RNA–Protein interactions for RNA: YPL179W

PPQ1, Transcript of Protein phosphatase that regulates the mating response, yeast

Gene PPQ1, Length 1,650 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PPQ1	YPL179W	POP5	P28005	173 aa		2.98	□□□□□ -1.93
PPQ1	YPL179W	SMD3	P43321	101 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
PPQ1	YPL179W	IMP2	P46972	177 aa		2.98	□□□□□ -1.93
PPQ1	YPL179W	YDL186W	P48568	277 aa		2.98	□□□□□ -1.93
PPQ1	YPL179W	PAU4	P53427	120 aa		2.98	□□□□□ -1.93
PPQ1	YPL179W	HST4	P53688	370 aa		2.98	□□□□□ -1.93
PPQ1	YPL179W	CAF40	P53829	373 aa		2.98	□□□□□ -1.93
PPQ1	YPL179W	YMR253C	Q04835	414 aa		2.98	□□□□□ -1.93
PPQ1	YPL179W	TIM18	Q08749	192 aa		2.98	□□□□□ -1.93
PPQ1	YPL179W	ERV2	Q12284	196 aa		2.98	□□□□□ -1.93
PPQ1	YPL179W	YCR043C	P25361	127 aa		2.97	□□□□□ -1.93
PPQ1	YPL179W	SRB6	P32570	121 aa		2.97	□□□□□ -1.93
PPQ1	YPL179W	ALK2	P32789	676 aa	Predicted RBP	2.97	□□□□□ -1.93
PPQ1	YPL179W	RIB5	P38145	238 aa		2.97	□□□□□ -1.93
PPQ1	YPL179W	SFT2	P38166	215 aa		2.97	□□□□□ -1.93
PPQ1	YPL179W	MIC12	P38341	106 aa		2.97	□□□□□ -1.93
PPQ1	YPL179W	RPA43	P46669	326 aa		2.97	□□□□□ -1.93
PPQ1	YPL179W	CAX4	P53223	239 aa		2.97	□□□□□ -1.93
PPQ1	YPL179W	CAB4	P53332	305 aa		2.97	□□□□□ -1.93
PPQ1	YPL179W	MRPL23	Q12487	163 aa	Predicted RBP	2.97	□□□□□ -1.93
PPQ1	YPL179W	PAU1	P0CE88	120 aa		2.96	□□□□□ -1.94
PPQ1	YPL179W	PAU14	P0CE89	120 aa		2.96	□□□□□ -1.94
PPQ1	YPL179W	PAU6	P0CE90	120 aa		2.96	□□□□□ -1.94
PPQ1	YPL179W	PAU18	P0CE91	120 aa		2.96	□□□□□ -1.94
PPQ1	YPL179W	PAU8	P0CE92	120 aa		2.96	□□□□□ -1.94
PPQ1	YPL179W	PAU11	P0CE93	120 aa		2.96	□□□□□ -1.94
PPQ1	YPL179W	LDS1	P31379	325 aa		2.96	□□□□□ -1.94
PPQ1	YPL179W	YBR090C	P38253	122 aa		2.96	□□□□□ -1.94
PPQ1	YPL179W	SHG1	P38337	142 aa		2.96	□□□□□ -1.94
PPQ1	YPL179W	PAU13	P38725	120 aa		2.96	□□□□□ -1.94
PPQ1	YPL179W	YIL163C	P40448	117 aa		2.96	□□□□□ -1.94
PPQ1	YPL179W	RTS2	P40962	232 aa		2.96	□□□□□ -1.94
PPQ1	YPL179W	SAS2	P40963	338 aa		2.96	□□□□□ -1.94
PPQ1	YPL179W	LCB3	P47013	409 aa		2.96	□□□□□ -1.94
PPQ1	YPL179W	TOM7	P53507	60 aa		2.96	□□□□□ -1.94
PPQ1	YPL179W	OCA2	P53949	197 aa		2.96	□□□□□ -1.94
PPQ1	YPL179W	PAU10	Q03050	120 aa		2.96	□□□□□ -1.94
PPQ1	YPL179W	ATC1	Q04005	294 aa		2.96	□□□□□ -1.94
PPQ1	YPL179W	PAU20	Q08322	120 aa		2.96	□□□□□ -1.94
PPQ1	YPL179W	FIT2	Q08906	153 aa		2.96	□□□□□ -1.94
PPQ1	YPL179W	PAU9	Q3E770	120 aa		2.96	□□□□□ -1.94
PPQ1	YPL179W	PCC1	Q3E833	88 aa		2.96	□□□□□ -1.94
PPQ1	YPL179W	YHR212W-A	P0CX91	67 aa		2.95	□□□□□ -1.94
PPQ1	YPL179W	CNB1	P25296	175 aa		2.95	□□□□□ -1.94
PPQ1	YPL179W	RNA15	P25299	296 aa	Predicted RBP	2.95	□□□□□ -1.94
PPQ1	YPL179W	YKL075C	P36083	450 aa		2.95	□□□□□ -1.94
PPQ1	YPL179W	PHD1	P36093	366 aa		2.95	□□□□□ -1.94
PPQ1	YPL179W	PRY2	P36110	329 aa		2.95	□□□□□ -1.94
PPQ1	YPL179W	MST28	P39552	234 aa		2.95	□□□□□ -1.94
