RNA–Protein interactions for RNA: YOL077C

BRX1, Transcript of Nucleolar protein, yeast

Gene BRX1, Length 876 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
BRX1	YOL077C	YDC1	Q02896	317 aa		0.72	□□□□□ -2.29
BRX1	YOL077C	YDR102C	Q03864	110 aa		0.72	□□□□□ -2.29
BRX1	YOL077C	YPR114W	Q06107	315 aa		0.72	□□□□□ -2.29
BRX1	YOL077C	NMA1	Q06178	401 aa	Known RBP	0.72	□□□□□ -2.29
BRX1	YOL077C	KEI1	Q06346	221 aa		0.72	□□□□□ -2.29
BRX1	YOL077C	YPR202W	Q08993	238 aa		0.72	□□□□□ -2.29
BRX1	YOL077C	QCR6	P00127	147 aa		0.71	□□□□□ -2.3
BRX1	YOL077C	KIN28	P06242	306 aa		0.71	□□□□□ -2.3
BRX1	YOL077C	RPC19	P28000	142 aa	Known RBP	0.71	□□□□□ -2.3
BRX1	YOL077C	CPR5	P35176	225 aa		0.71	□□□□□ -2.3
BRX1	YOL077C	SHB17	P36136	271 aa	Known RBP	0.71	□□□□□ -2.3
BRX1	YOL077C	YER181C	P40097	107 aa		0.71	□□□□□ -2.3
BRX1	YOL077C	VMA10	P48836	114 aa	Known RBP	0.71	□□□□□ -2.3
BRX1	YOL077C	ORM1	P53224	222 aa		0.71	□□□□□ -2.3
BRX1	YOL077C	AVO2	Q04749	426 aa		0.71	□□□□□ -2.3
BRX1	YOL077C	PET54	P10834	293 aa		0.7	□□□□□ -2.3
BRX1	YOL077C	PHO13	P19881	312 aa		0.7	□□□□□ -2.3
BRX1	YOL077C	RME1	P32338	300 aa	Known RBP	0.7	□□□□□ -2.3
BRX1	YOL077C	SPT14	P32363	452 aa		0.7	□□□□□ -2.3
BRX1	YOL077C	YEL014C	P39999	101 aa		0.7	□□□□□ -2.3
BRX1	YOL077C	FIP1	P45976	327 aa		0.7	□□□□□ -2.3
BRX1	YOL077C	MOG1	P47123	218 aa		0.7	□□□□□ -2.3
BRX1	YOL077C	RCF2	P53721	224 aa		0.7	□□□□□ -2.3
BRX1	YOL077C	YDR366C	P87287	132 aa		0.7	□□□□□ -2.3
BRX1	YOL077C	TMA23	Q03525	211 aa		0.7	□□□□□ -2.3
BRX1	YOL077C	FMN1	Q03778	218 aa		0.7	□□□□□ -2.3
BRX1	YOL077C	YOR072W	Q08486	104 aa		0.7	□□□□□ -2.3
BRX1	YOL077C	FCY1	Q12178	158 aa		0.7	□□□□□ -2.3
BRX1	YOL077C	HUT1	Q12520	339 aa		0.7	□□□□□ -2.3
BRX1	YOL077C	SRL3	P36167	246 aa		0.69	□□□□□ -2.3
BRX1	YOL077C	IPI1	P38803	334 aa	Predicted RBP	0.69	□□□□□ -2.3
BRX1	YOL077C	GLC8	P41818	229 aa		0.69	□□□□□ -2.3
BRX1	YOL077C	GPI2	P46961	280 aa		0.69	□□□□□ -2.3
BRX1	YOL077C	LSM1	P47017	172 aa	Known RBP	0.69	□□□□□ -2.3
BRX1	YOL077C	SPG1	P50088	95 aa		0.69	□□□□□ -2.3
BRX1	YOL077C	HHO1	P53551	258 aa		0.69	□□□□□ -2.3
BRX1	YOL077C	EST3	Q03096	181 aa		0.69	□□□□□ -2.3
BRX1	YOL077C	SMD2	Q06217	110 aa	Known RBP	0.69	□□□□□ -2.3
BRX1	YOL077C	RFU1	Q08003	200 aa		0.69	□□□□□ -2.3
BRX1	YOL077C	SUI1	P32911	108 aa	Known RBP	0.68	□□□□□ -2.3
BRX1	YOL077C	MRPL24	P36525	258 aa	Predicted RBP	0.68	□□□□□ -2.3
BRX1	YOL077C	RBL2	P48606	106 aa	Known RBP	0.68	□□□□□ -2.3
BRX1	YOL077C	YPR153W	Q06537	140 aa		0.68	□□□□□ -2.3
BRX1	YOL077C	YDL241W	Q07738	123 aa		0.68	□□□□□ -2.3
BRX1	YOL077C	IRC19	Q07843	230 aa		0.68	□□□□□ -2.3
BRX1	YOL077C	SCS22	Q6Q595	175 aa		0.68	□□□□□ -2.3
BRX1	YOL077C	NHP6A	P11632	93 aa	Known RBP	0.67	□□□□□ -2.3
BRX1	YOL077C	HSP12	P22943	109 aa	Known RBP	0.67	□□□□□ -2.3
BRX1	YOL077C	SRP21	P32342	167 aa		0.67	□□□□□ -2.3
BRX1	YOL077C	LSM8	P47093	109 aa	Known RBP	0.67	□□□□□ -2.3
