
CPD1YGR247W UBC5P15732 148 aa6.05□□□□□ -1.44
CPD1YGR247W POF1P25576 258 aa6.05□□□□□ -1.44
CPD1YGR247W MIX23P38162 196 aa6.05□□□□□ -1.44
CPD1YGR247W COX19Q3E731 98 aa6.05□□□□□ -1.44
CPD1YGR247W FZF1P32805 299 aa6.04□□□□□ -1.44
CPD1YGR247W SHG1P38337 142 aa6.04□□□□□ -1.44
CPD1YGR247W JAC1P53193 184 aa6.04□□□□□ -1.44
CPD1YGR247W YMR320WQ04897 101 aa6.04□□□□□ -1.44
CPD1YGR247W SEC59P20048 519 aa6.03□□□□□ -1.44
CPD1YGR247W PGD1P40356 397 aa6.03□□□□□ -1.44
CPD1YGR247W YGR017WP53210 297 aa6.03□□□□□ -1.44
CPD1YGR247W TIR1P10863 254 aa6.01□□□□□ -1.45
CPD1YGR247W YBR090CP38253 122 aa6.01□□□□□ -1.45
CPD1YGR247W RPA14P50106 137 aa6.01□□□□□ -1.45
CPD1YGR247W LCL1Q02786 101 aa6.01□□□□□ -1.45
CPD1YGR247W DXO1Q06349 442 aa6.01□□□□□ -1.45
CPD1YGR247W ARC15P40518 154 aaRIP-Chip data6□□□□□ -1.45not detected
CPD1YGR247W MOG1P47123 218 aa6□□□□□ -1.45
CPD1YGR247W YHR140WP38842 239 aa5.99□□□□□ -1.45
CPD1YGR247W PHO23P50947 330 aa5.99□□□□□ -1.45
CPD1YGR247W YLR307C-AQ3E825 87 aa5.99□□□□□ -1.45
CPD1YGR247W FRS1P15624 595 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
CPD1YGR247W RPL16AP26784 199 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
CPD1YGR247W MRP49P32388 137 aa5.98□□□□□ -1.45
CPD1YGR247W ERG28P40030 148 aa5.98□□□□□ -1.45
CPD1YGR247W YIL059CP40520 121 aa5.98□□□□□ -1.45
CPD1YGR247W ISU2Q12056 156 aa5.98□□□□□ -1.45
CPD1YGR247W YDR029WQ12111 104 aa5.97□□□□□ -1.45
CPD1YGR247W MRPL31P14063 131 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
CPD1YGR247W SRP21P32342 167 aa5.96□□□□□ -1.46
CPD1YGR247W RIB5P38145 238 aa5.96□□□□□ -1.46
CPD1YGR247W TVP18Q04767 167 aa5.96□□□□□ -1.46
CPD1YGR247W CSM4Q08955 156 aa5.96□□□□□ -1.46
CPD1YGR247W SNU23Q12368 194 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
CPD1YGR247W YBR085C-AO43137 85 aa5.94□□□□□ -1.46
CPD1YGR247W RPL27AP0C2H6 136 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
CPD1YGR247W RPL42AP0CX27 106 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
CPD1YGR247W RPL42BP0CX28 106 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
CPD1YGR247W MSK1P32048 576 aa5.94□□□□□ -1.46
CPD1YGR247W RPB11P38902 120 aa5.94□□□□□ -1.46
CPD1YGR247W GPI19Q04082 140 aa5.94□□□□□ -1.46
CPD1YGR247W MMS2P53152 137 aa5.93□□□□□ -1.46
CPD1YGR247W GIM5Q04493 163 aa5.93□□□□□ -1.46
CPD1YGR247W YCL001W-BQ96VH2 84 aa5.93□□□□□ -1.46
CPD1YGR247W HIT1P46973 164 aa5.92□□□□□ -1.46
CPD1YGR247W NAT3Q06504 195 aa5.92□□□□□ -1.46
CPD1YGR247W SMT3Q12306 101 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
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