PPQ1	YPL179W	YNL194C	P40169	301 aa		2.95	□□□□□ -1.94
PPQ1	YPL179W	HIT1	P46973	164 aa		2.95	□□□□□ -1.94
PPQ1	YPL179W	AIM24	P47127	394 aa		2.95	□□□□□ -1.94
PPQ1	YPL179W	BNS1	P50084	137 aa		2.95	□□□□□ -1.94
PPQ1	YPL179W	MST27	P53176	234 aa		2.95	□□□□□ -1.94
PPQ1	YPL179W	RAV2	Q03956	351 aa		2.95	□□□□□ -1.94
PPQ1	YPL179W	LOA1	Q06508	300 aa		2.95	□□□□□ -1.94
PPQ1	YPL179W	LDS2	Q08218	356 aa		2.95	□□□□□ -1.94
PPQ1	YPL179W	YPR145C-A	Q2V2P0	78 aa		2.95	□□□□□ -1.94
PPQ1	YPL179W	TAR1	Q8TGM6	124 aa		2.95	□□□□□ -1.94
PPQ1	YPL179W	YKL102C	P34249	101 aa		2.95	□□□□□ -1.94
PPQ1	YPL179W	ICS2	P38284	255 aa		2.95	□□□□□ -1.94
PPQ1	YPL179W	POR2	P40478	281 aa		2.95	□□□□□ -1.94
PPQ1	YPL179W	SDH7	Q04401	133 aa		2.95	□□□□□ -1.94
PPQ1	YPL179W	ATG39	Q06159	398 aa		2.95	□□□□□ -1.94
PPQ1	YPL179W	YLR112W	Q12130	139 aa		2.95	□□□□□ -1.94
PPQ1	YPL179W	YGR035W-A	Q45U48	73 aa		2.95	□□□□□ -1.94
PPQ1	YPL179W	YLR302C	O13544	120 aa		2.94	□□□□□ -1.94
PPQ1	YPL179W	HSP12	P22943	109 aa	Known RBP	2.94	□□□□□ -1.94
PPQ1	YPL179W	ECM25	P32525	599 aa		2.94	□□□□□ -1.94
PPQ1	YPL179W	NTF2	P33331	125 aa	Known RBP	2.94	□□□□□ -1.94
PPQ1	YPL179W	TIR2	P33890	251 aa		2.94	□□□□□ -1.94
PPQ1	YPL179W	PHS1	P40857	217 aa		2.94	□□□□□ -1.94
PPQ1	YPL179W	YPI1	P43587	155 aa		2.94	□□□□□ -1.94
PPQ1	YPL179W	YOL160W	Q08321	113 aa		2.94	□□□□□ -1.94
PPQ1	YPL179W	RPL42A	P0CX27	106 aa	Known RBP	2.93	□□□□□ -1.94
PPQ1	YPL179W	RPL42B	P0CX28	106 aa	Known RBP	2.93	□□□□□ -1.94
PPQ1	YPL179W	HMX1	P32339	317 aa		2.93	□□□□□ -1.94
PPQ1	YPL179W	YMR141C	P40211	102 aa		2.93	□□□□□ -1.94
PPQ1	YPL179W	SIM1	P40472	476 aa		2.93	□□□□□ -1.94
PPQ1	YPL179W	PRM3	Q08931	133 aa		2.93	□□□□□ -1.94
PPQ1	YPL179W	TDH1	P00360	332 aa	Known RBP	2.92	□□□□□ -1.94
PPQ1	YPL179W	RPS22A	P0C0W1	130 aa	Known RBP	2.92	□□□□□ -1.94
PPQ1	YPL179W	DDI2	P0CH63	225 aa		2.92	□□□□□ -1.94
PPQ1	YPL179W	DDI3	P0CH64	225 aa		2.92	□□□□□ -1.94
PPQ1	YPL179W	CMC1	P36064	111 aa		2.92	□□□□□ -1.94
PPQ1	YPL179W	YHR173C	P38864	112 aa		2.92	□□□□□ -1.94
PPQ1	YPL179W	SNF11	P38956	169 aa		2.92	□□□□□ -1.94
PPQ1	YPL179W	MBB1	P39534	108 aa		2.92	□□□□□ -1.94
PPQ1	YPL179W	POG1	P40473	351 aa		2.92	□□□□□ -1.94
PPQ1	YPL179W	MRPL49	P40858	161 aa	Predicted RBP	2.92	□□□□□ -1.94
PPQ1	YPL179W	TIM11	P81449	96 aa	Predicted RBP	2.92	□□□□□ -1.94
PPQ1	YPL179W	MRX11	Q03079	207 aa		2.92	□□□□□ -1.94
PPQ1	YPL179W	IZH1	Q03419	316 aa		2.92	□□□□□ -1.94
PPQ1	YPL179W	NAT3	Q06504	195 aa		2.92	□□□□□ -1.94
PPQ1	YPL179W	PRM7	Q12459	698 aa		2.92	□□□□□ -1.94
PPQ1	YPL179W	YOR011W-A	Q3E807	68 aa		2.92	□□□□□ -1.94
PPQ1	YPL179W	HTB2	P02294	131 aa		2.92	□□□□□ -1.94
PPQ1	YPL179W	MRS1	P07266	363 aa		2.92	□□□□□ -1.94
PPQ1	YPL179W	RPB3	P16370	318 aa	Known RBP	2.92	□□□□□ -1.94
PPQ1	YPL179W	FZF1	P32805	299 aa		2.92	□□□□□ -1.94

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