RNA–Protein interactions for RNA: tT(AGU)C

tT(AGU)C, Transcript of Threonine tRNA (tRNA-Thr), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tT(AGU)C, Length 73 nt, Biotype tRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tT(AGU)CtT(AGU)C MRPL20P22354 195 aaPredicted RBP0.5□□□□□ -2.33
tT(AGU)CtT(AGU)C SPO13P23624 291 aa0.5□□□□□ -2.33
tT(AGU)CtT(AGU)C TIP1P27654 210 aaPredicted RBP0.5□□□□□ -2.33
tT(AGU)CtT(AGU)C AGA1P32323 725 aa0.5□□□□□ -2.33
tT(AGU)CtT(AGU)C HMX1P32339 317 aa0.5□□□□□ -2.33
tT(AGU)CtT(AGU)C QRI5P32344 111 aa0.5□□□□□ -2.33
tT(AGU)CtT(AGU)C PHD1P36093 366 aa0.5□□□□□ -2.33
tT(AGU)CtT(AGU)C DER1P38307 211 aa0.5□□□□□ -2.33
tT(AGU)CtT(AGU)C TRS20P38334 175 aa0.5□□□□□ -2.33
tT(AGU)CtT(AGU)C SHG1P38337 142 aa0.5□□□□□ -2.33
tT(AGU)CtT(AGU)C YBR292CP38357 123 aa0.5□□□□□ -2.33
tT(AGU)CtT(AGU)C PAU13P38725 120 aa0.5□□□□□ -2.33
tT(AGU)CtT(AGU)C YHR022CP38763 256 aa0.5□□□□□ -2.33
tT(AGU)CtT(AGU)C VMA22P38784 181 aa0.5□□□□□ -2.33
tT(AGU)CtT(AGU)C KRE9P39005 276 aa0.5□□□□□ -2.33
tT(AGU)CtT(AGU)C MBB1P39534 108 aa0.5□□□□□ -2.33
tT(AGU)CtT(AGU)C MST28P39552 234 aa0.5□□□□□ -2.33
tT(AGU)CtT(AGU)C RRT13P40042 185 aa0.5□□□□□ -2.33
tT(AGU)CtT(AGU)C YER135CP40082 130 aa0.5□□□□□ -2.33
tT(AGU)CtT(AGU)C YMR141CP40211 102 aa0.5□□□□□ -2.33
tT(AGU)CtT(AGU)C PRE5P40302 234 aaKnown RBP0.5□□□□□ -2.33
tT(AGU)CtT(AGU)C CYB5P40312 120 aa0.5□□□□□ -2.33
tT(AGU)CtT(AGU)C SIM1P40472 476 aa0.5□□□□□ -2.33
tT(AGU)CtT(AGU)C RPR2P40571 144 aa0.5□□□□□ -2.33
tT(AGU)CtT(AGU)C ATG27P46989 271 aa0.5□□□□□ -2.33
tT(AGU)CtT(AGU)C COX16P47081 118 aa0.5□□□□□ -2.33
tT(AGU)CtT(AGU)C PUS4P48567 403 aaKnown RBP0.5□□□□□ -2.33
tT(AGU)CtT(AGU)C PHO23P50947 330 aa0.5□□□□□ -2.33
tT(AGU)CtT(AGU)C MST27P53176 234 aa0.5□□□□□ -2.33
tT(AGU)CtT(AGU)C TIM21P53220 239 aa0.5□□□□□ -2.33
tT(AGU)CtT(AGU)C PAU4P53427 120 aa0.5□□□□□ -2.33
tT(AGU)CtT(AGU)C YNR071CP53757 342 aa0.5□□□□□ -2.33
tT(AGU)CtT(AGU)C FMP41P53889 259 aaKnown RBP0.5□□□□□ -2.33
tT(AGU)CtT(AGU)C YDR366CP87287 132 aa0.5□□□□□ -2.33
tT(AGU)CtT(AGU)C UBC7Q02159 165 aa0.5□□□□□ -2.33
tT(AGU)CtT(AGU)C PAU10Q03050 120 aa0.5□□□□□ -2.33
tT(AGU)CtT(AGU)C YMR181CQ03231 154 aa0.5□□□□□ -2.33
tT(AGU)CtT(AGU)C ADD37Q03233 198 aa0.5□□□□□ -2.33
tT(AGU)CtT(AGU)C MRPS17Q03246 237 aaPredicted RBP0.5□□□□□ -2.33
tT(AGU)CtT(AGU)C TMA23Q03525 211 aa0.5□□□□□ -2.33
tT(AGU)CtT(AGU)C YMR007WQ03675 126 aa0.5□□□□□ -2.33
tT(AGU)CtT(AGU)C SDH7Q04401 133 aa0.5□□□□□ -2.33
tT(AGU)CtT(AGU)C SHH3Q04487 196 aa0.5□□□□□ -2.33
tT(AGU)CtT(AGU)C ARC18Q05933 178 aaKnown RBP0.5□□□□□ -2.33
tT(AGU)CtT(AGU)C CTR3Q06686 241 aa0.5□□□□□ -2.33
tT(AGU)CtT(AGU)C PAU20Q08322 120 aa0.5□□□□□ -2.33
tT(AGU)CtT(AGU)C VTS1Q08831 523 aaKnown RBP RIP-Chip data0.5□□□□□ -2.33not detected
tT(AGU)CtT(AGU)C YPL162CQ12042 273 aa0.5□□□□□ -2.33
tT(AGU)CtT(AGU)C YLR122CQ12312 125 aa0.5□□□□□ -2.33