BRX1	YOL077C	YGR039W	P53225	103 aa		0.67	□□□□□ -2.3
BRX1	YOL077C	RAF1	Q06891	181 aa		0.67	□□□□□ -2.3
BRX1	YOL077C	DDR48	P18899	430 aa	Known RBP	0.66	□□□□□ -2.3
BRX1	YOL077C	MRS4	P23500	304 aa		0.66	□□□□□ -2.3
BRX1	YOL077C	YCR001W	P25347	104 aa		0.66	□□□□□ -2.3
BRX1	YOL077C	YBR027C	P38220	110 aa		0.66	□□□□□ -2.3
BRX1	YOL077C	IPT1	P38954	527 aa		0.66	□□□□□ -2.3
BRX1	YOL077C	YJL218W	P40892	196 aa	Known RBP	0.66	□□□□□ -2.3
BRX1	YOL077C	YJL009W	P47078	108 aa		0.66	□□□□□ -2.3
BRX1	YOL077C	IRC21	Q04772	201 aa		0.66	□□□□□ -2.3
BRX1	YOL077C	GPI11	Q06636	219 aa		0.66	□□□□□ -2.3
BRX1	YOL077C	HSL1	P34244	1518 aa		0.65	□□□□□ -2.31
BRX1	YOL077C	RPL33A	P05744	107 aa	Known RBP	0.65	□□□□□ -2.31
BRX1	YOL077C	HAP2	P06774	265 aa		0.65	□□□□□ -2.31
BRX1	YOL077C	YOL013W-A	P0C272	63 aa	Predicted RBP	0.65	□□□□□ -2.31
BRX1	YOL077C	MRPL44	P19956	98 aa		0.65	□□□□□ -2.31
BRX1	YOL077C	HSP150	P32478	413 aa		0.65	□□□□□ -2.31
BRX1	YOL077C	DIE2	P50076	525 aa		0.65	□□□□□ -2.31
BRX1	YOL077C	SED1	Q01589	338 aa		0.65	□□□□□ -2.31
BRX1	YOL077C	COF1	Q03048	143 aa	Known RBP	0.65	□□□□□ -2.31
BRX1	YOL077C	ATP14	Q12349	124 aa		0.65	□□□□□ -2.31
BRX1	YOL077C	KTI11	Q3E840	82 aa		0.65	□□□□□ -2.31
BRX1	YOL077C	RPS22A	P0C0W1	130 aa	Known RBP	0.64	□□□□□ -2.31
BRX1	YOL077C	ANB1	P19211	157 aa		0.64	□□□□□ -2.31
BRX1	YOL077C	PHB1	P40961	287 aa		0.64	□□□□□ -2.31
BRX1	YOL077C	EMC4	P53073	190 aa		0.64	□□□□□ -2.31
BRX1	YOL077C	MPC1	P53157	130 aa	Known RBP	0.64	□□□□□ -2.31
BRX1	YOL077C	NAT5	Q08689	176 aa		0.64	□□□□□ -2.31
BRX1	YOL077C	SPC3	Q12133	184 aa		0.64	□□□□□ -2.31
BRX1	YOL077C	RPS22B	Q3E7Y3	130 aa	Known RBP	0.64	□□□□□ -2.31
BRX1	YOL077C	YHR213W-B	Q8TGK1	99 aa		0.64	□□□□□ -2.31
BRX1	YOL077C	FUN14	P18411	198 aa		0.63	□□□□□ -2.31
BRX1	YOL077C	RPS1B	P23248	255 aa	Known RBP	0.63	□□□□□ -2.31
BRX1	YOL077C	FYV5	P25585	152 aa		0.63	□□□□□ -2.31
BRX1	YOL077C	ATG8	P38182	117 aa	RIP-Chip data	0.63	□□□□□ -2.31	not detected
BRX1	YOL077C	YGR201C	P42936	225 aa		0.63	□□□□□ -2.31
BRX1	YOL077C	YGR017W	P53210	297 aa		0.63	□□□□□ -2.31
BRX1	YOL077C	YNL122C	P53921	115 aa	Predicted RBP	0.63	□□□□□ -2.31
BRX1	YOL077C	YNL019C	P53975	284 aa		0.63	□□□□□ -2.31
BRX1	YOL077C	CSN9	Q03981	162 aa		0.63	□□□□□ -2.31
BRX1	YOL077C	CMC4	Q3E7A9	73 aa		0.63	□□□□□ -2.31
BRX1	YOL077C	MHF1	Q3E835	90 aa		0.63	□□□□□ -2.31
BRX1	YOL077C	COA6	Q3E846	104 aa		0.63	□□□□□ -2.31
BRX1	YOL077C	DDP1	Q99321	188 aa	Known RBP	0.63	□□□□□ -2.31
BRX1	YOL077C	CDC39	P25655	2108 aa	Known RBP	0.62	□□□□□ -2.31
BRX1	YOL077C	COX5B	P00425	151 aa		0.62	□□□□□ -2.31
BRX1	YOL077C	PFY1	P07274	126 aa		0.62	□□□□□ -2.31
BRX1	YOL077C	HAP3	P13434	144 aa		0.62	□□□□□ -2.31
BRX1	YOL077C	GIM4	P40005	111 aa	Known RBP	0.62	□□□□□ -2.31
BRX1	YOL077C	YGR042W	P53227	271 aa		0.62	□□□□□ -2.31

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