tT(AGU)CtT(AGU)C PAA1Q12447 191 aaKnown RBP0.5□□□□□ -2.33
tT(AGU)CtT(AGU)C PRM7Q12459 698 aa0.5□□□□□ -2.33
tT(AGU)CtT(AGU)C YPR145C-AQ2V2P0 78 aa0.5□□□□□ -2.33
tT(AGU)CtT(AGU)C YBR200W-AQ3E755 54 aa0.5□□□□□ -2.33
tT(AGU)CtT(AGU)C PAU9Q3E770 120 aa0.5□□□□□ -2.33
tT(AGU)CtT(AGU)C YGR240C-AQ3E786 66 aa0.5□□□□□ -2.33
tT(AGU)CtT(AGU)C TFB5Q3E7C1 72 aaPredicted RBP0.5□□□□□ -2.33
tT(AGU)CtT(AGU)C YLR342W-AQ3E810 57 aa0.5□□□□□ -2.33
tT(AGU)CtT(AGU)C YPL229WQ99395 206 aa0.5□□□□□ -2.33
tT(AGU)CtT(AGU)C URA2P07259 2214 aaKnown RBP0.5□□□□□ -2.33
tT(AGU)CtT(AGU)C YBR085C-AO43137 85 aa0.49□□□□□ -2.33
tT(AGU)CtT(AGU)C DFR1P07807 211 aaKnown RBP RIP-Chip data0.49□□□□□ -2.33not detected
tT(AGU)CtT(AGU)C RPS22AP0C0W1 130 aaKnown RBP0.49□□□□□ -2.33
tT(AGU)CtT(AGU)C HMRA1P0CY11 126 aa0.49□□□□□ -2.33
tT(AGU)CtT(AGU)C NHP6AP11632 93 aaKnown RBP0.49□□□□□ -2.33
tT(AGU)CtT(AGU)C MRPL31P14063 131 aaPredicted RBP0.49□□□□□ -2.33
tT(AGU)CtT(AGU)C CUP2P15315 225 aa0.49□□□□□ -2.33
tT(AGU)CtT(AGU)C RPB3P16370 318 aaKnown RBP0.49□□□□□ -2.33
tT(AGU)CtT(AGU)C SEC59P20048 519 aa0.49□□□□□ -2.33
tT(AGU)CtT(AGU)C ZRC1P20107 442 aa0.49□□□□□ -2.33
tT(AGU)CtT(AGU)C MAG1P22134 296 aaKnown RBP0.49□□□□□ -2.33
tT(AGU)CtT(AGU)C HSP12P22943 109 aaKnown RBP0.49□□□□□ -2.33
tT(AGU)CtT(AGU)C CNB1P25296 175 aa0.49□□□□□ -2.33
tT(AGU)CtT(AGU)C YCR023CP25351 611 aa0.49□□□□□ -2.33
tT(AGU)CtT(AGU)C POF1P25576 258 aa0.49□□□□□ -2.33
tT(AGU)CtT(AGU)C COQ3P27680 312 aa0.49□□□□□ -2.33
tT(AGU)CtT(AGU)C LDS1P31379 325 aa0.49□□□□□ -2.33
tT(AGU)CtT(AGU)C MSK1P32048 576 aa0.49□□□□□ -2.33
tT(AGU)CtT(AGU)C MRP49P32388 137 aa0.49□□□□□ -2.33
tT(AGU)CtT(AGU)C FZF1P32805 299 aa0.49□□□□□ -2.33
tT(AGU)CtT(AGU)C RPS0AP32905 252 aaKnown RBP0.49□□□□□ -2.33
tT(AGU)CtT(AGU)C TIR2P33890 251 aa0.49□□□□□ -2.33
tT(AGU)CtT(AGU)C YRA2P36036 203 aaKnown RBP RIP-Chip data0.49□□□□□ -2.33not detected
tT(AGU)CtT(AGU)C CMC1P36064 111 aa0.49□□□□□ -2.33
tT(AGU)CtT(AGU)C RPL14AP36105 138 aaKnown RBP0.49□□□□□ -2.33
tT(AGU)CtT(AGU)C YPT10P38146 199 aa0.49□□□□□ -2.33
tT(AGU)CtT(AGU)C MIX23P38162 196 aa0.49□□□□□ -2.33
tT(AGU)CtT(AGU)C RPL14BP38754 138 aaKnown RBP0.49□□□□□ -2.33
tT(AGU)CtT(AGU)C SIT1P39980 628 aa0.49□□□□□ -2.33
tT(AGU)CtT(AGU)C SNU13P39990 126 aaKnown RBP0.49□□□□□ -2.33
tT(AGU)CtT(AGU)C IRC22P40006 225 aa0.49□□□□□ -2.33
tT(AGU)CtT(AGU)C GET2P40056 285 aa0.49□□□□□ -2.33
tT(AGU)CtT(AGU)C PGD1P40356 397 aa0.49□□□□□ -2.33
tT(AGU)CtT(AGU)C YIL077CP40508 320 aa0.49□□□□□ -2.33
tT(AGU)CtT(AGU)C EMC5P40540 141 aa0.49□□□□□ -2.33
tT(AGU)CtT(AGU)C PAU15P40585 124 aa0.49□□□□□ -2.33
tT(AGU)CtT(AGU)C DAN1P47178 298 aa0.49□□□□□ -2.33
tT(AGU)CtT(AGU)C SNN1P48232 102 aa0.49□□□□□ -2.33
tT(AGU)CtT(AGU)C YPS5P53057 165 aa0.49□□□□□ -2.33
tT(AGU)CtT(AGU)C PKP2P53170 491 aa0.49□□□□□ -2.33
tT(AGU)CtT(AGU)C YGR026WP53217 278 aa0.49□□□□□ -2.33
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 38.1 ms